FuNGI

A0A5M6C055

Protein Details

Accession

A0A5M6C055

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
41-61	ASAFARSRKQQQARQDGQRAL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
208-218	KRAESRSGKGK

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013929 RNA_pol_II_AP1_C IPR013930 RNA_pol_II_AP1_N IPR039913 RPAP1/Rba50
Gene Ontology	GO:0006366 P:transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF08620 RPAP1_C PF08621 RPAP1_N

Amino Acid Sequences

MLKDIVERPSQPPSASTSSPQPPTPGSTGFPVAQHRSQRPASAFARSRKQQQARQDGQRALGEGRAVDVVPSIQISAPRARSEVDEVRDAVDKENTARVEGMSSEEREQEIEELKERFGESVLETMTKRREARARSEAQPTANGSSSSSTPQVPVSLEQHMGDAQKVLEEVSEENERKVRSMGTQEVEQEVEELQERFGSKVMEALRKRAESRSGKGKAKEVAQPEDQQISSPGPSSTSPRVRFVDQPSQSQAKPKNIPSTASESSKLQWTQPLASTSSDASIRFDLSGNVLSDSAKSDLPTHLGLHHHGSSPDLAGYTLQDILYLCRSTVPSQRITMMSVLAKIVSRLRATEGELRYSDEVETECADLGVVQQAIELGVEVLAGLTRGVGVIHAGVDLLFQALGGPSWSWINHDAAICRAFAPDTNATTADTPTGLASVPFEDVLPRLTELLSIEDGLSEDTTQQLILILRRATFSSQQVCESITPIVPYIVRQHVVQRSWPPKNDRSPSVDALRLLRDISASSRASAEDLLSQGVYETTLKFVITATWTGEDVDNDTLRHGQALALEILRTYQVLGRYGLSSSVVTSSGEVWRRLGVWVQNRCTGNAVSAWDTTLVEAYFQCLSIWTTCAVDPHRTTPEHDITWAQVSALNWTDEAIYAITTLIERKDRWSEIASALDLLVSWTKGAQVNGVKGGEDEKSAVLNGLKSVDWNVLVDHGREHVLRVLAPLVQLHVQLHPIGELLDANVLSQIRQLRNGKSDTAATHTTSLDYHLLLIDVQSEAEPPARWLPKAIDVLNAFQIGDEPLALDLVDLILKADWKKSASSELISSLLHPDGLQVIRPLLQYAVLPDVESVVAPTQPSHLYLKATKTLRPPVPPSSDEKPAIVGLPIQPDWVFSPLNELLRSGTSVALSQVPPDWNASETEVVQATLLLAELAYVRPEGLDRSRVLFNLMKVFMLEHGQQSSTSTSDGEVFRDPIVTKWMSSLMAKLVNTDSTTVNSNATNIAAPLEVVSLPFLGSGVPFFQFYTDFLALYEAISFSDTLFAQCVIAPLSMSYPPDYRKLLWNDHSTALRGMKLSLDQVPLESTSASIQGKDNEGGLRAYLYPIETNPEVLNGYARALIRRWIAPSTHLFLATLALHHLAGLFWLGMEEGKESTRVGLMIMLLANGDDDLLKMVTEWDLDSLGKDTVGQEEKERRKQVVGDLTGERGRKRVESI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.38
2	0.37
3	0.37
4	0.38
5	0.43
6	0.47
7	0.47
8	0.43
9	0.39
10	0.42
11	0.43
12	0.38
13	0.32
14	0.32
15	0.35
16	0.33
17	0.34
18	0.35
19	0.37
20	0.4
21	0.47
22	0.47
23	0.51
24	0.52
25	0.55
26	0.52
27	0.54
28	0.5
29	0.52
30	0.55
31	0.55
32	0.63
33	0.61
34	0.67
35	0.69
36	0.76
37	0.73
38	0.76
39	0.79
40	0.78
41	0.83
42	0.82
43	0.75
44	0.7
45	0.65
46	0.56
47	0.47
48	0.39
49	0.3
50	0.21
51	0.2
52	0.16
53	0.14
54	0.11
55	0.11
56	0.09
57	0.09
58	0.09
59	0.08
60	0.09
61	0.11
62	0.15
63	0.21
64	0.24
65	0.25
66	0.26
67	0.27
68	0.28
69	0.34
70	0.38
71	0.35
72	0.35
73	0.34
74	0.35
75	0.38
76	0.35
77	0.3
78	0.26
79	0.23
80	0.22
81	0.27
82	0.26
83	0.23
84	0.23
85	0.21
86	0.19
87	0.18
88	0.21
89	0.19
90	0.21
91	0.22
92	0.22
93	0.23
94	0.22
95	0.22
96	0.2
97	0.2
98	0.2
99	0.22
