FuNGI

A0A5M6BX15

Protein Details

Accession

A0A5M6BX15

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-25	MAEAFIRKRKDKERRPRVASARVAV	Hydrophilic
173-196	GTEAPQERKRKMKKGTKEVFHQDI	Hydrophilic
628-647	SSQPSSTKIKTKRKTTSESP	Hydrophilic
687-710	SSAPNGGPPKKKSKKVGSSTPTPA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
7-17	RKRKDKERRPR
180-187	RKRKMKKG
442-452	KKLRKIMKKRR
661-701	SGKRKTSPGASSVGGEAKKPKPSTSTSSAPNGGPPKKKSKK

Subcellular Location(s)

mito 14, mito_nucl 12.333, nucl 9.5, cyto_mito 9.333

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MAEAFIRKRKDKERRPRVASARVAVASSTNAPSPASSTLNGVGGRPSPAPSGPGGPSLKSEPDAVKSEPNPHVQEIKIYSSGASRTGLRYNIMRLNSAKDIDPKDITVPILMNRKRPGPRAPPIFATDGEGKIIGKFVYDNEGKQLLDAEGQPVIERKADNSADMSLVGHAPGTEAPQERKRKMKKGTKEVFHQDIEIMRLRREEALPWVMESAKPKEKPTIPEHWVGRMIEASTHPKVLLMNDGTGEGFEMIPLGRTYRFDPERPFKLLDPDAANKLFEHQAKHKIHDRWSLRPEGPNQMNINGGGEGSTSRVKVEREMEERAARMEGRIRQLKGLNIDRKPKVERYDDDYRREGRMAERGLEGGIDEELDFDEAEGFQDDDDNNTFYRDVNEEEEAKELEERLKKEFRLANTNVGDRPQIAADDDEDDLFGDNELNDEGKKLRKIMKKRREEDPNENDYMDSDEDSEESDAESVNSKATDKEKDKEKDKEAERGRNSPIPEQQPRSSSRGPGARTASPSGRRPNMPTSKRTGTAPPGSGAALVAQRAASRGASPRPHSSGRASSPLSGRAASPEVTAGGRGTSPAVRGSSPASRAASPAPPPGVRGSSPASVSGPSTRDVSPAPGSSQPSSTKIKTKRKTTSESPARDSAASSAGPSPSGKRKTSPGASSVGGEAKKPKPSTSTSSAPNGGPPKKKSKKVGSSTPTPAPEDIPPFEGMITKTEVLDWFKKNGRQGVVMSEAIGAFKSKIVESGKNRDANQKLFLGWVRAVADQKGQVLSLKEEYQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.87
2	0.89
3	0.91
4	0.89
5	0.88
6	0.84
7	0.77
8	0.71
9	0.61
10	0.54
11	0.43
12	0.36
13	0.28
14	0.24
15	0.22
16	0.16
17	0.16
18	0.16
19	0.16
20	0.18
21	0.19
22	0.19
23	0.18
24	0.2
25	0.21
26	0.25
27	0.25
28	0.22
29	0.21
30	0.19
31	0.22
32	0.2
33	0.2
34	0.19
35	0.19
36	0.21
37	0.2
38	0.23
39	0.22
40	0.28
41	0.28
42	0.26
43	0.29
44	0.3
45	0.31
46	0.28
47	0.3
48	0.25
49	0.28
50	0.32
51	0.31
52	0.35
53	0.35
54	0.42
55	0.43
56	0.48
57	0.46
58	0.45
59	0.47
60	0.4
61	0.44
62	0.39
63	0.39
64	0.33
65	0.3
66	0.27
67	0.26
68	0.26
69	0.22
70	0.2
71	0.17
72	0.19
73	0.23
74	0.24
75	0.24
76	0.26
77	0.3
78	0.34
79	0.33
80	0.34
81	0.31
82	0.35
83	0.36
84	0.35
85	0.32
86	0.34
87	0.36
88	0.36
89	0.36
90	0.32
91	0.3
92	0.3
93	0.27
94	0.22
95	0.2
96	0.21
97	0.29
98	0.31
99	0.35
100	0.37
101	0.44
102	0.48
103	0.52
104	0.57
105	0.56
106	0.64
107	0.66
108	0.66
109	0.62
110	0.61
111	0.58
112	0.48
113	0.43
114	0.37
115	0.29
116	0.25
117	0.22
118	0.18
119	0.15
120	0.16
121	0.11
122	0.08
123	0.08
124	0.09
125	0.16
126	0.17
127	0.17
128	0.2
129	0.23
130	0.22
131	0.21
132	0.22
133	0.15
134	0.16
135	0.16
136	0.13
137	0.11
138	0.12
139	0.12
140	0.12
141	0.12
142	0.12
143	0.12
144	0.12
145	0.19
146	0.19
147	0.2
148	0.2
149	0.2
150	0.18
151	0.18
152	0.17
153	0.11
154	0.1
155	0.09
156	0.07
157	0.06
158	0.06
159	0.07
160	0.08
161	0.11
