Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5M6C2S4

Protein Details
Accession A0A5M6C2S4    Localization Confidence High Confidence Score 22
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
93-120DSLDAKSWIKKQKKREKQRAKEMAEARAHydrophilic
278-303KEGEAGFKKPKKKKAKRSARRAEVDDBasic
338-358ALSRARRENAKKKPRAKPEDIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
56-74RKAKEEKDIKERIEKARNR
101-113IKKQKKREKQRAK
188-190RKR
284-298FKKPKKKKAKRSARR
341-354RARRENAKKKPRAK
610-623KTSGRMKTEKRLKK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 14, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005011  SNU66/SART1  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03343  SART-1  
Amino Acid Sequences MSSMNQDSLTLEETNKVRISLGLTPIGAAPAEGEDVPVDKDAEAEANFAQRKEDMRKAKEEKDIKERIEKARNRSALNAKLKGSTLGDNNADDSLDAKSWIKKQKKREKQRAKEMAEARARDMEEQDKAVYDENDLTGLKVAHDADDFEEGQDVILTLKDSRVLEGDEDELQNVNLVDDAAVKAAKERKRKAAAQYTGYDDEEFDENRIGQRAEVLSKYDDEFASGKVKSEGFRLGAPVEKKMKITDEDTEMIGAAPATKVKLNIDYTKEFDVSDYAKEGEAGFKKPKKKKAKRSARRAEVDDEEINGMEVDQKPTFSRRQVGDGPDNLVDDDDLQAALSRARRENAKKKPRAKPEDIAAQLAQQRQEEETAPQEANDDDDGRITFDETSEFVRNVTLESLAAPVKRERAATPPTQQEQAVVVKIERPEDGEVDEDEEMESEDEDEALAEIAAREGMSLAEYRLKIDSQLNEIETIKQENAEIGTEAEPVVGNGMAGILSLLRHQGAIKIRTAEDEERERVQKQKDLWLADHRRRMAQREMERIAARGGNKDQAQREWENRMREQQEAKDALESYRNYKPDVNIVYHDEFGREMTPKEAWKSLSHKFHGKTSGRMKTEKRLKKIAEERKQYTMNATDTPTGMTDAFSRRQHKTGEAHMVLSVGNKGSVQMSNKKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.25
3 0.23
4 0.21
5 0.21
6 0.25
7 0.25
8 0.28
9 0.26
10 0.25
11 0.25
12 0.25
13 0.24
14 0.19
15 0.13
16 0.09
17 0.07
18 0.09
19 0.08
20 0.08
21 0.08
22 0.09
23 0.11
24 0.11
25 0.11
26 0.09
27 0.1
28 0.1
29 0.13
30 0.12
31 0.13
32 0.13
33 0.19
34 0.21
35 0.21
36 0.22
37 0.21
38 0.27
39 0.32
40 0.41
41 0.44
42 0.47
43 0.58
44 0.63
45 0.68
46 0.72
47 0.72
48 0.7
49 0.7
50 0.72
51 0.66
52 0.69
53 0.68
54 0.68
55 0.7
56 0.7
57 0.68
58 0.7
59 0.72
60 0.65
61 0.66
62 0.66
63 0.65
64 0.67
65 0.64
66 0.56
67 0.53
68 0.51
69 0.46
70 0.4
71 0.34
72 0.29
73 0.29
74 0.29
75 0.27
76 0.27
77 0.25
78 0.22
79 0.17
80 0.15
81 0.11
82 0.1
83 0.11
84 0.12
85 0.16
86 0.24
87 0.34
88 0.43
89 0.48
90 0.59
91 0.69
92 0.78
93 0.85
94 0.89
95 0.91
96 0.91
97 0.96
98 0.95
99 0.89
100 0.87
101 0.8
102 0.78
103 0.74
104 0.64
105 0.55
106 0.49
107 0.44
108 0.36
109 0.35
110 0.3
111 0.24
112 0.25
113 0.23
114 0.19
115 0.19
116 0.2
117 0.17
118 0.15
119 0.14
120 0.13
121 0.14
