FuNGI

A0A544ZYL6

Protein Details

Accession

A0A544ZYL6

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
22-52	IRRSRAIDPLRPRKKPLRRPPRLDPPKSLLA	Basic
498-544	RDNDHLKKPQSRKRPGSPNLSESSGNESSRKKSKKKHVLNPETSDPK	Hydrophilic
596-620	VKGDLSDRAKKRRKLKVSATNVSSR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
19-44	PQFIRRSRAIDPLRPRKKPLRRPPRL
417-432	RKKLGKGVKKALKKRE
505-513	KPQSRKRPG
525-533	SSRKKSKKK
604-610	AKKRRKL

Subcellular Location(s)

nucl 25, cyto_nucl 14.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSAYPSGQSIGPTPNNKRPQFIRRSRAIDPLRPRKKPLRRPPRLDPPKSLLAESKLFYPVNGLAPQKISLQQQTCDQIRESNDGWTNKPEGEYCDFPLITTKRAVREGLRYHIARFAGKKEIDPWNQNEFTRPVVLHRRDPQQPSGRGSKDDETEADQVIDSKERERQEIARAEKEKQRVLDLAQIAPTGNNPSLASKKIVSGRNEKTTQVYRLDKTVEEKKASDLRYEEALPWHIEDADNKNTWVGNYEAALSDINVAFIIQDGVFKMIPLEKWYKFASKGQFKAYTIDEAEAKMGKKVKESRWVMKENEQKEADRANLEGRKAMFKLYTVKSESTTFRNSGKREVEDMDELDFNGDDLFQDDDELATVEPDKDEESKEAQDRIKKEQLGANFFGQANEAEVDQELFEEEKEAEVRKKLGKGVKKALKKRERNYIYDSDSDHPYSESSEDDTSDEEKVKEIDRRLEEESKNKIKTENKSFTSTNLTKDINFPVIRSRDNDHLKKPQSRKRPGSPNLSESSGNESSRKKSKKKHVLNPETSDPKPESRQTSFSSQSNTSQVNRYNTTLKINSSQARASDAYSALTTLNPNSDSEAVKGDLSDRAKKRRKLKVSATNVSSRTSSRQCSPALVTSPVGTQRSGPITTSEIVSALPTTGISIGNLMKSFGGRVGDDPAIQTKKAEFIRLVRENAKYGPDKLLRPK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.52
2	0.61
3	0.62
4	0.66
5	0.67
6	0.7
7	0.73
8	0.75
9	0.75
10	0.74
11	0.79
12	0.75
13	0.77
14	0.74
15	0.72
16	0.72
17	0.74
18	0.75
19	0.74
20	0.78
21	0.78
22	0.82
23	0.84
24	0.84
25	0.85
26	0.85
27	0.89
28	0.92
29	0.92
30	0.92
31	0.88
32	0.85
33	0.8
34	0.79
35	0.72
36	0.64
37	0.57
38	0.51
39	0.48
40	0.41
41	0.37
42	0.32
43	0.3
44	0.28
45	0.27
46	0.24
47	0.25
48	0.28
49	0.27
50	0.24
51	0.26
52	0.28
53	0.27
54	0.28
55	0.28
56	0.31
57	0.34
58	0.33
59	0.37
60	0.44
61	0.44
62	0.42
63	0.39
64	0.36
65	0.35
66	0.39
67	0.34
68	0.34
69	0.38
70	0.38
71	0.39
72	0.38
73	0.37
74	0.33
75	0.34
76	0.28
77	0.26
78	0.3
79	0.3
80	0.29
81	0.33
82	0.31
83	0.29
84	0.37
85	0.33
86	0.29
87	0.32
88	0.33
89	0.31
90	0.35
91	0.38
92	0.33
93	0.41
94	0.44
95	0.45
96	0.48
97	0.45
98	0.43
99	0.45
100	0.43
101	0.38
102	0.35
103	0.32
104	0.33
105	0.33
106	0.34
107	0.35
108	0.43
109	0.45
110	0.48
111	0.49
112	0.49
113	0.52
114	0.5
115	0.49
116	0.41
117	0.37
118	0.34
119	0.29
120	0.27
121	0.34
122	0.39
123	0.42
124	0.47
125	0.52
126	0.56
127	0.61
128	0.64
129	0.63
130	0.64
131	0.61
132	0.63
133	0.58
134	0.53
135	0.53
136	0.48
137	0.41
138	0.38
139	0.34
140	0.3
141	0.29
142	0.26
