Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5M6BU23

Protein Details
Accession A0A5M6BU23    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24MARPQQNANRRKRHRGEYDDYSSNHydrophilic
147-168SGQFQRTKKVKQRHPALQKESWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
224-229RSKGKK
Subcellular Location(s) nucl 13.5, mito 9, cyto_nucl 8.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035426  Gemin2/Brr1  
Gene Ontology GO:0000387  P:spliceosomal snRNP assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04938  SIP1  
Amino Acid Sequences MARPQQNANRRKRHRGEYDDYSSNANASASASASGSTSINLAAMVPDPSDEADLPDEDATKGGADPSVERNPRSQCLPVADLPADFDGLPLDGAQFLALANRANETLPSFTRVDNPYREYSPSIPVEEEDIRGIAVGDDRGEGSSSSGQFQRTKKVKQRHPALQKESWEVLFPIHYQSYRKNLAARWPPSPLLPYPATYPPLPESSGRSDWYMFINGYTVPSKRSKGKKKVVVQVDEEEAMNGGGGLDLVDVPVEVEEKVEKGESREPLVSVLQQLNASQTINVLSHFATWLDENINQLPSPYPSSPILLPTQPDEADDDDIPSATRTTKPTSTNTSTRAPDPLPLNYFNWIFALILVLPAQLSSGEISTLRELSRAAMRVAGWRWIRGVVCRDVGEGWKLGEKGWLKKRTQGGGGSSEDGVVIEDTVDEMLARCWIIVHAVAIGWGQKDLLEELESLFS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.88
2 0.87
3 0.85
4 0.84
5 0.83
6 0.76
7 0.68
8 0.61
9 0.5
10 0.41
11 0.33
12 0.23
13 0.16
14 0.12
15 0.12
16 0.09
17 0.1
18 0.1
19 0.09
20 0.1
21 0.11
22 0.1
23 0.09
24 0.09
25 0.08
26 0.08
27 0.07
28 0.07
29 0.06
30 0.07
31 0.08
32 0.07
33 0.08
34 0.08
35 0.09
36 0.11
37 0.1
38 0.11
39 0.12
40 0.12
41 0.14
42 0.14
43 0.14
44 0.12
45 0.12
46 0.11
47 0.09
48 0.09
49 0.08
50 0.09
51 0.08
52 0.11
53 0.17
54 0.26
55 0.29
56 0.3
57 0.35
58 0.39
59 0.42
60 0.43
61 0.4
62 0.34
63 0.37
64 0.4
65 0.36
66 0.35
67 0.33
68 0.29
69 0.28
70 0.24
71 0.19
72 0.15
73 0.12
74 0.08
75 0.08
76 0.08
77 0.06
78 0.06
79 0.05
80 0.05
81 0.05
82 0.04
83 0.04
84 0.05
85 0.06
86 0.07
87 0.07
88 0.08
89 0.09
90 0.09
91 0.1
92 0.11
93 0.14
94 0.14
95 0.17
96 0.18
97 0.18
98 0.24
99 0.27
100 0.3
101 0.32
102 0.35
103 0.35
104 0.36
105 0.38
106 0.35
107 0.34
108 0.35
109 0.32
110 0.29
111 0.25
112 0.23
113 0.25
114 0.23
115 0.21
116 0.15
117 0.13
118 0.11
119 0.11
120 0.11
121 0.07
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.08
131 0.11
132 0.11
133 0.13
134 0.15
135 0.18
136 0.23
137 0.25
138 0.33
139 0.37
140 0.45
141 0.53
142 0.61
143 0.67
144 0.71
145 0.78
146 0.78
147 0.82
148 0.82
149 0.8
150 0.75
151 0.69
152 0.64
153 0.56
154 0.46
155 0.37
156 0.27
157 0.2
158 0.17
159 0.14
160 0.12
161 0.12
162 0.13
163 0.14
164 0.17
