Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5M6C0V1

Protein Details
Accession A0A5M6C0V1    Localization Confidence High Confidence Score 18.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
78-106APGALDLKKERKKKEKKIRDPNAPKRPPSBasic
243-267AAVAPASEKKEKKRKNKEDEAAVAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
85-104KKERKKKEKKIRDPNAPKRP
250-263EKKEKKRKNKEDEA
268-283ALGTAAEKKKKKKTKE
Subcellular Location(s) nucl 16.5, mito_nucl 10, cyto 6, mito 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MSAPTYEEMEAKRQEMITSFREIASAMTRCVQVIEDYTSLSPNHLTKTDFSQIAGGVQAALAPLNGHVIDGINVSSIAPGALDLKKERKKKEKKIRDPNAPKRPPSAYILFQNEIRDDIRNSNPGMAYKDILGIISQKWKDLTDSQKKVYEGLYQNAHKTYQAEEQAYSKRDDGIPVPAAIIPPVASESSDSSDSDDSSDDDSTPAVTVPTSVSKSKNIKPPTTTLPLQAPTASPATLQAATAAVAPASEKKEKKRKNKEDEAAVAAALGTAAEKKKKKKTKE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.26
3 0.29
4 0.25
5 0.28
6 0.28
7 0.25
8 0.25
9 0.24
10 0.22
11 0.24
12 0.22
13 0.18
14 0.2
15 0.2
16 0.2
17 0.2
18 0.19
19 0.14
20 0.15
21 0.18
22 0.15
23 0.17
24 0.17
25 0.18
26 0.17
27 0.17
28 0.17
29 0.15
30 0.18
31 0.18
32 0.2
33 0.2
34 0.27
35 0.31
36 0.29
37 0.27
38 0.26
39 0.24
40 0.22
41 0.21
42 0.14
43 0.08
44 0.07
45 0.07
46 0.05
47 0.05
48 0.04
49 0.04
50 0.04
51 0.05
52 0.05
53 0.05
54 0.05
55 0.06
56 0.06
57 0.07
58 0.07
59 0.05
60 0.05
61 0.05
62 0.05
63 0.05
64 0.04
65 0.03
66 0.04
67 0.07
68 0.08
69 0.1
70 0.13
71 0.22
72 0.3
73 0.37
74 0.46
75 0.54
76 0.64
77 0.73
78 0.82
79 0.84
80 0.88
81 0.92
82 0.93
83 0.94
84 0.94
85 0.94
86 0.93
87 0.88
88 0.79
89 0.72
90 0.65
91 0.56
92 0.5
93 0.44
94 0.36
95 0.36
96 0.38
97 0.35
98 0.33
99 0.31
100 0.27
101 0.24
102 0.21
103 0.17
104 0.13
105 0.16
106 0.17
107 0.19
108 0.19
109 0.19
110 0.19
111 0.19
112 0.2
113 0.16
114 0.14
115 0.12
116 0.12
117 0.1
118 0.1
119 0.08
120 0.07
121 0.07
122 0.12
123 0.12
124 0.12
125 0.13
126 0.13
127 0.15
128 0.19
129 0.28
130 0.32
131 0.36
132 0.38
133 0.41
134 0.41
135 0.4
136 0.36
137 0.33
138 0.26
139 0.25
140 0.28
141 0.26
142 0.27
143 0.27
144 0.26
145 0.2
146 0.18
147 0.17
148 0.17
149 0.19
150 0.19
151 0.19
152 0.22
153 0.25
154 0.26
155 0.25
156 0.2
157 0.18
158 0.18
159 0.18
160 0.16
161 0.17
162 0.17
163 0.15
164 0.16
165 0.14
166 0.14
167 0.13
168 0.11
169 0.06
170 0.05
171 0.06
172 0.06
173 0.05
174 0.06
175 0.08
176 0.1
177 0.11
178 0.11
179 0.12
180 0.13
181 0.13
182 0.13
183 0.12
184 0.1
185 0.11
186 0.11
187 0.1
188 0.09
189 0.09
190 0.09
191 0.08
192 0.07
193 0.06
194 0.05
195 0.05
196 0.07
197 0.11
198 0.14
199 0.16
200 0.18
201 0.26
202 0.33
203 0.39
204 0.46
205 0.49
206 0.51
207 0.53
208 0.56
209 0.55
210 0.56
211 0.51
212 0.45
213 0.44
214 0.4
215 0.37
216 0.33
217 0.26
218 0.22
219 0.22
220 0.19
221 0.13
222 0.13
223 0.15
224 0.14
225 0.14
226 0.11
227 0.1
228 0.11
229 0.11
230 0.1
231 0.06
232 0.06
233 0.07
234 0.1
235 0.15
236 0.22
237 0.26
238 0.37
239 0.48
240 0.58
241 0.68
242 0.76
243 0.82
244 0.85
245 0.92
246 0.9
247 0.89
248 0.84
249 0.78
250 0.67
251 0.56
252 0.45
253 0.34
254 0.25
255 0.15
256 0.09
257 0.04
258 0.07
259 0.12
260 0.2
261 0.28
262 0.37
263 0.48