162	0.14
163	0.19
164	0.28
165	0.37
166	0.41
167	0.5
168	0.58
169	0.63
170	0.71
171	0.76
172	0.78
173	0.81
174	0.86
175	0.82
176	0.82
177	0.8
178	0.75
179	0.66
180	0.56
181	0.46
182	0.38
183	0.34
184	0.31
185	0.25
186	0.2
187	0.2
188	0.21
189	0.22
190	0.21
191	0.2
192	0.2
193	0.22
194	0.22
195	0.21
196	0.21
197	0.19
198	0.2
199	0.22
200	0.23
201	0.27
202	0.29
203	0.3
204	0.37
205	0.41
206	0.46
207	0.49
208	0.51
209	0.47
210	0.52
211	0.52
212	0.47
213	0.46
214	0.4
215	0.34
216	0.26
217	0.22
218	0.17
219	0.18
220	0.2
221	0.18
222	0.18
223	0.17
224	0.17
225	0.17
226	0.16
227	0.19
228	0.15
229	0.14
230	0.14
231	0.14
232	0.13
233	0.12
234	0.12
235	0.07
236	0.05
237	0.04
238	0.05
239	0.04
240	0.05
241	0.06
242	0.07
243	0.07
244	0.09
245	0.11
246	0.2
247	0.23
248	0.25
249	0.33
250	0.4
251	0.44
252	0.46
253	0.46
254	0.39
255	0.42
256	0.4
257	0.36
258	0.33
259	0.3
260	0.3
261	0.28
262	0.28
263	0.21
264	0.22
265	0.23
266	0.2
267	0.22
268	0.23
269	0.33
270	0.34
271	0.39
272	0.45
273	0.45
274	0.49
275	0.54
276	0.53
277	0.52
278	0.54
279	0.56
280	0.5
281	0.5
282	0.47
283	0.47
284	0.44
285	0.41
286	0.38
287	0.33
288	0.31
289	0.27
290	0.24
291	0.15
292	0.13
293	0.07
294	0.06
295	0.06
296	0.07
297	0.08
298	0.07
299	0.07
300	0.1
301	0.1
302	0.14
303	0.18
304	0.22
305	0.25
306	0.28
307	0.3
308	0.29
309	0.29
310	0.27
311	0.23
312	0.17
313	0.15
314	0.16
315	0.17
316	0.23
317	0.28
318	0.27
319	0.3
320	0.32
321	0.33
322	0.35
323	0.4
324	0.4
325	0.39
326	0.46
327	0.45
328	0.47
329	0.48
330	0.46
331	0.43
332	0.42
333	0.4
334	0.4
335	0.49
336	0.5
337	0.51
338	0.5
339	0.47
340	0.42
341	0.4
342	0.34
343	0.25
344	0.26
345	0.23
346	0.2
347	0.19
348	0.17
349	0.17
350	0.15
351	0.13
352	0.07
353	0.06
354	0.04
355	0.03
356	0.03
357	0.03
358	0.04
359	0.04
360	0.03
361	0.04
362	0.03
363	0.04
364	0.04
365	0.04
366	0.03
367	0.05
368	0.05
369	0.06
370	0.07
371	0.07
372	0.07
373	0.08
374	0.08
375	0.07
376	0.09
377	0.09
378	0.09
379	0.11
380	0.12
381	0.12
382	0.13
383	0.14
384	0.12
385	0.11
386	0.1
387	0.08
388	0.11
389	0.14
390	0.15
391	0.18
392	0.22
393	0.21
394	0.27
395	0.3
396	0.28
397	0.33
398	0.33
399	0.36
400	0.35
401	0.37
402	0.31
403	0.29
404	0.27
405	0.18
406	0.17
407	0.1
408	0.08
409	0.07
410	0.07
411	0.07
412	0.08
413	0.08
414	0.07
415	0.07
416	0.07
417	0.06
418	0.06
419	0.05
420	0.04
421	0.04
422	0.04
423	0.04
424	0.04
425	0.04
426	0.05
427	0.07
428	0.1
429	0.12
430	0.15
431	0.23
432	0.3
433	0.41
434	0.52
435	0.6
436	0.67
437	0.7
438	0.76
439	0.78
440	0.78
441	0.78
442	0.75
443	0.7
444	0.61
445	0.57
446	0.47
447	0.37
448	0.32
449	0.22
450	0.14
451	0.09
452	0.07
453	0.07
454	0.08
455	0.08
456	0.06
457	0.05
458	0.05
459	0.05
460	0.05
461	0.06
462	0.06
463	0.06
464	0.07
465	0.07
466	0.09
467	0.12
468	0.2
