Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5M6C913

Protein Details
Accession A0A5M6C913    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
37-56HLPPKRARPILPKLGRRTPTBasic
510-533FVNSGGKTRRRDEKGRRRMNDEMVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
516-527KTRRRDEKGRRR
Subcellular Location(s) mito 19, nucl 5, cyto 1, plas 1, pero 1, cyto_pero 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF13812  PPR_3  
Amino Acid Sequences MSRICHTCRSLASAQVRAHAPARAFATAITTGKYEHHLPPKRARPILPKLGRRTPTTQSLPTLLKTLSDLKSKSRRPTPSAYITIIKAAGDYALGRNASDGDETEGLGWQVAMAAWDDAKRGGIDLGTDGIESLMRFSVIYPHLLPSLLLYSDSQLASSYQAMIKASSLSSNLEQTFLLITEMFARDITPLPATLKASIRIACEWGCPRLALQLAQKVETESSTGQRIDRDSWFDILVSSADSQYLHGVETAWDRVKSSYTPDEGLVLAMLNTAGRWGRPDFASTILESLPTSPQEHHLAPLLEAFCNAGQVPNAFHVLSSIRASGLTPTLATIQPIVTVLKDAEVIDQAFYALEDMHKAGQPVDITALNALIEASARLGDLQRVRATQIAASDLGLKPDVDTFNGVLACCITTRHRPLGDTVLSEMVASDITPNAKTYETLILLCLTQATYEDAFYYLEKTKADGFKPSYAIYEALIRKCVTLQDSRWRLVVDEMKEVGYRMDSELHEFVNSGGKTRRRDEKGRRRMNDEMVGSKRRQWIGQSQRDSER
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.47
3 0.46
4 0.41
5 0.4
6 0.36
7 0.3
8 0.28
9 0.3
10 0.25
11 0.24
12 0.21
13 0.23
14 0.23
15 0.23
16 0.2
17 0.17
18 0.17
19 0.19
20 0.22
21 0.23
22 0.27
23 0.37
24 0.44
25 0.51
26 0.6
27 0.69
28 0.74
29 0.75
30 0.74
31 0.74
32 0.75
33 0.79
34 0.78
35 0.77
36 0.76
37 0.8
38 0.78
39 0.74
40 0.7
41 0.65
42 0.65
43 0.62
44 0.58
45 0.52
46 0.52
47 0.49
48 0.44
49 0.41
50 0.32
51 0.26
52 0.25
53 0.28
54 0.27
55 0.31
56 0.32
57 0.37
58 0.48
59 0.54
60 0.6
61 0.63
62 0.66
63 0.66
64 0.73
65 0.72
66 0.71
67 0.69
68 0.64
69 0.58
70 0.51
71 0.46
72 0.38
73 0.29
74 0.2
75 0.15
76 0.11
77 0.08
78 0.09
79 0.08
80 0.11
81 0.11
82 0.11
83 0.11
84 0.12
85 0.12
86 0.12
87 0.11
88 0.11
89 0.12
90 0.12
91 0.12
92 0.12
93 0.11
94 0.1
95 0.09
96 0.05
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.06
103 0.06
104 0.07
105 0.07
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.08
110 0.07
111 0.07
112 0.08
113 0.09
114 0.08
115 0.08
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.06
120 0.07
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.12
126 0.13
127 0.15
128 0.15
129 0.16
130 0.17
131 0.17
132 0.17
133 0.12
134 0.13
135 0.1
136 0.1
137 0.09
138 0.1
139 0.12
140 0.12
141 0.11
142 0.09
143 0.1
144 0.1
145 0.11
146 0.11
147 0.09
148 0.11
149 0.11
150 0.11
151 0.11
152 0.1
153 0.1
154 0.09
155 0.1
156 0.1
157 0.11
158 0.15
159 0.14
160 0.14
161 0.14
162 0.13
163 0.13
164 0.11
165 0.1
166 0.06
167 0.06
168 0.08
169 0.09
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.1
175 0.11
176 0.09
177 0.09
178 0.1
179 0.12
180 0.13
181 0.15
182 0.16
183 0.16
184 0.18
185 0.19
186 0.2
187 0.18
188 0.19
189 0.17
190 0.19
191 0.19
192 0.18
193 0.17
194 0.15
195 0.14
196 0.15
197 0.16
198 0.15
199 0.16
200 0.2
201 0.2
202 0.21
203 0.21
204 0.19
205 0.18
206 0.15
207 0.14
