Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A507CHD8

Protein Details
Accession A0A507CHD8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
611-635LKKIEARMPKVVKKRRRVMDPISGEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
618-627MPKVVKKRRR
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 3.5, cyto_mito 3.5, mito 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02184  HAT  
PF13181  TPR_8  
Amino Acid Sequences MAQRPSKVKDKRPAPVQITAEQILREAKERTAPQLKIPKQKISDKEELDEYKLAKRKQFEDAIRRNRTQVPTWMKARSIFERALEADHRNTNLWMKYAEMEMKLKNVNMARNIFDRAVAVLPRIDQFWYKYTYMEETLENVAGARQVFERWMEWEPPEEAWMAYIKMERRYGEIERARTLHQRFVSVHPEPKNWLKWAKFEENIGKIDRARAIYEQCIEALGEELIDQNVWVSFAKFETRQKEIDRARAIYKYSLDRLPKGQRENLYNVYTQFEKQFGAKEGIEDVVTAKRRVKYEEASASRSTPGYPLPPVELASNPKNYDVWFDYVKLEESNGDVAKIREVYERSIGQLPPINEKRFWRRYIYLWIFYAVWEELETKDHERTKEVYIQCLKTIPHKTFTFAKVWLLYAQYLIRQGDLDTARKTLGAAIGMCPKQNLFKGYIELEVSLREFDRARKLYERYLEWNPANCVAWIKFSELELQLGDVDRSRGIYEIAVSQPSLDMPEVLWKAYIDFEVEQQEWQRVRDLYSRLLERTEHVKVWISFANSEMSAMDHPDDATRISKARAIFEKGHAALKAKDAREERVILLEAWREYERSLIDNSTVQNDTELKKIEARMPKVVKKRRRVMDPISGEPAGWEEHYDFIFPEDDKDKPSFKLLSMAQKWKMQQALGNDDDDEDDEDEDEDEDEDAVDTDGKLKSTGIGKWEQTAADDADEDDEEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.77
3 0.72
4 0.66
5 0.62
6 0.55
7 0.48
8 0.38
9 0.34
10 0.29
11 0.26
12 0.26
13 0.22
14 0.22
15 0.28
16 0.3
17 0.37
18 0.43
19 0.43
20 0.48
21 0.57
22 0.63
23 0.66
24 0.7
25 0.7
26 0.68
27 0.75
28 0.75
29 0.73
30 0.74
31 0.67
32 0.65
33 0.63
34 0.59
35 0.54
36 0.49
37 0.42
38 0.41
39 0.44
40 0.44
41 0.42
42 0.45
43 0.45
44 0.5
45 0.57
46 0.59
47 0.63
48 0.7
49 0.75
50 0.77
51 0.75
52 0.71
53 0.7
54 0.66
55 0.6
56 0.59
57 0.58
58 0.57
59 0.61
60 0.6
61 0.55
62 0.55
63 0.55
64 0.51
65 0.47
66 0.42
67 0.37
68 0.38
69 0.36
70 0.35
71 0.33
72 0.31
73 0.3
74 0.32
75 0.32
76 0.29
77 0.3
78 0.32
79 0.3
80 0.29
81 0.24
82 0.22
83 0.22
84 0.24
85 0.25
86 0.22
87 0.24
88 0.23
89 0.27
90 0.27
91 0.26
92 0.28
93 0.28
94 0.3
95 0.33
96 0.35
97 0.34
98 0.35
99 0.38
100 0.33
101 0.29
102 0.25
103 0.2
104 0.2
105 0.17
106 0.15
107 0.13
108 0.14
109 0.14
110 0.15
111 0.14
112 0.14
113 0.16
114 0.19
115 0.23
116 0.22
117 0.23
118 0.24
119 0.26
120 0.26
121 0.25
122 0.22
123 0.19
124 0.2
125 0.19
126 0.17
127 0.13
128 0.11
129 0.11
130 0.11
131 0.09
132 0.08
133 0.09
134 0.1
135 0.11
136 0.12
137 0.14
138 0.17
139 0.18
140 0.18
141 0.21
142 0.21
143 0.2
144 0.2
145 0.17
146 0.14
147 0.12
148 0.13
149 0.1
150 0.1
151 0.13
152 0.15
153 0.19
154 0.22
155 0.22
156 0.24
157 0.28
158 0.3
159 0.36
160 0.39
161 0.38
162 0.39
163 0.4
164 0.4
165 0.43
166 0.43
167 0.4
168 0.35
169 0.36
170 0.35
171 0.38
172 0.43
173 0.39
174 0.44
175 0.4
176 0.41
177 0.41
178 0.45
179 0.44
180 0.41
181 0.45
182 0.4
183 0.43
184 0.49
185 0.51
186 0.46
187 0.47
188 0.49
189 0.45
190 0.46
191 0.41
192 0.36
193 0.29
194 0.3
195 0.28
196 0.23
197 0.21
198 0.21
199 0.22
200 0.23
201 0.24
202 0.22
203 0.18
204 0.17
205 0.15
206 0.12
207 0.1
208 0.07
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.06
221 0.07
222 0.1
223 0.13
224 0.19
225 0.23
226 0.26
227 0.29
228 0.31
229 0.39
230 0.4
231 0.45
232 0.43
233 0.42
234 0.41
235 0.4
236 0.39
237 0.33
238 0.32
239 0.28
240 0.27
241 0.3
242 0.29
243 0.29
244 0.34
245 0.4
246 0.43
247 0.44
248 0.45
249 0.44
250 0.46
251 0.5
252 0.48
253 0.42
254 0.37
255 0.33
256 0.3
257 0.27
258 0.23
259 0.19
260 0.15
261 0.13
262 0.13
263 0.15
264 0.15
265 0.17
266 0.16
267 0.16
268 0.15
269 0.15
270 0.14
271 0.11
272 0.1
273 0.12
274 0.13
275 0.14
276 0.17
277 0.2
278 0.22
279 0.25
280 0.29
281 0.27
282 0.33
283 0.41
284 0.4
285 0.41
286 0.4
287 0.37
288 0.34
289 0.31
290 0.24
291 0.16
292 0.14
293 0.12
294 0.12
295 0.12
296 0.12
297 0.13
298 0.13
299 0.13
300 0.14
301 0.16
302 0.18
303 0.21
304 0.2
305 0.2
306 0.19
307 0.19
308 0.21
309 0.18
310 0.18
311 0.15
312 0.16
313 0.16
314 0.16
315 0.17
316 0.13
317 0.11
318 0.08
319 0.08
320 0.09
321 0.09
322 0.08
323 0.09
324 0.09
325 0.1
326 0.1
327 0.1
328 0.11
329 0.12
330 0.13
331 0.16
332 0.16
333 0.17
334 0.2
335 0.19
336 0.17
337 0.19
338 0.18
339 0.24
340 0.28
341 0.28
342 0.26
343 0.3
344 0.38
345 0.41
346 0.42
347 0.39
348 0.37
349 0.38
350 0.46
351 0.47
352 0.4
353 0.35
354 0.33
355 0.28
356 0.26
357 0.24
358 0.13
359 0.09
360 0.07
361 0.07
362 0.06
363 0.08
364 0.1
365 0.1
366 0.14
367 0.17
368 0.17
369 0.19
370 0.21
371 0.22
372 0.29
373 0.27
374 0.3
375 0.32
376 0.32
377 0.3
378 0.3
379 0.28
380 0.28
381 0.33
382 0.28
383 0.3
384 0.29
385 0.32
386 0.34
387 0.36
388 0.32
389 0.27
390 0.27
391 0.21
392 0.21
393 0.19
394 0.15
395 0.13
396 0.11
397 0.11
398 0.1
399 0.11
400 0.11
401 0.1
402 0.09
403 0.09
404 0.13
405 0.15
406 0.17
407 0.15
408 0.16
409 0.16
410 0.15
411 0.15
412 0.11
413 0.1
414 0.09
415 0.08
416 0.09
417 0.15
418 0.16
419 0.16
420 0.15
421 0.14
422 0.16
423 0.18
424 0.18
425 0.15
426 0.16
427 0.19
428 0.19
429 0.2
