Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5M6C0Y5

Protein Details
Accession A0A5M6C0Y5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
429-451PPPPPEPEDVRRRRKWKEFVEELBasic
520-544IHAAPEREKDRKRARTVNPRAGRLGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
439-443RRRRK
524-552PEREKDRKRARTVNPRAGRLGAGGGGGRG
Subcellular Location(s) mito 12, nucl 9.5, cyto_nucl 7.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR037794  TAF12  
IPR003228  TFIID_TAF12_dom  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0046695  C:SLIK (SAGA-like) complex  
GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF03847  TFIID_20kDa  
CDD cd07981  TAF12  
Amino Acid Sequences MSRPPAQAGAGTPGAGGRPPQQAGATIQTILQNLPNLFQMHARGTLSDLQINQLRQLMHTHYRQIIASSIATSRPNPLLSLPPAIDPTLPWQGRPPLVSKEAYKELIAKTTMHIREAMAKRASELQRSQLGQVQAGSVSTPSPPAAGGVGGASQAHGQAVRPNIMTNPSTSATAGAPTRPPAQMVRPGTPGGNGTRPQPRPRLPGPPPGVLTHEQLRSLARLPQTERQEWLSRDPARLAQFNMSVKYWQAQSKPPDPPAQVRPPPPNQQPVLQPVAQQPTATSSAGPSTPPAAAAVASAAPDIASTSTSAPQPETPSTVPTLPTLPTDPATGPTASEPDAPEPNVVASTAGPSSTIDATPNTSDDVQPPAVTDPSTTTSTDPPGDVAPAPADDTAVFLASAAANPSVNPAFVTALPDARTFELKPPPPPPPPPEPEDVRRRRKWKEFVEELAPGLEVEQGVDEVLGDLLDSMIEEGVKGATRMAKHRGSEKVELKDMSFFIDQSWDMVVPGFDAMPHKHIHAAPEREKDRKRARTVNPRAGRLGAGGGGGRGRDEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.15
3 0.16
4 0.15
5 0.2
6 0.21
7 0.23
8 0.24
9 0.26
10 0.29
11 0.32
12 0.28
13 0.23
14 0.23
15 0.23
16 0.24
17 0.22
18 0.2
19 0.2
20 0.18
21 0.19
22 0.22
23 0.21
24 0.21
25 0.22
26 0.23
27 0.21
28 0.24
29 0.24
30 0.2
31 0.22
32 0.26
33 0.26
34 0.26
35 0.23
36 0.25
37 0.29
38 0.29
39 0.28
40 0.26
41 0.24
42 0.22
43 0.26
44 0.28
45 0.31
46 0.34
47 0.38
48 0.37
49 0.39
50 0.38
51 0.35
52 0.31
53 0.26
54 0.22
55 0.18
56 0.17
57 0.17
58 0.19
59 0.19
60 0.21
61 0.22
62 0.22
63 0.21
64 0.22
65 0.26
66 0.26
67 0.3
68 0.27
69 0.25
70 0.26
71 0.26
72 0.24
73 0.18
74 0.2
75 0.26
76 0.25
77 0.24
78 0.27
79 0.32
80 0.35
81 0.36
82 0.35
83 0.31
84 0.35
85 0.38
86 0.35
87 0.36
88 0.38
89 0.38
90 0.34
91 0.33
92 0.3
93 0.31
94 0.3
95 0.24
96 0.21
97 0.29
98 0.29
99 0.26
100 0.25
101 0.22
102 0.3
103 0.33
104 0.38
105 0.32
106 0.31
107 0.31
108 0.39
109 0.41
110 0.37
111 0.36
112 0.34
113 0.37
114 0.39
115 0.39
116 0.35
117 0.33
118 0.28
119 0.26
120 0.21
121 0.15
122 0.14
123 0.12
124 0.08
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.07
133 0.06
134 0.06
135 0.05
136 0.06
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.09
146 0.12
147 0.13
148 0.13
149 0.14
150 0.15
151 0.18
152 0.18
153 0.16
154 0.18
155 0.17
156 0.17
157 0.16
158 0.17
159 0.13
160 0.15
161 0.15
162 0.12
163 0.13
164 0.15
165 0.17
166 0.16
167 0.17
168 0.17
169 0.21
170 0.28
171 0.3
172 0.31
173 0.3
174 0.31
175 0.3
176 0.28
177 0.26
178 0.21
179 0.22
180 0.19
181 0.21
182 0.29
183 0.34
184 0.38
185 0.44
186 0.46
187 0.48
188 0.52
189 0.58
190 0.53
191 0.59
192 0.58
193 0.54
194 0.5
195 0.44
196 0.44
197 0.36
198 0.35
199 0.29
200 0.26
201 0.22
202 0.21
203 0.21
204 0.18
205 0.17
206 0.19
207 0.16
208 0.18
209 0.22
210 0.28
211 0.32
212 0.32
213 0.33
214 0.33
215 0.36
216 0.34
217 0.35
218 0.36
219 0.32
220 0.32
221 0.32
222 0.32
223 0.29
224 0.29
225 0.26
226 0.21
227 0.23
228 0.23
229 0.23
230 0.19
231 0.17
232 0.15
233 0.16
234 0.16
235 0.16
236 0.17
237 0.21
238 0.26
239 0.33
240 0.37
241 0.38
242 0.4
243 0.39
244 0.42
245 0.43
246 0.46
247 0.44
248 0.45
249 0.48
250 0.49
251 0.54
252 0.53
253 0.52
254 0.45
255 0.43
256 0.41
257 0.39
258 0.37
259 0.3
260 0.28
261 0.25
262 0.27
263 0.24
264 0.21
265 0.16
266 0.16
267 0.17
268 0.16
269 0.12
270 0.09
271 0.1
272 0.11
273 0.11
274 0.08
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.03
288 0.03
289 0.03
290 0.03
291 0.03
292 0.04
293 0.05
294 0.07
295 0.08
296 0.09
297 0.1
298 0.11
299 0.14
300 0.14
301 0.17
302 0.16
303 0.17
304 0.18
305 0.18
306 0.17
307 0.15
308 0.15
309 0.12
310 0.13
311 0.13
312 0.12
313 0.12
314 0.13
315 0.12
316 0.13
317 0.14
318 0.13
319 0.12
320 0.11
321 0.11
322 0.11
323 0.12
324 0.11
325 0.12
326 0.14
327 0.14
328 0.13
329 0.12
330 0.12
331 0.1
332 0.09
333 0.07
334 0.05
335 0.06
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.06
340 0.08
341 0.08
342 0.08
343 0.08
344 0.08
345 0.11
346 0.11
347 0.11
348 0.11
349 0.11
350 0.11
351 0.12
352 0.15
353 0.14
354 0.13
355 0.13
356 0.13
357 0.13
358 0.13
359 0.12
360 0.1
361 0.14
362 0.16
363 0.15
364 0.16
365 0.17
366 0.19
367 0.2
368 0.17
369 0.15
370 0.13
371 0.14
372 0.12
373 0.11
374 0.09
375 0.09
376 0.1
377 0.08
378 0.08
379 0.07
380 0.08
381 0.07
382 0.07
383 0.06
384 0.05
385 0.06
386 0.05
387 0.06
388 0.06
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.09
393 0.09
394 0.09
395 0.09
396 0.09
397 0.1
398 0.1
399 0.14
400 0.11
401 0.13
402 0.15
403 0.15
404 0.16
405 0.16
406 0.18
407 0.16
408 0.21
409 0.28
410 0.3
411 0.35
412 0.39
413 0.44
414 0.48
415 0.53
416 0.53
417 0.53
418 0.55
419 0.54
420 0.55
421 0.55
422 0.57
423 0.61
424 0.65
425 0.67
426 0.71
427 0.75
428 0.78
429 0.82
430 0.84
431 0.82
432 0.83
433 0.79
434 0.75
435 0.72
436 0.64
437 0.54
438 0.45
439 0.35
440 0.24
441 0.18
442 0.13
443 0.07
444 0.06
445 0.06
446 0.05
447 0.05
448 0.05
449 0.05
450 0.04
451 0.04
452 0.04
453 0.03
454 0.03
455 0.03
456 0.03
457 0.03
458 0.03
459 0.04
460 0.04
461 0.04
462 0.04
463 0.05
464 0.06
465 0.06
466 0.08
467 0.11
468 0.14
469 0.2
470 0.27
471 0.32
472 0.34
473 0.41
474 0.47
475 0.5
476 0.57
477 0.59
478 0.58
479 0.58
480 0.56
481 0.51
482 0.46
483 0.4
484 0.35
485 0.28
486 0.22
487 0.17
488 0.19
489 0.18
490 0.15
491 0.17
492 0.12
493 0.12
494 0.12
495 0.11
496 0.09
497 0.09
498 0.08
499 0.08
500 0.11
501 0.13
502 0.16
503 0.17
504 0.17
505 0.22
506 0.24
507 0.3
508 0.36
509 0.43
510 0.48
511 0.57
512 0.62
513 0.66
514 0.69
515 0.73
516 0.74
517 0.75
518 0.76
519 0.76
520 0.82
521 0.84
522 0.9
523 0.9
524 0.87
525 0.82
526 0.76
527 0.67
528 0.58
529 0.48
530 0.39
531 0.28
532 0.21
533 0.17
534 0.14
535 0.14
536 0.13