100	0.22
101	0.22
102	0.23
103	0.22
104	0.2
105	0.17
106	0.16
107	0.13
108	0.15
109	0.16
110	0.17
111	0.17
112	0.21
113	0.25
114	0.3
115	0.3
116	0.34
117	0.41
118	0.44
119	0.53
120	0.58
121	0.59
122	0.59
123	0.65
124	0.62
125	0.56
126	0.55
127	0.48
128	0.42
129	0.38
130	0.32
131	0.25
132	0.24
133	0.23
134	0.22
135	0.21
136	0.18
137	0.17
138	0.18
139	0.19
140	0.18
141	0.2
142	0.2
143	0.21
144	0.22
145	0.21
146	0.21
147	0.21
148	0.2
149	0.17
150	0.15
151	0.12
152	0.11
153	0.11
154	0.1
155	0.08
156	0.08
157	0.09
158	0.11
159	0.19
160	0.19
161	0.21
162	0.25
163	0.25
164	0.25
165	0.26
166	0.24
167	0.21
168	0.27
169	0.32
170	0.31
171	0.34
172	0.34
173	0.34
174	0.33
175	0.28
176	0.22
177	0.15
178	0.13
179	0.12
180	0.11
181	0.09
182	0.11
183	0.12
184	0.12
185	0.13
186	0.13
187	0.11
188	0.15
189	0.2
190	0.27
191	0.28
192	0.34
193	0.38
194	0.41
195	0.43
196	0.43
197	0.48
198	0.46
199	0.51
200	0.55
201	0.57
202	0.61
203	0.62
204	0.63
205	0.58
206	0.56
207	0.56
208	0.51
209	0.48
210	0.46
211	0.46
212	0.43
213	0.42
214	0.37
215	0.32
216	0.28
217	0.24
218	0.2
219	0.18
220	0.15
221	0.13
222	0.15
223	0.2
224	0.27
225	0.34
226	0.36
227	0.41
228	0.44
229	0.45
230	0.5
231	0.52
232	0.54
233	0.48
234	0.49
235	0.5
236	0.51
237	0.48
238	0.5
239	0.49
240	0.48
241	0.51
242	0.52
243	0.56
244	0.53
245	0.55
246	0.51
247	0.53
248	0.48
249	0.44
250	0.4
251	0.32
252	0.32
253	0.36
254	0.33
255	0.25
256	0.25
257	0.25
258	0.26
259	0.28
260	0.29
261	0.24
262	0.25
263	0.25
264	0.21
265	0.2
266	0.19
267	0.15
268	0.15
269	0.15
270	0.14
271	0.14
272	0.14
273	0.12
274	0.12
275	0.15
276	0.13
277	0.13
278	0.13
279	0.12
280	0.12
281	0.14
282	0.13
283	0.11
284	0.11
285	0.12
286	0.13
287	0.15
288	0.16
289	0.15
290	0.16
291	0.18
292	0.19
293	0.21
294	0.22
295	0.21
296	0.2
297	0.2
298	0.18
299	0.17
300	0.15
301	0.11
302	0.09
303	0.08
304	0.08
305	0.08
306	0.08
307	0.07
308	0.08
309	0.08
310	0.09
311	0.12
312	0.12
313	0.11
314	0.12
315	0.14
316	0.16
317	0.23
318	0.26
319	0.26
320	0.27
321	0.3
322	0.29
323	0.28
324	0.26
325	0.21
326	0.18
327	0.15
328	0.14
329	0.12
330	0.11
331	0.11
332	0.13
333	0.13
334	0.13
335	0.13
336	0.16
337	0.17
338	0.21
339	0.27
340	0.26
341	0.26
342	0.26
343	0.28
344	0.26
345	0.25
346	0.21
347	0.15
348	0.14
349	0.11
350	0.12
351	0.09
352	0.09
353	0.08
354	0.07
355	0.06
356	0.06
357	0.07
358	0.06
359	0.06
360	0.06
361	0.06
362	0.06
363	0.06
364	0.05
365	0.03
366	0.03
367	0.03
368	0.03
369	0.02
370	0.02
371	0.03
372	0.02
373	0.02
374	0.02
375	0.03
376	0.03
377	0.03
378	0.03
379	0.03
380	0.03
381	0.03
