Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A545A2L8

Protein Details
Accession A0A545A2L8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
234-254LSAVRKEKKTEYRQYMNRVGGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
106-129KRGSSRSGRHGSSKREREARKDAR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MEETRAYRADSKQKWGESDRRSDMILVTETVIDDTEAGRRGIVDTAEAAGEMKGTKEAAGIEREGMMNERRDLEEQEKPVSIQSILLHEIQTKLTVKDSGAEYRDKRGSSRSGRHGSSKREREARKDARSVSPEVEKLTKINRGRPEALGVSDRIATPPVSFKVDLAQEFDHMDVDSAGRKANNDRAGIAKASINESQEDEILIEEDGLAAMKAMMGFADFGTTHQKKVPGNNLSAVRKEKKTEYRQYMNRVGGFNRPLSPSHPSR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.62
3 0.64
4 0.6
5 0.65
6 0.62
7 0.56
8 0.53
9 0.48
10 0.41
11 0.36
12 0.31
13 0.22
14 0.17
15 0.15
16 0.15
17 0.14
18 0.13
19 0.09
20 0.07
21 0.07
22 0.09
23 0.11
24 0.11
25 0.1
26 0.11
27 0.12
28 0.13
29 0.13
30 0.1
31 0.09
32 0.1
33 0.1
34 0.09
35 0.09
36 0.07
37 0.07
38 0.06
39 0.06
40 0.06
41 0.06
42 0.07
43 0.07
44 0.09
45 0.11
46 0.13
47 0.13
48 0.13
49 0.14
50 0.14
51 0.13
52 0.14
53 0.15
54 0.15
55 0.16
56 0.17
57 0.18
58 0.19
59 0.22
60 0.25
61 0.27
62 0.27
63 0.28
64 0.27
65 0.25
66 0.24
67 0.22
68 0.17
69 0.14
70 0.12
71 0.12
72 0.14
73 0.14
74 0.14
75 0.13
76 0.14
77 0.12
78 0.14
79 0.13
80 0.12
81 0.13
82 0.13
83 0.12
84 0.15
85 0.17
86 0.18
87 0.19
88 0.23
89 0.23
90 0.28
91 0.31
92 0.28
93 0.27
94 0.27
95 0.33
96 0.36
97 0.43
98 0.46
99 0.48
100 0.49
101 0.56
102 0.58
103 0.59
104 0.61
105 0.61
106 0.57
107 0.6
108 0.61
109 0.59
110 0.64
111 0.65
112 0.6
113 0.58
114 0.55
115 0.52
116 0.52
117 0.47
118 0.39
119 0.32
120 0.27
121 0.24
122 0.23
123 0.18
124 0.16
125 0.17
126 0.22
127 0.21
128 0.27
129 0.31
130 0.34
131 0.36
132 0.35
133 0.36
134 0.3
135 0.29
136 0.24
137 0.19
138 0.15
139 0.14
140 0.13
141 0.1
142 0.1
143 0.09
144 0.08
145 0.11
146 0.11
147 0.13
148 0.13
149 0.13
150 0.16
151 0.18
152 0.18
153 0.18
154 0.17
155 0.15
156 0.15
157 0.15
158 0.12
159 0.1
160 0.09
161 0.06
162 0.06
163 0.08
164 0.07
165 0.08
166 0.08
167 0.09
168 0.13
169 0.2
170 0.24
171 0.23
172 0.24
173 0.26
174 0.28
175 0.27
176 0.24
177 0.19
178 0.15
179 0.18
180 0.19
181 0.17
182 0.16
183 0.17
184 0.16
185 0.15
186 0.14
187 0.1
188 0.09
189 0.08
190 0.07
191 0.06
192 0.05
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.04
205 0.04
206 0.06
207 0.06
208 0.07
209 0.17
210 0.18
211 0.2
212 0.22
213 0.27
214 0.29
215 0.37
216 0.46
217 0.42
218 0.44
219 0.49
220 0.54
221 0.54
222 0.57
223 0.56
224 0.53
225 0.51
226 0.53
227 0.56
228 0.58
229 0.64
230 0.69
231 0.71
232 0.75
233 0.79
234 0.82
235 0.82
236 0.78
237 0.71
238 0.64
239 0.56
240 0.54
241 0.5
242 0.44
243 0.4
244 0.36
245 0.33
246 0.34