Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

H1VQJ3

Protein Details
Accession H1VQJ3    Localization Confidence High Confidence Score 18.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
59-85DIAAAKKRKAGRPAKKTNATKKLKQAVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
63-82AKKRKAGRPAKKTNATKKLK
155-164APKRRGRPRK
234-253KKVPTTHGRGVGRSKKTLPR
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR016197  Chromo-like_dom_sf  
IPR000953  Chromo/chromo_shadow_dom  
IPR017984  Chromo_dom_subgr  
IPR023780  Chromo_domain  
IPR023779  Chromodomain_CS  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
KEGG chig:CH63R_06005  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00385  Chromo  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00598  CHROMO_1  
PS50013  CHROMO_2  
CDD cd00024  CD_CSD  
Amino Acid Sequences MSVPLVFKGREEEMTIEELAAMSVAAKVKSTEQGTDDEEEISLVKSDITNSPAPATQSDIAAAKKRKAGRPAKKTNATKKLKQAVNSKATVKPSSAANNPSSSYGNPEPPSSAPSSTGKLSQTAAPVGADSDKRADEVDAKDDEKNSASPEPASAPKRRGRPRKTQALVPNSTADQGKRIKTKSRATSARVLMLLAKRQAKTDQHGMIDSVRTTRAASRNGFMKPVPAKTTPAKKVPTTHGRGVGRSKKTLPRGKSIAPQFTDEEYVVEKIIDSRIDPATKEQMYMVKWKGYAAKDNTWEPKKNLGKCGAMIKTFNNSQNAKGKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.25
3 0.2
4 0.17
5 0.15
6 0.12
7 0.1
8 0.07
9 0.04
10 0.06
11 0.08
12 0.09
13 0.09
14 0.1
15 0.13
16 0.19
17 0.21
18 0.22
19 0.22
20 0.25
21 0.28
22 0.29
23 0.28
24 0.22
25 0.2
26 0.17
27 0.16
28 0.13
29 0.1
30 0.07
31 0.07
32 0.07
33 0.09
34 0.12
35 0.16
36 0.17
37 0.17
38 0.19
39 0.21
40 0.22
41 0.2
42 0.23
43 0.19
44 0.18
45 0.18
46 0.19
47 0.2
48 0.26
49 0.29
50 0.27
51 0.33
52 0.39
53 0.44
54 0.52
55 0.6
56 0.63
57 0.7
58 0.78
59 0.82
60 0.85
61 0.88
62 0.89
63 0.89
64 0.86
65 0.82
66 0.8
67 0.8
68 0.74
69 0.71
70 0.7
71 0.68
72 0.67
73 0.63
74 0.57
75 0.52
76 0.52
77 0.46
78 0.38
79 0.31
80 0.28
81 0.29
82 0.3
83 0.3
84 0.28
85 0.29
86 0.29
87 0.29
88 0.27
89 0.22
90 0.25
91 0.23
92 0.26
93 0.25
94 0.25
95 0.25
96 0.24
97 0.27
98 0.23
99 0.21
100 0.18
101 0.19
102 0.21
103 0.19
104 0.22
105 0.19
106 0.18
107 0.19
108 0.18
109 0.17
110 0.15
111 0.14
112 0.11
113 0.11
114 0.1
115 0.11
116 0.09
117 0.08
118 0.09
119 0.09
120 0.09
121 0.1
122 0.1
123 0.12
124 0.13
125 0.16
126 0.16
127 0.18
128 0.18
129 0.18
130 0.18
131 0.15
132 0.14
133 0.13
134 0.12
135 0.11
136 0.11
137 0.11
138 0.13
139 0.17
140 0.21
141 0.21
142 0.26
143 0.31
144 0.4
145 0.48
146 0.56
147 0.58
148 0.65
149 0.7
150 0.76
151 0.73
152 0.71
153 0.7
154 0.67
155 0.62
156 0.53
157 0.46
158 0.35
159 0.34
160 0.27
161 0.19
162 0.17
163 0.18
164 0.21
165 0.25
166 0.27
167 0.33
168 0.4
169 0.49
170 0.51
171 0.56
172 0.57
173 0.56
174 0.62
175 0.56
176 0.5
177 0.42
178 0.35
179 0.29
180 0.26
181 0.24
182 0.21
183 0.24
184 0.21
185 0.23
186 0.27
187 0.27
188 0.3
189 0.35
190 0.34
191 0.3
192 0.31
193 0.3
194 0.26
195 0.25
196 0.2
197 0.14
198 0.11
199 0.1
200 0.11
201 0.15
202 0.19
203 0.23
204 0.25
205 0.26
206 0.31
207 0.31
208 0.32
209 0.27
210 0.29
211 0.27
212 0.3
213 0.31
214 0.28
215 0.32
216 0.37
217 0.47
218 0.45
219 0.49
220 0.49
221 0.48
222 0.52
223 0.56
224 0.59
225 0.56
226 0.55
227 0.56
228 0.54
229 0.55
230 0.59
231 0.59
232 0.53
233 0.51
234 0.52
235 0.52
236 0.6
237 0.65
238 0.6
239 0.59
240 0.61
241 0.61
242 0.63
243 0.63
244 0.61
245 0.54
246 0.53
247 0.47
248 0.43
249 0.4
250 0.32
251 0.26
252 0.19
253 0.18
254 0.15
255 0.13
256 0.11
257 0.1
258 0.12
259 0.11
260 0.1
261 0.13
262 0.17
263 0.19
264 0.19
265 0.22
266 0.29
267 0.28
268 0.28
269 0.27
270 0.27
271 0.28
272 0.34
273 0.33
274 0.29
275 0.29
276 0.31
277 0.35
278 0.35
279 0.42
280 0.41
281 0.45
282 0.46
283 0.53
284 0.6
285 0.61
286 0.63
287 0.57
288 0.62
289 0.63
290 0.64
291 0.65
292 0.62
293 0.59
294 0.56
295 0.62
296 0.57
297 0.51
298 0.48
299 0.43
300 0.43
301 0.45
302 0.47
303 0.46
304 0.42
305 0.45