Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VGD5

Protein Details
Accession H1VGD5    Localization Confidence Low Confidence Score 9.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-50AVTERRSKIWKAKGKRHDMGSYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
38-43WKAKGK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 7.333, cyto 6, nucl 5.5, extr 5, cysk 5, cyto_mito 4.999, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR046676  DUF6546  
KEGG chig:CH63R_07532  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF20183  DUF6546  
Amino Acid Sequences MGEKTEMASWNGLPVELKGLILGHLASGAVTERRSKIWKAKGKRHDMGSYAVVCRQWQGFIEKVNFSNLEISTSKDLASFDEIFQGPSRRSYLRRVSLRVELPRYANKLAKIPETDVEQNDNEIAFTQGIWNFFDILSKWTTSGAGIELELSAASPSDKNKYFGEMGLDQDGNSRFFDHDLDFCFITAGCDQVGRHGLPEVSVVSSCQVLRRNHRNFSSRALLTIFSSLPQLHEVRFEPWHQVDMEAQLEVDSDHARTLPFWPSHIKRISLFEHFDAFADGGEGEWEDADSGDESEAEENADAVAAPGPTMDDEEDGGVPRTSCPSLGHNLGYLSLQAEEMAVSNVSDVSDFFEGFISRRSAPPVWKHLRRLVVTSNMMIDGVDAELINNVLRMVANVAKHMPALQVMEIYKTDQFGGAVFRYSVETLSTKASWESTWDFRVDKDVKAAWTEVAKKNTPHSLEFLPEIRLGDYQGPYVFFDQNLVTKDLVLHPSSLEDMLSKKLDKCKACHGFCAHPKNSEQVWGSLGVDG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.17
3 0.15
4 0.15
5 0.12
6 0.12
7 0.12
8 0.12
9 0.11
10 0.07
11 0.07
12 0.07
13 0.06
14 0.06
15 0.08
16 0.09
17 0.11
18 0.15
19 0.17
20 0.22
21 0.27
22 0.34
23 0.41
24 0.5
25 0.58
26 0.64
27 0.73
28 0.79
29 0.84
30 0.85
31 0.82
32 0.77
33 0.7
34 0.64
35 0.59
36 0.52
37 0.44
38 0.39
39 0.33
40 0.28
41 0.28
42 0.24
43 0.2
44 0.18
45 0.21
46 0.22
47 0.28
48 0.32
49 0.32
50 0.32
51 0.35
52 0.32
53 0.29
54 0.3
55 0.24
56 0.24
57 0.21
58 0.23
59 0.23
60 0.23
61 0.22
62 0.19
63 0.2
64 0.17
65 0.22
66 0.2
67 0.16
68 0.22
69 0.22
70 0.22
71 0.24
72 0.26
73 0.21
74 0.23
75 0.26
76 0.25
77 0.28
78 0.36
79 0.43
80 0.5
81 0.56
82 0.57
83 0.58
84 0.61
85 0.65
86 0.63
87 0.58
88 0.52
89 0.49
90 0.5
91 0.51
92 0.47
93 0.44
94 0.39
95 0.4
96 0.4
97 0.41
98 0.37
99 0.35
100 0.33
101 0.35
102 0.36
103 0.32
104 0.33
105 0.28
106 0.25
107 0.24
108 0.21
109 0.15
110 0.12
111 0.11
112 0.07
113 0.07
114 0.09
115 0.1
116 0.12
117 0.12
118 0.12
119 0.12
120 0.12
121 0.13
122 0.11
123 0.12
124 0.13
125 0.12
126 0.12
127 0.12
128 0.12
129 0.11
130 0.11
131 0.09
132 0.08
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.06
137 0.06
138 0.05
139 0.04
140 0.04
141 0.05
142 0.06
143 0.08
144 0.14
145 0.16
146 0.19
147 0.2
148 0.24
149 0.24
150 0.23
151 0.27
152 0.22
153 0.22
154 0.22
155 0.22
156 0.17
157 0.2
158 0.2
159 0.17
160 0.15
161 0.15
162 0.12
163 0.13
164 0.15
165 0.12
166 0.13
167 0.15
168 0.17
169 0.16
170 0.15
171 0.15
172 0.13
173 0.13
174 0.11
175 0.08
176 0.06
177 0.07
178 0.07
179 0.1
180 0.13
181 0.11
182 0.11
183 0.12
184 0.12
185 0.11
186 0.12
187 0.1
188 0.08
189 0.08
190 0.08
191 0.07
192 0.08
193 0.08
194 0.1
195 0.17
196 0.2
197 0.29
198 0.39
199 0.45
200 0.5
201 0.55
202 0.57
