Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VMQ7

Protein Details
Accession H1VMQ7    Localization Confidence High Confidence Score 25.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
83-108TDGAKAKKPKEGRREKKRSRDDEVSGBasic
113-135DSGRPARKSRRQADGERKPRPKABasic
161-182DAAMKGPVKRKKKKDEIDLEDEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
76-102KASKRKVTDGAKAKKPKEGRREKKRSR
115-135GRPARKSRRQADGERKPRPKA
151-174RRRRAIDRALDAAMKGPVKRKKKK
423-425KKR
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
KEGG chig:CH63R_07653  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSDIESLPESPLPDRDDHLDNEEPREGAGGATATELSDDDQLSEMDEDQFEDYDPETANIEDRPVAVDEDVAKTLKASKRKVTDGAKAKKPKEGRREKKRSRDDEVSGELEGDSGRPARKSRRQADGERKPRPKAAEPEIDDESHLTPEERRRRAIDRALDAAMKGPVKRKKKKDEIDLEDEIDEQIADLKVAMEKACEADNSAREAGQPAVHKLKLLPTVTGLLNRNNIQHAILDPDTNFLQHVKFFLEPLNDGSLPAYNIQRDIFSALIRLPIEKEALLSSGIGKVVYFYTRSKRPEPSIKRMAERLLGDWSRPILKRTDDYKKRHVETRDFDYEALKMSQRQAGSSQFTLTQRPSQSARELEREAMLAPVVSSNRARPGGLPDSYTIAPKSTYDVSRAPEHRPIGAGGLEAFRKMTQNRKKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.28
3 0.3
4 0.31
5 0.36
6 0.38
7 0.37
8 0.39
9 0.39
10 0.34
11 0.3
12 0.29
13 0.23
14 0.15
15 0.15
16 0.1
17 0.08
18 0.09
19 0.09
20 0.07
21 0.07
22 0.08
23 0.08
24 0.1
25 0.09
26 0.09
27 0.1
28 0.1
29 0.11
30 0.12
31 0.12
32 0.11
33 0.11
34 0.11
35 0.11
36 0.12
37 0.1
38 0.11
39 0.1
40 0.11
41 0.11
42 0.11
43 0.11
44 0.11
45 0.13
46 0.12
47 0.13
48 0.11
49 0.11
50 0.12
51 0.12
52 0.13
53 0.11
54 0.13
55 0.13
56 0.15
57 0.16
58 0.15
59 0.13
60 0.13
61 0.2
62 0.24
63 0.3
64 0.34
65 0.4
66 0.47
67 0.52
68 0.6
69 0.59
70 0.63
71 0.66
72 0.69
73 0.71
74 0.73
75 0.7
76 0.69
77 0.72
78 0.72
79 0.72
80 0.75
81 0.76
82 0.79
83 0.88
84 0.91
85 0.92
86 0.94
87 0.9
88 0.87
89 0.84
90 0.77
91 0.72
92 0.66
93 0.57
94 0.46
95 0.39
96 0.29
97 0.21
98 0.17
99 0.11
100 0.08
101 0.08
102 0.1
103 0.12
104 0.16
105 0.26
106 0.35
107 0.45
108 0.51
109 0.59
110 0.65
111 0.72
112 0.79
113 0.81
114 0.82
115 0.82
116 0.81
117 0.74
118 0.71
119 0.67
120 0.63
121 0.6
122 0.58
123 0.57
124 0.54
125 0.56
126 0.53
127 0.47
128 0.4
129 0.33
130 0.26
131 0.17
132 0.14
133 0.1
134 0.11
135 0.2
136 0.3
137 0.31
138 0.33
139 0.37
140 0.41
141 0.48
142 0.52
143 0.49
144 0.44
145 0.44
146 0.42
147 0.38
148 0.33
149 0.28
150 0.22
151 0.17
152 0.15
153 0.19
154 0.26
155 0.36
156 0.46
157 0.54
158 0.62
159 0.72
160 0.79
161 0.81
162 0.84
163 0.81
164 0.79
165 0.71
166 0.61
167 0.51
168 0.43
169 0.32
170 0.21
171 0.13
172 0.06
173 0.06
174 0.05
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.05
179 0.06
180 0.06
181 0.05
182 0.05
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.07
187 0.09
188 0.1
189 0.13
190 0.13
191 0.12
192 0.12
193 0.13
194 0.12
195 0.13
196 0.12
197 0.12
198 0.16
199 0.16
200 0.16
201 0.15
202 0.18
203 0.21
204 0.21
205 0.18
206 0.16
207 0.18
208 0.19
209 0.22
210 0.2
211 0.16
212 0.18
213 0.19
214 0.19
215 0.17
216 0.17
217 0.14
218 0.13
219 0.11
220 0.12
221 0.12
222 0.11
223 0.11
224 0.12
225 0.12
226 0.11
227 0.11
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.08
232 0.09
233 0.09
234 0.09
235 0.12
236 0.12
237 0.12
238 0.14
239 0.16
240 0.14
241 0.14
242 0.14
243 0.12
244 0.11
245 0.13
246 0.12
247 0.09
248 0.1
249 0.11
250 0.1
251 0.1
252 0.11
253 0.1
254 0.08
255 0.09
256 0.08
257 0.11
258 0.11
259 0.11
260 0.1
261 0.11
262 0.12
263 0.1
264 0.11
265 0.08
266 0.09
267 0.09
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.09
277 0.1
278 0.12
279 0.19
280 0.26
281 0.31
282 0.35
283 0.4
284 0.47
285 0.56
286 0.61
287 0.64
288 0.67
289 0.67
290 0.66
291 0.62
292 0.57
293 0.51
294 0.44
295 0.36
296 0.34
297 0.3
298 0.27
299 0.25
300 0.24
301 0.25
302 0.25
303 0.25
304 0.22
305 0.25
306 0.31
307 0.37
308 0.47
309 0.5
310 0.56
311 0.64
312 0.69
313 0.7
314 0.71
315 0.7
316 0.68
317 0.65
318 0.67
319 0.63
320 0.55
321 0.52
322 0.46
323 0.39
324 0.32
325 0.28
326 0.21
327 0.17
328 0.18
329 0.22
330 0.21
331 0.22
332 0.22
333 0.26
334 0.29
335 0.28
336 0.27
337 0.28
338 0.29
339 0.32
340 0.31
341 0.33
342 0.29
343 0.33
344 0.35
345 0.34
346 0.39
347 0.42
348 0.44
349 0.43
350 0.44
351 0.41
352 0.39
353 0.35
354 0.29
355 0.23
356 0.18
357 0.11
358 0.09
359 0.11
360 0.11
361 0.13
362 0.14
363 0.16
364 0.22
365 0.24
366 0.24
367 0.23
368 0.3
369 0.34
370 0.34
371 0.33
372 0.28
373 0.32
374 0.32
375 0.33
376 0.26
377 0.2
378 0.19
379 0.18
380 0.21
381 0.22
382 0.24
383 0.26
384 0.29
385 0.32
386 0.41
387 0.43
388 0.44
389 0.46
390 0.46
391 0.43
392 0.41
393 0.37
394 0.31
395 0.29
396 0.24
397 0.18
398 0.2
399 0.18
400 0.17
401 0.17
402 0.15
403 0.2
404 0.24
405 0.33