Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A544ZWI9

Protein Details
Accession A0A544ZWI9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
604-627SDASGKSRRKSMKHRRMSSAHQVLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
600-619KRGVSDASGKSRRKSMKHRR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13.5, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR026847  VPS13  
IPR031646  VPS13_extend_chorein  
IPR031642  VPS13_mid_RBG  
Pfam View protein in Pfam  
PF16908  VPS13  
PF16910  VPS13_mid_rpt  
Amino Acid Sequences KAQATYATHQFILKPVNGQAKIELDKTGDVTVPKFKANLVFEEIGLVLDDDQYRDALMMVDLFHYFLRHQEYKALQPKGVSPKEDPRAWLKFAGNAVLGKIHERNRKWSWDYFRERRDDRIRYIELFKKKKAQQPLTTEENEDLGKLEWKLDYEDLRFWRSLARNQLKKENAAALKMQSQQEQQTGWLAWMWGSKPQGTIEENEENTQMTEEQRKELYDMIDWNEKSALAESVDLPREAVKMCLEASLGTGSFTLKKNANTNPIDLLSLHFDVFKAKALQRKDSTLLNVSLGGLRVNDGTTPDSLYPEIVRVKDAPNAKRRKRMSLLELEQSSENDPFFSFEVEKNPIEREGDIALVGKLKPLEVVWNPNFVIGVVDFFRPPERHMESISALMETAGATVEGIREQTRAGLEFALEEHKTINAELDLQAPLIIVPGSITTHDSTCLIVDAGHIHVNSELVDHGTMKEIQAKQRQAYSEEDFKRLESVMYDRFLVKLTSTQVLIGPSIDETKAQLNQSKGASPCHVVEQINVDFVVETSILPKAPNLTKFKISGHLPLLHATFSDSKYKNLMRIIDVAIPKFDDATPVETSQQLQKPITRKRGVSDASGKSRRKSMKHRRMSSAHQVLQPHTAVVLEDLDDDEEDDFEDAVDGGDNDHLKIQQRVFQFNFKVDTLKGSLYRSDPDRKKPDTLLVELVAERFDLEFYTRPFDMAAEVSLGSVTVDDFVDNPSPEFKSIISSGDSEDLQAGRSLVNVKFLKVKPQSPEFMPVYEGVETNITAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.3
3 0.38
4 0.38
5 0.38
6 0.37
7 0.38
8 0.4
9 0.37
10 0.33
11 0.26
12 0.26
13 0.26
14 0.24
15 0.21
16 0.19
17 0.21
18 0.27
19 0.27
20 0.27
21 0.26
22 0.26
23 0.31
24 0.33
25 0.34
26 0.33
27 0.32
28 0.3
29 0.31
30 0.29
31 0.22
32 0.19
33 0.15
34 0.08
35 0.09
36 0.1
37 0.09
38 0.1
39 0.1
40 0.09
41 0.09
42 0.09
43 0.08
44 0.08
45 0.08
46 0.07
47 0.09
48 0.09
49 0.1
50 0.09
51 0.1
52 0.1
53 0.13
54 0.21
55 0.22
56 0.23
57 0.3
58 0.34
59 0.43
60 0.52
61 0.51
62 0.44
63 0.43
64 0.49
65 0.53
66 0.53
67 0.48
68 0.44
69 0.51
70 0.57
71 0.58
72 0.54
73 0.51
74 0.52
75 0.51
76 0.51
77 0.42
78 0.39
79 0.38
80 0.37
81 0.31
82 0.26
83 0.24
84 0.21
85 0.2
86 0.19
87 0.23
88 0.28
89 0.35
90 0.37
91 0.45
92 0.49
93 0.57
94 0.59
95 0.62
96 0.64
97 0.66
98 0.73
99 0.74
100 0.75
101 0.76
102 0.73
103 0.74
104 0.74
105 0.7
106 0.66
107 0.65
108 0.61
109 0.56
110 0.62
111 0.6
112 0.6
113 0.6
114 0.59
115 0.6
116 0.64
117 0.67
118 0.7
119 0.72
120 0.71
121 0.72
122 0.74
123 0.71
124 0.66
125 0.6
126 0.5
127 0.42
128 0.33
129 0.25
130 0.19
131 0.13
132 0.14
133 0.13
134 0.14
135 0.12
136 0.13
137 0.16
138 0.18
139 0.2
140 0.2
141 0.26
142 0.27
143 0.3
144 0.29
145 0.27
146 0.31
147 0.32
148 0.36
149 0.41
150 0.48
151 0.52
152 0.56
153 0.65
154 0.61
155 0.59
156 0.56
157 0.53
158 0.44
159 0.4
160 0.38
161 0.31
162 0.32
163 0.35
164 0.34
165 0.28
166 0.29
167 0.3
168 0.3
169 0.28
170 0.24
171 0.22
172 0.2
173 0.17
174 0.15
175 0.12
176 0.11
177 0.12
178 0.12
179 0.14
180 0.15
181 0.16
182 0.17
183 0.18
184 0.21
185 0.2
186 0.22
187 0.23
188 0.27
189 0.27
190 0.27
191 0.26
192 0.22
193 0.21
194 0.19
195 0.14
196 0.11
197 0.18
198 0.18
199 0.2
200 0.21
201 0.21
202 0.21
203 0.23
204 0.22
205 0.17
206 0.18
207 0.19
208 0.25
209 0.24
210 0.24
211 0.21
212 0.2
213 0.18
214 0.17
215 0.15
216 0.08
217 0.09
218 0.1
219 0.13
220 0.15
221 0.14
222 0.13
223 0.13
224 0.13
225 0.13
226 0.13
227 0.09
228 0.09
229 0.1
230 0.1
231 0.1
232 0.08
233 0.09
234 0.09
235 0.08
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.11
240 0.12
241 0.14
242 0.16
243 0.19
244 0.25
245 0.29
246 0.37
247 0.35
248 0.36
249 0.35
250 0.32
251 0.3
252 0.24
253 0.21
254 0.16
255 0.15
256 0.14
257 0.11
258 0.11
259 0.11
260 0.12
261 0.13
262 0.13
263 0.15
264 0.2
265 0.23
266 0.31
267 0.32
268 0.35
269 0.35
270 0.33
271 0.34
272 0.32
273 0.3
274 0.22
275 0.2
276 0.17
277 0.15
278 0.13
279 0.11
280 0.07
281 0.07
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.07
286 0.08
287 0.08
288 0.09
289 0.09
290 0.1
291 0.1
292 0.1
293 0.09
294 0.11
295 0.13
296 0.12
297 0.13
298 0.13
299 0.15
300 0.19
301 0.25
302 0.29
303 0.36
304 0.46
305 0.5
306 0.57
307 0.59
308 0.63
309 0.62
310 0.62
311 0.59
312 0.59
313 0.57
314 0.54
315 0.51
316 0.44
317 0.38
318 0.33
319 0.27
320 0.18
321 0.14
322 0.09
323 0.09
324 0.08
325 0.08
326 0.09
327 0.09
328 0.09
329 0.13
330 0.16
331 0.16
332 0.16
333 0.17
334 0.16
335 0.16
336 0.15
337 0.13
338 0.1
339 0.1
340 0.09
341 0.09
342 0.08
343 0.08
344 0.08
345 0.07
346 0.07
347 0.06
348 0.07
349 0.06
350 0.1
351 0.1
352 0.18
353 0.18
354 0.21
355 0.21
356 0.21
357 0.21
358 0.16
359 0.15
360 0.07
361 0.08
362 0.06
363 0.07
364 0.06
365 0.07
366 0.1
367 0.1
368 0.11
369 0.16
370 0.18
371 0.19
372 0.2
373 0.22
374 0.2
375 0.22
376 0.21
377 0.14
378 0.11
379 0.09
380 0.08
381 0.06
382 0.05
383 0.03
384 0.03
385 0.02
386 0.03
387 0.03
388 0.03
389 0.04
390 0.04
391 0.05
392 0.05
393 0.06
394 0.06
395 0.07
396 0.08
397 0.07
398 0.07
399 0.06
400 0.07
401 0.09
402 0.08
403 0.07
404 0.07
405 0.07
406 0.08
407 0.08
408 0.08
409 0.05
410 0.06
411 0.06
412 0.08
413 0.07
414 0.07
415 0.07
416 0.06
417 0.06
418 0.05
419 0.05
420 0.03
421 0.03
422 0.03
423 0.04
424 0.04
425 0.06
426 0.06
427 0.07
428 0.07
429 0.08
430 0.08
431 0.07
432 0.07
433 0.06
434 0.05
435 0.05
436 0.06
437 0.07
438 0.08
439 0.08
440 0.08
441 0.08
442 0.08
443 0.08
444 0.07
445 0.06
446 0.05
447 0.05
448 0.05
449 0.06
450 0.07
451 0.07
452 0.07
453 0.14
454 0.15
455 0.21
456 0.28
457 0.31
458 0.31
