Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5M6C1J8

Protein Details
Accession A0A5M6C1J8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
100-122GWGVRKMRKEARRKRGRAPHVPTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
104-118RKMRKEARRKRGRAP
269-275KRRKWGV
Subcellular Location(s) mito 12, nucl 11, cyto_nucl 8.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR037818  TAF8  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
Amino Acid Sequences MPSTITSASSSATTITSLPTSSSSTHIPPSTPSAYLRQVIVNTLLKRGFEGAEAGALAEIERLLEQHITNVFEDSIDYAHLSGRREVNAQDLVAAQEESGWGVRKMRKEARRKRGRAPHVPTIPSPPPSPKSESLASLFQQQDPTSTSTQEDRKPDLDRTPTSSNSTKGEKPYYAEDWVPSLPLKYTYSLSTLPLPTKKVEFELEDEIVKDDEDKPPVRVTSALLDFIKLTATERGDIPPELGVVDYRRETGSAIVDGQEHRQGQGQAKRRKWGVKAATRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.11
3 0.11
4 0.11
5 0.12
6 0.13
7 0.15
8 0.16
9 0.18
10 0.2
11 0.21
12 0.27
13 0.27
14 0.26
15 0.26
16 0.31
17 0.31
18 0.29
19 0.29
20 0.29
21 0.32
22 0.33
23 0.31
24 0.27
25 0.25
26 0.25
27 0.28
28 0.29
29 0.26
30 0.29
31 0.28
32 0.25
33 0.26
34 0.25
35 0.2
36 0.15
37 0.15
38 0.11
39 0.11
40 0.1
41 0.09
42 0.08
43 0.07
44 0.06
45 0.04
46 0.04
47 0.04
48 0.04
49 0.04
50 0.05
51 0.07
52 0.07
53 0.1
54 0.12
55 0.14
56 0.14
57 0.15
58 0.14
59 0.12
60 0.12
61 0.1
62 0.08
63 0.07
64 0.07
65 0.06
66 0.08
67 0.11
68 0.12
69 0.15
70 0.17
71 0.18
72 0.19
73 0.2
74 0.21
75 0.21
76 0.19
77 0.16
78 0.14
79 0.13
80 0.12
81 0.12
82 0.07
83 0.05
84 0.05
85 0.05
86 0.06
87 0.07
88 0.07
89 0.11
90 0.15
91 0.19
92 0.27
93 0.35
94 0.43
95 0.53
96 0.63
97 0.7
98 0.77
99 0.78
100 0.81
101 0.82
102 0.83
103 0.82
104 0.79
105 0.77
106 0.71
107 0.68
108 0.59
109 0.56
110 0.49
111 0.41
112 0.35
113 0.3
114 0.28
115 0.29
116 0.33
117 0.28
118 0.3
119 0.29
120 0.29
121 0.28
122 0.27
123 0.24
124 0.25
125 0.23
126 0.2
127 0.2
128 0.18
129 0.16
130 0.16
131 0.18
132 0.13
133 0.13
134 0.14
135 0.16
136 0.21
137 0.24
138 0.25
139 0.25
140 0.27
141 0.29
142 0.31
143 0.32
144 0.33
145 0.3
146 0.33
147 0.35
148 0.34
149 0.36
150 0.36
151 0.33
152 0.31
153 0.33
154 0.3
155 0.3
156 0.32
157 0.28
158 0.27
159 0.3
160 0.29
161 0.27
162 0.25
163 0.21
164 0.2
165 0.19
166 0.18
167 0.14
168 0.11
169 0.1
170 0.12
171 0.13
172 0.12
173 0.13
174 0.14
175 0.17
176 0.17
177 0.18
178 0.19
179 0.2
180 0.22
181 0.23
182 0.24
183 0.23
184 0.24
185 0.23
186 0.22
187 0.23
188 0.21
189 0.22
190 0.24
191 0.24
192 0.22
193 0.22
194 0.2
195 0.17
196 0.15
197 0.13
198 0.1
199 0.13
200 0.17
201 0.18
202 0.19
203 0.22
204 0.23
205 0.22
206 0.22
207 0.2
208 0.22
209 0.22
210 0.24
211 0.21
212 0.22
213 0.2
214 0.2
215 0.18
216 0.12
217 0.12
218 0.12
219 0.14
220 0.14
221 0.16
222 0.17
223 0.19
224 0.2
225 0.19
226 0.15
227 0.13
228 0.12
229 0.11
230 0.11
231 0.11
232 0.14
233 0.14
234 0.15
235 0.15
236 0.16
237 0.16
238 0.17
239 0.18
240 0.16
241 0.16
242 0.15
243 0.17
244 0.18
245 0.2
246 0.23
247 0.21
248 0.2
249 0.24
250 0.27
251 0.33
252 0.41
253 0.48
254 0.53
255 0.58
256 0.66
257 0.68
258 0.72
259 0.68
260 0.7
261 0.71