Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A512UGN4

Protein Details
Accession A0A512UGN4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
205-229ERTLAKQAKKHLKKEPTTKQFPSMRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
210-231KQAKKHLKKEPTTKQFPSMRKR
Subcellular Location(s) cyto 12, cyto_nucl 11, nucl 8, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR034158  SF3B4_RRM1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12334  RRM1_SF3B4  
Amino Acid Sequences MNVFRKPQENERNINATIYVGNLDAQVTEALLYELFIQVAPVKSLNLPKDRVLRTHQGFGFVEFRTAEDAGYTINVLRGVRFFGRMLKMKKIDPSGSGSNAPDLKQVAGVGAKLFIKNLHQLVDEKYLQNTFAAIGNLINQPVIVRDDKGHSKGYGFIEFGDFESSDRAIERLSGAILMNNRINLSYAYKEGLEGKKIQHGDSAERTLAKQAKKHLKKEPTTKQFPSMRKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.44
3 0.34
4 0.27
5 0.21
6 0.15
7 0.1
8 0.1
9 0.09
10 0.09
11 0.07
12 0.08
13 0.07
14 0.06
15 0.06
16 0.06
17 0.06
18 0.06
19 0.06
20 0.06
21 0.06
22 0.06
23 0.06
24 0.06
25 0.08
26 0.09
27 0.1
28 0.1
29 0.11
30 0.13
31 0.2
32 0.25
33 0.28
34 0.29
35 0.33
36 0.42
37 0.43
38 0.44
39 0.45
40 0.48
41 0.47
42 0.52
43 0.47
44 0.44
45 0.42
46 0.41
47 0.38
48 0.28
49 0.26
50 0.18
51 0.18
52 0.16
53 0.15
54 0.12
55 0.09
56 0.09
57 0.07
58 0.07
59 0.07
60 0.05
61 0.05
62 0.07
63 0.07
64 0.07
65 0.08
66 0.1
67 0.11
68 0.12
69 0.12
70 0.15
71 0.2
72 0.27
73 0.3
74 0.34
75 0.36
76 0.37
77 0.41
78 0.4
79 0.37
80 0.32
81 0.34
82 0.29
83 0.29
84 0.28
85 0.24
86 0.22
87 0.22
88 0.2
89 0.16
90 0.14
91 0.12
92 0.1
93 0.1
94 0.08
95 0.07
96 0.07
97 0.06
98 0.06
99 0.07
100 0.06
101 0.07
102 0.06
103 0.07
104 0.1
105 0.11
106 0.11
107 0.11
108 0.12
109 0.15
110 0.2
111 0.19
112 0.17
113 0.17
114 0.16
115 0.16
116 0.14
117 0.12
118 0.07
119 0.08
120 0.07
121 0.07
122 0.06
123 0.08
124 0.09
125 0.09
126 0.08
127 0.06
128 0.06
129 0.07
130 0.09
131 0.08
132 0.08
133 0.09
134 0.14
135 0.18
136 0.21
137 0.22
138 0.2
139 0.2
140 0.24
141 0.26
142 0.24
143 0.2
144 0.18
145 0.17
146 0.17
147 0.17
148 0.14
149 0.11
150 0.09
151 0.11
152 0.1
153 0.09
154 0.09
155 0.09
156 0.07
157 0.07
158 0.08
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.09
164 0.11
165 0.13
166 0.14
167 0.14
168 0.14
169 0.13
170 0.14
171 0.13
172 0.16
173 0.15
174 0.15
175 0.16
176 0.16
177 0.17
178 0.23
179 0.24
180 0.24
181 0.24
182 0.25
183 0.3
184 0.32
185 0.31
186 0.29
187 0.28
188 0.32
189 0.34
190 0.37
191 0.32
192 0.32
193 0.32
194 0.35
195 0.39
196 0.37
197 0.36
198 0.42
199 0.51
200 0.59
201 0.67
202 0.69
203 0.74
204 0.79
205 0.85
206 0.86
207 0.86
208 0.86
209 0.82
210 0.81
211 0.79