143	0.22
144	0.18
145	0.16
146	0.15
147	0.17
148	0.13
149	0.14
150	0.19
151	0.2
152	0.23
153	0.25
154	0.27
155	0.32
156	0.39
157	0.42
158	0.45
159	0.47
160	0.49
161	0.51
162	0.54
163	0.5
164	0.43
165	0.41
166	0.34
167	0.33
168	0.35
169	0.31
170	0.27
171	0.24
172	0.23
173	0.19
174	0.18
175	0.17
176	0.13
177	0.11
178	0.11
179	0.11
180	0.14
181	0.17
182	0.19
183	0.2
184	0.17
185	0.22
186	0.27
187	0.33
188	0.35
189	0.41
190	0.46
191	0.51
192	0.52
193	0.49
194	0.48
195	0.47
196	0.46
197	0.43
198	0.43
199	0.36
200	0.37
201	0.38
202	0.33
203	0.34
204	0.39
205	0.37
206	0.34
207	0.33
208	0.35
209	0.4
210	0.39
211	0.37
212	0.3
213	0.27
214	0.27
215	0.27
216	0.23
217	0.19
218	0.2
219	0.17
220	0.16
221	0.15
222	0.12
223	0.12
224	0.14
225	0.17
226	0.19
227	0.19
228	0.19
229	0.19
230	0.19
231	0.19
232	0.18
233	0.13
234	0.09
235	0.09
236	0.1
237	0.09
238	0.1
239	0.1
240	0.08
241	0.08
242	0.07
243	0.07
244	0.06
245	0.05
246	0.05
247	0.05
248	0.05
249	0.04
250	0.04
251	0.05
252	0.06
253	0.06
254	0.06
255	0.07
256	0.08
257	0.08
258	0.12
259	0.17
260	0.16
261	0.2
262	0.22
263	0.24
264	0.25
265	0.3
266	0.35
267	0.38
268	0.4
269	0.43
270	0.45
271	0.43
272	0.43
273	0.39
274	0.32
275	0.25
276	0.22
277	0.17
278	0.14
279	0.14
280	0.13
281	0.12
282	0.12
283	0.16
284	0.15
285	0.21
286	0.28
287	0.32
288	0.4
289	0.45
290	0.5
291	0.53
292	0.57
293	0.54
294	0.55
295	0.58
296	0.49
297	0.51
298	0.44
299	0.38
300	0.35
301	0.34
302	0.26
303	0.2
304	0.19
305	0.18
306	0.19
307	0.18
308	0.19
309	0.18
310	0.19
311	0.18
312	0.19
313	0.14
314	0.12
315	0.19
316	0.19
317	0.22
318	0.22
319	0.23
320	0.23
321	0.26
322	0.27
323	0.24
324	0.25
325	0.22
326	0.25
327	0.3
328	0.29
329	0.33
330	0.34
331	0.31
332	0.31
333	0.3
334	0.27
335	0.23
336	0.22
337	0.17
338	0.14
339	0.12
340	0.1
341	0.08
342	0.06
343	0.05
344	0.04
345	0.03
346	0.04
347	0.04
348	0.04
349	0.04
350	0.04
351	0.04
352	0.04
353	0.05
354	0.04
355	0.03
356	0.04
357	0.04
358	0.04
359	0.04
360	0.05
361	0.06
362	0.07
363	0.09
364	0.11
365	0.13
366	0.15
367	0.19
368	0.21
369	0.24
370	0.26
371	0.31
372	0.35
373	0.33
374	0.33
375	0.32
376	0.33
377	0.33
378	0.33
379	0.27
380	0.24
381	0.23
382	0.21
383	0.19
384	0.15
385	0.11
386	0.09
387	0.08
388	0.06
389	0.06
390	0.06
391	0.05
392	0.05
393	0.04
394	0.04
395	0.04
396	0.05
397	0.05
398	0.05
399	0.06
400	0.08
401	0.1
402	0.11
403	0.14
404	0.16
405	0.18
406	0.23
407	0.29
408	0.34
409	0.4
410	0.49
411	0.54
412	0.59
413	0.65
414	0.71
415	0.75
