Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1V3N5

Protein Details
Accession H1V3N5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
619-643DDTSTTSAQSRRKKNKQPQEYIDEDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
411-458ARATAKRSTDDKARDKEAKATEREQERERKRQEKEAAKEQRAKEKERA
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 13.833, cyto 10, cyto_mito 5.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR042530  EME1/EME2_C  
IPR006166  ERCC4_domain  
IPR033310  Mms4/EME1/EME2  
IPR047521  XPF_nuclease_EME1_ascomycetes  
Gene Ontology GO:0048476  C:Holliday junction resolvase complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0051321  P:meiotic cell cycle  
KEGG chig:CH63R_10586  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02732  ERCC4  
CDD cd20085  XPF_nuclease_Mms4  
Amino Acid Sequences MAAEIISLLSSSPSVGDQPAPPPCRPAQPAVTAVTKALTYDDDDVFDLTADSPEFAPQSLPQPGPPEASRSPGTAPRAKRPREEQAPVTAPVYFNSDDFDTTVDLESSLPIDEDVHEGLRNTKRPRLSLSRSGSTTSINRSHPLADQPGHPPVKQSNGLRQVHTLADPIEFSSSPGIASRPGIASRPTTIAQVASEGPESDDPFAALPPSAQLPPSAQPVPSRESPPRVAPTAVVARIDYDLSSDDPFASSPRAPAKPASKPCPIVLDVDGDDDPFASSPRRVPVETMKFPTIGNTGNVIPNGKQKVASPRRKANWDPISSSAPEHKTRNDPFDSSPPPPRRTLTKAVSLVIDLSDSDSAPVNAVVDSDEEFPDLDNFDVTKLKARLDTQTTVSRGSSKTAPKPTAKSTSARATAKRSTDDKARDKEAKATEREQERERKRQEKEAAKEQRAKEKERAAALAEVNKIRTDKKVSTPEMIADLPSSLATAVTLQIQTLLKDLDVQSNTWDSPVGNVVKWRRKVASRFNDELNHWEPIPLRIEPDKFALVIVTADEFVTYALGPEGSDLEAHVLKMKRHFPKEQLIYLIEGLNPWMRKNRNVRNRQFASAVRNQGDEADADDTSTTSAQSRRKKNKQPQEYIDEDSVEDALLQLQVMHGVLIHHTNAAVETAQWVAIFTQHISTVPYRKQREATNAAGAGFCMETGQVRTGEDVKDTYVRMLQEIVRVTQPIAYGIVSEFGTVPELVRAFEERGPLCLENCRKSTNKDGGFSDRAVGKAVSKRICKVFTGRDEWSTDV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.11
3 0.14
4 0.16
5 0.22
6 0.32
7 0.36
8 0.35
9 0.39
10 0.41
11 0.47
12 0.48
13 0.49
14 0.46
15 0.47
16 0.51
17 0.49
18 0.49
19 0.41
20 0.37
21 0.31
22 0.25
23 0.19
24 0.16
25 0.13
26 0.13
27 0.16
28 0.17
29 0.17
30 0.18
31 0.18
32 0.17
33 0.15
34 0.13
35 0.09
36 0.1
37 0.09
38 0.09
39 0.09
40 0.11
41 0.12
42 0.11
43 0.12
44 0.13
45 0.18
46 0.23
47 0.24
48 0.25
49 0.29
50 0.31
51 0.34
52 0.33
53 0.35
54 0.3
55 0.35
56 0.34
57 0.31
58 0.34
59 0.35
60 0.41
61 0.41
62 0.45
63 0.5
64 0.59
65 0.61
66 0.65
67 0.67
68 0.71
69 0.73
70 0.75
71 0.68
72 0.68
73 0.67
74 0.6
75 0.53
76 0.44
77 0.35
78 0.28
79 0.29
80 0.2
81 0.16
82 0.17
83 0.17
84 0.16
85 0.16
86 0.16
87 0.12
88 0.12
89 0.13
90 0.11
91 0.1
92 0.09
93 0.09
94 0.09
95 0.08
96 0.07
97 0.06
98 0.07
99 0.08
100 0.1
101 0.1
102 0.11
103 0.11
104 0.12
105 0.19
106 0.25
107 0.32
108 0.34
109 0.4
110 0.43
111 0.46
112 0.53
113 0.56
114 0.58
115 0.6
116 0.63
117 0.63
118 0.6
119 0.59
120 0.52
121 0.46
122 0.41
123 0.38
124 0.37
125 0.32
126 0.33
127 0.32
128 0.33
129 0.31
130 0.33
131 0.33
132 0.29
133 0.3
134 0.32
135 0.39
136 0.4
137 0.37
138 0.35
139 0.32
140 0.37
141 0.41
142 0.4
143 0.42
