Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5M6C9G4

Protein Details
Accession A0A5M6C9G4    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
284-310TYMNPNKRGRGRPKGSKNKPRANPIPRHydrophilic
313-336KPPGPPPRPKGRPPKQRDPDEQADBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
289-329NKRGRGRPKGSKNKPRANPIPRPPKPPGPPPRPKGRPPKQR
340-360RKQEKALGIKRQKGRPRKFPG
Subcellular Location(s) extr 9, nucl 8, mito 4, cyto 2, golg 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000116  HMGA  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Amino Acid Sequences MSRHRHGQQQQQHQSAVQQIINSTLNESQLDPSLFILAAQVQAEAQAQAQAQAAAAAVASGAAGGGGDADFGIGVGVGVNGGDGGGGVPIDPALFQIEEVVNDVRRGRIRLDDVDTTTTQQGEQHQQDGNGTLDGGSGAVENGGLALDDEIDPTLREIVNSLTNAQQSSHTAGPGMSHAQAAAAIGAHLTDAEERERLQQSLQTTLEDLTQETFSSLFPNNFPQSPSQNYLNLNHDPDAEHHVHDDNSQAGPSSSHLPDTPNDGSLDHHSNHHLDSLPLTPRTTYMNPNKRGRGRPKGSKNKPRANPIPRPPKPPGPPPRPKGRPPKQRDPDEQADYELRKQEKALGIKRQKGRPRKFPGYLVREMRLKKNREEFNELLRSYDQSGMPHHLGSGSDGGSGLEGGEYDQEMMLQGLAAAGAQHLDVDENGNEHVHVHEEHDFSNWSNLPDGQTLLDVVGVGVGVGVGVGVGVGGHHGMVDVDVGMNDESGHGQDGMEGVFGLSHHGVGH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.54
3 0.49
4 0.4
5 0.31
6 0.26
7 0.29
8 0.3
9 0.27
10 0.23
11 0.2
12 0.2
13 0.2
14 0.21
15 0.18
16 0.2
17 0.21
18 0.19
19 0.17
20 0.17
21 0.16
22 0.14
23 0.13
24 0.1
25 0.1
26 0.1
27 0.09
28 0.08
29 0.09
30 0.1
31 0.09
32 0.08
33 0.09
34 0.09
35 0.11
36 0.11
37 0.11
38 0.1
39 0.1
40 0.09
41 0.06
42 0.06
43 0.04
44 0.03
45 0.03
46 0.03
47 0.02
48 0.02
49 0.02
50 0.02
51 0.02
52 0.02
53 0.02
54 0.03
55 0.03
56 0.03
57 0.03
58 0.03
59 0.03
60 0.02
61 0.02
62 0.03
63 0.03
64 0.03
65 0.03
66 0.03
67 0.02
68 0.02
69 0.02
70 0.02
71 0.02
72 0.03
73 0.03
74 0.03
75 0.03
76 0.03
77 0.04
78 0.03
79 0.04
80 0.06
81 0.06
82 0.06
83 0.09
84 0.09
85 0.09
86 0.12
87 0.14
88 0.12
89 0.14
90 0.15
91 0.16
92 0.19
93 0.21
94 0.2
95 0.25
96 0.29
97 0.32
98 0.37
99 0.36
100 0.36
101 0.38
102 0.36
103 0.33
104 0.29
105 0.24
106 0.19
107 0.18
108 0.2
109 0.24
110 0.25
111 0.27
112 0.27
113 0.27
114 0.28
115 0.28
116 0.24
117 0.16
118 0.14
119 0.1
120 0.08
121 0.08
122 0.07
123 0.05
124 0.04
125 0.04
126 0.03
127 0.03
128 0.03
129 0.03
130 0.03
131 0.03
132 0.03
133 0.03
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.09
146 0.12
147 0.13
148 0.14
149 0.14
150 0.15
151 0.16
152 0.16
153 0.15
154 0.14
155 0.17
156 0.16
157 0.14
158 0.13
159 0.13
160 0.13
161 0.13
162 0.13
163 0.09
164 0.08
165 0.08
166 0.08
167 0.08
168 0.07
169 0.06
170 0.04
171 0.03
172 0.03
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.04
179 0.06
180 0.06
181 0.07
182 0.12
183 0.14
184 0.14
185 0.14
186 0.16
187 0.16
188 0.2
189 0.2
190 0.16
191 0.15
192 0.15
