Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5M6C6D8

Protein Details
Accession A0A5M6C6D8    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
360-385TSSSSTSPPPPKKRYDSRRSPPLRLTHydrophilic
448-470AAEREERERKARKEALKKQKMRGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
26-56LAAKAAREKQQAKEEDERRKRLEAASKEARR
341-351RIPPSSARKRR
438-470AARIARKEDEAAEREERERKARKEALKKQKMRG
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013256  Chromatin_SPT2  
Pfam View protein in Pfam  
PF08243  SPT2  
Amino Acid Sequences MSDYQARKARLLELQREKEEELKRELAAKAAREKQQAKEEDERRKRLEAASKEARRLELMRANEELNKKAANGHGKGNGSSKAVDMEYDPFAEDAKPVGPPIVHKPNTTKPSLKSTHSNGTSRPSSAVPRSSNNKPAISRSSSGLITKDKASPPPLGRKEKAARAFAQQAKKSAGDSLFSVRALVEARESPGAAIPLHRASSNGTAAGPSRSTAPSSVTVHGIGMANGLKRAAPLQSGSGGKGKGSVRDQIQRKGAEEGLRKLCPDRSTRDRRTIEEIARDIKAKKDGLTSTSVRGVDERRISPVKGGRPVTATNGGGGAKPIPGSSGMNRAPLSRRDDPRIPPSSARKRRPSTSSTSSTSSSSTSPPPPKKRYDSRRSPPLRLTEKSSAAAVSAEIQALFRRPGRPPPRTSGYDDLSDGSSDMEAALSDVELEERRAARIARKEDEAAEREERERKARKEALKKQKMRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.62
3 0.63
4 0.6
5 0.6
6 0.58
7 0.53
8 0.49
9 0.44
10 0.42
11 0.44
12 0.42
13 0.41
14 0.38
15 0.38
16 0.41
17 0.46
18 0.51
19 0.55
20 0.59
21 0.59
22 0.64
23 0.65
24 0.63
25 0.65
26 0.67
27 0.7
28 0.75
29 0.76
30 0.7
31 0.68
32 0.64
33 0.61
34 0.63
35 0.58
36 0.58
37 0.61
38 0.62
39 0.63
40 0.62
41 0.56
42 0.5
43 0.46
44 0.44
45 0.4
46 0.38
47 0.36
48 0.36
49 0.36
50 0.38
51 0.39
52 0.34
53 0.3
54 0.27
55 0.24
56 0.25
57 0.29
58 0.32
59 0.31
60 0.34
61 0.38
62 0.39
63 0.41
64 0.41
65 0.38
66 0.31
67 0.29
68 0.24
69 0.21
70 0.19
71 0.17
72 0.15
73 0.15
74 0.15
75 0.15
76 0.15
77 0.12
78 0.12
79 0.12
80 0.11
81 0.09
82 0.09
83 0.09
84 0.08
85 0.1
86 0.1
87 0.13
88 0.21
89 0.3
90 0.32
91 0.34
92 0.4
93 0.48
94 0.53
95 0.55
96 0.52
97 0.45
98 0.52
99 0.55
100 0.52
101 0.5
102 0.51
103 0.55
104 0.55
105 0.54
106 0.46
107 0.49
108 0.47
109 0.41
110 0.37
111 0.29
112 0.29
113 0.31
114 0.36
115 0.33
116 0.37
117 0.42
118 0.45
119 0.51
120 0.5
121 0.5
122 0.45
123 0.47
124 0.47
125 0.45
126 0.41
127 0.35
128 0.34
129 0.31
130 0.3
131 0.28
132 0.24
133 0.21
134 0.22
135 0.25
136 0.24
137 0.26
138 0.28
139 0.31
140 0.34
141 0.42
142 0.48
143 0.52
144 0.51
145 0.56
146 0.59
147 0.6
148 0.62
149 0.56
150 0.49
151 0.46
152 0.54
153 0.51
154 0.53
155 0.47
156 0.44
157 0.42
158 0.41
159 0.36
160 0.31
161 0.25
162 0.18
163 0.17
164 0.18
165 0.17
166 0.16
167 0.16
168 0.12
169 0.12
170 0.12
171 0.1
172 0.08
173 0.08
174 0.09
175 0.09
176 0.1
177 0.09
178 0.09
179 0.1
180 0.08
181 0.08
182 0.09
183 0.1
184 0.11
185 0.11
186 0.1
187 0.11
188 0.15
189 0.15
190 0.13
191 0.11
192 0.11
193 0.12
194 0.13
195 0.11
196 0.08
197 0.09
198 0.09
199 0.1
200 0.1
201 0.12
202 0.15
203 0.17
204 0.18
205 0.17
206 0.16
207 0.15
208 0.16
209 0.14
210 0.09
211 0.08
212 0.08
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.06
217 0.06
218 0.07
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.07
223 0.1
224 0.11
225 0.12
226 0.14
227 0.14
228 0.13
229 0.17
230 0.17
231 0.17
232 0.19
233 0.22
234 0.23
235 0.3
236 0.34
237 0.34
238 0.39
239 0.36
240 0.36
241 0.34
242 0.33
243 0.31
244 0.3
245 0.31
246 0.31
247 0.3
248 0.29
249 0.28
250 0.29
251 0.28
252 0.28
253 0.29
254 0.35
255 0.45
256 0.5
257 0.58
258 0.58
259 0.57
260 0.61
261 0.6
262 0.53
263 0.47
264 0.44
265 0.36
266 0.35
267 0.34
268 0.27
269 0.24
270 0.25
271 0.21
272 0.2
273 0.22
274 0.22
275 0.23
276 0.28
277 0.26
278 0.24
279 0.27
280 0.26
281 0.21
282 0.22
283 0.22
284 0.22
285 0.25
286 0.24
287 0.25
288 0.27
289 0.27
290 0.3
291 0.34
292 0.34
293 0.36
294 0.37
295 0.33
296 0.34
297 0.35
298 0.34
299 0.33
300 0.28
301 0.21
302 0.2
303 0.19
304 0.16
305 0.15
306 0.12
307 0.08
308 0.08
309 0.08
310 0.07
311 0.08
312 0.1
313 0.11
314 0.19
315 0.2
316 0.23
317 0.24
318 0.26
319 0.28
320 0.32
321 0.38
322 0.38
323 0.42
324 0.45
325 0.51
326 0.54
327 0.59
328 0.59
329 0.55
330 0.53
331 0.59
332 0.63
333 0.67
334 0.7
335 0.72
336 0.73
337 0.76
338 0.76
339 0.72
340 0.69
341 0.67
342 0.64
343 0.58
344 0.55
345 0.5
346 0.44
347 0.39
348 0.32
349 0.25
350 0.22
351 0.23
352 0.28
353 0.36
354 0.45
355 0.54
356 0.59
357 0.66
358 0.72
359 0.79
360 0.81
361 0.82
362 0.84
363 0.84
364 0.88
365 0.86
366 0.83
367 0.79
368 0.78
369 0.75
370 0.67
371 0.65
372 0.61
373 0.58
374 0.52
375 0.46
376 0.36
377 0.29
378 0.26
379 0.18
380 0.13
381 0.1
382 0.1
383 0.09
384 0.09
385 0.1
386 0.12
387 0.15
388 0.16
389 0.2
390 0.23
391 0.34
392 0.44
393 0.51
394 0.55
395 0.61
396 0.65
397 0.65
398 0.69
399 0.66
400 0.59
401 0.54
402 0.48
403 0.41
404 0.34
405 0.3
406 0.23
407 0.16
408 0.12
409 0.09
410 0.08
411 0.06
412 0.05
413 0.05
414 0.05
415 0.04
416 0.04
417 0.04
418 0.06
419 0.07
420 0.09
421 0.13
422 0.13
423 0.15
424 0.18
425 0.21
426 0.27
427 0.35
428 0.41
429 0.42
430 0.46
431 0.47
432 0.48
433 0.54
434 0.49
435 0.46
436 0.43
437 0.41
438 0.42
439 0.46
440 0.45
441 0.47
442 0.53
443 0.52
444 0.58
445 0.64
446 0.69
447 0.74
448 0.81
449 0.83
450 0.84