Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5M6C0H1

Protein Details
Accession A0A5M6C0H1    Localization Confidence High Confidence Score 19.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
34-63RDRERDYDRERDRERRHRDRGDEREDRHRGBasic
89-112GGPGGYDDRPPRRRRREDDEFGLABasic
536-557VEGVRIPRPTPKSKKWEPSDSAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
42-104RERDRERRHRDRGDEREDRHRGDRDRERDRDRDGHRDRDRGGDRYDRGGPGGYDDRPPRRRRR
156-199SPPRRRRDDDDWRGGGGGGGGGRGGRRDGRDGGRRDDRRGGGGF
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12230  RRM1_U2AF65  
cd12231  RRM2_U2AF65  
cd12232  RRM3_U2AF65  
Amino Acid Sequences MDAGYDALEEAASSFAKSRDRGDDDGRSHRSSNRDRERDYDRERDRERRHRDRGDEREDRHRGDRDRERDRDRDGHRDRDRGGDRYDRGGPGGYDDRPPRRRRREDDEFGLAAEPMSGGGGGGPGGPGGGRDNGHRDRRPRYDDGREFAQPMRGFSPPRRRRDDDDWRGGGGGGGGGRGGRRDGRDGGRRDDRRGGGGFSPGGGGRSPTPPGAVPLEERHVQNSHWDERPPQFEGVGAMEAKMTGMFTYGPGRVPPPLHLGIPQSLVAGSFPPSNPVRQTKRLYIGGINEHMTEQQIQDFFNKLMHENKLAVDMPGEPVAQCQINNEKSFAFVEFRTPEEATAALQFDGVMYEGSPLRVRRPKDYAGIDPLMGTFGGSIAPSVADSPNKLFVGGLPTYLNDEQVMELLKSFGELKSFNLVKESAGVSKGFAFCEYLDPTVTDMAIQGLHNFALGDRNLVVQRAAVGRNQPGSSAMPGSAAFLSQAVPHILQANADAPTSRVMLLLNMVTPEELVRDDDYADIIEDINEECGKYGEVEGVRIPRPTPKSKKWEPSDSAAATAEKNRKADEEAGVGRVYVMYRDIESTKKAMKAIGGRQFAGRTILVANVPEEEFLGPAPPPPPPPEPEDLDAAAADAVKDIMSGLMD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.13
3 0.18
4 0.2
5 0.25
6 0.32
7 0.38
8 0.42
9 0.47
10 0.53
11 0.54
12 0.62
13 0.63
14 0.58
15 0.54
16 0.54
17 0.57
18 0.58
19 0.63
20 0.64
21 0.67
22 0.67
23 0.71
24 0.73
25 0.74
26 0.71
27 0.71
28 0.67
29 0.68
30 0.72
31 0.76
32 0.79
33 0.79
34 0.83
35 0.83
36 0.86
37 0.85
38 0.88
39 0.88
40 0.88
41 0.88
42 0.86
43 0.8
44 0.8
45 0.77
46 0.72
47 0.68
48 0.66
49 0.62
50 0.63
51 0.68
52 0.67
53 0.72
54 0.76
55 0.76
56 0.74
57 0.75
58 0.74
59 0.7
60 0.71
61 0.68
62 0.7
63 0.69
64 0.7
65 0.64
66 0.65
67 0.65
68 0.59
69 0.57
70 0.55
71 0.5
72 0.49
73 0.52
74 0.42
75 0.38
76 0.35
77 0.3
78 0.27
79 0.29
80 0.25
81 0.28
82 0.34
83 0.43
84 0.5
85 0.59
86 0.64
87 0.7
88 0.79
89 0.8
90 0.83
91 0.84
92 0.84
93 0.83
94 0.78
95 0.68
96 0.58
97 0.5
98 0.4
99 0.29
100 0.2
101 0.12
102 0.06
103 0.05
104 0.04
105 0.03
106 0.03
107 0.03
108 0.03
109 0.04
110 0.03
111 0.03
112 0.03
113 0.03
114 0.04
115 0.06
116 0.09
117 0.09
118 0.12
119 0.2
120 0.28
121 0.37
122 0.42
123 0.47
124 0.53
125 0.61
126 0.66
127 0.66
128 0.67
129 0.69
130 0.69
131 0.68
132 0.64
133 0.57
134 0.52
135 0.46
136 0.45
137 0.35
138 0.31
139 0.29
140 0.27
141 0.28
142 0.34
143 0.44
144 0.46
145 0.54
146 0.6
147 0.63
148 0.67
149 0.75
150 0.78
151 0.76
152 0.77
153 0.7
154 0.61
155 0.56
156 0.48
157 0.38
158 0.26
159 0.17
160 0.07
161 0.06
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.06
166 0.08
167 0.1
168 0.12
169 0.16
170 0.21
171 0.28
172 0.37
173 0.4
174 0.46
175 0.53
176 0.54
177 0.55
178 0.57
179 0.5
180 0.46
181 0.44
182 0.39
183 0.3
184 0.3
185 0.25
186 0.18
187 0.18
188 0.13
189 0.13
190 0.1
191 0.1
192 0.09
193 0.12
194 0.13
195 0.12
196 0.13
197 0.13
198 0.15
199 0.16
200 0.15
201 0.15
202 0.16
203 0.2
204 0.21
205 0.21
206 0.22
207 0.21
208 0.2
209 0.24
210 0.27
211 0.28
212 0.28
213 0.29
214 0.3
215 0.34
216 0.37
217 0.33
218 0.29
219 0.24
220 0.22
221 0.21
222 0.18
223 0.15
224 0.11
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.07
229 0.06
230 0.05
231 0.03
232 0.04
233 0.04
234 0.05
235 0.08
236 0.09
237 0.09
238 0.1
239 0.11
240 0.13
241 0.14
242 0.15
243 0.17
244 0.18
245 0.18
246 0.19