203 0.52
204 0.54
205 0.52
206 0.42
207 0.37
208 0.32
209 0.27
210 0.22
211 0.22
212 0.16
213 0.1
214 0.11
215 0.09
216 0.09
217 0.11
218 0.11
219 0.1
220 0.12
221 0.13
222 0.14
223 0.16
224 0.16
225 0.18
226 0.17
227 0.19
228 0.16
229 0.16
230 0.14
231 0.14
232 0.13
233 0.09
234 0.08
235 0.07
236 0.07
237 0.06
238 0.06
239 0.05
240 0.04
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.06
245 0.08
246 0.12
247 0.12
248 0.13
249 0.2
250 0.22
251 0.29
252 0.31
253 0.3
254 0.26
255 0.3
256 0.32
257 0.29
258 0.29
259 0.23
260 0.22
261 0.21
262 0.19
263 0.15
264 0.12
265 0.08
266 0.07
267 0.06
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.03
272 0.03
273 0.03
274 0.02
275 0.03
276 0.03
277 0.03
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.05
283 0.05
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.04
289 0.03
290 0.03
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.05
298 0.05
299 0.04
300 0.05
301 0.05
302 0.06
303 0.06
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.09
309 0.09
310 0.1
311 0.11
312 0.13
313 0.16
314 0.18
315 0.18
316 0.17
317 0.17
318 0.17
319 0.15
320 0.12
321 0.09
322 0.07
323 0.06
324 0.05
325 0.05
326 0.04
327 0.05
328 0.05
329 0.04
330 0.04
331 0.04
332 0.04
333 0.04
334 0.04
335 0.04
336 0.06
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.08
341 0.08
342 0.09
343 0.12
344 0.12
345 0.13
346 0.14
347 0.18
348 0.2
349 0.26
350 0.32
351 0.39
352 0.46
353 0.51
354 0.56
355 0.57
356 0.62
357 0.57
358 0.55
359 0.49
360 0.47
361 0.43
362 0.38
363 0.32
364 0.25
365 0.23
366 0.19
367 0.14
368 0.07
369 0.05
370 0.05
371 0.04
372 0.04
373 0.04
374 0.05
375 0.05
376 0.04
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.05
381 0.07
382 0.1
383 0.1
384 0.12
385 0.13
386 0.13
387 0.13
388 0.14
389 0.12
390 0.1
391 0.11
392 0.1
393 0.12
394 0.12
395 0.13
396 0.13
397 0.14
398 0.14
399 0.13
400 0.13
401 0.1
402 0.1
403 0.09
404 0.13
405 0.11
406 0.12
407 0.11
408 0.12
409 0.13
410 0.13
411 0.13
412 0.11
413 0.12
414 0.12
415 0.16
416 0.15
417 0.14
418 0.15
419 0.16
420 0.14
421 0.17
422 0.21
423 0.21
424 0.23
425 0.25
426 0.24
427 0.24
428 0.33
429 0.3
430 0.27
431 0.28
432 0.28
433 0.28
434 0.29
435 0.3
436 0.23
437 0.26
438 0.33
439 0.34
440 0.38
441 0.4
442 0.4
443 0.45
444 0.5
445 0.48
446 0.42
447 0.4
448 0.37
449 0.36
450 0.37
451 0.34
452 0.29
453 0.27
454 0.25
455 0.22
456 0.2
457 0.19
458 0.2
459 0.19
460 0.19
461 0.19
462 0.19
463 0.2
464 0.22
465 0.21
466 0.16
467 0.18
468 0.17
469 0.2
470 0.22
471 0.22
472 0.19
473 0.18
474 0.21
475 0.23
476 0.25
477 0.22
478 0.2
479 0.18
480 0.19
481 0.21
482 0.19
483 0.14
484 0.12
485 0.13
486 0.17
487 0.2
488 0.21
489 0.25
490 0.33
491 0.41
492 0.45
493 0.48
494 0.55
495 0.61
496 0.61
497 0.64
498 0.62
499 0.64
500 0.68
501 0.74
502 0.66
503 0.62
504 0.61
505 0.59
506 0.55
507 0.52
508 0.45
509 0.37
510 0.35
511 0.32