Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A545A9V4

Protein Details
Accession A0A545A9V4    Localization Confidence High Confidence Score 18.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-25SSNERMARKKWIDKKTASHFTLHydrophilic
296-316TTTTNGGRRRRRKGALTNPSTHydrophilic
382-405GGYSMSGKKRMKRGKYQNGIEQLDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
303-308RRRRRK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MRDSSNERMARKKWIDKKTASHFTLVHRPQNDPLIHDPSASSTVLNPTTNLNSNKSKKLDDLILELGPEVEKIRANEGEAATHGIYFDDTEYDYMQHMRDLGSGSGESYFVDAQSTKIRNKGKEKQPLEEALKDAVSKDRFEMLLDKDILPSKNLRHVTYQAQQNIPDALAGFQPDMDPRLREVLIALEDDAYVDDQDDIISNLAKDGEEIDQDEFSQSQWDYEEAGWDSDATAKPIKEYQSNSNLPSSTHNPNDEFEDCEDHGDGAWMENFSKFKRDQKPRSMHLASSTVSSAMTTTTNGGRRRRRKGALTNPSTYSMTSSSLFRTEGLTALDARFQKIEEQYNEDLDDNASVSQCSRSTIAFTDDCVREDFDGIMDEFLGGYSMSGKKRMKRGKYQNGIEQLDEIRRGLGPAIVRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.76
3 0.75
4 0.82
5 0.82
6 0.83
7 0.75
8 0.7
9 0.63
10 0.6
11 0.63
12 0.6
13 0.57
14 0.49
15 0.5
16 0.49
17 0.55
18 0.49
19 0.44
20 0.43
21 0.43
22 0.4
23 0.38
24 0.34
25 0.29
26 0.31
27 0.26
28 0.2
29 0.15
30 0.2
31 0.23
32 0.23
33 0.2
34 0.2
35 0.25
36 0.32
37 0.33
38 0.34
39 0.4
40 0.46
41 0.53
42 0.53
43 0.51
44 0.47
45 0.49
46 0.48
47 0.41
48 0.4
49 0.35
50 0.32
51 0.29
52 0.26
53 0.21
54 0.16
55 0.14
56 0.1
57 0.08
58 0.1
59 0.11
60 0.16
61 0.16
62 0.18
63 0.23
64 0.22
65 0.21
66 0.2
67 0.22
68 0.17
69 0.16
70 0.15
71 0.1
72 0.1
73 0.09
74 0.09
75 0.06
76 0.07
77 0.08
78 0.09
79 0.09
80 0.1
81 0.11
82 0.11
83 0.1
84 0.1
85 0.1
86 0.11
87 0.12
88 0.11
89 0.11
90 0.11
91 0.11
92 0.11
93 0.1
94 0.09
95 0.08
96 0.08
97 0.06
98 0.08
99 0.08
100 0.09
101 0.16
102 0.2
103 0.21
104 0.28
105 0.34
106 0.4
107 0.49
108 0.58
109 0.6
110 0.67
111 0.69
112 0.67
113 0.66
114 0.66
115 0.61
116 0.53
117 0.45
118 0.36
119 0.33
120 0.28
121 0.24
122 0.22
123 0.19
124 0.17
125 0.17
126 0.18
127 0.17
128 0.18
129 0.22
130 0.18
131 0.22
132 0.23
133 0.22
134 0.22
135 0.25
136 0.24
137 0.21
138 0.22
139 0.18
140 0.24
141 0.27
142 0.27
143 0.27
144 0.3
145 0.35
146 0.38
147 0.43
148 0.39
149 0.38
150 0.37
151 0.34
152 0.31
153 0.25
154 0.18
155 0.12
156 0.09
157 0.07
158 0.07
159 0.06
160 0.05
161 0.06
162 0.06
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.09
167 0.12
168 0.12
169 0.11
170 0.11
171 0.11
172 0.11
173 0.1
174 0.1
175 0.07
176 0.06
177 0.07
178 0.06
179 0.05
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.03
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.05
192 0.04
193 0.04
194 0.05
195 0.05
196 0.06
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.08
202 0.06
203 0.06
204 0.07
205 0.06
206 0.06
207 0.07
208 0.07
209 0.08
210 0.08
211 0.1
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.07
217 0.09
218 0.1
219 0.1
220 0.12
221 0.11
222 0.12
223 0.16
224 0.17
225 0.19
226 0.22
227 0.26
228 0.33
229 0.35
230 0.36
231 0.35
232 0.34
233 0.3
234 0.31
235 0.29
236 0.26
237 0.27
238 0.27
239 0.26
240 0.27
241 0.3
242 0.27
243 0.24
244 0.2
245 0.21
246 0.19
247 0.18
248 0.18
249 0.13
250 0.12
251 0.11
252 0.1
253 0.06
254 0.07
255 0.06
256 0.07
257 0.09
258 0.1
259 0.1
260 0.15
261 0.17
262 0.25
263 0.36
264 0.46
265 0.54
266 0.63
267 0.71
268 0.71
269 0.78
270 0.71
271 0.62
272 0.55
273 0.49
274 0.39
275 0.32
276 0.28
277 0.18
278 0.15
279 0.14
280 0.1
281 0.08
282 0.08
283 0.06
284 0.08
285 0.12
286 0.19
287 0.25
288 0.33
289 0.43
290 0.52
291 0.6
292 0.68
293 0.71
294 0.74
295 0.79
296 0.82
297 0.82
298 0.8
299 0.75
300 0.68
301 0.64
302 0.55
303 0.44
304 0.36
305 0.26
306 0.22
307 0.19
308 0.18
309 0.16
310 0.17
311 0.17
312 0.15
313 0.16
314 0.14
315 0.14
316 0.14
317 0.14
318 0.13
319 0.13
320 0.18
321 0.16
322 0.17
323 0.16
324 0.15
325 0.19
326 0.22
327 0.3
328 0.28
329 0.34
330 0.34
331 0.36
332 0.37
333 0.32
334 0.28
335 0.2
336 0.18
337 0.12
338 0.11
339 0.1
340 0.08
341 0.09
342 0.11
343 0.11
344 0.13
345 0.13
346 0.13
347 0.16
348 0.18
349 0.23
350 0.2
351 0.22
352 0.28
353 0.28
354 0.28
355 0.27
356 0.27
357 0.22
358 0.23
359 0.2
360 0.13
361 0.15
362 0.14
363 0.12
364 0.11
365 0.1
366 0.08
367 0.08
368 0.08
369 0.05
370 0.04
371 0.08
372 0.13
373 0.15
374 0.24
375 0.29
376 0.36
377 0.47
378 0.57
379 0.63
380 0.69
381 0.79
382 0.82
383 0.87
384 0.88
385 0.86
386 0.85
387 0.78
388 0.68
389 0.6
390 0.52
391 0.46
392 0.4
393 0.31
394 0.23
395 0.2
396 0.2
397 0.18
398 0.18