144 0.49
145 0.52
146 0.5
147 0.48
148 0.44
149 0.39
150 0.36
151 0.27
152 0.18
153 0.16
154 0.15
155 0.13
156 0.13
157 0.11
158 0.11
159 0.11
160 0.11
161 0.1
162 0.11
163 0.11
164 0.1
165 0.1
166 0.12
167 0.12
168 0.13
169 0.15
170 0.16
171 0.18
172 0.19
173 0.22
174 0.2
175 0.19
176 0.19
177 0.18
178 0.16
179 0.16
180 0.14
181 0.11
182 0.11
183 0.1
184 0.11
185 0.12
186 0.13
187 0.12
188 0.11
189 0.1
190 0.1
191 0.1
192 0.09
193 0.08
194 0.07
195 0.06
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.09
200 0.11
201 0.14
202 0.19
203 0.19
204 0.18
205 0.21
206 0.24
207 0.28
208 0.29
209 0.32
210 0.32
211 0.36
212 0.38
213 0.41
214 0.42
215 0.39
216 0.36
217 0.31
218 0.32
219 0.31
220 0.29
221 0.23
222 0.19
223 0.18
224 0.18
225 0.18
226 0.12
227 0.08
228 0.08
229 0.09
230 0.1
231 0.09
232 0.08
233 0.09
234 0.09
235 0.09
236 0.11
237 0.1
238 0.13
239 0.19
240 0.2
241 0.21
242 0.27
243 0.32
244 0.39
245 0.46
246 0.49
247 0.49
248 0.49
249 0.49
250 0.48
251 0.42
252 0.36
253 0.29
254 0.26
255 0.2
256 0.2
257 0.18
258 0.14
259 0.13
260 0.1
261 0.09
262 0.06
263 0.07
264 0.06
265 0.07
266 0.1
267 0.14
268 0.17
269 0.17
270 0.2
271 0.29
272 0.37
273 0.4
274 0.42
275 0.39
276 0.37
277 0.36
278 0.35
279 0.28
280 0.2
281 0.16
282 0.14
283 0.14
284 0.15
285 0.15
286 0.14
287 0.14
288 0.18
289 0.2
290 0.18
291 0.18
292 0.19
293 0.3
294 0.39
295 0.48
296 0.49
297 0.56
298 0.61
299 0.67
300 0.67
301 0.66
302 0.64
303 0.58
304 0.53
305 0.48
306 0.45
307 0.39
308 0.38
309 0.33
310 0.28
311 0.29
312 0.28
313 0.28
314 0.33
315 0.35
316 0.4
317 0.37
318 0.35
319 0.34
320 0.4
321 0.41
322 0.36
323 0.43
324 0.43
325 0.44
326 0.44
327 0.43
328 0.41
329 0.43
330 0.48
331 0.42
332 0.44
333 0.42
334 0.41
335 0.39
336 0.33
337 0.27
338 0.18
339 0.15
340 0.07
341 0.06
342 0.05
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.05
347 0.06
348 0.06
349 0.05
350 0.04
351 0.05
352 0.04
353 0.05
354 0.06
355 0.07
356 0.07
357 0.07
358 0.07
359 0.07
360 0.07
361 0.07
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.05
366 0.07
367 0.07
368 0.12
369 0.13
370 0.14
371 0.16
372 0.17
373 0.2
374 0.23
375 0.25
376 0.23
377 0.27
378 0.27
379 0.25
380 0.24
381 0.23
382 0.19
383 0.19
384 0.21
385 0.21
386 0.27
387 0.32
388 0.36
389 0.37
390 0.4
391 0.43
392 0.45
393 0.42
394 0.38
395 0.36
396 0.38
397 0.41
398 0.4
399 0.37
400 0.35
401 0.38
402 0.38
403 0.37
404 0.33
405 0.3
406 0.35
407 0.4
408 0.42
409 0.42
410 0.45
411 0.45
412 0.44
413 0.48
414 0.48
415 0.45
416 0.41
417 0.4
418 0.41
419 0.41
420 0.44
421 0.42
422 0.45
423 0.46
424 0.52
425 0.56
426 0.59
427 0.57
428 0.63
429 0.67
430 0.66
431 0.66
432 0.67
433 0.68
434 0.66
435 0.7
436 0.63
437 0.64
438 0.59
439 0.57
440 0.53
441 0.5
442 0.48
443 0.42
444 0.41
445 0.33
446 0.32
447 0.29
448 0.26
449 0.22
450 0.19
451 0.18
452 0.18
453 0.17
454 0.15
455 0.18
456 0.2
