Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5M6C244

Protein Details
Accession A0A5M6C244    Localization Confidence Low Confidence Score 8.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
44-65SNSNSLRKSSLRRRNAPSSHNDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 13.333, cyto 11, cyto_mito 6.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045030  LYSM1-4  
IPR018392  LysM_dom  
IPR036779  LysM_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF01476  LysM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51782  LYSM  
CDD cd00118  LysM  
Amino Acid Sequences MYPSSSTTSVSDEVIRRSSLGGLSSSPPSDSDIWGSSNANSNDSNSNSLRKSSLRRRNAPSSHNDSTTSSSNSGDRPNPHRPDLSQRRTSSTPSPHPLSHSTPPTHHTDVLGDISRPALKRVTTETERQVAESSRSGGSESLRGSFDVLRMSTVDEPTGGGEVEVLIHTIKPNESLAGIALIYGIDLATLRKVNKLWASDPIHIRTHLYVPLDACRWNKARETLVRGPGEGQVTLMPKVDKRKTNGLDKGKGKQKEEDHDGPRSHKGNGLNGRLDTPSGVDAEGGWGQSEWTSNDSGEIDGIAQTFLPSTNIAYNRPSVDLSLPPPVESSSMLDQQEDNEPTPRVLDVVRIPSSQLRFFPRPQKPPDPSRASLERDRDESDGGFGDTNRRSSMAIRRNSSGGAEGPSIVHDLSTLPPPLRHSHSHSNAESDSPPKANVKTRAKTTVVRLRPPQPTQPLHSSSKLANRLSSLFTVPPPPPQAPFGTKQGSSVSRPRISLDSSFSSTPRSSAGSRRGSGASSPATLKMREESMEMMTRLREEPGNVGLGIGQGDEGVTRRVGSARMGKKDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.29
3 0.25
4 0.25
5 0.26
6 0.22
7 0.2
8 0.18
9 0.17
10 0.2
11 0.22
12 0.22
13 0.2
14 0.19
15 0.21
16 0.21
17 0.2
18 0.21
19 0.2
20 0.21
21 0.23
22 0.24
23 0.21
24 0.28
25 0.27
26 0.26
27 0.25
28 0.26
29 0.29
30 0.3
31 0.34
32 0.28
33 0.34
34 0.32
35 0.34
36 0.35
37 0.35
38 0.43
39 0.49
40 0.57
41 0.61
42 0.69
43 0.75
44 0.82
45 0.83
46 0.81
47 0.79
48 0.78
49 0.73
50 0.66
51 0.6
52 0.51
53 0.48
54 0.45
55 0.4
56 0.32
57 0.28
58 0.28
59 0.29
60 0.32
61 0.33
62 0.36
63 0.4
64 0.49
65 0.53
66 0.55
67 0.56
68 0.53
69 0.59
70 0.63
71 0.65
72 0.64
73 0.6
74 0.63
75 0.61
76 0.63
77 0.6
78 0.59
79 0.58
80 0.56
81 0.59
82 0.53
83 0.56
84 0.56
85 0.54
86 0.52
87 0.51
88 0.47
89 0.44
90 0.46
91 0.49
92 0.47
93 0.41
94 0.34
95 0.28
96 0.27
97 0.29
98 0.27
99 0.2
100 0.17
101 0.17
102 0.2
103 0.19
104 0.18
105 0.17
106 0.16
107 0.19
108 0.25
109 0.31
110 0.32
111 0.38
112 0.41
113 0.43
114 0.42
115 0.41
116 0.37
117 0.31
118 0.3
119 0.26
120 0.23
121 0.18
122 0.18
123 0.18
124 0.17
125 0.16
126 0.17
127 0.16
128 0.16
129 0.16
130 0.16
131 0.17
132 0.17
133 0.17
134 0.15
135 0.15
136 0.13
137 0.13
138 0.15
139 0.16
140 0.15
141 0.14
142 0.11
143 0.11
144 0.11
145 0.11
146 0.08
147 0.06
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.04
154 0.05
155 0.06
156 0.07
157 0.07
158 0.08
159 0.09
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.08
164 0.08
165 0.07
166 0.05
167 0.05
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.03
172 0.02
173 0.03
174 0.03
175 0.05
176 0.08
177 0.08
178 0.11
179 0.12
180 0.16
181 0.2
182 0.23
183 0.23
184 0.29
185 0.34
186 0.37
187 0.4
188 0.4
189 0.38
190 0.35
191 0.35
192 0.27
193 0.25
194 0.22
195 0.2
196 0.17
197 0.16
198 0.18
199 0.18
200 0.2
201 0.19
202 0.21
203 0.23
204 0.24
205 0.26
206 0.27
207 0.32
208 0.33
209 0.41
210 0.42
211 0.47
212 0.44
213 0.42
214 0.39
215 0.36
216 0.32
217 0.23
218 0.17
219 0.12
220 0.13
221 0.13
222 0.13
223 0.11
224 0.13
225 0.21
226 0.26
227 0.29
228 0.32
229 0.41
230 0.45
231 0.53
232 0.59
233 0.59
234 0.61
235 0.6
236 0.63
237 0.61
238 0.61
239 0.54
240 0.52
241 0.49
242 0.47
243 0.52
244 0.52
245 0.48
246 0.49
247 0.49
248 0.45
249 0.45
250 0.4
251 0.33
252 0.29
253 0.27
254 0.29
255 0.34
256 0.35
257 0.32
258 0.31
259 0.31
260 0.28
261 0.26
262 0.18
263 0.12
264 0.08
265 0.07
266 0.07
267 0.05
268 0.05
269 0.06
270 0.07
271 0.06
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.06
277 0.05
278 0.06
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.08
283 0.08
284 0.07
285 0.06
286 0.05
287 0.04
288 0.05
289 0.04
290 0.03
291 0.03
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.05
297 0.09
298 0.1
299 0.12
300 0.13
301 0.15
302 0.15
303 0.16
304 0.15
305 0.12
306 0.13
307 0.13
308 0.14
309 0.18
310 0.17
311 0.16
312 0.16
313 0.15
314 0.15
315 0.13
316 0.14
317 0.12
318 0.16
319 0.16
320 0.16
321 0.16
322 0.16
323 0.2
324 0.19
325 0.17
326 0.16
327 0.16
328 0.15
329 0.16
330 0.14
331 0.1
332 0.09
333 0.11
334 0.12
335 0.17
336 0.18
337 0.18
338 0.19
339 0.22
340 0.24
341 0.23
342 0.24
343 0.25
344 0.28
345 0.33
346 0.42
347 0.47
348 0.53
349 0.58
350 0.65
351 0.64
352 0.68
353 0.72
354 0.7
355 0.63
356 0.62
357 0.6
358 0.56
359 0.55
360 0.54
361 0.47
362 0.42
363 0.42
364 0.37
365 0.32
366 0.27
367 0.22
368 0.16
369 0.14
370 0.12
371 0.1
372 0.15
373 0.15
374 0.16
375 0.15
376 0.15
377 0.16
378 0.19
379 0.29
380 0.32
381 0.37
382 0.39
383 0.4
384 0.4
385 0.4
386 0.37
387 0.29
388 0.22
389 0.17
390 0.14
391 0.13
392 0.12
393 0.12
394 0.12
395 0.1
396 0.08
397 0.06
398 0.07
399 0.08
400 0.11
401 0.12
402 0.12
403 0.14
404 0.17
405 0.21
406 0.26
407 0.28
408 0.33
409 0.42
410 0.49
411 0.55
412 0.53
413 0.52
414 0.48
415 0.46
416 0.4
417 0.32
418 0.27
419 0.2
420 0.22
421 0.21
422 0.25
423 0.3
424 0.38
425 0.46
426 0.49
427 0.54
428 0.59
429 0.59
430 0.6
431 0.61
432 0.61
433 0.58
434 0.59
435 0.6
436 0.61
437 0.65
438 0.65
439 0.65
440 0.63
441 0.62
442 0.61
443 0.62
444 0.6
445 0.57
446 0.55
447 0.49
448 0.44
449 0.48
450 0.49
451 0.42
452 0.38
453 0.36
454 0.35
455 0.35
456 0.33
457 0.27
458 0.22
459 0.22
460 0.25
461 0.24
462 0.27
463 0.29
464 0.29
465 0.29
466 0.3
467 0.34
468 0.34
469 0.38
470 0.39
471 0.39
472 0.37
473 0.37
474 0.4
475 0.38
476 0.38
477 0.42
478 0.44
479 0.42
480 0.43
481 0.44
482 0.42
483 0.42
484 0.4
485 0.38
486 0.35
487 0.35
488 0.35
489 0.33
490 0.34
491 0.31
492 0.28
493 0.24
494 0.22
495 0.22
496 0.29
497 0.38
498 0.41
499 0.42
500 0.45
501 0.44
502 0.41
503 0.39
504 0.37
505 0.3
506 0.25
507 0.25
508 0.27
509 0.28
510 0.28
511 0.28
512 0.26
513 0.26
514 0.24
515 0.24
516 0.22
517 0.23
518 0.28
519 0.27
520 0.25
521 0.23
522 0.25
523 0.24
524 0.24
525 0.22
526 0.18
527 0.21
528 0.22
529 0.24
530 0.21
531 0.2
532 0.17
533 0.16
534 0.14
535 0.11
536 0.08
537 0.05
538 0.05
539 0.06
540 0.07
541 0.08
542 0.09
543 0.09
544 0.11
545 0.13
546 0.14
547 0.2
548 0.29
549 0.35