416	0.77
417	0.75
418	0.76
419	0.74
420	0.7
421	0.69
422	0.65
423	0.58
424	0.51
425	0.49
426	0.4
427	0.38
428	0.34
429	0.27
430	0.2
431	0.17
432	0.15
433	0.13
434	0.11
435	0.11
436	0.1
437	0.11
438	0.11
439	0.12
440	0.12
441	0.12
442	0.13
443	0.11
444	0.11
445	0.12
446	0.14
447	0.17
448	0.19
449	0.25
450	0.26
451	0.3
452	0.34
453	0.4
454	0.4
455	0.43
456	0.49
457	0.49
458	0.48
459	0.45
460	0.47
461	0.46
462	0.52
463	0.56
464	0.56
465	0.52
466	0.55
467	0.55
468	0.51
469	0.53
470	0.47
471	0.39
472	0.36
473	0.33
474	0.28
475	0.31
476	0.31
477	0.28
478	0.26
479	0.23
480	0.26
481	0.28
482	0.29
483	0.29
484	0.3
485	0.33
486	0.42
487	0.47
488	0.46
489	0.52
490	0.58
491	0.64
492	0.71
493	0.7
494	0.72
495	0.77
496	0.8
497	0.8
498	0.84
499	0.82
500	0.83
501	0.79
502	0.74
503	0.67
504	0.61
505	0.52
506	0.42
507	0.42
508	0.35
509	0.31
510	0.29
511	0.28
512	0.31
513	0.4
514	0.48
515	0.49
516	0.55
517	0.65
518	0.72
519	0.8
520	0.85
521	0.87
522	0.89
523	0.9
524	0.86
525	0.83
526	0.78
527	0.68
528	0.62
529	0.53
530	0.47
531	0.44
532	0.43
533	0.42
534	0.4
535	0.45
536	0.44
537	0.49
538	0.49
539	0.46
540	0.45
541	0.41
542	0.4
543	0.39
544	0.38
545	0.34
546	0.35
547	0.38
548	0.39
549	0.4
550	0.39
551	0.39
552	0.37
553	0.42
554	0.39
555	0.35
556	0.34
557	0.37
558	0.38
559	0.37
560	0.37
561	0.31
562	0.33
563	0.31
564	0.28
565	0.25
566	0.21
567	0.19
568	0.17
569	0.17
570	0.13
571	0.13
572	0.13
573	0.11
574	0.13
575	0.13
576	0.13
577	0.15
578	0.17
579	0.18
580	0.18
581	0.2
582	0.18
583	0.17
584	0.17
585	0.15
586	0.19
587	0.22
588	0.3
589	0.34
590	0.44
591	0.53
592	0.61
593	0.7
594	0.74
595	0.8
596	0.81
597	0.85
598	0.85
599	0.86
600	0.87
601	0.82
602	0.79
603	0.7
604	0.62
605	0.53
606	0.45
607	0.42
608	0.39
609	0.39
610	0.36
611	0.4
612	0.39
613	0.42
614	0.44
615	0.42
616	0.4
617	0.38
618	0.34
619	0.3
620	0.32
621	0.33
622	0.3
623	0.24
624	0.21
625	0.24
626	0.27
627	0.27
628	0.25
629	0.22
630	0.24
631	0.25
632	0.25
633	0.2
634	0.16
635	0.15
636	0.14
637	0.12
638	0.09
639	0.08
640	0.07
641	0.07
642	0.08
643	0.08
644	0.08
645	0.1
646	0.11
647	0.14
648	0.14
649	0.14
650	0.14
651	0.14
652	0.15
653	0.15
654	0.16
655	0.14
656	0.15
657	0.2
658	0.21
659	0.2
660	0.22
661	0.27
662	0.28
663	0.27
664	0.27
665	0.23
666	0.3
667	0.32
668	0.34
669	0.3
670	0.34
671	0.44
672	0.49
673	0.53
674	0.51
675	0.52
676	0.5
677	0.49
678	0.5
679	0.44
680	0.41
681	0.45
682	0.45

A0A544ZYL6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer