Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VMR0

Protein Details
Accession H1VMR0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
77-98KAGAATKPPKEKKKAGKKEELTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
57-95KKALKAKAGAATKGKAPSKTKAGAATKPPKEKKKAGKKE
204-213RRITGRRAPR
Subcellular Location(s) mito 20.5, cyto_mito 11, nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
KEGG chig:CH63R_00638  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09011  HMG_box_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd00084  HMG-box_SF  
Amino Acid Sequences MLTGIGRAAAQRLLIRTAFLASPRTQPLFRVTYRSFSTSRWASLPAAKASSTTTETKKALKAKAGAATKGKAPSKTKAGAATKPPKEKKKAGKKEELTSEQMQKIKVKEHKKLALLPNPKKLPNSAWTVYITERANDPELAIDLESRAKLNSESYRNLSSYELQRLEEKAKENRLANIATYKTWVESHTPIAVAEANRARANIRRITGRRAPRPIHDERQPKRSSTAFIMFVKARWDTGDFSGVDPVVANRQISEQWNALPESEKEPYKQLAKADYERWERDSFHTLGRVIVKS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.19
3 0.18
4 0.2
5 0.19
6 0.18
7 0.21
8 0.19
9 0.25
10 0.29
11 0.32
12 0.31
13 0.31
14 0.36
15 0.38
16 0.38
17 0.41
18 0.38
19 0.41
20 0.44
21 0.46
22 0.41
23 0.36
24 0.43
25 0.37
26 0.38
27 0.32
28 0.32
29 0.29
30 0.33
31 0.37
32 0.31
33 0.3
34 0.27
35 0.26
36 0.25
37 0.26
38 0.24
39 0.24
40 0.24
41 0.28
42 0.31
43 0.34
44 0.38
45 0.41
46 0.42
47 0.43
48 0.43
49 0.42
50 0.48
51 0.47
52 0.45
53 0.42
54 0.4
55 0.38
56 0.41
57 0.39
58 0.38
59 0.39
60 0.4
61 0.43
62 0.45
63 0.44
64 0.45
65 0.46
66 0.46
67 0.51
68 0.56
69 0.56
70 0.63
71 0.69
72 0.69
73 0.71
74 0.75
75 0.76
76 0.77
77 0.81
78 0.8
79 0.82
80 0.79
81 0.79
82 0.78
83 0.72
84 0.66
85 0.59
86 0.56
87 0.49
88 0.46
89 0.4
90 0.36
91 0.33
92 0.35
93 0.39
94 0.41
95 0.45
96 0.51
97 0.55
98 0.54
99 0.6
100 0.6
101 0.6
102 0.63
103 0.61
104 0.61
105 0.59
106 0.58
107 0.51
108 0.45
109 0.4
110 0.35
111 0.36
112 0.28
113 0.27
114 0.26
115 0.27
116 0.26
117 0.27
118 0.22
119 0.16
120 0.16
121 0.15
122 0.15
123 0.13
124 0.13
125 0.08
126 0.09
127 0.08
128 0.07
129 0.06
130 0.05
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.05
135 0.06
136 0.06
137 0.1
138 0.14
139 0.17
140 0.2
141 0.23
142 0.25
143 0.25
144 0.25
145 0.23
146 0.21
147 0.21
148 0.24
149 0.22
150 0.2
151 0.22
152 0.22
153 0.23
154 0.23
155 0.24
156 0.24
157 0.27
158 0.31
159 0.31
160 0.31
161 0.32
162 0.29
163 0.25
164 0.25
165 0.21
166 0.17
167 0.18
168 0.16
169 0.14
170 0.14
171 0.14
172 0.14
173 0.15
174 0.17
175 0.16
176 0.16
177 0.15
178 0.15
179 0.16
180 0.13
181 0.15
182 0.15
183 0.17
184 0.17
185 0.17
186 0.18
187 0.2
188 0.26
189 0.26
190 0.26
191 0.33
192 0.35
193 0.43
194 0.5
195 0.54
196 0.57
197 0.61
198 0.62
199 0.59
200 0.64
201 0.65
202 0.64
203 0.63
204 0.66
205 0.62
206 0.69
207 0.64
208 0.58
209 0.55
210 0.5
211 0.45
212 0.41
213 0.42
214 0.37
215 0.36
216 0.38
217 0.34
218 0.32
219 0.32
220 0.26
221 0.21
222 0.17
223 0.18
224 0.17
225 0.18
226 0.22
227 0.19
228 0.19
229 0.21
230 0.19
231 0.17
232 0.15
233 0.13
234 0.13
235 0.14
236 0.13
237 0.12
238 0.14
239 0.17
240 0.2
241 0.23
242 0.2
243 0.2
244 0.23
245 0.23
246 0.22
247 0.22
248 0.21
249 0.23
250 0.26
251 0.27
252 0.26
253 0.29
254 0.34
255 0.36
256 0.37
257 0.35
258 0.38
259 0.43
260 0.46
261 0.48
262 0.51
263 0.54
264 0.55
265 0.56
266 0.51
267 0.47
268 0.47
269 0.48
270 0.41
271 0.38
272 0.39
273 0.34
274 0.36