459 0.34
460 0.35
461 0.31
462 0.34
463 0.32
464 0.35
465 0.34
466 0.35
467 0.32
468 0.31
469 0.29
470 0.24
471 0.2
472 0.12
473 0.14
474 0.14
475 0.15
476 0.16
477 0.15
478 0.15
479 0.16
480 0.14
481 0.11
482 0.11
483 0.12
484 0.12
485 0.12
486 0.12
487 0.13
488 0.13
489 0.13
490 0.1
491 0.08
492 0.07
493 0.08
494 0.08
495 0.07
496 0.07
497 0.1
498 0.13
499 0.14
500 0.18
501 0.18
502 0.21
503 0.22
504 0.26
505 0.24
506 0.24
507 0.24
508 0.22
509 0.22
510 0.21
511 0.24
512 0.19
513 0.19
514 0.22
515 0.2
516 0.19
517 0.18
518 0.14
519 0.11
520 0.11
521 0.11
522 0.06
523 0.05
524 0.06
525 0.07
526 0.07
527 0.07
528 0.08
529 0.12
530 0.16
531 0.23
532 0.28
533 0.31
534 0.34
535 0.36
536 0.37
537 0.38
538 0.36
539 0.34
540 0.32
541 0.33
542 0.3
543 0.3
544 0.29
545 0.24
546 0.22
547 0.19
548 0.18
549 0.16
550 0.24
551 0.23
552 0.23
553 0.29
554 0.31
555 0.33
556 0.33
557 0.34
558 0.27
559 0.3
560 0.31
561 0.3
562 0.3
563 0.26
564 0.23
565 0.21
566 0.19
567 0.17
568 0.14
569 0.12
570 0.11
571 0.15
572 0.16
573 0.17
574 0.18
575 0.18
576 0.19
577 0.24
578 0.26
579 0.26
580 0.25
581 0.29
582 0.37
583 0.46
584 0.54
585 0.52
586 0.5
587 0.5
588 0.57
589 0.54
590 0.53
591 0.53
592 0.5
593 0.54
594 0.62
595 0.61
596 0.54
597 0.6
598 0.61
599 0.6
600 0.64
601 0.66
602 0.68
603 0.76
604 0.82
605 0.82
606 0.81
607 0.81
608 0.8
609 0.78
610 0.72
611 0.65
612 0.6
613 0.53
614 0.51
615 0.43
616 0.32
617 0.22
618 0.17
619 0.14
620 0.12
621 0.11
622 0.07
623 0.07
624 0.07
625 0.07
626 0.07
627 0.07
628 0.07
629 0.06
630 0.06
631 0.06
632 0.06
633 0.05
634 0.06
635 0.05
636 0.05
637 0.05
638 0.05
639 0.05
640 0.08
641 0.08
642 0.09
643 0.1
644 0.12
645 0.15
646 0.2
647 0.21
648 0.24
649 0.28
650 0.35
651 0.37
652 0.43
653 0.43
654 0.41
655 0.43
656 0.38
657 0.38
658 0.3
659 0.31
660 0.26
661 0.27
662 0.26
663 0.24
664 0.27
665 0.26
666 0.31
667 0.33
668 0.41
669 0.44
670 0.51
671 0.58
672 0.6
673 0.63
674 0.62
675 0.65
676 0.6
677 0.57
678 0.51
679 0.43
680 0.4
681 0.35
682 0.32
683 0.23
684 0.17
685 0.13
686 0.09
687 0.08
688 0.07
689 0.09
690 0.13
691 0.15
692 0.21
693 0.2
694 0.2
695 0.2
696 0.2
697 0.19
698 0.16
699 0.15
700 0.11
701 0.11
702 0.11
703 0.1
704 0.1
705 0.07
706 0.06
707 0.05
708 0.05
709 0.05
710 0.06
711 0.06
712 0.09
713 0.13
714 0.14
715 0.15
716 0.17
717 0.19
718 0.2
719 0.2
720 0.18
721 0.19
722 0.2
723 0.21
724 0.2
725 0.19
726 0.2
727 0.22
728 0.22
729 0.17
730 0.18
731 0.16
732 0.15
733 0.15
734 0.13
735 0.1
736 0.12
737 0.16
738 0.15
739 0.24
740 0.24
741 0.25
742 0.34
743 0.35
744 0.43
745 0.46
746 0.51
747 0.5
748 0.56
749 0.59
750 0.54
751 0.61
752 0.53
753 0.47
754 0.43
755 0.36
756 0.32
757 0.28
758 0.25
759 0.17
760 0.16