Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VV19

Protein Details
Accession H1VV19    Localization Confidence High Confidence Score 20
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
117-141PAPVEEKKERKKRTHDPNAPKRPLTBasic
266-287APAPVKTPKKPASTRKRKTATPHydrophilic
293-318AKNTGTPASPDKKRRRTSTKVADAVEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
123-131KKERKKRTH
271-288KTPKKPASTRKRKTATPA
301-308SPDKKRRR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 10.833, cyto_mito 7.333, cyto 7, mito 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MPRPSKKAATEAPKPPVAAVPVAPAQPVQPLQIPQRHIDVEGFIRVRDSVHQRLITILELIKNFSEDYYRQTSLLLGESANDGIPGIDHPLVNLEHAVAQNIAPLALGLPGGAAYLPAPVEEKKERKKRTHDPNAPKRPLTPYFLYMQTARPIIALDLGDAAPKGAVQEEGQRRWKAMNPAEKAGWNNAYQYNLRLYQARVHAYKQGGNSEARLMDDDAALKYAEEHNIQINPVDVVPDVEDAIAEQLNQANTVDAPGEDEEEDEAPAPVKTPKKPASTRKRKTATPAAEAEAKNTGTPASPDKKRRRTSTKVADAVEPAEPAKNEQS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.52
3 0.47
4 0.4
5 0.33
6 0.25
7 0.23
8 0.23
9 0.23
10 0.22
11 0.19
12 0.17
13 0.19
14 0.19
15 0.17
16 0.18
17 0.22
18 0.29
19 0.34
20 0.37
21 0.34
22 0.39
23 0.37
24 0.35
25 0.31
26 0.28
27 0.24
28 0.28
29 0.26
30 0.21
31 0.21
32 0.2
33 0.2
34 0.23
35 0.28
36 0.28
37 0.34
38 0.35
39 0.34
40 0.36
41 0.36
42 0.3
43 0.25
44 0.2
45 0.17
46 0.16
47 0.17
48 0.16
49 0.15
50 0.14
51 0.13
52 0.15
53 0.12
54 0.18
55 0.23
56 0.24
57 0.23
58 0.23
59 0.23
60 0.21
61 0.22
62 0.17
63 0.1
64 0.09
65 0.1
66 0.1
67 0.09
68 0.08
69 0.06
70 0.05
71 0.05
72 0.05
73 0.07
74 0.08
75 0.08
76 0.08
77 0.11
78 0.11
79 0.11
80 0.11
81 0.08
82 0.09
83 0.1
84 0.1
85 0.08
86 0.08
87 0.09
88 0.08
89 0.08
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.05
94 0.05
95 0.03
96 0.03
97 0.03
98 0.03
99 0.03
100 0.03
101 0.03
102 0.03
103 0.03
104 0.04
105 0.06
106 0.06
107 0.11
108 0.18
109 0.25
110 0.35
111 0.45
112 0.52
113 0.59
114 0.68
115 0.73
116 0.78
117 0.82
118 0.83
119 0.84
120 0.88
121 0.9
122 0.85
123 0.75
124 0.66
125 0.62
126 0.54
127 0.48
128 0.4
129 0.31
130 0.3
131 0.3
132 0.29
133 0.24
134 0.22
135 0.19
136 0.17
137 0.14
138 0.12
139 0.11
140 0.09
141 0.09
142 0.07
143 0.05
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.05
148 0.05
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.03
153 0.04
154 0.04
155 0.12
156 0.17
157 0.21
158 0.27
159 0.27
160 0.28
161 0.29
162 0.32
163 0.32
164 0.34
165 0.39
166 0.36
167 0.38
168 0.39
169 0.39
170 0.36
171 0.31
172 0.27
173 0.18
174 0.18
175 0.16
176 0.18
177 0.17
178 0.17
179 0.17
180 0.16
181 0.17
182 0.16
183 0.16
184 0.19
185 0.23
186 0.26
187 0.24
188 0.24
189 0.28
190 0.28
191 0.3
192 0.27
193 0.25
194 0.23
195 0.23
196 0.22
197 0.19
198 0.18
199 0.15
200 0.14
201 0.12
202 0.11
203 0.1
204 0.11
205 0.09
206 0.09
207 0.09
208 0.07
209 0.08
210 0.09
211 0.11
212 0.1
213 0.11
214 0.13
215 0.14
216 0.14
217 0.13
218 0.12
219 0.11
220 0.1
221 0.1
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.06
228 0.06
229 0.05
230 0.07
231 0.06
232 0.05
233 0.05
234 0.07
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.06
243 0.08
244 0.08
245 0.09
246 0.09
247 0.09
248 0.1
249 0.1
250 0.1
251 0.08
252 0.08
253 0.08
254 0.08
255 0.09
256 0.13
257 0.18
258 0.22
259 0.31
260 0.39
261 0.47
262 0.57
263 0.67
264 0.72
265 0.78
266 0.84
267 0.85
268 0.84
269 0.79
270 0.79
271 0.79
272 0.74
273 0.69
274 0.64
275 0.57
276 0.58
277 0.53
278 0.46
279 0.4
280 0.33
281 0.26
282 0.23
283 0.2
284 0.14
285 0.17
286 0.23
287 0.27
288 0.36
289 0.46
290 0.57
291 0.67
292 0.75
293 0.83
294 0.84
295 0.85
296 0.87
297 0.88
298 0.87
299 0.84
300 0.77
301 0.7
302 0.62
303 0.55
304 0.45
305 0.35
306 0.25
307 0.22
308 0.2