Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A5M6BTJ1

Protein Details
Accession A0A5M6BTJ1   
Localization Confidence High
Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-65MSSHLSPRDRDRRYTRDRDRERDDEPLPVRPRERERERERDRDSIRSKSRSRSPPRREGRYDDRYBasic
293-315GGVKIHKQRTWRQYMNRRGGFNRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
28-60PVRPRERERERERDRDSIRSKSRSRSPPRREGR
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13.5, nucl 23.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MSSHLSPRDRDRRYTRDRDRERDDEPLPVRPRERERERERDRDSIRSKSRSRSPPRREGRYDDRYGDRDRRERSYDRDRPPRGDYASERDRSAPRREVPDGPSAHGTPTPGVRDVKPTLPTAPSGPSGRGGDGRHDSPSFNNSNPNNDPNYRPPYRQNYDQTRGGYGPPGRGGRGGGGGFGGRGGGSSGGGYDERGYAGGGGGRDSYGREREYNTPLDRRAIEEGRRKREEERAKGITYTEDGTRIDPSQAGIKEEPKEEVDMDDPEAAMAAMMGFGGFDSTKGKGIPTNAEGGVKIHKQRTWRQYMNRRGGFNRPLERMKD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.82
3 0.83
4 0.88
5 0.88
6 0.87
7 0.82
8 0.76
9 0.73
10 0.63
11 0.61
12 0.54
13 0.54
14 0.5
15 0.5
16 0.51
17 0.5
18 0.58
19 0.59
20 0.66
21 0.67
22 0.71
23 0.76
24 0.81
25 0.83
26 0.8
27 0.79
28 0.74
29 0.74
30 0.7
31 0.69
32 0.7
33 0.69
34 0.69
35 0.67
36 0.73
37 0.74
38 0.79
39 0.8
40 0.81
41 0.82
42 0.87
43 0.87
44 0.83
45 0.82
46 0.81
47 0.79
48 0.75
49 0.69
50 0.65
51 0.6
52 0.61
53 0.6
54 0.58
55 0.56
56 0.56
57 0.57
58 0.58
59 0.59
60 0.6
61 0.63
62 0.65
63 0.67
64 0.73
65 0.71
66 0.7
67 0.69
68 0.67
69 0.59
70 0.55
71 0.5
72 0.48
73 0.51
74 0.48
75 0.44
76 0.42
77 0.44
78 0.43
79 0.46
80 0.45
81 0.41
82 0.46
83 0.49
84 0.49
85 0.48
86 0.5
87 0.44
88 0.39
89 0.37
90 0.31
91 0.28
92 0.24
93 0.21
94 0.15
95 0.16
96 0.16
97 0.16
98 0.18
99 0.17
100 0.22
101 0.24
102 0.27
103 0.27
104 0.26
105 0.25
106 0.24
107 0.25
108 0.21
109 0.2
110 0.19
111 0.18
112 0.17
113 0.18
114 0.18
115 0.17
116 0.19
117 0.18
118 0.19
119 0.21
120 0.22
121 0.21
122 0.21
123 0.21
124 0.18
125 0.23
126 0.21
127 0.19
128 0.25
129 0.23
130 0.29
131 0.3
132 0.32
133 0.31
134 0.3
135 0.33
136 0.32
137 0.38
138 0.35
139 0.35
140 0.38
141 0.44
142 0.46
143 0.51
144 0.52
145 0.54
146 0.56
147 0.58
148 0.52
149 0.45
150 0.41
151 0.34
152 0.3
153 0.22
154 0.18
155 0.18
156 0.17
157 0.16
158 0.16
159 0.16
160 0.12
161 0.13
162 0.12
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.07
167 0.06
168 0.06
169 0.03
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.04
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.06
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.08
193 0.1
194 0.12
195 0.14
196 0.15
197 0.18
198 0.23
199 0.27
200 0.32
201 0.33
202 0.34
203 0.34
204 0.36
205 0.33
206 0.31
207 0.33
208 0.32
209 0.35
210 0.41
211 0.48
212 0.53
213 0.56
214 0.55
215 0.53
216 0.58
217 0.61
218 0.6
219 0.6
220 0.56
221 0.54
222 0.53
223 0.5
224 0.41
225 0.32
226 0.26
227 0.18
228 0.15
229 0.14
230 0.15
231 0.17
232 0.16
233 0.15
234 0.13
235 0.14
236 0.18
237 0.18
238 0.21
239 0.21
240 0.25
241 0.27
242 0.28
243 0.3
244 0.24
245 0.25
246 0.21
247 0.21
248 0.19
249 0.17
250 0.18
251 0.16
252 0.14
253 0.12
254 0.12
255 0.09
256 0.07
257 0.05
258 0.03
259 0.03
260 0.03
261 0.02
262 0.02
263 0.02
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.07
268 0.08
269 0.11
270 0.11
271 0.12
272 0.15
273 0.18
274 0.24
275 0.24
276 0.27
277 0.26
278 0.27
279 0.27
280 0.25
281 0.28
282 0.28
283 0.32
284 0.33
285 0.34
286 0.41
287 0.5
288 0.59
289 0.63
290 0.66
291 0.71
292 0.77
293 0.85
294 0.89
295 0.85
296 0.8
297 0.74
298 0.74
299 0.71
300 0.7
301 0.67
302 0.63