247 0.2
248 0.19
249 0.19
250 0.17
251 0.12
252 0.1
253 0.1
254 0.09
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.11
260 0.12
261 0.14
262 0.17
263 0.25
264 0.3
265 0.36
266 0.4
267 0.41
268 0.46
269 0.46
270 0.44
271 0.38
272 0.35
273 0.31
274 0.28
275 0.24
276 0.19
277 0.17
278 0.15
279 0.13
280 0.11
281 0.08
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.09
286 0.11
287 0.1
288 0.11
289 0.12
290 0.11
291 0.15
292 0.16
293 0.16
294 0.15
295 0.15
296 0.16
297 0.16
298 0.14
299 0.11
300 0.1
301 0.09
302 0.1
303 0.09
304 0.06
305 0.06
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.08
310 0.13
311 0.17
312 0.17
313 0.18
314 0.17
315 0.17
316 0.18
317 0.17
318 0.13
319 0.09
320 0.13
321 0.13
322 0.14
323 0.15
324 0.15
325 0.14
326 0.13
327 0.13
328 0.09
329 0.1
330 0.09
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.04
338 0.03
339 0.04
340 0.05
341 0.06
342 0.08
343 0.08
344 0.15
345 0.2
346 0.22
347 0.26
348 0.32
349 0.34
350 0.38
351 0.42
352 0.38
353 0.38
354 0.37
355 0.32
356 0.26
357 0.23
358 0.17
359 0.13
360 0.1
361 0.04
362 0.03
363 0.04
364 0.03
365 0.03
366 0.03
367 0.03
368 0.03
369 0.05
370 0.06
371 0.06
372 0.07
373 0.09
374 0.12
375 0.12
376 0.12
377 0.11
378 0.11
379 0.15
380 0.14
381 0.14
382 0.11
383 0.11
384 0.15
385 0.15
386 0.14
387 0.09
388 0.09
389 0.08
390 0.09
391 0.1
392 0.06
393 0.06
394 0.06
395 0.06
396 0.06
397 0.07
398 0.06
399 0.07
400 0.08
401 0.09
402 0.17
403 0.18
404 0.17
405 0.18
406 0.18
407 0.16
408 0.18
409 0.18
410 0.12
411 0.13
412 0.13
413 0.11
414 0.14
415 0.14
416 0.12
417 0.11
418 0.11
419 0.1
420 0.14
421 0.15
422 0.13
423 0.13
424 0.13
425 0.13
426 0.13
427 0.12
428 0.08
429 0.07
430 0.06
431 0.07
432 0.07
433 0.06
434 0.06
435 0.06
436 0.06
437 0.06
438 0.06
439 0.09
440 0.09
441 0.09
442 0.09
443 0.12
444 0.12
445 0.13
446 0.12
447 0.09
448 0.11
449 0.13
450 0.14
451 0.13
452 0.16
453 0.18
454 0.22
455 0.22
456 0.2
457 0.19
458 0.2
459 0.19
460 0.17
461 0.15
462 0.12
463 0.12
464 0.13
465 0.11
466 0.09
467 0.08
468 0.07
469 0.07
470 0.07
471 0.08
472 0.08
473 0.08
474 0.09
475 0.11
476 0.1
477 0.1
478 0.11
479 0.12
480 0.11
481 0.11
482 0.11
483 0.09
484 0.11
485 0.12
486 0.11
487 0.09
488 0.08
489 0.08
490 0.1
491 0.1
492 0.09
493 0.08
494 0.08
495 0.08
496 0.08
497 0.07
498 0.07
499 0.07
500 0.08
501 0.09
502 0.09
503 0.1
504 0.1
505 0.1
506 0.09
507 0.09
508 0.08
509 0.07
510 0.06
511 0.06
512 0.07
513 0.08
514 0.08
515 0.07
516 0.07
517 0.08
518 0.08
519 0.09
520 0.09
521 0.12
522 0.12
523 0.14
524 0.16
525 0.2
526 0.22
527 0.22
528 0.22
529 0.26
530 0.32
531 0.41
532 0.48
533 0.54
534 0.62
535 0.71
536 0.8
537 0.81
538 0.84
539 0.78
540 0.76
541 0.74
542 0.65
543 0.57
544 0.49
545 0.42
546 0.33
547 0.36
548 0.35
549 0.31
550 0.32
551 0.31
552 0.31
553 0.34
554 0.36
555 0.32
556 0.32
557 0.3
558 0.31
559 0.29
560 0.27
561 0.23
562 0.2
563 0.17
564 0.1
565 0.1
566 0.09
567 0.1
568 0.13
569 0.15
570 0.18
571 0.2
572 0.24
573 0.28
574 0.29
575 0.3
576 0.28
577 0.32
578 0.37
579 0.43
580 0.48
581 0.46
582 0.44
583 0.46
584 0.45
585 0.41
586 0.36
587 0.27
588 0.19
589 0.17
590 0.18
591 0.16
592 0.16
593 0.16
594 0.14
595 0.15
596 0.13
597 0.13
598 0.11
599 0.1
600 0.1
601 0.11
602 0.09
603 0.11
604 0.12
605 0.14
606 0.18
607 0.23
608 0.28
609 0.29
610 0.35
611 0.38
612 0.43
613 0.43
614 0.44
615 0.39
616 0.35
617 0.31
618 0.25
619 0.2
620 0.14
621 0.11
622 0.07
623 0.07
624 0.05
625 0.05
626 0.05