193 0.16
194 0.13
195 0.12
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.07
200 0.07
201 0.06
202 0.09
203 0.1
204 0.09
205 0.1
206 0.15
207 0.16
208 0.17
209 0.18
210 0.18
211 0.21
212 0.24
213 0.27
214 0.24
215 0.26
216 0.27
217 0.29
218 0.31
219 0.29
220 0.26
221 0.23
222 0.21
223 0.18
224 0.18
225 0.2
226 0.16
227 0.15
228 0.14
229 0.15
230 0.14
231 0.14
232 0.13
233 0.09
234 0.09
235 0.08
236 0.08
237 0.07
238 0.07
239 0.08
240 0.11
241 0.09
242 0.1
243 0.11
244 0.12
245 0.12
246 0.18
247 0.17
248 0.14
249 0.15
250 0.14
251 0.15
252 0.17
253 0.2
254 0.15
255 0.15
256 0.15
257 0.16
258 0.16
259 0.16
260 0.13
261 0.1
262 0.11
263 0.13
264 0.15
265 0.15
266 0.15
267 0.13
268 0.14
269 0.18
270 0.19
271 0.24
272 0.31
273 0.4
274 0.47
275 0.53
276 0.59
277 0.62
278 0.68
279 0.69
280 0.7
281 0.69
282 0.72
283 0.77
284 0.81
285 0.85
286 0.86
287 0.87
288 0.86
289 0.84
290 0.83
291 0.82
292 0.79
293 0.78
294 0.78
295 0.8
296 0.74
297 0.75
298 0.71
299 0.7
300 0.67
301 0.67
302 0.68
303 0.67
304 0.73
305 0.71
306 0.77
307 0.75
308 0.78
309 0.79
310 0.79
311 0.8
312 0.79
313 0.85
314 0.84
315 0.85
316 0.84
317 0.81
318 0.78
319 0.72
320 0.63
321 0.55
322 0.49
323 0.42
324 0.37
325 0.34
326 0.27
327 0.23
328 0.23
329 0.25
330 0.28
331 0.34
332 0.38
333 0.43
334 0.49
335 0.57
336 0.64
337 0.67
338 0.7
339 0.73
340 0.76
341 0.76
342 0.78
343 0.79
344 0.76
345 0.76
346 0.78
347 0.74
348 0.73
349 0.67
350 0.6
351 0.57
352 0.56
353 0.57
354 0.55
355 0.52
356 0.52
357 0.57
358 0.6
359 0.6
360 0.67
361 0.59
362 0.59
363 0.63
364 0.55
365 0.48
366 0.42
367 0.37
368 0.3
369 0.32
370 0.24
371 0.18
372 0.21
373 0.24
374 0.24
375 0.22
376 0.2
377 0.17
378 0.16
379 0.16
380 0.15
381 0.1
382 0.1
383 0.1
384 0.09
385 0.09
386 0.08
387 0.06
388 0.04
389 0.04
390 0.04
391 0.04
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.05
397 0.05
398 0.05
399 0.04
400 0.04
401 0.03
402 0.03
403 0.03
404 0.03
405 0.03
406 0.03
407 0.03
408 0.03
409 0.03
410 0.04
411 0.05
412 0.07
413 0.07
414 0.08
415 0.09
416 0.09
417 0.09
418 0.09
419 0.1
420 0.1
421 0.1
422 0.12
423 0.17
424 0.18
425 0.19
426 0.2
427 0.21
428 0.2
429 0.25
430 0.24
431 0.2
432 0.2
433 0.21
434 0.22
435 0.22
436 0.22
437 0.16
438 0.15
439 0.14
440 0.12
441 0.11
442 0.08
443 0.06
444 0.05
445 0.04
446 0.04
447 0.03
448 0.03
449 0.02
450 0.02
451 0.02
452 0.02
453 0.02
454 0.02
455 0.01
456 0.02
457 0.02
458 0.02
459 0.03
460 0.03
461 0.03
462 0.03
463 0.04
464 0.04
465 0.05
466 0.04
467 0.05
468 0.05
469 0.07
470 0.07
471 0.07
472 0.07
473 0.07
474 0.07
475 0.08
476 0.1
477 0.09
478 0.08
479 0.09
480 0.1
481 0.09
482 0.09
483 0.08
484 0.06
485 0.06
486 0.06
487 0.1
488 0.09