430 0.18
431 0.16
432 0.14
433 0.12
434 0.11
435 0.09
436 0.08
437 0.08
438 0.09
439 0.11
440 0.2
441 0.21
442 0.24
443 0.29
444 0.32
445 0.36
446 0.4
447 0.4
448 0.37
449 0.4
450 0.43
451 0.39
452 0.39
453 0.35
454 0.32
455 0.29
456 0.24
457 0.22
458 0.16
459 0.17
460 0.15
461 0.16
462 0.15
463 0.14
464 0.18
465 0.16
466 0.16
467 0.13
468 0.13
469 0.11
470 0.11
471 0.11
472 0.07
473 0.07
474 0.07
475 0.07
476 0.07
477 0.07
478 0.07
479 0.07
480 0.08
481 0.1
482 0.11
483 0.11
484 0.11
485 0.1
486 0.1
487 0.09
488 0.1
489 0.07
490 0.06
491 0.06
492 0.13
493 0.13
494 0.13
495 0.13
496 0.12
497 0.13
498 0.13
499 0.13
500 0.09
501 0.09
502 0.1
503 0.14
504 0.14
505 0.15
506 0.15
507 0.2
508 0.19
509 0.19
510 0.22
511 0.19
512 0.22
513 0.27
514 0.29
515 0.29
516 0.33
517 0.35
518 0.32
519 0.33
520 0.3
521 0.27
522 0.3
523 0.28
524 0.23
525 0.22
526 0.27
527 0.25
528 0.28
529 0.29
530 0.25
531 0.22
532 0.22
533 0.23
534 0.16
535 0.16
536 0.13
537 0.11
538 0.1
539 0.11
540 0.1
541 0.08
542 0.09
543 0.09
544 0.1
545 0.1
546 0.11
547 0.12
548 0.13
549 0.14
550 0.17
551 0.18
552 0.23
553 0.27
554 0.31
555 0.33
556 0.35
557 0.41
558 0.39
559 0.4
560 0.35
561 0.33
562 0.29
563 0.33
564 0.37
565 0.3
566 0.36
567 0.35
568 0.38
569 0.39
570 0.4
571 0.33
572 0.3
573 0.3
574 0.24
575 0.24
576 0.23
577 0.18
578 0.19
579 0.19
580 0.16
581 0.15
582 0.18
583 0.17
584 0.16
585 0.18
586 0.15
587 0.16
588 0.19
589 0.2
590 0.21
591 0.21
592 0.19
593 0.19
594 0.21
595 0.21
596 0.23
597 0.25
598 0.22
599 0.25
600 0.28
601 0.33
602 0.38
603 0.41
604 0.46
605 0.51
606 0.58
607 0.65
608 0.72
609 0.74
610 0.76
611 0.82
612 0.81
613 0.82
614 0.82
615 0.8
616 0.8
617 0.77
618 0.71
619 0.67
620 0.58
621 0.49
622 0.4
623 0.34
624 0.24
625 0.18
626 0.15
627 0.1
628 0.12
629 0.13
630 0.13
631 0.12
632 0.12
633 0.15
634 0.13
635 0.17
636 0.17
637 0.18
638 0.21
639 0.25
640 0.26
641 0.25
642 0.31
643 0.29
644 0.27
645 0.34
646 0.35
647 0.42
648 0.47
649 0.54
650 0.52
651 0.55
652 0.57
653 0.55
654 0.53
655 0.44
656 0.4
657 0.39
658 0.42
659 0.39
660 0.38
661 0.32
662 0.3
663 0.29
664 0.26
665 0.21
666 0.14
667 0.12
668 0.11
669 0.11
670 0.11
671 0.11
672 0.1
673 0.08
674 0.08
675 0.08
676 0.07
677 0.07
678 0.07
679 0.07
680 0.08
681 0.07
682 0.11
683 0.12
684 0.13
685 0.13
686 0.13
687 0.16
688 0.2
689 0.23
690 0.25
691 0.3
692 0.31
693 0.34
694 0.36
695 0.32
696 0.29
697 0.3
698 0.26
699 0.2
700 0.19
701 0.16
702 0.16