382	0.03
383	0.03
384	0.03
385	0.03
386	0.03
387	0.03
388	0.03
389	0.03
390	0.03
391	0.03
392	0.04
393	0.04
394	0.04
395	0.06
396	0.06
397	0.08
398	0.1
399	0.11
400	0.13
401	0.14
402	0.14
403	0.16
404	0.16
405	0.15
406	0.13
407	0.12
408	0.09
409	0.09
410	0.14
411	0.14
412	0.14
413	0.16
414	0.16
415	0.16
416	0.17
417	0.16
418	0.12
419	0.09
420	0.08
421	0.07
422	0.07
423	0.06
424	0.05
425	0.05
426	0.06
427	0.06
428	0.06
429	0.06
430	0.06
431	0.06
432	0.07
433	0.08
434	0.07
435	0.07
436	0.07
437	0.08
438	0.08
439	0.09
440	0.08
441	0.08
442	0.08
443	0.07
444	0.07
445	0.07
446	0.07
447	0.05
448	0.05
449	0.05
450	0.05
451	0.05
452	0.04
453	0.06
454	0.07
455	0.07
456	0.11
457	0.11
458	0.11
459	0.12
460	0.13
461	0.14
462	0.16
463	0.19
464	0.21
465	0.21
466	0.22
467	0.22
468	0.22
469	0.2
470	0.19
471	0.15
472	0.1
473	0.1
474	0.09
475	0.09
476	0.08
477	0.09
478	0.12
479	0.13
480	0.14
481	0.14
482	0.2
483	0.24
484	0.25
485	0.28
486	0.32
487	0.38
488	0.42
489	0.47
490	0.48
491	0.5
492	0.58
493	0.59
494	0.55
495	0.53
496	0.53
497	0.52
498	0.48
499	0.43
500	0.35
501	0.31
502	0.29
503	0.22
504	0.17
505	0.13
506	0.11
507	0.09
508	0.1
509	0.13
510	0.12
511	0.12
512	0.13
513	0.12
514	0.13
515	0.12
516	0.11
517	0.07
518	0.07
519	0.07
520	0.06
521	0.06
522	0.06
523	0.05
524	0.05
525	0.05
526	0.05
527	0.05
528	0.06
529	0.06
530	0.06
531	0.06
532	0.06
533	0.07
534	0.08
535	0.07
536	0.08
537	0.08
538	0.09
539	0.09
540	0.08
541	0.09
542	0.1
543	0.09
544	0.09
545	0.09
546	0.09
547	0.09
548	0.09
549	0.07
550	0.06
551	0.06
552	0.08
553	0.08
554	0.07
555	0.07
556	0.07
557	0.07
558	0.06
559	0.05
560	0.04
561	0.06
562	0.07
563	0.08
564	0.09
565	0.1
566	0.1
567	0.1
568	0.1
569	0.09
570	0.08
571	0.07
572	0.07
573	0.06
574	0.06
575	0.06
576	0.07
577	0.1
578	0.12
579	0.12
580	0.12
581	0.12
582	0.13
583	0.13
584	0.14
585	0.15
586	0.2
587	0.26
588	0.28
589	0.33
590	0.32
591	0.32
592	0.32
593	0.27
594	0.2
595	0.16
596	0.15
597	0.11
598	0.11
599	0.11
600	0.09
601	0.09
602	0.08
603	0.07
604	0.06
605	0.05
606	0.05
607	0.06
608	0.06
609	0.06
610	0.06
611	0.06
612	0.07
613	0.07
614	0.08
615	0.07
616	0.07
617	0.08
618	0.1
619	0.11
620	0.14
621	0.15
622	0.18
623	0.21
624	0.21
625	0.23
626	0.26
627	0.28
628	0.25
629	0.24
630	0.22
631	0.19
632	0.2
633	0.17
634	0.11
635	0.1
636	0.09
637	0.1
638	0.11
639	0.1
640	0.08
641	0.09
642	0.09
643	0.07
644	0.07
645	0.06
646	0.04
647	0.04
648	0.04
649	0.04
650	0.04
651	0.05
652	0.06
653	0.08
654	0.08
655	0.11
656	0.15
657	0.16
658	0.18
659	0.19
660	0.2
661	0.19
662	0.2
663	0.17
664	0.14
