Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VDF8

Protein Details
Accession H1VDF8    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
95-117DLKTSHEKGRNSRHRKKAEVADDBasic
306-325GDCAPKPKGHGQKTKKHKGVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
274-295KFKSKAERKAARKADQKKNKGK
311-323KPKGHGQKTKKHK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001005  SANT/Myb  
KEGG chig:CH63R_04378  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50090  MYB_LIKE  
CDD cd00167  SANT  
Amino Acid Sequences MKNSKKNKSKHLQDPAAGTWNDDGNFSTTTVTVQSDDNVSDTMTLVDVFPDMAVGDLFESDDNTTSVETSVTPSSEVSTNKQSTPGAEASNNELDLKTSHEKGRNSRHRKKAEVADDVESEPGISADTSSAEISTISEELTSSEAGSAEIAMAQSTTSGETASNEASTSGDKSTKSGGASSSAQSSNAGNWTPSEDALIISMKNGGESWASIGNAINRGKNEVKKRWHVAKVNAANSESGGDSQTESGGDVSQSDSVDETQSDQSQEGQKANEKFKSKAERKAARKADQKKNKGKSMADDTTKEAGDCAPKPKGHGQKTKKHKGVESSEAPTTPKTTPSFNSIGDSPNSSLRNRLTLLRDTTSASSSTSSATSNDGEYGDGPPNQCYTRELARQERYIRRHVNPTLYPPPPPPLSSLMLPPKTANPPSHLDKRQRRDDKILASLMSQREATKWLEMQANFYNVTGRMVPLHMIKTRCDAEEDRGKAAGIQYWAASVAHDKEMLDPNEGTDAPEDALVDSDEDDEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.71
3 0.68
4 0.57
5 0.48
6 0.39
7 0.34
8 0.3
9 0.25
10 0.22
11 0.17
12 0.18
13 0.17
14 0.16
15 0.13
16 0.13
17 0.14
18 0.14
19 0.13
20 0.12
21 0.14
22 0.15
23 0.15
24 0.15
25 0.14
26 0.13
27 0.12
28 0.11
29 0.1
30 0.08
31 0.08
32 0.07
33 0.07
34 0.07
35 0.06
36 0.06
37 0.05
38 0.05
39 0.05
40 0.05
41 0.05
42 0.05
43 0.05
44 0.05
45 0.05
46 0.07
47 0.07
48 0.08
49 0.08
50 0.09
51 0.09
52 0.09
53 0.09
54 0.09
55 0.08
56 0.1
57 0.12
58 0.12
59 0.12
60 0.12
61 0.14
62 0.18
63 0.2
64 0.21
65 0.29
66 0.31
67 0.31
68 0.34
69 0.33
70 0.3
71 0.33
72 0.31
73 0.25
74 0.24
75 0.24
76 0.27
77 0.28
78 0.27
79 0.22
80 0.19
81 0.17
82 0.16
83 0.21
84 0.2
85 0.22
86 0.27
87 0.34
88 0.39
89 0.47
90 0.58
91 0.63
92 0.69
93 0.75
94 0.8
95 0.81
96 0.82
97 0.82
98 0.8
99 0.77
100 0.74
101 0.67
102 0.6
103 0.54
104 0.48
105 0.4
106 0.29
107 0.21
108 0.13
109 0.1
110 0.07
111 0.05
112 0.04
113 0.05
114 0.06
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.06
119 0.07
120 0.07
121 0.08
122 0.07
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.08
128 0.07
129 0.06
130 0.06
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.06
135 0.04
136 0.05
137 0.05
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.05
144 0.04
145 0.05
146 0.05
147 0.06
148 0.08
149 0.09
150 0.08
151 0.08
152 0.08
153 0.08
154 0.09
155 0.09
156 0.09
157 0.11
158 0.11
159 0.13
160 0.15
161 0.17
162 0.17
163 0.16
164 0.15
165 0.17
166 0.18
167 0.18
168 0.2
169 0.17
170 0.17
171 0.17
172 0.16
173 0.14
174 0.14
175 0.13
176 0.1
177 0.1
178 0.12
179 0.12
180 0.11
181 0.11
182 0.09
183 0.09
184 0.09
185 0.1
186 0.07
187 0.07
188 0.08
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.06
