Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5M6BWJ0

Protein Details
Accession A0A5M6BWJ0    Localization Confidence High Confidence Score 21.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
126-155GEDDEEERRRRRRKKKQRAEANRKRREQSDBasic
186-205AIGKKAKVVRRKKKGGEDDGBasic
385-405EDGAPRRKKRFDIKKALEENABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
133-151RRRRRRKKKQRAEANRKRR
188-200GKKAKVVRRKKKG
390-399RRKKRFDIKK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 13, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSASPPPEAAPAPEQAELYNQVFGGEGSDASDGSDDERRPRGRLAFPKRPAAEGEDGDGDAEAVAATQEEDEDKDEDEDKDEENGEQYVPATATSPAKIPKFKKTKRDSGDEEDVDEDDEDEEDDGEDDEEERRRRRRKKKQRAEANRKRREQSDGDVDVDDDEEAAPAYDAETQRRLEIEQRIDAIGKKAKVVRRKKKGGEDDGDIVDSYHDEVCARLRDRMIAAADKDEASNRAKLPGTAKLAMLDEVMGVLRNTTLWQSIVDNGVLEAVKRWLEPLPDRSLPSVGIQKAIFEVLPKMDLDTTTLKECRLGPIVLFYTKTKRVTPAINRQADALVQAWSRPIIKRPANFRSKFVESQNDVESQNQSQGESQSRGGGYSQSQAEDGAPRRKKRFDIKKALEENATRKGARLQIVKDIQYTVAPESRTHHLAEEMQHVSRIQLDNKKFNKFARQMKGGRGGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.22
3 0.25
4 0.26
5 0.24
6 0.21
7 0.18
8 0.16
9 0.16
10 0.16
11 0.14
12 0.1
13 0.08
14 0.08
15 0.09
16 0.09
17 0.09
18 0.09
19 0.07
20 0.1
21 0.16
22 0.16
23 0.21
24 0.29
25 0.32
26 0.34
27 0.4
28 0.44
29 0.48
30 0.58
31 0.63
32 0.65
33 0.69
34 0.76
35 0.71
36 0.66
37 0.59
38 0.54
39 0.5
40 0.4
41 0.37
42 0.29
43 0.27
44 0.25
45 0.22
46 0.16
47 0.1
48 0.08
49 0.05
50 0.03
51 0.03
52 0.03
53 0.04
54 0.03
55 0.04
56 0.05
57 0.06
58 0.08
59 0.1
60 0.1
61 0.12
62 0.14
63 0.14
64 0.17
65 0.17
66 0.16
67 0.17
68 0.16
69 0.15
70 0.14
71 0.15
72 0.12
73 0.11
74 0.1
75 0.1
76 0.09
77 0.09
78 0.09
79 0.1
80 0.12
81 0.13
82 0.16
83 0.2
84 0.24
85 0.32
86 0.35
87 0.43
88 0.52
89 0.59
90 0.66
91 0.7
92 0.76
93 0.75
94 0.8
95 0.77
96 0.74
97 0.75
98 0.65
99 0.58
100 0.48
101 0.41
102 0.33
103 0.26
104 0.18
105 0.09
106 0.08
107 0.07
108 0.06
109 0.06
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.06
116 0.08
117 0.13
118 0.17
119 0.23
120 0.32
121 0.42
122 0.53
123 0.63
124 0.73
125 0.79
126 0.87
127 0.92
128 0.94
129 0.95
130 0.96
131 0.97
132 0.96
133 0.96
134 0.94
135 0.9
136 0.83
137 0.74
138 0.69
139 0.62
140 0.57
141 0.55
142 0.48
143 0.42
144 0.38
145 0.36
146 0.29
147 0.24
148 0.18
149 0.08
150 0.06
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.03
156 0.04
157 0.08
158 0.09
159 0.11
160 0.14
161 0.14
162 0.15
163 0.16
164 0.16
165 0.17
166 0.23
167 0.24
168 0.23
169 0.23
170 0.23
