FuNGI

A0A545A0D6

Protein Details

Accession

A0A545A0D6

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
38-58	RACNRDYRKSVSKRTPLQHLV	Hydrophilic
491-513	GEEICGKKHKWWKMPCSNHCVCK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 15.5, mito_nucl 12.5, nucl 8.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR037033 DNA-dir_RNAP_su2_hyb_sf IPR007121 RNA_pol_bsu_CS
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
PROSITE	View protein in PROSITE PS01166 RNA_POL_BETA

Amino Acid Sequences

MQQCCTKQVVKMNTTLLSVPPRLSHTGSTYLEQQYTLRACNRDYRKSVSKRTPLQHLVELDGYRQLGKIAPLTTFDTTFGHCVDGITRVFDFRVCGSMLEWIECIEHFISSTIRNGYAWDLDRIITIDIENDIKQNATPTAARECIESQVVNKHNPICAYSAQAYVECREKRGRKTTLYPMPTQSTLMTGILGGINNNTTLEMGFEEQEGTKDMEKRTYKEDMFGFICCGHTAHSQDAGKSRRVASFTRIRVLHEGRWKVYCMGIIFHTDLEGVVSMVDCMDSRLKLYAKSQFSYPNNFSMFAPPTYTIYYKHKILCISISPGAILRLMPSGKMIDSSMYHYQPINPIRRQEKIPGSGIDSIKYKYSAFFLLCPYLEDDRPPRTLLASGQTVQAVCYPWAPATAKVSPCHSSKPLVATSFMRTVQKDHEENDEAIWDILPGEDMLVCFCNLPLNYDDAMIVSNKFADYGGFETLSICTYRLFSNDTIPVVGEEICGKKHKWWKMPCSNHCVCKGFNLHTSIKRNIMKIVSDPRIPSAVVLESNTAEIGEYQIRVLSHAQLLTGDKISTTHGQKGVIRIVQSHDLPMIVMKDGSTMIADGPMKRTCAT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.46
2	0.42
3	0.36
4	0.33
5	0.32
6	0.28
7	0.26
8	0.29
9	0.31
10	0.33
11	0.32
12	0.3
13	0.36
14	0.37
15	0.37
16	0.39
17	0.38
18	0.36
19	0.33
20	0.29
21	0.28
22	0.28
23	0.31
24	0.31
25	0.3
26	0.32
27	0.41
28	0.49
29	0.51
30	0.54
31	0.57
32	0.62
33	0.69
34	0.77
35	0.77
36	0.79
37	0.79
38	0.8
39	0.82
40	0.78
41	0.74
42	0.7
43	0.61
44	0.55
45	0.5
46	0.44
47	0.35
48	0.3
49	0.26
50	0.2
51	0.18
52	0.15
53	0.13
54	0.14
55	0.18
56	0.16
57	0.16
58	0.19
59	0.23
60	0.24
61	0.23
62	0.22
63	0.19
64	0.2
65	0.2
66	0.18
67	0.15
68	0.13
69	0.13
70	0.12
71	0.16
72	0.14
73	0.15
74	0.15
75	0.15
76	0.15
77	0.15
78	0.16
79	0.13
80	0.15
81	0.13
82	0.13
83	0.13
84	0.18
85	0.18
86	0.17
87	0.16
88	0.14
89	0.14
90	0.13
91	0.15
92	0.1
93	0.09
94	0.08
95	0.1
96	0.11
97	0.12
98	0.15
99	0.14
100	0.15
101	0.15
102	0.16
103	0.17
104	0.2
105	0.21
106	0.19
107	0.18
108	0.18
109	0.18
110	0.18
111	0.16
112	0.12
113	0.1
114	0.09
115	0.09
116	0.11
117	0.11
118	0.1
119	0.1
120	0.1
121	0.1
122	0.12
123	0.11
124	0.12
125	0.13
126	0.15
127	0.19
128	0.21
129	0.21
130	0.21
131	0.22
132	0.21
133	0.22
134	0.2
135	0.17
136	0.23
137	0.26
138	0.26
139	0.29
140	0.28
141	0.29
142	0.29
143	0.28
144	0.23
145	0.21
146	0.23
147	0.21
148	0.21
149	0.19
150	0.2
151	0.19
152	0.18
153	0.25
154	0.21
155	0.23
156	0.31
157	0.37
158	0.44
159	0.52
160	0.56
161	0.55
162	0.62
163	0.68
164	0.69
165	0.67
166	0.62
167	0.57
168	0.54
169	0.48
170	0.42
171	0.32
172	0.24
173	0.2
174	0.17
175	0.13
176	0.09
177	0.09
178	0.08
179	0.08
180	0.06
181	0.05
182	0.06
183	0.06
184	0.06
185	0.05
186	0.05
187	0.05
188	0.05
189	0.06
190	0.06
191	0.07
192	0.07
193	0.07
194	0.07
195	0.08
196	0.09
197	0.1
198	0.12
199	0.16
200	0.16
201	0.24
202	0.26
203	0.28
204	0.31
205	0.36
206	0.34
207	0.34
208	0.34
209	0.3
210	0.29
211	0.27
212	0.24
213	0.17
214	0.17
215	0.13
216	0.12
217	0.1
218	0.12
219	0.14
220	0.14
221	0.19
222	0.19
223	0.2
224	0.27
225	0.28
226	0.27
227	0.28
228	0.29
229	0.26
230	0.28
231	0.28
232	0.28
233	0.34
234	0.33
235	0.37
236	0.35
237	0.34
238	0.38
239	0.39
240	0.38
241	0.37
242	0.38
243	0.33
244	0.34
245	0.34
246	0.28
247	0.26
248	0.22
249	0.15
250	0.13
251	0.12
252	0.13
253	0.12
254	0.11
255	0.11
256	0.09
257	0.08
258	0.07
259	0.06
260	0.04
261	0.03
262	0.03
263	0.03
264	0.03
265	0.03
266	0.03
267	0.04
268	0.05
269	0.05
270	0.06
271	0.09
272	0.1
273	0.11
274	0.15
275	0.21
276	0.23
277	0.24
278	0.25
279	0.3
280	0.32
281	0.37
282	0.35
283	0.32
284	0.3
285	0.3
286	0.29
287	0.25
288	0.25
289	0.19
290	0.18
291	0.14
292	0.15
293	0.15
294	0.16
295	0.15
296	0.19
297	0.21
298	0.23
299	0.25
300	0.25
301	0.24
302	0.24
303	0.24
304	0.19
305	0.2
306	0.18
307	0.16
308	0.14
309	0.13
310	0.13
311	0.11
312	0.09
313	0.06
314	0.07
315	0.07
316	0.07
317	0.07
318	0.08
319	0.08
320	0.08
321	0.08
322	0.07
323	0.08
324	0.12
325	0.15
326	0.15
327	0.16
328	0.16
329	0.17
330	0.22
331	0.27
332	0.3
333	0.29
334	0.34
335	0.37
336	0.4
337	0.41
338	0.42
339	0.42
340	0.39
341	0.4
342	0.35
343	0.34
344	0.37
345	0.35
346	0.29
347	0.25
348	0.21
349	0.19
350	0.19
351	0.16
352	0.11
353	0.13
354	0.14
355	0.13
356	0.14
357	0.15
358	0.16
359	0.16
360	0.16
361	0.17
362	0.17
363	0.16
364	0.17
365	0.19
366	0.2
367	0.22
368	0.22
369	0.19
370	0.18
371	0.19
372	0.18
373	0.18
374	0.17
375	0.17
376	0.17
377	0.17
378	0.16
379	0.15
380	0.15
381	0.12
382	0.1
383	0.09
384	0.09
385	0.09
386	0.12
387	0.13
388	0.13
389	0.17
390	0.21
391	0.24
392	0.24
393	0.28
394	0.28
395	0.29
396	0.32
397	0.29
398	0.27
399	0.27
400	0.3
401	0.3
402	0.27
403	0.28
404	0.26
405	0.27
406	0.28
407	0.28
408	0.26
409	0.23
410	0.24
411	0.27
412	0.32
413	0.3
414	0.28
415	0.32
416	0.33
417	0.32
418	0.3
419	0.25
420	0.19
421	0.17
422	0.15
423	0.09
424	0.06
425	0.05
426	0.05
427	0.04
428	0.04
429	0.04
430	0.04
431	0.05
432	0.06
433	0.06
434	0.06
435	0.06
436	0.11
437	0.1
438	0.13
439	0.13
440	0.16
441	0.16
442	0.16
443	0.16
444	0.12
445	0.13
446	0.11
447	0.1
448	0.07
449	0.07
450	0.07
451	0.07
452	0.07
453	0.06
454	0.08
455	0.09
456	0.11
457	0.11
458	0.11
459	0.11
460	0.12
461	0.13
462	0.11
463	0.09
464	0.08
465	0.09
466	0.1
467	0.11
468	0.15
469	0.15
470	0.19
471	0.22
472	0.22
473	0.21
474	0.2
475	0.19
476	0.16
477	0.15
478	0.1
479	0.11
480	0.11
481	0.13
482	0.16
483	0.17
484	0.24
485	0.33
486	0.41
487	0.48
488	0.56
489	0.65
490	0.73
491	0.83
492	0.83
493	0.84
494	0.82
495	0.79
496	0.76
497	0.68
498	0.57
499	0.54
500	0.52
501	0.47
502	0.46
503	0.45
504	0.45
505	0.5
506	0.56
507	0.52
508	0.54
509	0.54
510	0.5
511	0.49
512	0.46
513	0.4
514	0.41
515	0.46
516	0.42
517	0.42
518	0.41
519	0.39
520	0.37
521	0.35
522	0.28
523	0.22
524	0.2
525	0.18
526	0.17
527	0.17
528	0.15
529	0.16
530	0.15
531	0.12
532	0.09
533	0.08
534	0.1
535	0.1
536	0.1
537	0.1
538	0.12
539	0.12
540	0.14
541	0.16
542	0.16
543	0.17
544	0.17
545	0.17
546	0.17
547	0.2
548	0.2
549	0.2
550	0.17
551	0.14
552	0.14
553	0.18
554	0.23
555	0.25
556	0.29
557	0.3
558	0.34
559	0.37
560	0.42
561	0.45
562	0.41
563	0.38
564	0.33
565	0.36
566	0.38
567	0.36
568	0.32
569	0.26
570	0.23
571	0.22
572	0.22
573	0.18
574	0.13
575	0.13
576	0.11
577	0.11
578	0.11
579	0.12
580	0.1
581	0.09
582	0.08
583	0.13
584	0.15
585	0.16
586	0.21
587	0.23

A0A545A0D6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer