Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5M6C5X0

Protein Details
Accession A0A5M6C5X0    Localization Confidence Low Confidence Score 8.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
142-165EEARAKREKRAKAKAEKERAKRAABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
127-164IRRRAASKAEFEKAGEEARAKREKRAKAKAEKERAKRA
Subcellular Location(s) mito 20, cyto 3, nucl 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011856  tRNA_endonuc-like_dom_sf  
IPR036167  tRNA_intron_Endo_cat-like_sf  
IPR006677  tRNA_intron_Endonuc_cat-like  
IPR016690  tRNA_splic_SEN34  
Gene Ontology GO:0000214  C:tRNA-intron endonuclease complex  
GO:0016829  F:lyase activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000213  F:tRNA-intron endonuclease activity  
GO:0000379  P:tRNA-type intron splice site recognition and cleavage  
Pfam View protein in Pfam  
PF01974  tRNA_int_endo  
CDD cd22363  tRNA-intron_lyase_C  
cd22265  UDM1_RNF168  
Amino Acid Sequences MASIPKNGEPSTRQRTAPKDGSIALYLVNGVATVWDAQVAATLHCVHSVSGLRAGTLPGVSQQNGFLGLPLTLMQEETAYLVTQGIAHLIPLSLNPTVPSPSEIAQHTAARIKRVQALEQRAKEDEIRRRAASKAEFEKAGEEARAKREKRAKAKAEKERAKRAAEAGDEGGEGLFGGDERKDVTTKENDNTETSKSTLPTKVTASTPAVSAPVPDSTPSPGYFHTVPSHPVHSTTSSSQNVITTLPHPLFPFPTTPRDHALLGVFTTLQSLNLRMGLGPRFGGEYLIYPGDYLRYHAHFTSQVIVRDEPIRPAEIVAWGRLGTGTKKAGLICCWDDGQRGDKVQLRGDEEKKAEVEFYSLEWANFG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.59
3 0.63
4 0.65
5 0.59
6 0.54
7 0.51
8 0.5
9 0.44
10 0.37
11 0.28
12 0.21
13 0.17
14 0.13
15 0.1
16 0.07
17 0.05
18 0.05
19 0.05
20 0.06
21 0.05
22 0.06
23 0.06
24 0.06
25 0.09
26 0.1
27 0.09
28 0.11
29 0.12
30 0.12
31 0.13
32 0.14
33 0.1
34 0.14
35 0.17
36 0.16
37 0.2
38 0.2
39 0.19
40 0.19
41 0.2
42 0.17
43 0.14
44 0.12
45 0.12
46 0.15
47 0.15
48 0.15
49 0.15
50 0.14
51 0.16
52 0.15
53 0.12
54 0.09
55 0.09
56 0.08
57 0.08
58 0.09
59 0.07
60 0.07
61 0.07
62 0.06
63 0.06
64 0.07
65 0.07
66 0.06
67 0.06
68 0.06
69 0.06
70 0.06
71 0.06
72 0.06
73 0.05
74 0.05
75 0.06
76 0.05
77 0.05
78 0.05
79 0.08
80 0.07
81 0.08
82 0.08
83 0.09
84 0.11
85 0.11
86 0.13
87 0.12
88 0.13
89 0.16
90 0.16
91 0.18
92 0.2
93 0.2
94 0.19
95 0.23
96 0.24
97 0.24
98 0.25
99 0.24
100 0.27
101 0.28
102 0.33
103 0.35
104 0.43
105 0.48
106 0.49
107 0.49
108 0.44
109 0.44
110 0.43
111 0.43
112 0.42
113 0.4
114 0.42
115 0.4
116 0.41
117 0.41
118 0.43
119 0.39
120 0.38
121 0.36
122 0.34
123 0.33
124 0.32
125 0.31
126 0.26
127 0.23
128 0.17
129 0.14
130 0.14
131 0.21
132 0.29
133 0.28
134 0.35
135 0.42
136 0.49
137 0.57
138 0.64
139 0.67
140 0.69
141 0.78
142 0.81
143 0.83
144 0.83
145 0.8
146 0.8
147 0.76
148 0.68
149 0.59
150 0.51
151 0.44
152 0.36
153 0.3
154 0.21
155 0.16
156 0.14
157 0.12
158 0.1
159 0.06
160 0.05
161 0.03
162 0.02
163 0.02
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.04
168 0.05
169 0.06
170 0.07
171 0.1
172 0.15
173 0.18
174 0.2
175 0.22
176 0.23
177 0.24
178 0.26
179 0.24
180 0.2
181 0.19
182 0.18
183 0.16
184 0.18
185 0.19
186 0.19
187 0.19
188 0.19
189 0.2
190 0.19
191 0.21
192 0.2
193 0.18
194 0.17
195 0.15
196 0.14
197 0.11
198 0.11
199 0.09
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.09
204 0.1
205 0.12
206 0.12
207 0.13
208 0.12
209 0.16
210 0.16
211 0.18
212 0.18
213 0.18
214 0.2
215 0.21
216 0.23
217 0.2
218 0.21
219 0.2
220 0.2
221 0.22
222 0.21
223 0.26
224 0.24
225 0.24
226 0.23
227 0.22
228 0.2
229 0.18
230 0.16
231 0.1
232 0.14
233 0.13
234 0.14
235 0.14
236 0.15
237 0.17
238 0.17
239 0.21
240 0.2
241 0.26
242 0.28
243 0.3
244 0.33
245 0.33
246 0.32
247 0.28
248 0.27
249 0.21
250 0.17
251 0.15
252 0.12
253 0.09
254 0.1
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.09
259 0.09
260 0.1
261 0.1
262 0.09
263 0.12
264 0.13
265 0.13
266 0.12
267 0.12
268 0.12
269 0.12
270 0.13
271 0.1
272 0.1
273 0.12
274 0.12
275 0.12
276 0.1
277 0.1
278 0.12
279 0.12
280 0.13
281 0.15
282 0.17
283 0.19
284 0.2
285 0.23
286 0.22
287 0.23
288 0.28
289 0.28
290 0.29
291 0.3
292 0.3
293 0.3
294 0.32
295 0.31
296 0.28
297 0.26
298 0.23
299 0.2
300 0.21
301 0.19
302 0.22
303 0.23
304 0.19
305 0.19
306 0.17
307 0.17
308 0.17
309 0.18
310 0.13
311 0.17
312 0.19
313 0.19
314 0.22
315 0.24
316 0.26
317 0.26
318 0.3
319 0.27
320 0.28
321 0.28
322 0.27
323 0.28
324 0.28
325 0.3
326 0.28
327 0.27
328 0.3
329 0.34
330 0.36
331 0.39
332 0.41
333 0.44
334 0.48
335 0.49
336 0.52
337 0.48
338 0.48
339 0.44
340 0.39
341 0.34
342 0.26
343 0.25
344 0.18
345 0.17
346 0.19
347 0.19