194 0.06
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.09
200 0.1
201 0.15
202 0.16
203 0.16
204 0.14
205 0.19
206 0.23
207 0.28
208 0.35
209 0.38
210 0.44
211 0.5
212 0.57
213 0.6
214 0.64
215 0.64
216 0.61
217 0.63
218 0.63
219 0.59
220 0.54
221 0.46
222 0.38
223 0.32
224 0.27
225 0.17
226 0.11
227 0.08
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.04
237 0.04
238 0.05
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.07
245 0.06
246 0.08
247 0.08
248 0.09
249 0.09
250 0.09
251 0.11
252 0.14
253 0.16
254 0.15
255 0.15
256 0.2
257 0.24
258 0.27
259 0.3
260 0.29
261 0.29
262 0.35
263 0.44
264 0.44
265 0.48
266 0.55
267 0.58
268 0.62
269 0.7
270 0.71
271 0.68
272 0.72
273 0.74
274 0.75
275 0.76
276 0.8
277 0.8
278 0.8
279 0.77
280 0.74
281 0.65
282 0.6
283 0.59
284 0.55
285 0.48
286 0.42
287 0.39
288 0.36
289 0.35
290 0.29
291 0.2
292 0.16
293 0.17
294 0.17
295 0.18
296 0.2
297 0.2
298 0.24
299 0.32
300 0.4
301 0.45
302 0.54
303 0.58
304 0.63
305 0.73
306 0.8
307 0.78
308 0.72
309 0.67
310 0.65
311 0.63
312 0.62
313 0.56
314 0.48
315 0.44
316 0.4
317 0.38
318 0.3
319 0.27
320 0.2
321 0.2
322 0.18
323 0.2
324 0.21
325 0.26
326 0.28
327 0.26
328 0.27
329 0.23
330 0.24
331 0.22
332 0.23
333 0.18
334 0.2
335 0.22
336 0.2
337 0.23
338 0.21
339 0.24
340 0.23
341 0.27
342 0.26
343 0.29
344 0.33
345 0.31
346 0.31
347 0.29
348 0.29
349 0.26
350 0.22
351 0.17
352 0.14
353 0.13
354 0.13
355 0.12
356 0.11
357 0.1
358 0.12
359 0.12
360 0.11
361 0.12
362 0.11
363 0.11
364 0.11
365 0.12
366 0.13
367 0.14
368 0.14
369 0.14
370 0.17
371 0.17
372 0.17
373 0.16
374 0.18
375 0.23
376 0.29
377 0.34
378 0.4
379 0.45
380 0.5
381 0.57
382 0.61
383 0.59
384 0.63
385 0.64
386 0.6
387 0.63
388 0.62
389 0.62
390 0.56
391 0.59
392 0.58
393 0.52
394 0.51
395 0.44
396 0.45
397 0.39
398 0.37
399 0.32
400 0.29
401 0.3
402 0.29
403 0.34
404 0.37
405 0.37
406 0.36
407 0.34
408 0.35
409 0.38
410 0.41
411 0.37
412 0.32
413 0.37
414 0.43
415 0.52
416 0.54
417 0.58
418 0.64
419 0.71
420 0.77
421 0.8
422 0.79
423 0.78
424 0.78
425 0.74
426 0.7
427 0.64
428 0.54
429 0.46
430 0.46
431 0.38
432 0.32
433 0.27
434 0.21
435 0.19
436 0.22
437 0.22
438 0.2
439 0.2
440 0.22
441 0.28
442 0.28
443 0.32
444 0.33
445 0.33
446 0.3
447 0.29
448 0.27
449 0.21
450 0.23
451 0.18
452 0.15
453 0.14
454 0.14
455 0.17
456 0.18
457 0.22
458 0.25
459 0.26
460 0.27
461 0.33
462 0.34
463 0.33
464 0.35
465 0.32
466 0.36
467 0.43
468 0.44
469 0.4
470 0.38
471 0.37
472 0.33
473 0.32
474 0.28
475 0.2
476 0.18
477 0.16
478 0.16
479 0.17
480 0.15
481 0.14
482 0.14
483 0.15
484 0.16
485 0.17
486 0.17
487 0.21
488 0.29
489 0.3
490 0.3
491 0.27
492 0.26
493 0.29
494 0.29
495 0.25
496 0.18
497 0.18
498 0.14
499 0.15
500 0.14
501 0.1
502 0.11
503 0.1
504 0.1
505 0.09