171 0.24
172 0.23
173 0.22
174 0.2
175 0.17
176 0.18
177 0.22
178 0.26
179 0.35
180 0.46
181 0.52
182 0.58
183 0.67
184 0.71
185 0.76
186 0.8
187 0.79
188 0.72
189 0.65
190 0.57
191 0.49
192 0.42
193 0.32
194 0.23
195 0.15
196 0.11
197 0.08
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.07
203 0.12
204 0.13
205 0.14
206 0.14
207 0.15
208 0.15
209 0.18
210 0.17
211 0.14
212 0.14
213 0.13
214 0.13
215 0.12
216 0.12
217 0.1
218 0.11
219 0.1
220 0.13
221 0.12
222 0.14
223 0.14
224 0.15
225 0.17
226 0.21
227 0.23
228 0.22
229 0.22
230 0.2
231 0.2
232 0.19
233 0.16
234 0.1
235 0.06
236 0.05
237 0.05
238 0.04
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.04
244 0.04
245 0.05
246 0.05
247 0.06
248 0.07
249 0.08
250 0.09
251 0.09
252 0.08
253 0.07
254 0.08
255 0.07
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.07
260 0.06
261 0.08
262 0.08
263 0.12
264 0.16
265 0.2
266 0.25
267 0.26
268 0.28
269 0.28
270 0.27
271 0.24
272 0.23
273 0.24
274 0.18
275 0.19
276 0.18
277 0.17
278 0.16
279 0.16
280 0.14
281 0.09
282 0.09
283 0.07
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.11
290 0.12
291 0.14
292 0.16
293 0.17
294 0.17
295 0.19
296 0.19
297 0.2
298 0.2
299 0.19
300 0.15
301 0.19
302 0.21
303 0.2
304 0.21
305 0.19
306 0.22
307 0.27
308 0.3
309 0.27
310 0.29
311 0.32
312 0.39
313 0.46
314 0.52
315 0.56
316 0.57
317 0.56
318 0.52
319 0.49
320 0.4
321 0.32
322 0.22
323 0.14
324 0.11
325 0.11
326 0.1
327 0.11
328 0.13
329 0.14
330 0.18
331 0.25
332 0.31
333 0.36
334 0.45
335 0.53
336 0.61
337 0.61
338 0.6
339 0.59
340 0.59
341 0.57
342 0.53
343 0.53
344 0.46
345 0.47
346 0.46
347 0.41
348 0.36
349 0.33
350 0.31
351 0.23
352 0.24
353 0.21
354 0.19
355 0.18
356 0.21
357 0.24
358 0.24
359 0.24
360 0.23
361 0.23
362 0.23
363 0.22
364 0.2
365 0.17
366 0.2
367 0.2
368 0.17
369 0.17
370 0.17
371 0.18
372 0.22
373 0.27
374 0.32
375 0.38
376 0.45
377 0.51
378 0.56
379 0.63
380 0.67
381 0.72
382 0.73
383 0.77
384 0.79
385 0.83
386 0.83
387 0.79
388 0.74
389 0.68
390 0.62
391 0.58
392 0.54
393 0.43
394 0.39
395 0.41
396 0.4
397 0.42
398 0.44
399 0.38
400 0.44
401 0.49
402 0.5
403 0.46
404 0.42
405 0.35
406 0.3
407 0.29
408 0.23
409 0.22
410 0.21
411 0.21
412 0.24
413 0.29
414 0.3
415 0.29
416 0.26
417 0.26
418 0.28
419 0.31
420 0.34
421 0.31
422 0.3
423 0.3
424 0.28
425 0.26
426 0.28
427 0.28
428 0.29
429 0.35
430 0.41
431 0.5
432 0.56
433 0.64
434 0.62
435 0.64
436 0.67
437 0.67
438 0.7
439 0.7
440 0.73
441 0.71
442 0.74