Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5M6CCW2

Protein Details
Accession A0A5M6CCW2    Localization Confidence High Confidence Score 21.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-39TTTTTRTSGRARHKSQRAIESEHydrophilic
61-89ASTENKAKPMPKPRGKGKKKEEVYCVCKQHydrophilic
156-176VAPAKRKQSKHVKSPAAKSESHydrophilic
188-213ASSSHSPPPPKRRQPSQDTKRKVPIDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
66-80KAKPMPKPRGKGKKK
198-200KRR
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012921  SPOC_C  
IPR003618  TFIIS_cen_dom  
IPR036575  TFIIS_cen_dom_sf  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00628  PHD  
PF07744  SPOC  
PF07500  TFIIS_M  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51321  TFIIS_CENTRAL  
PS01359  ZF_PHD_1  
PS50016  ZF_PHD_2  
CDD cd21538  SPOC_TFIIS  
Amino Acid Sequences MSDSVPEASGSQSAPTTTTTTTRTSGRARHKSQRAIESEDTKRLLASHAAASATREASSSASTENKAKPMPKPRGKGKKKEEVYCVCKQNTDGPMIECDECNDWFHFGCVNLTDEDAEKIHKYVCPECEKRTGEKTTHTFDIQTFPSPTPPPGITVAPAKRKQSKHVKSPAAKSESESESDSESDADASSSHSPPPPKRRQPSQDTKRKVPIDRKPSISTGGLPPMRKYVREKLVPSIKSLFSTIEDGKAEEYAAEVEEAMFKSFKETVNGKETAGTRYKTQFNLLHSSMTKGLRASLSESIINGSLTPSQVAVLTSADLASEEQLAAMERAKQAVLEQHVRAKEDVTTIRLGRDGFEKVEDTHEKEMKLLAAQEEAARVRRAEEARRESPVSEVPQSPVVPDVPRMTPKRSESIDVVGSPANQFAMKSAWGEEKADDAHEEAMFGAGGDQELDLSDIVQGDDVIDDLLEEKLLDESPGEMDIFEAKPVVWSGGISNPADPSPHIPPMQLRLICRSSQSNWSLLLPHKTIEITGRVPTKTSLQFLGDTRLNPAKELITVAFSLDQKASQDEAKAWEALIEYLISRDRHAIYLPYGERPPQGAAKELYMIPLRPNDPAPDFTDLIDGFSLPAKGRPASLFLGVFIANRQSTSVSLPAPAQAPAPRAPLPAAAAAPTIESEKLKALMASLNPTMLQGLVGGSTPPQGSFTPIAGSSTPMPPPNFPPFPPPQLPHSSQGYSPYPPPPPADPYVSMSGSYSPHMGGPYQPPRQNGPPPPPPPSSSRQRGFDRERDNGWGSRGGDRRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.15
3 0.17
4 0.17
5 0.2
6 0.22
7 0.25
8 0.27
9 0.29
10 0.33
11 0.37
12 0.44
13 0.51
14 0.59
15 0.64
16 0.71
17 0.78
18 0.81
19 0.82
20 0.83
21 0.77
22 0.75
23 0.73
24 0.71
25 0.67
26 0.64
27 0.57
28 0.48
29 0.43
30 0.35
31 0.31
32 0.26
33 0.24
34 0.2
35 0.2
36 0.21
37 0.21
38 0.22
39 0.23
40 0.2
41 0.18
42 0.15
43 0.14
44 0.15
45 0.16
46 0.14
47 0.15
48 0.17
49 0.2
50 0.26
51 0.28
52 0.32
53 0.36
54 0.4
55 0.45
56 0.52
57 0.61
58 0.64
59 0.7
60 0.76
61 0.82
62 0.87
63 0.89
64 0.89
65 0.88
66 0.87
67 0.86
68 0.85
69 0.84
70 0.81
71 0.79
72 0.77
73 0.67
74 0.61
75 0.55
76 0.53
77 0.46
78 0.43
79 0.37
80 0.3
81 0.32
82 0.33
83 0.32
84 0.24
85 0.23
86 0.21
87 0.2
88 0.2
89 0.18
90 0.17
91 0.16
92 0.17
93 0.17
94 0.14
95 0.15
96 0.14
97 0.15
98 0.14
99 0.14
100 0.14
101 0.14
102 0.15
103 0.13
104 0.14
105 0.13
106 0.14
107 0.15
108 0.16
109 0.2
110 0.24
111 0.31
112 0.39
113 0.42
114 0.46
115 0.54
116 0.55
117 0.57
118 0.59
119 0.57
120 0.51
121 0.55
122 0.56
123 0.52
124 0.52
125 0.47
126 0.41
127 0.36
128 0.38
129 0.31
130 0.3
131 0.27
132 0.24
133 0.28
134 0.28
135 0.28
136 0.27
137 0.25
138 0.24
139 0.24
140 0.24
141 0.21
142 0.28
143 0.34
144 0.39
145 0.43
146 0.47
147 0.53
148 0.56
149 0.63
150 0.66
151 0.68
152 0.69
153 0.74
154 0.78
155 0.77
156 0.82
157 0.82
158 0.75
159 0.67
160 0.59
161 0.55
162 0.47
163 0.42
164 0.35
165 0.26
166 0.23
167 0.23
168 0.21
169 0.14
170 0.12
171 0.1
172 0.09
173 0.08
174 0.06
175 0.09
176 0.12
177 0.12
178 0.14
179 0.17
180 0.24
181 0.32
182 0.43
183 0.51
184 0.58
185 0.65
186 0.74
187 0.8
188 0.84
189 0.87
190 0.88
191 0.87
192 0.84
193 0.83
194 0.82
195 0.79
196 0.77
197 0.75
198 0.74
199 0.73
200 0.72
201 0.71
202 0.65
203 0.61
204 0.56
205 0.47
206 0.4
207 0.34
208 0.35
209 0.33
210 0.3
211 0.29
212 0.34
213 0.34
214 0.34
215 0.37
216 0.38
217 0.43
218 0.49
219 0.5
220 0.51
221 0.59
222 0.56
223 0.54
224 0.49
225 0.41
226 0.36
227 0.34
228 0.26
229 0.19
230 0.23
231 0.2
232 0.18
233 0.17
234 0.17
235 0.16
236 0.15
237 0.13
238 0.09
239 0.08
240 0.06
241 0.06
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.07
246 0.07
247 0.08
248 0.07
249 0.07
250 0.1
251 0.12
252 0.13
253 0.16
254 0.18
255 0.22
256 0.28
257 0.29
258 0.26
259 0.28
260 0.28
261 0.28
262 0.31
263 0.27
264 0.25
265 0.29
266 0.33
267 0.29
268 0.34
269 0.33
270 0.32
271 0.37
272 0.35
273 0.33
274 0.3
275 0.31
276 0.29
277 0.27
278 0.24
279 0.17
280 0.18
281 0.15
282 0.16
283 0.17
284 0.15
285 0.15
286 0.15
287 0.15
288 0.14
289 0.14
290 0.13
291 0.09
292 0.08
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.06
297 0.06
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.06
302 0.06
303 0.06
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.04
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.07
317 0.07
318 0.08
319 0.08
320 0.08
321 0.08
322 0.11
323 0.15
324 0.16
325 0.17
326 0.21
327 0.23
328 0.24
329 0.23
330 0.2
331 0.17
332 0.17
333 0.17
334 0.15
335 0.16
336 0.15
337 0.16
338 0.17
339 0.16
340 0.13
341 0.14
342 0.13
343 0.11
344 0.12
345 0.13
346 0.12
347 0.17
348 0.18
349 0.19
350 0.22
351 0.24
352 0.23
353 0.22
354 0.22
355 0.17
356 0.16
357 0.14
358 0.09
359 0.07
360 0.08
361 0.08
362 0.08
363 0.09
364 0.1
365 0.09
366 0.09
367 0.1
368 0.14
369 0.17
370 0.21
371 0.28
372 0.34
373 0.35
374 0.38
375 0.37
376 0.33
377 0.32
378 0.3
379 0.25
380 0.2
381 0.19
382 0.17
383 0.19
384 0.19
385 0.17
386 0.14
387 0.13
388 0.1
389 0.11
390 0.12
391 0.12
392 0.18
393 0.2
394 0.22
395 0.26
396 0.28
397 0.32
398 0.31
399 0.31
400 0.27
401 0.27
402 0.26
403 0.21
404 0.2
405 0.15
406 0.14
407 0.11
408 0.1
409 0.07
410 0.06
411 0.06
412 0.05
413 0.06
414 0.06
415 0.06
416 0.08
417 0.09
418 0.1
419 0.11
420 0.1
421 0.11
422 0.11
423 0.1
424 0.09
425 0.08
426 0.08
427 0.07
428 0.07
429 0.06
430 0.06
431 0.05
432 0.05
433 0.04
434 0.03
435 0.03
436 0.03
437 0.03
438 0.03
439 0.03
440 0.03
441 0.03
442 0.03
443 0.04
444 0.04
445 0.04
446 0.04
447 0.04
448 0.03
449 0.03
450 0.03
451 0.03
452 0.02
453 0.02
454 0.03
455 0.03
456 0.03
457 0.03
458 0.03
459 0.04
460 0.04
461 0.05