122 0.13
123 0.13
124 0.12
125 0.12
126 0.11
127 0.12
128 0.11
129 0.11
130 0.11
131 0.12
132 0.11
133 0.14
134 0.14
135 0.12
136 0.12
137 0.11
138 0.1
139 0.09
140 0.08
141 0.05
142 0.05
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.1
147 0.11
148 0.11
149 0.13
150 0.13
151 0.13
152 0.14
153 0.15
154 0.14
155 0.14
156 0.13
157 0.12
158 0.11
159 0.11
160 0.1
161 0.08
162 0.06
163 0.06
164 0.05
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.1
171 0.17
172 0.24
173 0.32
174 0.37
175 0.46
176 0.53
177 0.59
178 0.65
179 0.68
180 0.68
181 0.64
182 0.61
183 0.57
184 0.52
185 0.47
186 0.38
187 0.27
188 0.23
189 0.2
190 0.17
191 0.13
192 0.11
193 0.11
194 0.12
195 0.13
196 0.12
197 0.1
198 0.12
199 0.13
200 0.14
201 0.15
202 0.16
203 0.15
204 0.16
205 0.17
206 0.16
207 0.14
208 0.14
209 0.14
210 0.14
211 0.17
212 0.15
213 0.15
214 0.15
215 0.17
216 0.15
217 0.17
218 0.18
219 0.15
220 0.16
221 0.16
222 0.15
223 0.19
224 0.19
225 0.22
226 0.24
227 0.24
228 0.24
229 0.24
230 0.26
231 0.24
232 0.26
233 0.23
234 0.23
235 0.23
236 0.22
237 0.21
238 0.18
239 0.15
240 0.12
241 0.09
242 0.05
243 0.04
244 0.04
245 0.05
246 0.06
247 0.07
248 0.08
249 0.13
250 0.16
251 0.2
252 0.24
253 0.26
254 0.28
255 0.29
256 0.28
257 0.23
258 0.2
259 0.18
260 0.14
261 0.13
262 0.12
263 0.1
264 0.1
265 0.1
266 0.1
267 0.13
268 0.14
269 0.17
270 0.23
271 0.27
272 0.37
273 0.44
274 0.54
275 0.6
276 0.69
277 0.77
278 0.81
279 0.87
280 0.89
281 0.93
282 0.93
283 0.91
284 0.86
285 0.78
286 0.71
287 0.62
288 0.55
289 0.44
290 0.34
291 0.25
292 0.19
293 0.16
294 0.11
295 0.08
296 0.07
297 0.07
298 0.09
299 0.09
300 0.1
301 0.11
302 0.14
303 0.17
304 0.17
305 0.22
306 0.2
307 0.25
308 0.29
309 0.33
310 0.34
311 0.32
312 0.31
313 0.26
314 0.25
315 0.2
316 0.16
317 0.11
318 0.07
319 0.07
320 0.05
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.06
326 0.08
327 0.09
328 0.1
329 0.12
330 0.18
331 0.26
332 0.36
333 0.46
334 0.54
335 0.61
336 0.7
337 0.78
338 0.82
339 0.83
340 0.79
341 0.73
342 0.67
343 0.67
344 0.58
345 0.51
346 0.4
347 0.34
348 0.31
349 0.27
350 0.24
351 0.15
352 0.15
353 0.13
354 0.15
355 0.13
356 0.11
357 0.12
358 0.13
359 0.13
360 0.12
361 0.12
362 0.1
363 0.11
364 0.1
365 0.1
366 0.07
367 0.08
368 0.08
369 0.08
370 0.08
371 0.07
372 0.07
373 0.06
374 0.07
375 0.07
376 0.1
377 0.11
378 0.11
379 0.1
380 0.11
381 0.11
382 0.1
383 0.1
384 0.07
385 0.06
386 0.06
387 0.07
388 0.08
389 0.09
390 0.1
391 0.1
392 0.13
393 0.14
394 0.15
395 0.15
396 0.2
397 0.24
398 0.28
399 0.32
400 0.36
401 0.37
402 0.37
403 0.36
404 0.3
405 0.28
406 0.25
407 0.21
408 0.15
409 0.13
410 0.14
411 0.15
412 0.15
413 0.12
414 0.13
415 0.13
416 0.13
417 0.14
418 0.12
419 0.11
420 0.12
421 0.12
422 0.1
423 0.09
424 0.08
425 0.07
426 0.06
427 0.06
428 0.04
429 0.04
430 0.04
431 0.04
432 0.04
433 0.04
434 0.04
435 0.03
436 0.03
437 0.03
438 0.03
439 0.03
440 0.03
441 0.03
442 0.03
443 0.03
444 0.04
445 0.05
446 0.05
447 0.1
448 0.1
449 0.11
450 0.12
451 0.12
452 0.14
453 0.18
454 0.19
455 0.18
456 0.21
457 0.2
458 0.21
459 0.22
460 0.21
461 0.18
462 0.18
463 0.15
464 0.13
465 0.12
466 0.11
467 0.11
468 0.1
469 0.09
470 0.09
471 0.09
472 0.09
473 0.09
474 0.08
475 0.07
476 0.06
477 0.07
478 0.05
479 0.04
480 0.04
481 0.04
482 0.03
483 0.03
484 0.03
485 0.03
486 0.03
487 0.04
488 0.05
489 0.05
490 0.05
491 0.06
492 0.11
493 0.18
494 0.2
495 0.23
496 0.25
497 0.25
498 0.27
499 0.31
500 0.29
501 0.27
502 0.31
503 0.31
504 0.32
505 0.35
506 0.35
507 0.37
508 0.38
509 0.38
510 0.35
511 0.41
512 0.42
513 0.43
514 0.45
515 0.49
516 0.55
517 0.57
518 0.62
519 0.55
520 0.56
521 0.56
522 0.58
523 0.56
524 0.57
525 0.56
526 0.58
527 0.58
528 0.57
529 0.54
530 0.49
531 0.43
532 0.36
533 0.3
534 0.26
535 0.26
536 0.27
537 0.3
538 0.34
539 0.35
540 0.36
541 0.41
542 0.42
543 0.44
544 0.47
545 0.5
546 0.51
547 0.52
548 0.57
549 0.53
550 0.53
551 0.54
552 0.49
553 0.51
554 0.48
555 0.45
556 0.39
557 0.37
558 0.33
559 0.34
560 0.31
561 0.27
562 0.31
563 0.31
564 0.31
565 0.34
566 0.34
567 0.36
568 0.39
569 0.37
570 0.34
571 0.4
572 0.39
573 0.37
574 0.36
575 0.28
576 0.23
577 0.21
578 0.2
579 0.16
580 0.14
581 0.16
582 0.19
583 0.22
584 0.26
585 0.29
586 0.28
587 0.33
588 0.39
589 0.44
590 0.5
591 0.51
592 0.56
593 0.55
594 0.59
595 0.63
596 0.6
597 0.61
598 0.62
599 0.66
600 0.62
601 0.67
602 0.65
603 0.66
604 0.73
605 0.73
606 0.71
607 0.71
608 0.69
609 0.73
610 0.78
611 0.79
612 0.78
613 0.79
614 0.76
615 0.75
616 0.74
617 0.64
618 0.6
619 0.55
620 0.48
621 0.41
622 0.39
623 0.34
624 0.31
625 0.31
626 0.26
627 0.22
628 0.18
629 0.16
630 0.17
631 0.21
632 0.27
633 0.33
634 0.38
635 0.41
636 0.45
637 0.48
638 0.51
639 0.51
640 0.53
641 0.57
642 0.53
643 0.49
644 0.45
645 0.42
646 0.35
647 0.3
648 0.23
649 0.13
650 0.12
651 0.11
652 0.12
653 0.14
654 0.18
655 0.23