165 0.23
166 0.26
167 0.27
168 0.28
169 0.28
170 0.36
171 0.43
172 0.42
173 0.38
174 0.37
175 0.37
176 0.34
177 0.35
178 0.27
179 0.22
180 0.21
181 0.19
182 0.19
183 0.21
184 0.23
185 0.2
186 0.21
187 0.18
188 0.19
189 0.19
190 0.16
191 0.18
192 0.21
193 0.23
194 0.22
195 0.21
196 0.2
197 0.2
198 0.2
199 0.18
200 0.12
201 0.1
202 0.1
203 0.09
204 0.1
205 0.11
206 0.09
207 0.11
208 0.14
209 0.17
210 0.24
211 0.34
212 0.43
213 0.51
214 0.6
215 0.66
216 0.72
217 0.77
218 0.76
219 0.71
220 0.63
221 0.55
222 0.46
223 0.38
224 0.3
225 0.21
226 0.14
227 0.1
228 0.07
229 0.04
230 0.03
231 0.02
232 0.02
233 0.02
234 0.02
235 0.02
236 0.02
237 0.02
238 0.02
239 0.02
240 0.02
241 0.03
242 0.03
243 0.03
244 0.04
245 0.04
246 0.05
247 0.06
248 0.06
249 0.09
250 0.13
251 0.14
252 0.17
253 0.18
254 0.17
255 0.18
256 0.19
257 0.16
258 0.14
259 0.14
260 0.12
261 0.12
262 0.11
263 0.11
264 0.11
265 0.11
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.08
280 0.09
281 0.1
282 0.12
283 0.12
284 0.11
285 0.12
286 0.12
287 0.12
288 0.16
289 0.14
290 0.16
291 0.16
292 0.18
293 0.18
294 0.2
295 0.2
296 0.17
297 0.18
298 0.17
299 0.18
300 0.16
301 0.16
302 0.16
303 0.15
304 0.16
305 0.15
306 0.14
307 0.11
308 0.12
309 0.11
310 0.1
311 0.09
312 0.08
313 0.11
314 0.13
315 0.19
316 0.24
317 0.28
318 0.32
319 0.4
320 0.45
321 0.47
322 0.48
323 0.49
324 0.46
325 0.44
326 0.43
327 0.35
328 0.34
329 0.32
330 0.33
331 0.3
332 0.31
333 0.3
334 0.3
335 0.29
336 0.25
337 0.22
338 0.17
339 0.13
340 0.1
341 0.11
342 0.07
343 0.08
344 0.07
345 0.07
346 0.06
347 0.06
348 0.06
349 0.04
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.06
354 0.06
355 0.08
356 0.1
357 0.12
358 0.11
359 0.11
360 0.11
361 0.13
362 0.18
363 0.18
364 0.17
365 0.18
366 0.18
367 0.23
368 0.24
369 0.3
370 0.26
371 0.25
372 0.26
373 0.27
374 0.28
375 0.28
376 0.32
377 0.29
378 0.31
379 0.3
380 0.3
381 0.28
382 0.29
383 0.26
384 0.22
385 0.18
386 0.19
387 0.19
388 0.18
389 0.23
390 0.26
391 0.33
392 0.41
393 0.49
394 0.47
395 0.54
396 0.61
397 0.61
398 0.62
399 0.58
400 0.52
401 0.5
402 0.51
403 0.46
404 0.38
405 0.32
406 0.26
407 0.2
408 0.16
409 0.1
410 0.08
411 0.05
412 0.05
413 0.06
414 0.06
415 0.05
416 0.05
417 0.05
418 0.06
419 0.07
420 0.07
421 0.06
422 0.07
423 0.07
424 0.09
425 0.1
426 0.1
427 0.09
428 0.09
429 0.1
430 0.1
431 0.12
432 0.1
433 0.09
434 0.09
435 0.09
436 0.1
437 0.11
438 0.12
439 0.12
440 0.12