208 0.1
209 0.11
210 0.13
211 0.13
212 0.13
213 0.15
214 0.16
215 0.17
216 0.18
217 0.21
218 0.19
219 0.2
220 0.19
221 0.18
222 0.16
223 0.13
224 0.11
225 0.08
226 0.07
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.05
235 0.06
236 0.06
237 0.07
238 0.1
239 0.1
240 0.1
241 0.11
242 0.11
243 0.12
244 0.12
245 0.15
246 0.16
247 0.16
248 0.17
249 0.17
250 0.17
251 0.16
252 0.15
253 0.11
254 0.07
255 0.05
256 0.04
257 0.04
258 0.03
259 0.02
260 0.03
261 0.03
262 0.03
263 0.06
264 0.06
265 0.08
266 0.09
267 0.1
268 0.11
269 0.13
270 0.14
271 0.12
272 0.12
273 0.1
274 0.1
275 0.09
276 0.09
277 0.08
278 0.08
279 0.09
280 0.08
281 0.12
282 0.15
283 0.15
284 0.15
285 0.17
286 0.16
287 0.15
288 0.17
289 0.15
290 0.11
291 0.11
292 0.11
293 0.08
294 0.08
295 0.08
296 0.06
297 0.05
298 0.06
299 0.07
300 0.07
301 0.09
302 0.08
303 0.08
304 0.08
305 0.09
306 0.1
307 0.1
308 0.09
309 0.08
310 0.08
311 0.08
312 0.08
313 0.08
314 0.07
315 0.06
316 0.06
317 0.09
318 0.09
319 0.09
320 0.08
321 0.07
322 0.07
323 0.08
324 0.08
325 0.06
326 0.06
327 0.06
328 0.06
329 0.07
330 0.07
331 0.07
332 0.08
333 0.08
334 0.07
335 0.07
336 0.07
337 0.06
338 0.05
339 0.05
340 0.04
341 0.04
342 0.05
343 0.05
344 0.07
345 0.08
346 0.08
347 0.08
348 0.1
349 0.1
350 0.1
351 0.11
352 0.1
353 0.09
354 0.09
355 0.09
356 0.07
357 0.07
358 0.06
359 0.04
360 0.04
361 0.03
362 0.04
363 0.03
364 0.03
365 0.04
366 0.05
367 0.09
368 0.11
369 0.15
370 0.16
371 0.17
372 0.18
373 0.2
374 0.2
375 0.17
376 0.16
377 0.14
378 0.13
379 0.12
380 0.15
381 0.13
382 0.13
383 0.13
384 0.12
385 0.1
386 0.13
387 0.13
388 0.11
389 0.12
390 0.12
391 0.14
392 0.15
393 0.14
394 0.11
395 0.11
396 0.1
397 0.09
398 0.1
399 0.11
400 0.18
401 0.24
402 0.3
403 0.31
404 0.32
405 0.35
406 0.41
407 0.39
408 0.33
409 0.29
410 0.24
411 0.22
412 0.21
413 0.17
414 0.1
415 0.08
416 0.06
417 0.05
418 0.06
419 0.07
420 0.08
421 0.09
422 0.1
423 0.11
424 0.11
425 0.13
426 0.17
427 0.17
428 0.17
429 0.17
430 0.16
431 0.16
432 0.15
433 0.13
434 0.08
435 0.06
436 0.07
437 0.09
438 0.09
439 0.09
440 0.1
441 0.1
442 0.11
443 0.11
444 0.14
445 0.14
446 0.15
447 0.15
448 0.17
449 0.23
450 0.27
451 0.29
452 0.33
453 0.35
454 0.38
455 0.4
456 0.39
457 0.35
458 0.31
459 0.3
460 0.23
461 0.26
462 0.27
463 0.26
464 0.29
465 0.27
466 0.25
467 0.26
468 0.29
469 0.25
470 0.26
471 0.31
472 0.38
473 0.44
474 0.45
475 0.46
476 0.43
477 0.4
478 0.4
479 0.41
480 0.33
481 0.33
482 0.32
483 0.31
484 0.31
485 0.3
486 0.24
487 0.18
488 0.17
489 0.13
490 0.17
491 0.16
492 0.21
493 0.22
494 0.22
495 0.21
496 0.2
497 0.19
498 0.22
499 0.22
500 0.21
501 0.27
502 0.32
503 0.38
504 0.45
505 0.55
506 0.54
507 0.65
508 0.72
509 0.77
510 0.81
511 0.87
512 0.86
513 0.83
514 0.82
515 0.8
516 0.77
517 0.7
518 0.67
519 0.64
520 0.64
521 0.58
522 0.57
523 0.57
524 0.51
525 0.49
526 0.47
527 0.5
528 0.55
529 0.64
530 0.65