665	0.13
666	0.11
667	0.08
668	0.07
669	0.05
670	0.04
671	0.04
672	0.04
673	0.05
674	0.07
675	0.08
676	0.11
677	0.12
678	0.14
679	0.16
680	0.16
681	0.14
682	0.13
683	0.14
684	0.11
685	0.09
686	0.09
687	0.07
688	0.07
689	0.07
690	0.08
691	0.07
692	0.07
693	0.07
694	0.07
695	0.07
696	0.07
697	0.08
698	0.08
699	0.08
700	0.08
701	0.07
702	0.09
703	0.1
704	0.1
705	0.09
706	0.09
707	0.11
708	0.1
709	0.11
710	0.1
711	0.1
712	0.1
713	0.1
714	0.1
715	0.09
716	0.09
717	0.09
718	0.07
719	0.08
720	0.08
721	0.08
722	0.08
723	0.08
724	0.08
725	0.08
726	0.07
727	0.07
728	0.06
729	0.06
730	0.05
731	0.04
732	0.05
733	0.05
734	0.05
735	0.06
736	0.06
737	0.05
738	0.08
739	0.13
740	0.13
741	0.19
742	0.23
743	0.25
744	0.3
745	0.32
746	0.3
747	0.27
748	0.29
749	0.23
750	0.24
751	0.23
752	0.19
753	0.19
754	0.18
755	0.17
756	0.15
757	0.16
758	0.12
759	0.1
760	0.09
761	0.08
762	0.08
763	0.07
764	0.07
765	0.05
766	0.04
767	0.05
768	0.04
769	0.05
770	0.05
771	0.07
772	0.07
773	0.08
774	0.14
775	0.16
776	0.16
777	0.17
778	0.19
779	0.23
780	0.28
781	0.26
782	0.25
783	0.25
784	0.26
785	0.26
786	0.24
787	0.17
788	0.13
789	0.13
790	0.09
791	0.07
792	0.06
793	0.05
794	0.04
795	0.04
796	0.04
797	0.04
798	0.03
799	0.03
800	0.03
801	0.03
802	0.03
803	0.03
804	0.05
805	0.06
806	0.08
807	0.09
808	0.11
809	0.12
810	0.13
811	0.18
812	0.18
813	0.19
814	0.19
815	0.19
816	0.19
817	0.18
818	0.17
819	0.14
820	0.12
821	0.1
822	0.09
823	0.08
824	0.1
825	0.1
826	0.1
827	0.09
828	0.09
829	0.11
830	0.11
831	0.12
832	0.09
833	0.09
834	0.08
835	0.09
836	0.11
837	0.09
838	0.09
839	0.08
840	0.09
841	0.08
842	0.08
843	0.07
844	0.06
845	0.06
846	0.06
847	0.07
848	0.08
849	0.09
850	0.11
851	0.13
852	0.14
853	0.17
854	0.2
855	0.24
856	0.29
857	0.3
858	0.32
859	0.36
860	0.43
861	0.44
862	0.47
863	0.49
864	0.48
865	0.52
866	0.51
867	0.51
868	0.47
869	0.48
870	0.44
871	0.39
872	0.33
873	0.28
874	0.26
875	0.2
876	0.17
877	0.12
878	0.15
879	0.14
880	0.14
881	0.13
882	0.14
883	0.15
884	0.16
885	0.14
886	0.1
887	0.16
888	0.18
889	0.21
890	0.2
891	0.18
892	0.17
893	0.18
894	0.19
895	0.13
896	0.11
897	0.09
898	0.09
899	0.1
900	0.12
901	0.11
902	0.11
903	0.13
904	0.14
905	0.14
906	0.16
907	0.15
908	0.13
909	0.14
910	0.16
911	0.14
912	0.13
913	0.14
914	0.13
915	0.12
916	0.11
917	0.1
918	0.08
919	0.06
920	0.06
921	0.04
922	0.03
923	0.03
924	0.04
925	0.04
926	0.05
927	0.05
928	0.05
929	0.05
930	0.06
931	0.09
932	0.12
933	0.16
934	0.16
935	0.2
936	0.22
937	0.22
938	0.26
939	0.25
940	0.24
941	0.27
942	0.26
943	0.22
944	0.21
945	0.21
946	0.18
947	0.18
