Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5M6C7D0

Protein Details
Accession A0A5M6C7D0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
208-256NEDEEERRRKKRKLGKEKEKAEKEKAARAKAKRVKNKDDKERTRHYEVVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
214-249RRRKKRKLGKEKEKAEKEKAARAKAKRVKNKDDKER
Subcellular Location(s) nucl 21, mito_nucl 12.833, cyto_nucl 12.333, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018607  Ctf8  
Gene Ontology GO:0031390  C:Ctf18 RFC-like complex  
GO:0007064  P:mitotic sister chromatid cohesion  
Pfam View protein in Pfam  
PF09696  Ctf8  
Amino Acid Sequences MRIHLPLHPHHFAQPSASSSSGPPPPLVQLGGDLVIVELQGTLTFEGDKSNGVLGVIGLDRPDKPTLHLGEHHLLHGKFVNLQKPYAVIRRVVGTPSSVSVIENGKAVALEGDASEEESDDEGSDSEEEDEEEDQPLFAANPDMFPSTPSPTNKKRAPQSSSPMSWAPASTPKDYSSELDPSSPARSEMDDFGFPKRSQPVDEDDEENEDEEERRRKKRKLGKEKEKAEKEKAARAKAKRVKNKDDKERTRHYEVVGVVRKKVVFALRPEPLVAPTLLPE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.32
3 0.31
4 0.3
5 0.26
6 0.24
7 0.3
8 0.3
9 0.27
10 0.25
11 0.23
12 0.25
13 0.25
14 0.24
15 0.18
16 0.15
17 0.15
18 0.15
19 0.13
20 0.11
21 0.08
22 0.08
23 0.07
24 0.05
25 0.04
26 0.03
27 0.04
28 0.05
29 0.05
30 0.05
31 0.06
32 0.06
33 0.08
34 0.08
35 0.08
36 0.08
37 0.09
38 0.08
39 0.08
40 0.08
41 0.06
42 0.08
43 0.07
44 0.07
45 0.07
46 0.08
47 0.08
48 0.11
49 0.14
50 0.13
51 0.15
52 0.22
53 0.24
54 0.27
55 0.29
56 0.31
57 0.34
58 0.34
59 0.33
60 0.32
61 0.29
62 0.26
63 0.25
64 0.2
65 0.2
66 0.23
67 0.28
68 0.23
69 0.24
70 0.23
71 0.23
72 0.26
73 0.27
74 0.25
75 0.21
76 0.2
77 0.23
78 0.23
79 0.22
80 0.19
81 0.15
82 0.14
83 0.13
84 0.14
85 0.11
86 0.1
87 0.11
88 0.12
89 0.11
90 0.11
91 0.1
92 0.08
93 0.08
94 0.08
95 0.06
96 0.04
97 0.04
98 0.03
99 0.04
100 0.04
101 0.05
102 0.04
103 0.04
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.04
108 0.05
109 0.04
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.04
125 0.04
126 0.05
127 0.04
128 0.05
129 0.06
130 0.07
131 0.07
132 0.08
133 0.1
134 0.12
135 0.16
136 0.18
137 0.24
138 0.29
139 0.37
140 0.4
141 0.45
142 0.5
143 0.54
144 0.57
145 0.57
146 0.59
147 0.57
148 0.54
149 0.51
150 0.43
151 0.37
152 0.31
153 0.24
154 0.19
155 0.2
156 0.22
157 0.21
158 0.22
159 0.22
160 0.24
161 0.25
162 0.25
163 0.21
164 0.21
165 0.2
166 0.19
167 0.18
168 0.18
169 0.19
170 0.17
171 0.14
172 0.12
173 0.13
174 0.14
175 0.16
176 0.17
177 0.17
178 0.18
179 0.2
180 0.24
181 0.22
182 0.24
183 0.27
184 0.25
185 0.25
186 0.26
187 0.3
188 0.3
189 0.33
190 0.31
191 0.28
192 0.29
193 0.27
194 0.25
195 0.19
196 0.14
197 0.13
198 0.16
199 0.23
200 0.27
201 0.36
202 0.44
203 0.5
204 0.6
205 0.69
206 0.76
207 0.79
208 0.84
209 0.86
210 0.88
211 0.92
212 0.93
213 0.92
214 0.88
215 0.83
216 0.8
217 0.73
218 0.71
219 0.69
220 0.67
221 0.66
222 0.64
223 0.68
224 0.68
225 0.75
226 0.76
227 0.78
228 0.8
229 0.83
230 0.88
231 0.88
232 0.91
233 0.9
234 0.89
235 0.89
236 0.86
237 0.83
238 0.76
239 0.66
240 0.61
241 0.54
242 0.55
243 0.54
244 0.48
245 0.42
246 0.42
247 0.4
248 0.35
249 0.37
250 0.33
251 0.3
252 0.35
253 0.42
254 0.42
255 0.43
256 0.44
257 0.41
258 0.35
259 0.32
260 0.25