Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VNR0

Protein Details
Accession H1VNR0    Localization Confidence High Confidence Score 23.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
211-235PEILRRPMPRPPLKRKRAKGDGNGHBasic
519-547VAIGKNTTEVQKRKKKPRTSSRSQQAVIDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
215-230RRPMPRPPLKRKRAKG
419-436PARPKASKQRSKTGGVRK
530-536KRKKKPR
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
Amino Acid Sequences MSYGIDLTMFGPLAPEATATDQDAMNENMFVKDETEVQGEGIPPTSTRFTAQYAQMDAVGLSQPSITPVEAAPAGVQPASLEHEEPRLTTSAPTSAPTSAPSSYKRQFSPATSRYILSRLHQGSDRKLFSSAPNPRKDEPPAPSKTSDEGALHCPVDLSTLPQTLHLPDPTHKASSIIALSQPPSAGAKRKRAVGDEAARMSSNLPAYSEPEILRRPMPRPPLKRKRAKGDGNGHPMCTNCKRTSYTSANRIVLCSCGEAWHQLCHNPEISDEVAVDLHRFQCRTCEVEEKEHAKYQRQLALYREAKQEQAEWKKQHNDIERRREKRLATLPKFPKTEIVGFEAGNASPAERREYFGDLMQSDLVNLLIFSNELQPGLLADVLVSISKKHPELPIFGSPNWAQPKVPQQEAQRPRQNNPARPKASKQRSKTGGVRKILKTAPAEAADPAANEADDDDALPESWPKAGHGLYAKLKPEKEDPFLLDDNDEEAFSHFMVDPRGKQIMEPLQAIGESSGTMVAIGKNTTEVQKRKKKPRTSSRSQQAVIDKDVYVISKELGGLEPWF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.08
3 0.08
4 0.11
5 0.13
6 0.14
7 0.15
8 0.15
9 0.16
10 0.19
11 0.19
12 0.16
13 0.16
14 0.15
15 0.14
16 0.15
17 0.15
18 0.13
19 0.12
20 0.13
21 0.15
22 0.16
23 0.16
24 0.15
25 0.17
26 0.17
27 0.16
28 0.16
29 0.13
30 0.12
31 0.15
32 0.17
33 0.16
34 0.18
35 0.19
36 0.22
37 0.27
38 0.32
39 0.33
40 0.32
41 0.32
42 0.3
43 0.28
44 0.23
45 0.19
46 0.15
47 0.1
48 0.08
49 0.08
50 0.07
51 0.09
52 0.1
53 0.09
54 0.09
55 0.09
56 0.12
57 0.12
58 0.12
59 0.11
60 0.11
61 0.11
62 0.1
63 0.1
64 0.07
65 0.08
66 0.12
67 0.12
68 0.12
69 0.13
70 0.17
71 0.18
72 0.18
73 0.19
74 0.17
75 0.17
76 0.17
77 0.18
78 0.17
79 0.18
80 0.19
81 0.19
82 0.19
83 0.19
84 0.2
85 0.21
86 0.19
87 0.22
88 0.24
89 0.31
90 0.35
91 0.4
92 0.39
93 0.41
94 0.43
95 0.46
96 0.52
97 0.48
98 0.5
99 0.46
100 0.45
101 0.41
102 0.41
103 0.37
104 0.29
105 0.34
106 0.28
107 0.3
108 0.34
109 0.36
110 0.4
111 0.47
112 0.46
113 0.38
114 0.38
115 0.36
116 0.35
117 0.41
118 0.44
119 0.44
120 0.5
121 0.53
122 0.55
123 0.58
124 0.6
125 0.57
126 0.53
127 0.54
128 0.52
129 0.52
130 0.51
131 0.49
132 0.45
133 0.39
134 0.36
135 0.28
136 0.24
137 0.23
138 0.24
139 0.21
140 0.19
141 0.17
142 0.14
143 0.15
144 0.13
145 0.12
146 0.12
147 0.15
148 0.15
149 0.16
150 0.17
151 0.17
152 0.2
153 0.19
154 0.19
155 0.18
156 0.24
157 0.26
158 0.26
159 0.24
160 0.22
161 0.21
162 0.21
163 0.2
164 0.15
165 0.14
166 0.14
167 0.14
168 0.14
169 0.13
170 0.11
171 0.12
172 0.13
173 0.2
174 0.25
175 0.34
176 0.36
177 0.41
178 0.43
179 0.43
180 0.46
181 0.46
182 0.45
183 0.41
184 0.4
185 0.35
186 0.33
187 0.3
188 0.26
189 0.2
190 0.15
191 0.1
192 0.1
193 0.1
194 0.13
195 0.15
196 0.17
197 0.15
198 0.17
199 0.18
200 0.19
201 0.22
202 0.22
203 0.22
204 0.26
205 0.35
206 0.41
207 0.5
208 0.59
209 0.67
210 0.74
211 0.82
212 0.83
213 0.84
214 0.84
215 0.83
216 0.81
217 0.8
218 0.78