457 0.21
458 0.28
459 0.37
460 0.38
461 0.4
462 0.39
463 0.37
464 0.34
465 0.3
466 0.22
467 0.14
468 0.11
469 0.09
470 0.08
471 0.07
472 0.04
473 0.04
474 0.04
475 0.04
476 0.04
477 0.05
478 0.05
479 0.05
480 0.08
481 0.09
482 0.09
483 0.09
484 0.09
485 0.08
486 0.1
487 0.11
488 0.14
489 0.14
490 0.14
491 0.15
492 0.16
493 0.16
494 0.14
495 0.14
496 0.08
497 0.09
498 0.13
499 0.13
500 0.12
501 0.17
502 0.25
503 0.32
504 0.35
505 0.37
506 0.37
507 0.42
508 0.49
509 0.55
510 0.58
511 0.58
512 0.58
513 0.59
514 0.58
515 0.52
516 0.5
517 0.42
518 0.34
519 0.26
520 0.24
521 0.21
522 0.2
523 0.22
524 0.17
525 0.17
526 0.2
527 0.21
528 0.21
529 0.23
530 0.21
531 0.18
532 0.18
533 0.15
534 0.11
535 0.09
536 0.08
537 0.06
538 0.05
539 0.05
540 0.05
541 0.05
542 0.04
543 0.05
544 0.04
545 0.04
546 0.04
547 0.04
548 0.04
549 0.04
550 0.05
551 0.05
552 0.05
553 0.05
554 0.07
555 0.08
556 0.08
557 0.13
558 0.15
559 0.17
560 0.23
561 0.31
562 0.37
563 0.43
564 0.48
565 0.48
566 0.56
567 0.6
568 0.57
569 0.52
570 0.45
571 0.4
572 0.36
573 0.32
574 0.21
575 0.15
576 0.14
577 0.14
578 0.13
579 0.13
580 0.2
581 0.21
582 0.29
583 0.4
584 0.49
585 0.56
586 0.66
587 0.73
588 0.76
589 0.78
590 0.74
591 0.68
592 0.61
593 0.59
594 0.55
595 0.54
596 0.44
597 0.4
598 0.37
599 0.33
600 0.3
601 0.22
602 0.16
603 0.12
604 0.1
605 0.1
606 0.1
607 0.09
608 0.09
609 0.09
610 0.08
611 0.08
612 0.14
613 0.22
614 0.31
615 0.42
616 0.52
617 0.63
618 0.74
619 0.82
620 0.87
621 0.9
622 0.91
623 0.88
624 0.85
625 0.79
626 0.72
627 0.63
628 0.53
629 0.42
630 0.32
631 0.24
632 0.16
633 0.11
634 0.07
635 0.06
636 0.05
637 0.05
638 0.04
639 0.04
640 0.05
641 0.05
642 0.05
643 0.05
644 0.05
645 0.06
646 0.08
647 0.08
648 0.08
649 0.08
650 0.08
651 0.08
652 0.09
653 0.08
654 0.06
655 0.07
656 0.07
657 0.08
658 0.07
659 0.07
660 0.06
661 0.08
662 0.09
663 0.09
664 0.1
665 0.1
666 0.11
667 0.14
668 0.18
669 0.23
670 0.29
671 0.38
672 0.42
673 0.46
674 0.51
675 0.54
676 0.6
677 0.59
678 0.57
679 0.54
680 0.5
681 0.46
682 0.41
683 0.34
684 0.26
685 0.19
686 0.14
687 0.07
688 0.06
689 0.07
690 0.09
691 0.12
692 0.11
693 0.12
694 0.14
695 0.17
696 0.18
697 0.19
698 0.17
699 0.18
700 0.2
701 0.2
702 0.2
703 0.2
704 0.2
705 0.19
706 0.21
707 0.2
708 0.22
709 0.24
710 0.24
711 0.23
712 0.23
713 0.22
714 0.21
715 0.2
716 0.16
717 0.15
718 0.13
719 0.12
720 0.11
721 0.13
722 0.11
723 0.11
724 0.1
725 0.09
726 0.11
727 0.1
728 0.1
729 0.11
730 0.12
731 0.12
732 0.13
733 0.16
734 0.17
735 0.19
736 0.25
737 0.22
738 0.24
739 0.28
740 0.28
741 0.27
742 0.33
743 0.38
744 0.39
745 0.42
746 0.46
747 0.45
748 0.5
749 0.58
750 0.59
751 0.58
752 0.56
753 0.58
754 0.6
755 0.6
756 0.55
757 0.5
758 0.42
759 0.36
760 0.34
761 0.29
762 0.27
763 0.3
764 0.38
765 0.41
766 0.43
767 0.49
768 0.53
769 0.56
770 0.54
771 0.55
772 0.57
773 0.58
774 0.6
775 0.57
776 0.54