462 0.04
463 0.04
464 0.05
465 0.06
466 0.05
467 0.05
468 0.05
469 0.07
470 0.07
471 0.07
472 0.07
473 0.06
474 0.07
475 0.07
476 0.07
477 0.05
478 0.05
479 0.06
480 0.09
481 0.11
482 0.11
483 0.11
484 0.12
485 0.12
486 0.12
487 0.11
488 0.12
489 0.14
490 0.17
491 0.17
492 0.17
493 0.19
494 0.23
495 0.29
496 0.27
497 0.25
498 0.27
499 0.29
500 0.29
501 0.3
502 0.29
503 0.25
504 0.3
505 0.31
506 0.27
507 0.25
508 0.25
509 0.26
510 0.26
511 0.28
512 0.21
513 0.19
514 0.18
515 0.17
516 0.17
517 0.16
518 0.17
519 0.14
520 0.17
521 0.21
522 0.2
523 0.21
524 0.22
525 0.25
526 0.24
527 0.24
528 0.22
529 0.2
530 0.22
531 0.22
532 0.27
533 0.23
534 0.21
535 0.23
536 0.26
537 0.25
538 0.23
539 0.23
540 0.18
541 0.16
542 0.18
543 0.14
544 0.11
545 0.11
546 0.11
547 0.13
548 0.12
549 0.13
550 0.12
551 0.12
552 0.11
553 0.12
554 0.13
555 0.11
556 0.12
557 0.12
558 0.16
559 0.17
560 0.17
561 0.15
562 0.14
563 0.13
564 0.12
565 0.11
566 0.08
567 0.06
568 0.07
569 0.11
570 0.11
571 0.11
572 0.14
573 0.15
574 0.15
575 0.17
576 0.17
577 0.15
578 0.22
579 0.23
580 0.24
581 0.24
582 0.24
583 0.24
584 0.24
585 0.25
586 0.22
587 0.22
588 0.22
589 0.22
590 0.22
591 0.23
592 0.21
593 0.22
594 0.19
595 0.19
596 0.17
597 0.21
598 0.2
599 0.2
600 0.22
601 0.22
602 0.24
603 0.26
604 0.27
605 0.27
606 0.26
607 0.25
608 0.27
609 0.23
610 0.21
611 0.18
612 0.15
613 0.1
614 0.11
615 0.12
616 0.09
617 0.11
618 0.13
619 0.13
620 0.16
621 0.16
622 0.19
623 0.2
624 0.22
625 0.2
626 0.17
627 0.19
628 0.17
629 0.16
630 0.13
631 0.14
632 0.11
633 0.11
634 0.12
635 0.11
636 0.12
637 0.14
638 0.17
639 0.14
640 0.15
641 0.15
642 0.17
643 0.17
644 0.16
645 0.16
646 0.16
647 0.19
648 0.2
649 0.24
650 0.23
651 0.24
652 0.24
653 0.23
654 0.22
655 0.21
656 0.19
657 0.15
658 0.14
659 0.13
660 0.12
661 0.11
662 0.11
663 0.1
664 0.1
665 0.11
666 0.12
667 0.13
668 0.14
669 0.13
670 0.13
671 0.15
672 0.16
673 0.2
674 0.18
675 0.18
676 0.17
677 0.17
678 0.16
679 0.12
680 0.1
681 0.06
682 0.06
683 0.05
684 0.06
685 0.06
686 0.06
687 0.08
688 0.08
689 0.08
690 0.11
691 0.11
692 0.15
693 0.17
694 0.17
695 0.18
696 0.18
697 0.2
698 0.17
699 0.2
700 0.18
701 0.2
702 0.22
703 0.25
704 0.26
705 0.27
706 0.33
707 0.4
708 0.41
709 0.38
710 0.43
711 0.45
712 0.51
713 0.55
714 0.52
715 0.5
716 0.54
717 0.57
718 0.54
719 0.54
720 0.48
721 0.42
722 0.46
723 0.43
724 0.38
725 0.38
726 0.39
727 0.37
728 0.38
729 0.41
730 0.38
731 0.41
732 0.42
733 0.43
734 0.4
735 0.41
736 0.43
737 0.4
738 0.36
739 0.3
740 0.29
741 0.24
742 0.23
743 0.19
744 0.14
745 0.15
746 0.16
747 0.16
748 0.17
749 0.26
750 0.34
751 0.42
752 0.45
753 0.47
754 0.53
755 0.6
756 0.65
757 0.65
758 0.65
759 0.66
760 0.68
761 0.71
762 0.69
763 0.65
764 0.61
765 0.6
766 0.62
767 0.61
768 0.63
769 0.64
770 0.67
771 0.74
772 0.76
773 0.77
774 0.75
775 0.71
776 0.67
777 0.66
778 0.63
779 0.56
780 0.5
781 0.47
782 0.41
783 0.44