Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A544ZX19

Protein Details
Accession A0A544ZX19    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
368-388DELERKAARADEKKRRQQGGSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
376-383RADEKKRR
394-400GKKSKRR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013953  FACT_Spt16  
IPR011993  PH-like_dom_sf  
IPR013719  RTT106/SPT16-like_middle_dom  
IPR040258  Spt16  
Gene Ontology GO:0035101  C:FACT complex  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF08512  Rtt106  
PF08644  SPT16  
Amino Acid Sequences MKRDSVKKEQEKKDMEDVVEQDKLVEIRNRRPAVLDNVFIRPAHEGKRVAGKVEIHQNGLRYQSPLNAQHRVDVLFSNIKHLFFQPCAHELIVIIHIHLKDPIIVGNKKKTKDVQFYREASDVQFDETGNRKRKYRSGDEDEIELEQEERRRRSQLNKEFKVFAERIAEASEGRVSVDVPYRELGFNGVPFRTNVLLQPTTDCLVHLTDPPFLVITLTDVEIVHLERVQFGLQSFDMVFVFSDFSRAPMHVTSIPTTSLDDVKQWLDSVDICVSEGAVNLNWGAIMKTVNEDPYDFFVEGGWGFLQGDSDDEGSDQSESGSEFGSDMDDGQEETDVESDSGSDFGDSAEDESGSDGFEDESEEGEDWDELERKAARADEKKRRQQGGSDDEDSGKKSKRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.64
3 0.59
4 0.53
5 0.47
6 0.42
7 0.36
8 0.27
9 0.24
10 0.23
11 0.22
12 0.25
13 0.27
14 0.34
15 0.44
16 0.46
17 0.44
18 0.47
19 0.48
20 0.51
21 0.5
22 0.46
23 0.39
24 0.41
25 0.42
26 0.39
27 0.34
28 0.29
29 0.27
30 0.28
31 0.31
32 0.29
33 0.31
34 0.41
35 0.41
36 0.39
37 0.39
38 0.37
39 0.36
40 0.44
41 0.43
42 0.37
43 0.38
44 0.38
45 0.36
46 0.37
47 0.32
48 0.25
49 0.23
50 0.24
51 0.29
52 0.35
53 0.38
54 0.41
55 0.4
56 0.41
57 0.42
58 0.38
59 0.33
60 0.25
61 0.25
62 0.23
63 0.23
64 0.27
65 0.26
66 0.26
67 0.26
68 0.28
69 0.27
70 0.23
71 0.27
72 0.24
73 0.24
74 0.26
75 0.25
76 0.22
77 0.19
78 0.19
79 0.18
80 0.14
81 0.13
82 0.14
83 0.14
84 0.14
85 0.14
86 0.12
87 0.1
88 0.1
89 0.14
90 0.17
91 0.22
92 0.26
93 0.35
94 0.41
95 0.42
96 0.46
97 0.5
98 0.52
99 0.59
100 0.63
101 0.61
102 0.63
103 0.64
104 0.63
105 0.57
106 0.49
107 0.39
108 0.33
109 0.25
110 0.19
111 0.17
112 0.13
113 0.15
114 0.21
115 0.29
116 0.34
117 0.37
118 0.39
119 0.43
120 0.49
121 0.54
122 0.57
123 0.58
124 0.58
125 0.63
126 0.6
127 0.57
128 0.52
129 0.44
130 0.34
131 0.24
132 0.16
133 0.1
134 0.14
135 0.18
136 0.2
137 0.22
138 0.26
139 0.3
140 0.39
141 0.48
142 0.54
143 0.6
144 0.62
145 0.63
146 0.61
147 0.57
148 0.54
149 0.44
150 0.35
151 0.28
152 0.23
153 0.2
154 0.19
155 0.19
156 0.12
157 0.13
158 0.11
159 0.07
160 0.07
161 0.06
162 0.06
163 0.07
164 0.11
165 0.11
166 0.11
167 0.12
168 0.13
169 0.13
170 0.13
171 0.13
172 0.09
173 0.1
174 0.11
175 0.11
176 0.1
177 0.1
178 0.12
179 0.11
180 0.11
181 0.1
182 0.13
183 0.14
184 0.14
185 0.15
186 0.14
187 0.14
188 0.14
189 0.13
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.11
194 0.11
195 0.11
196 0.11
197 0.11
198 0.1
199 0.09
200 0.09
201 0.06
202 0.06
203 0.05
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.07
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.05
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.08
219 0.07
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.08
224 0.07
225 0.07
226 0.05
227 0.07
228 0.06
229 0.08
230 0.07
231 0.08
232 0.09
233 0.09
234 0.1
235 0.1
236 0.13
237 0.14
238 0.16
239 0.16
240 0.16
241 0.16
242 0.15
243 0.16
244 0.14
245 0.13
246 0.12
247 0.11
248 0.12
249 0.12
250 0.12
251 0.11
252 0.1
253 0.09
254 0.09
255 0.1
256 0.1
257 0.09
258 0.09
259 0.08
260 0.09
261 0.08
262 0.08
263 0.06
264 0.05
265 0.06
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.06
274 0.08
275 0.09
276 0.1
277 0.11
278 0.12
279 0.12
280 0.15
281 0.18
282 0.16
283 0.15
284 0.14
285 0.14
286 0.13
287 0.12
288 0.09
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.07
293 0.06
294 0.07
295 0.07
296 0.08
297 0.07
298 0.07
299 0.08
300 0.08
301 0.08
302 0.07
303 0.06
304 0.06
305 0.06
306 0.07
307 0.07
308 0.06
309 0.06
310 0.06
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.07
315 0.07
316 0.07
317 0.07
318 0.08
319 0.07
320 0.07
321 0.08
322 0.08
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.07
327 0.07
328 0.06
329 0.06
330 0.05
331 0.05
332 0.06
333 0.06
334 0.07
335 0.07
336 0.07
337 0.07
338 0.08
339 0.08
340 0.08
341 0.08
342 0.07
343 0.06
344 0.06
345 0.08
346 0.07
347 0.08
348 0.1
349 0.1
350 0.1
351 0.1
352 0.1
353 0.09
354 0.12
355 0.13
356 0.12
357 0.16
358 0.18
359 0.18
360 0.21
361 0.25
362 0.31
363 0.38
364 0.49
365 0.56
366 0.65
367 0.74
368 0.81
369 0.84
370 0.78
371 0.76
372 0.76
373 0.74
374 0.71
375 0.64
376 0.57
377 0.53
378 0.51
379 0.46
380 0.42