219 0.78
220 0.71
221 0.62
222 0.53
223 0.45
224 0.41
225 0.36
226 0.33
227 0.25
228 0.28
229 0.3
230 0.33
231 0.41
232 0.44
233 0.45
234 0.47
235 0.52
236 0.51
237 0.48
238 0.45
239 0.37
240 0.29
241 0.23
242 0.16
243 0.1
244 0.09
245 0.09
246 0.11
247 0.11
248 0.12
249 0.13
250 0.14
251 0.16
252 0.16
253 0.17
254 0.14
255 0.13
256 0.14
257 0.13
258 0.11
259 0.1
260 0.08
261 0.08
262 0.07
263 0.08
264 0.06
265 0.08
266 0.08
267 0.09
268 0.08
269 0.12
270 0.13
271 0.15
272 0.16
273 0.22
274 0.23
275 0.28
276 0.33
277 0.33
278 0.34
279 0.35
280 0.35
281 0.3
282 0.33
283 0.31
284 0.31
285 0.3
286 0.3
287 0.29
288 0.37
289 0.36
290 0.36
291 0.36
292 0.31
293 0.31
294 0.29
295 0.3
296 0.29
297 0.34
298 0.37
299 0.37
300 0.41
301 0.46
302 0.48
303 0.51
304 0.53
305 0.55
306 0.57
307 0.65
308 0.69
309 0.68
310 0.69
311 0.68
312 0.59
313 0.58
314 0.58
315 0.58
316 0.53
317 0.59
318 0.61
319 0.63
320 0.63
321 0.55
322 0.49
323 0.42
324 0.41
325 0.32
326 0.3
327 0.24
328 0.23
329 0.23
330 0.2
331 0.16
332 0.13
333 0.11
334 0.08
335 0.08
336 0.09
337 0.13
338 0.12
339 0.14
340 0.16
341 0.19
342 0.19
343 0.19
344 0.21
345 0.17
346 0.17
347 0.16
348 0.14
349 0.1
350 0.09
351 0.08
352 0.05
353 0.05
354 0.04
355 0.03
356 0.04
357 0.04
358 0.06
359 0.06
360 0.06
361 0.06
362 0.06
363 0.06
364 0.07
365 0.06
366 0.04
367 0.04
368 0.04
369 0.04
370 0.05
371 0.05
372 0.05
373 0.07
374 0.1
375 0.11
376 0.13
377 0.18
378 0.2
379 0.24
380 0.28
381 0.35
382 0.36
383 0.35
384 0.37
385 0.33
386 0.38
387 0.38
388 0.34
389 0.26
390 0.26
391 0.36
392 0.36
393 0.39
394 0.37
395 0.39
396 0.49
397 0.56
398 0.62
399 0.61
400 0.6
401 0.6
402 0.65
403 0.68
404 0.66
405 0.68
406 0.69
407 0.67
408 0.68
409 0.73
410 0.73
411 0.75
412 0.76
413 0.72
414 0.72
415 0.71
416 0.74
417 0.75
418 0.74
419 0.72
420 0.7
421 0.72
422 0.63
423 0.65
424 0.59
425 0.55
426 0.47
427 0.42
428 0.39
429 0.32
430 0.31
431 0.24
432 0.25
433 0.2
434 0.17
435 0.15
436 0.11
437 0.09
438 0.08
439 0.08
440 0.07
441 0.06
442 0.06
443 0.06
444 0.06
445 0.07
446 0.07
447 0.08
448 0.08
449 0.09
450 0.09
451 0.1
452 0.13
453 0.13
454 0.17
455 0.19
456 0.26
457 0.3
458 0.35
459 0.4
460 0.41
461 0.42
462 0.42
463 0.46
464 0.45
465 0.44
466 0.43
467 0.41
468 0.41
469 0.42
470 0.39
471 0.32
472 0.26
473 0.23
474 0.19
475 0.16
476 0.11
477 0.1
478 0.1
479 0.09
480 0.11
481 0.1
482 0.11
483 0.16
484 0.19
485 0.2
486 0.25
487 0.28
488 0.26
489 0.26
490 0.32
491 0.36
492 0.36
493 0.35
494 0.3
495 0.28
496 0.27
497 0.28
498 0.2
499 0.12
500 0.08
501 0.07
502 0.06
503 0.05
504 0.06
505 0.06
506 0.07
507 0.09
508 0.09
509 0.09
510 0.11
511 0.13
512 0.19
513 0.27
514 0.35
515 0.44
516 0.55
517 0.65
518 0.74
519 0.83
520 0.87
521 0.89
522 0.92
523 0.92
524 0.91
525 0.92
526 0.92
527 0.91
528 0.82
529 0.78
530 0.75
531 0.69
532 0.63
533 0.54
534 0.44
535 0.35
536 0.35
537 0.29
538 0.22
539 0.18
540 0.15
541 0.13
542 0.13
543 0.13
544 0.13