Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A544ZWM4

Protein Details
Accession A0A544ZWM4    Localization Confidence High Confidence Score 24
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
221-240RFLPHFKKRNLSKRRVPLKVBasic
303-379FVPINEKDLKREKKKKSLASDEDSISQEKKKKKKVQIAEEDSVGHEKKKKRVRTTEEDSSGHERKKKKKDKLETVANHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
227-240KKRNLSKRRVPLKV
243-243K
281-298KDERLEKQQEKRAAKLKK
309-319KDLKREKKKKS
330-340EKKKKKKVQIA
344-373SVGHEKKKKRVRTTEEDSSGHERKKKKKDK
Subcellular Location(s) nucl 26
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041174  KH_8  
IPR004087  KH_dom  
IPR036612  KH_dom_type_1_sf  
IPR024166  rRNA_assembly_KRR1  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17903  KH_8  
CDD cd22393  KH-I_KRR1_rpt1  
cd22394  KH-I_KRR1_rpt2  
Amino Acid Sequences MPSTHKKEKPWDTDDIDKWKIEQFKPEDNTGGTFTEESSFITLFPKYREVYLREVWPLITRALEKFGIGCQLDLVEGSMMVKTTRKTYDPAAILNARDLIKLLARSVPAPQAIKILDDGVACDIIKIRNLTRNKERFVKRRQRILGPNGSTLKALELLTECYILVQGNTVATMGPYKGLKEIRRIIEDCMANIHPIYHIKELMIKRELQKDPDLAGESWDRFLPHFKKRNLSKRRVPLKVTDKSKKPYTPFPPPQEKSKIDLQIESGQYFLGKMAKERAAKDERLEKQQEKRAAKLKKMEEDFVPINEKDLKREKKKKSLASDEDSISQEKKKKKKVQIAEEDSVGHEKKKKRVRTTEEDSSGHERKKKKKDKLETVAN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.7
3 0.63
4 0.54
5 0.5
6 0.47
7 0.49
8 0.42
9 0.45
10 0.43
11 0.49
12 0.53
13 0.55
14 0.52
15 0.45
16 0.45
17 0.38
18 0.33
19 0.24
20 0.2
21 0.18
22 0.16
23 0.15
24 0.14
25 0.14
26 0.13
27 0.11
28 0.13
29 0.15
30 0.15
31 0.18
32 0.22
33 0.21
34 0.25
35 0.31
36 0.33
37 0.38
38 0.4
39 0.42
40 0.39
41 0.39
42 0.35
43 0.32
44 0.3
45 0.24
46 0.22
47 0.19
48 0.18
49 0.21
50 0.21
51 0.17
52 0.17
53 0.17
54 0.2
55 0.18
56 0.17
57 0.13
58 0.13
59 0.13
60 0.12
61 0.11
62 0.05
63 0.05
64 0.05
65 0.05
66 0.06
67 0.06
68 0.09
69 0.09
70 0.14
71 0.18
72 0.19
73 0.22
74 0.25
75 0.33
76 0.32
77 0.33
78 0.34
79 0.32
80 0.31
81 0.29
82 0.29
83 0.21
84 0.19
85 0.18
86 0.13
87 0.14
88 0.14
89 0.14
90 0.13
91 0.13
92 0.14
93 0.16
94 0.18
95 0.19
96 0.19
97 0.18
98 0.19
99 0.19
100 0.19
101 0.17
102 0.14
103 0.13
104 0.11
105 0.11
106 0.09
107 0.09
108 0.08
109 0.08
110 0.09
111 0.08
112 0.1
113 0.12
114 0.13
115 0.2
116 0.24
117 0.32
118 0.4
119 0.47
120 0.48
121 0.56
122 0.63
123 0.64
124 0.71
125 0.75
126 0.72
127 0.75
128 0.76
129 0.75
130 0.75
131 0.74
132 0.72
133 0.63
134 0.62
135 0.54
136 0.49
137 0.41
138 0.32
139 0.25
140 0.17
141 0.14
142 0.1
143 0.09
144 0.1
145 0.1
146 0.1
147 0.09
148 0.07
149 0.08
150 0.07
151 0.06
152 0.05
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.05
160 0.04
161 0.05
162 0.06
163 0.06
164 0.1
165 0.14
166 0.16
167 0.22
168 0.28
169 0.3
170 0.34
171 0.34
172 0.32
173 0.34
174 0.32
175 0.26
176 0.23
177 0.2
178 0.16
179 0.15
180 0.13
181 0.08
182 0.1
183 0.13
184 0.11
185 0.11
186 0.11
187 0.17
188 0.18
189 0.22
190 0.22
191 0.21
192 0.24
193 0.32
194 0.33
195 0.3
196 0.31
197 0.28
198 0.27
199 0.27
200 0.26
201 0.17
202 0.18
203 0.17
204 0.15
205 0.14
206 0.14
207 0.13
208 0.1
209 0.18
210 0.21
211 0.29
212 0.37
213 0.4
214 0.48
215 0.57
216 0.68
217 0.7
218 0.74
219 0.74
220 0.76
221 0.82
222 0.79
223 0.72
224 0.71
225 0.71
226 0.7
227 0.7
228 0.67
229 0.65
230 0.65
231 0.7
232 0.66
233 0.6
234 0.62
235 0.6
236 0.63
237 0.66
238 0.68
239 0.72
240 0.68
241 0.72
242 0.7
243 0.65
244 0.58
245 0.56
246 0.54
247 0.45
248 0.43
249 0.39
250 0.38
251 0.37
252 0.33
253 0.25
254 0.18
255 0.17
256 0.16
257 0.13
258 0.1
259 0.09
260 0.1
261 0.16
262 0.22
263 0.26
264 0.27
265 0.34
266 0.37
267 0.39
268 0.41
269 0.46
270 0.44
271 0.49
272 0.54
273 0.52
274 0.55
275 0.61
276 0.65
277 0.59
278 0.62
279 0.63
280 0.63
281 0.64
282 0.64
283 0.63
284 0.63
285 0.63
286 0.59
287 0.52
288 0.51
289 0.46
290 0.4
291 0.38
292 0.28
293 0.28
294 0.32
295 0.31
296 0.31
297 0.4
298 0.47
299 0.53
300 0.64
301 0.71
302 0.74
303 0.84
304 0.86
305 0.86
306 0.87
307 0.84
308 0.81
309 0.76
310 0.68
311 0.62
312 0.54
313 0.46
314 0.37
315 0.35
316 0.36
317 0.39
318 0.47
319 0.54
320 0.63
321 0.71
322 0.79
323 0.84
324 0.88
325 0.9
326 0.89
327 0.82
328 0.73
329 0.64
330 0.55
331 0.5
332 0.4
333 0.33
334 0.31
335 0.34
336 0.42
337 0.51
338 0.59
339 0.64
340 0.74
341 0.8
342 0.83
343 0.85
344 0.86
345 0.83
346 0.75
347 0.7
348 0.67
349 0.64
350 0.6
351 0.58
352 0.56
353 0.6
354 0.7
355 0.75
356 0.77
357 0.82
358 0.87
359 0.91