Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5M6C0U3

Protein Details
Accession A0A5M6C0U3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
409-434IVTRGAGFRKEKNKKKRGSYVGGEITHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
415-425GFRKEKNKKKR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 10.666, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006594  LisH  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08513  LisH  
PF05022  SRP40_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50896  LISH  
Amino Acid Sequences MSQQDLDSAVLSYLIKRGFTKSTKAFEKEASVKPAQDGKLEEAWTKLTAPSAKADADVEMASDSSDSESESESDSESSSSSSSSSSSDSESSDDEDEPKTAAKPTEPAAIPLPESDSDSDSDSDSDSDSSSSSSSSSSSSASTSKKEQDQPTSALSSVTLKGDSASSSSSSSSSSSDSDSDSESESEAEKSSDKTAKKFLDVEAEESSSDDSSDSESESKSESDSSSESSSSSSSSSSSSSSESESESEEEADPAKPVIGTKRKERSPSTSSSSSSSSSSSSGSSSSSSSSSGSSKPAVVVVTTKKRKLEDGTEEITSTTTVTPSHKSTTHPARTAMIDGSGSSTPNGMDTPTSANGKKGRVQGQRFERIKPETVTFHHDGLKDNSFDARERMGANPNDYGAKASRDLIVTRGAGFRKEKNKKKRGSYVGGEITLATHSIKFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.16
3 0.17
4 0.21
5 0.28
6 0.32
7 0.4
8 0.44
9 0.51
10 0.58
11 0.6
12 0.59
13 0.54
14 0.59
15 0.58
16 0.56
17 0.55
18 0.49
19 0.46
20 0.47
21 0.5
22 0.43
23 0.39
24 0.36
25 0.33
26 0.36
27 0.37
28 0.34
29 0.28
30 0.29
31 0.26
32 0.24
33 0.2
34 0.19
35 0.21
36 0.21
37 0.23
38 0.24
39 0.23
40 0.23
41 0.23
42 0.19
43 0.17
44 0.15
45 0.12
46 0.1
47 0.09
48 0.08
49 0.08
50 0.07
51 0.06
52 0.07
53 0.07
54 0.07
55 0.08
56 0.09
57 0.11
58 0.11
59 0.11
60 0.12
61 0.12
62 0.11
63 0.1
64 0.11
65 0.09
66 0.09
67 0.08
68 0.08
69 0.09
70 0.1
71 0.11
72 0.12
73 0.14
74 0.15
75 0.15
76 0.16
77 0.16
78 0.17
79 0.17
80 0.16
81 0.16
82 0.16
83 0.15
84 0.15
85 0.15
86 0.13
87 0.14
88 0.15
89 0.14
90 0.16
91 0.18
92 0.25
93 0.24
94 0.25
95 0.26
96 0.26
97 0.25
98 0.22
99 0.23
100 0.15
101 0.17
102 0.16
103 0.14
104 0.13
105 0.15
106 0.15
107 0.13
108 0.13
109 0.12
110 0.11
111 0.1
112 0.1
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.08
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.08
123 0.09
124 0.09
125 0.1
126 0.11
127 0.15
128 0.17
129 0.19
130 0.22
131 0.26
132 0.32
133 0.38
134 0.42
135 0.45
136 0.47
137 0.47
138 0.45
139 0.42
140 0.35
141 0.28
142 0.23
143 0.18
144 0.15
145 0.13
146 0.11
147 0.09
148 0.09
149 0.1
150 0.09
151 0.08
152 0.08
153 0.08
154 0.09
155 0.1
156 0.1
157 0.1
158 0.11
159 0.11
160 0.11
161 0.11
162 0.12
163 0.12
164 0.12
165 0.12
166 0.13
167 0.12
168 0.11
169 0.11
170 0.1
171 0.1
172 0.09
173 0.09
174 0.09
175 0.08
176 0.08
177 0.09
178 0.13
179 0.18
180 0.18
181 0.2
182 0.27
183 0.27
184 0.29
185 0.29
186 0.26
187 0.29
188 0.28
189 0.29
190 0.23
191 0.22
192 0.2
193 0.19
194 0.18
195 0.09
196 0.09
197 0.06
198 0.05
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.09
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.09
211 0.09
212 0.11
213 0.1
214 0.1
215 0.1
216 0.1
217 0.1
218 0.09
219 0.09
220 0.08
221 0.07
222 0.08
223 0.09
224 0.09
225 0.1
226 0.11
227 0.11
228 0.11
229 0.11
230 0.11
231 0.11
232 0.11
233 0.11
234 0.1
235 0.11
236 0.1
237 0.09
238 0.1
239 0.09
240 0.08
241 0.07
242 0.07
243 0.06
244 0.07
245 0.14
246 0.21
247 0.24
248 0.33
249 0.41
250 0.45
251 0.51
252 0.54
253 0.54
254 0.51
255 0.54
256 0.52
257 0.47
258 0.45
259 0.41
260 0.39
261 0.33
262 0.28
263 0.24
264 0.18
265 0.15
266 0.15
267 0.13
268 0.11
269 0.1
270 0.1
271 0.1
272 0.1
273 0.1
274 0.1
275 0.1
276 0.1
277 0.11
278 0.13
279 0.13
280 0.15
281 0.14
282 0.14
283 0.14
284 0.14
285 0.13
286 0.11
287 0.14
288 0.19
289 0.29
290 0.33
291 0.36
292 0.38
293 0.39
294 0.43
295 0.43
296 0.44
297 0.42
298 0.43
299 0.44
300 0.41
301 0.4
302 0.36
303 0.31
304 0.23
305 0.16
306 0.1
307 0.07
308 0.08
309 0.1
310 0.14
311 0.16
312 0.2
313 0.21
314 0.24
315 0.32
316 0.42
317 0.47
318 0.46
319 0.45
320 0.44
321 0.44
322 0.42
323 0.34
324 0.24
325 0.17
326 0.14
327 0.15
328 0.13
329 0.12
330 0.1
331 0.1
332 0.09
333 0.1
334 0.1
335 0.07
336 0.07
337 0.08
338 0.12
339 0.15
340 0.2
341 0.2
342 0.25
343 0.29
344 0.32
345 0.36
346 0.39
347 0.46
348 0.51
349 0.56
350 0.6
351 0.65
352 0.72
353 0.69
354 0.65
355 0.62
356 0.57
357 0.57
358 0.51
359 0.46
360 0.4
361 0.41
362 0.46
363 0.42
364 0.4
365 0.39
366 0.37
367 0.37
368 0.37
369 0.39
370 0.32
371 0.3
372 0.3
373 0.27
374 0.27
375 0.26
376 0.22
377 0.2
378 0.21
379 0.24
380 0.29
381 0.31
382 0.32
383 0.31
384 0.3
385 0.3
386 0.28
387 0.28
388 0.22
389 0.22
390 0.2
391 0.2
392 0.22
393 0.22
394 0.23
395 0.22
396 0.24
397 0.21
398 0.22
399 0.26
400 0.24
401 0.28
402 0.32
403 0.38
404 0.45
405 0.55
406 0.63
407 0.69
408 0.78
409 0.82
410 0.88
411 0.9
412 0.89
413 0.87
414 0.84
415 0.82
416 0.79
417 0.7
418 0.6
419 0.49
420 0.4
421 0.31
422 0.25
423 0.16
424 0.1