Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A507C560

Protein Details
Accession A0A507C560    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-32MGKRKRSKVEDFQKPKLRVGKRKPHAENQTDTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
3-24KRKRSKVEDFQKPKLRVGKRKP
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR024679  Ipi1_N  
IPR000684  RNA_pol_II_repeat_euk  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0097344  C:Rix1 complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF12333  Ipi1_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00115  RNA_POL_II_REPEAT  
Amino Acid Sequences MGKRKRSKVEDFQKPKLRVGKRKPHAENQTDTSFKSKSIVVPAQSISEDKTHQVTSSRNQSINELIQQLHHFNSLAKRDAIAGLRDILKNRRQGFELYLSPVLQGLCRLLIDENNSVRSGTITLIQDILTQFREEGFRPNASLAVSFALSGMTHLIEDVRIDAFKFLVILFRMVPGTMYTFHSRLLPQFVLMLGGGSDSRKDSAVRALTGSKQFRLELVTATHAFLGICLVPPKTKLKDFIPSGDIYVPGSPCFSPTSRPNSPMSPTYSPTSPTYSPNSPTYHPSSWKADEEASPFSHYYVSCVKH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.78
3 0.77
4 0.76
5 0.76
6 0.78
7 0.79
8 0.78
9 0.86
10 0.86
11 0.87
12 0.87
13 0.83
14 0.79
15 0.74
16 0.72
17 0.63
18 0.56
19 0.51
20 0.41
21 0.34
22 0.29
23 0.25
24 0.21
25 0.28
26 0.32
27 0.3
28 0.33
29 0.33
30 0.33
31 0.31
32 0.29
33 0.22
34 0.2
35 0.19
36 0.17
37 0.2
38 0.18
39 0.19
40 0.22
41 0.24
42 0.29
43 0.38
44 0.41
45 0.4
46 0.4
47 0.41
48 0.42
49 0.41
50 0.37
51 0.29
52 0.23
53 0.23
54 0.25
55 0.24
56 0.2
57 0.18
58 0.15
59 0.16
60 0.22
61 0.23
62 0.25
63 0.23
64 0.22
65 0.22
66 0.25
67 0.25
68 0.2
69 0.17
70 0.16
71 0.19
72 0.2
73 0.22
74 0.25
75 0.28
76 0.34
77 0.36
78 0.36
79 0.34
80 0.35
81 0.36
82 0.36
83 0.33
84 0.29
85 0.27
86 0.25
87 0.23
88 0.22
89 0.18
90 0.12
91 0.11
92 0.07
93 0.07
94 0.06
95 0.07
96 0.07
97 0.08
98 0.11
99 0.15
100 0.16
101 0.17
102 0.17
103 0.17
104 0.16
105 0.15
106 0.12
107 0.09
108 0.12
109 0.11
110 0.11
111 0.11
112 0.11
113 0.12
114 0.11
115 0.12
116 0.09
117 0.08
118 0.08
119 0.08
120 0.1
121 0.09
122 0.14
123 0.16
124 0.15
125 0.16
126 0.16
127 0.16
128 0.15
129 0.14
130 0.09
131 0.07
132 0.07
133 0.06
134 0.06
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.04
139 0.04
140 0.03
141 0.03
142 0.03
143 0.03
144 0.03
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.05
150 0.05
151 0.04
152 0.05
153 0.04
154 0.06
155 0.06
156 0.07
157 0.07
158 0.08
159 0.08
160 0.07
161 0.08
162 0.06
163 0.07
164 0.08
165 0.11
166 0.13
167 0.13
168 0.14
169 0.15
170 0.15
171 0.15
172 0.19
173 0.16
174 0.13
175 0.13
176 0.13
177 0.12
178 0.11
179 0.09
180 0.04
181 0.05
182 0.05
183 0.04
184 0.05
185 0.05
186 0.06
187 0.07
188 0.08
189 0.09
190 0.15
191 0.17
192 0.18
193 0.19
194 0.2
195 0.23
196 0.3
197 0.31
198 0.26
199 0.25
200 0.25
201 0.24
202 0.25
203 0.21
204 0.16
205 0.16
206 0.18
207 0.17
208 0.18
209 0.17
210 0.14
211 0.13
212 0.11
213 0.1
214 0.06
215 0.07
216 0.08
217 0.09
218 0.1
219 0.13
220 0.2
221 0.23
222 0.26
223 0.3
224 0.32
225 0.41
226 0.43
227 0.44
228 0.41
229 0.37
230 0.36
231 0.32
232 0.29
233 0.21
234 0.2
235 0.17
236 0.13
237 0.15
238 0.12
239 0.13
240 0.16
241 0.16
242 0.19
243 0.26
244 0.34
245 0.37
246 0.41
247 0.43
248 0.44
249 0.47
250 0.46
251 0.47
252 0.43
253 0.41
254 0.42
255 0.4
256 0.39
257 0.37
258 0.38
259 0.33
260 0.33
261 0.36
262 0.37
263 0.4
264 0.42
265 0.43
266 0.4
267 0.44
268 0.47
269 0.47
270 0.47
271 0.48
272 0.5
273 0.5
274 0.51
275 0.48
276 0.43
277 0.41
278 0.4
279 0.39
280 0.34
281 0.32
282 0.29
283 0.27
284 0.27
285 0.23
286 0.24