948	0.18
949	0.13
950	0.14
951	0.14
952	0.14
953	0.16
954	0.16
955	0.14
956	0.13
957	0.11
958	0.11
959	0.14
960	0.15
961	0.15
962	0.16
963	0.16
964	0.16
965	0.18
966	0.18
967	0.14
968	0.2
969	0.18
970	0.16
971	0.16
972	0.18
973	0.17
974	0.17
975	0.18
976	0.15
977	0.19
978	0.19
979	0.19
980	0.19
981	0.19
982	0.19
983	0.19
984	0.17
985	0.14
986	0.18
987	0.17
988	0.17
989	0.15
990	0.15
991	0.14
992	0.14
993	0.12
994	0.09
995	0.09
996	0.08
997	0.07
998	0.07
999	0.07
1000	0.07
1001	0.06
1002	0.07
1003	0.06
1004	0.06
1005	0.06
1006	0.06
1007	0.05
1008	0.05
1009	0.05
1010	0.06
1011	0.07
1012	0.08
1013	0.08
1014	0.09
1015	0.1
1016	0.1
1017	0.17
1018	0.16
1019	0.15
1020	0.15
1021	0.16
1022	0.15
1023	0.15
1024	0.14
1025	0.07
1026	0.07
1027	0.08
1028	0.07
1029	0.06
1030	0.09
1031	0.09
1032	0.09
1033	0.09
1034	0.09
1035	0.09
1036	0.1
1037	0.1
1038	0.09
1039	0.09
1040	0.09
1041	0.08
1042	0.1
1043	0.12
1044	0.13
1045	0.15
1046	0.17
1047	0.19
1048	0.24
1049	0.27
1050	0.27
1051	0.34
1052	0.39
1053	0.45
1054	0.48
1055	0.53
1056	0.51
1057	0.53
1058	0.53
1059	0.46
1060	0.43
1061	0.37
1062	0.31
1063	0.25
1064	0.22
1065	0.19
1066	0.19
1067	0.2
1068	0.2
1069	0.2
1070	0.18
1071	0.19
1072	0.2
1073	0.19
1074	0.18
1075	0.15
1076	0.12
1077	0.1
1078	0.15
1079	0.14
1080	0.14
1081	0.16
1082	0.18
1083	0.21
1084	0.21
1085	0.22
1086	0.19
1087	0.2
1088	0.19
1089	0.17
1090	0.16
1091	0.13
1092	0.13
1093	0.12
1094	0.13
1095	0.12
1096	0.13
1097	0.18
1098	0.17
1099	0.18
1100	0.17
1101	0.18
1102	0.17
1103	0.16
1104	0.18
1105	0.12
1106	0.13
1107	0.15
1108	0.16
1109	0.16
1110	0.17
1111	0.21
1112	0.23
1113	0.25
1114	0.27
1115	0.27
1116	0.27
1117	0.3
1118	0.35
1119	0.35
1120	0.34
1121	0.31
1122	0.28
1123	0.25
1124	0.26
1125	0.22
1126	0.16
1127	0.12
1128	0.11
1129	0.11
1130	0.1
1131	0.1
1132	0.07
1133	0.07
1134	0.07
1135	0.06
1136	0.05
1137	0.05
1138	0.05
1139	0.06
1140	0.06
1141	0.07
1142	0.08
1143	0.09
1144	0.1
1145	0.1
1146	0.11
1147	0.12
1148	0.11
1149	0.1
1150	0.11
1151	0.1
1152	0.11
1153	0.11
1154	0.09
1155	0.08
1156	0.08
1157	0.08
1158	0.06
1159	0.06
1160	0.04
1161	0.04
1162	0.06
1163	0.06
1164	0.06
1165	0.06
1166	0.08
1167	0.08
1168	0.09
1169	0.09
1170	0.09
1171	0.1
1172	0.1
1173	0.12
1174	0.13
1175	0.12
1176	0.11
1177	0.12
1178	0.11
1179	0.17
1180	0.22
1181	0.22
1182	0.27
1183	0.37
1184	0.47
1185	0.56
1186	0.6
1187	0.55
1188	0.56
1189	0.58
1190	0.6
1191	0.6
1192	0.54
1193	0.5
1194	0.47
1195	0.49
1196	0.49
1197	0.49
1198	0.41
1199	0.35
1200	0.34

A0A5M6C055

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer