Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VQ03

Protein Details
Accession H1VQ03    Localization Confidence High Confidence Score 17.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
33-55VEPEKVTKKKTTKVEKAEKAEKVHydrophilic
89-108AKKQKPVKASSKSKKSKPEPBasic
167-188DVGKVPKHAKKQKQLTNGKKEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-106KRTRSATASAEKPAAKKTAKVEKVEKVEPEKVTKKKTTKVEKAEKAEKVEKVEKVEKVEKVVKAEKAPKRKAPEEAQASPVAAKKQKPVKASSKSKKSKP
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11, mito 6, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAPELRKRTRSATASAEKPAAKKTAKVEKVEKVEPEKVTKKKTTKVEKAEKAEKVEKVEKVEKVEKVVKAEKAPKRKAPEEAQASPVAAKKQKPVKASSKSKKSKPEPVEEAEPETIEAAEESVVALDDAADSDEELDADIQALAAGLDSDAEKTPAGNGTFKEGMDVGKVPKHAKKQKQLTNGKKEEPGIVFISRLPHGFYEHELKGYFSQFGPINRLRLARNKKTGASKHYAFLEFAEESTAEIVSKTMDSYLLFGHILKVKTVPRDQLHEDVWKGANKRFKKIP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.57
3 0.56
4 0.49
5 0.47
6 0.45
7 0.43
8 0.37
9 0.38
10 0.43
11 0.48
12 0.52
13 0.57
14 0.6
15 0.61
16 0.66
17 0.66
18 0.63
19 0.59
20 0.59
21 0.55
22 0.57
23 0.57
24 0.57
25 0.61
26 0.64
27 0.65
28 0.66
29 0.73
30 0.75
31 0.76
32 0.8
33 0.83
34 0.82
35 0.84
36 0.84
37 0.78
38 0.74
39 0.71
40 0.63
41 0.59
42 0.57
43 0.51
44 0.5
45 0.51
46 0.47
47 0.48
48 0.51
49 0.45
50 0.45
51 0.48
52 0.43
53 0.43
54 0.46
55 0.42
56 0.43
57 0.51
58 0.52
59 0.56
60 0.61
61 0.62
62 0.64
63 0.65
64 0.66
65 0.63
66 0.65
67 0.62
68 0.58
69 0.54
70 0.46
71 0.43
72 0.37
73 0.32
74 0.27
75 0.23
76 0.23
77 0.27
78 0.35
79 0.39
80 0.41
81 0.46
82 0.52
83 0.58
84 0.67
85 0.7
86 0.72
87 0.76
88 0.79
89 0.82
90 0.79
91 0.79
92 0.74
93 0.72
94 0.67
95 0.64
96 0.63
97 0.53
98 0.5
99 0.4
100 0.34
101 0.25
102 0.19
103 0.14
104 0.08
105 0.07
106 0.04
107 0.03
108 0.03
109 0.03
110 0.03
111 0.03
112 0.03
113 0.03
114 0.02
115 0.02
116 0.02
117 0.03
118 0.03
119 0.03
120 0.03
121 0.03
122 0.03
123 0.03
124 0.03
125 0.03
126 0.03
127 0.03
128 0.03
129 0.03
130 0.03
131 0.02
132 0.02
133 0.02
134 0.02
135 0.02
136 0.02
137 0.04
138 0.04
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.08
144 0.09
145 0.1
146 0.1
147 0.14
148 0.15
149 0.15
150 0.16
151 0.13
152 0.12
153 0.12
154 0.13
155 0.09
156 0.11
157 0.13
158 0.15
159 0.2
160 0.3
161 0.38
162 0.45
163 0.54
164 0.62
165 0.67
166 0.75
167 0.81
168 0.82
169 0.83
170 0.8
171 0.73
172 0.66
173 0.59
174 0.53
175 0.43
176 0.36
177 0.28
178 0.23
179 0.2
180 0.18
181 0.2
182 0.16
183 0.16
184 0.14
185 0.12
186 0.14
187 0.15
188 0.16
189 0.2
190 0.2
191 0.21
192 0.2
193 0.21
194 0.21
195 0.21
196 0.2
197 0.13
198 0.17
199 0.18
200 0.19
201 0.25
202 0.25
203 0.27
204 0.28
205 0.31
206 0.3
207 0.37
208 0.46
209 0.47
210 0.54
211 0.55
212 0.58
213 0.65
214 0.69
215 0.66
216 0.64
217 0.57
218 0.53
219 0.53
220 0.49
221 0.4
222 0.34
223 0.3
224 0.22
225 0.2
226 0.18
227 0.13
228 0.12
229 0.12
230 0.11
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.06
235 0.07
236 0.07
237 0.06
238 0.08
239 0.08
240 0.09
241 0.1
242 0.11
243 0.11
244 0.1
245 0.14
246 0.18
247 0.19
248 0.19
249 0.23
250 0.25
251 0.32
252 0.37
253 0.41
254 0.41
255 0.47
256 0.51
257 0.52
258 0.52
259 0.51
260 0.47
261 0.43
262 0.43
263 0.42
264 0.39
265 0.39
266 0.44
267 0.42