469	0.23
470	0.28
471	0.37
472	0.43
473	0.5
474	0.55
475	0.57
476	0.58
477	0.57
478	0.61
479	0.59
480	0.62
481	0.58
482	0.56
483	0.55
484	0.5
485	0.49
486	0.44
487	0.44
488	0.43
489	0.45
490	0.46
491	0.45
492	0.46
493	0.48
494	0.5
495	0.45
496	0.4
497	0.39
498	0.39
499	0.38
500	0.39
501	0.39
502	0.35
503	0.36
504	0.37
505	0.37
506	0.37
507	0.41
508	0.42
509	0.42
510	0.42
511	0.43
512	0.49
513	0.54
514	0.54
515	0.52
516	0.53
517	0.53
518	0.52
519	0.5
520	0.45
521	0.42
522	0.42
523	0.39
524	0.32
525	0.29
526	0.27
527	0.25
528	0.2
529	0.14
530	0.1
531	0.08
532	0.08
533	0.07
534	0.07
535	0.08
536	0.09
537	0.07
538	0.08
539	0.13
540	0.19
541	0.24
542	0.28
543	0.32
544	0.37
545	0.39
546	0.4
547	0.41
548	0.42
549	0.4
550	0.42
551	0.39
552	0.37
553	0.37
554	0.37
555	0.33
556	0.27
557	0.23
558	0.2
559	0.2
560	0.17
561	0.16
562	0.12
563	0.12
564	0.12
565	0.12
566	0.09
567	0.08
568	0.07
569	0.07
570	0.08
571	0.08
572	0.09
573	0.11
574	0.12
575	0.12
576	0.13
577	0.17
578	0.2
579	0.21
580	0.24
581	0.24
582	0.23
583	0.24
584	0.26
585	0.27
586	0.25
587	0.27
588	0.27
589	0.25
590	0.26
591	0.28
592	0.28
593	0.24
594	0.25
595	0.25
596	0.24
597	0.24
598	0.24
599	0.22
600	0.19
601	0.2
602	0.2
603	0.18
604	0.16
605	0.19
606	0.17
607	0.18
608	0.18
609	0.21
610	0.21
611	0.21
612	0.22
613	0.24
614	0.27
615	0.27
616	0.3
617	0.29
618	0.3
619	0.35
620	0.35
621	0.4
622	0.47
623	0.56
624	0.61
625	0.68
626	0.74
627	0.76
628	0.81
629	0.79
630	0.8
631	0.79
632	0.77
633	0.73
634	0.67
635	0.6
636	0.53
637	0.46
638	0.36
639	0.29
640	0.22
641	0.18
642	0.17
643	0.15
644	0.16
645	0.16
646	0.2
647	0.26
648	0.33
649	0.33
650	0.34
651	0.41
652	0.49
653	0.55
654	0.54
655	0.48
656	0.46
657	0.44
658	0.42
659	0.37
660	0.34
661	0.26
662	0.24
663	0.28
664	0.28
665	0.35
666	0.36
667	0.36
668	0.36
669	0.42
670	0.48
671	0.48
672	0.49
673	0.46
674	0.51
675	0.51
676	0.46
677	0.47
678	0.48
679	0.49
680	0.5
681	0.51
682	0.57
683	0.63
684	0.71
685	0.75
686	0.77
687	0.8
688	0.81
689	0.86
690	0.82
691	0.81
692	0.8
693	0.76
694	0.69
695	0.61
696	0.53
697	0.45
698	0.42
699	0.39
700	0.34
701	0.3
702	0.27
703	0.25
704	0.24
705	0.24
706	0.2
707	0.18
708	0.2
709	0.17
710	0.16
711	0.17
712	0.2
713	0.23
714	0.29
715	0.3
716	0.32
717	0.38
718	0.43
719	0.48
720	0.52
721	0.5
722	0.47
723	0.46
724	0.45
725	0.43
726	0.39
727	0.33
728	0.27
729	0.23
730	0.19
731	0.18
732	0.13
733	0.09
734	0.1
735	0.12
736	0.11
737	0.17
738	0.21
739	0.3
740	0.36
741	0.46
742	0.52
743	0.56
744	0.58
745	0.62
746	0.64
747	0.59
748	0.57
749	0.49
750	0.42
751	0.41
752	0.41
753	0.36
754	0.29
755	0.28
756	0.26
757	0.27
758	0.29
759	0.25
760	0.27
761	0.25
762	0.27
763	0.24
764	0.23
765	0.23
766	0.23
767	0.26

A0A5M6BX15

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer