Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A507B5Y2

Protein Details
Accession A0A507B5Y2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
104-124DGVAPRAKMNQQRSRRFRTAQHydrophilic
1005-1027GYDGRGSRPYDNRDRNRNYRGSGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
425-426KR
Subcellular Location(s) nucl 9.5, mito 9, cyto_nucl 8.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGIPAAFRWLSSKYPKIISSVVEEQPVTMDDGTVIPVDYTRSNPNGEEFDNLYLDMNGIVHPCSHPEDRPPPKDEEEMMMEVFKYTDRVVNMVRPRKVLMIAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRTAQDAKQKEEDKQELLKLLKQQNGGVLAAESLETVTKKAFDSNSITPGTPFMDILAASLRYWCAYKLNTDPAWASLKIIISDATVPGEGEHKIMDFVRSQRSSPDHDPNTRHVIYGLDADLIMLSLATHEPHFRVLREDVFFQESKARMCKLCGQKGHEARACQGEAKEKAGDFDEKDKAHPLKPFIWLHVSVLREYLAVELDVPGLPFRWDLERAIDDWVFLCCFVGNDFLPHLPALEIRENGINTLTSIWKENLPYMGGYVTKDGHIDLERAQVIMSGLAKQEDAIFRRRKQQEDRREENAKRRKLQDQSSRRGYQQEAPLSNSKNRDQAYINNSDSISLRAISDIPADLPRNMTHDMVVNRGAVQQANLANKSAASVLKSRMQGHASQAAPDTPKKTDDAPQNDASDALTTPPTVLGKRKAAIETNDDDASSTPGAATPGTPSVSTADGPVDTVRLWEEGYGDRYYAQKFHVDPKDIEFRHKVARSYVEGLAWVLLYYFQGCPSWDWYYPYHYAPFAADFVDLSKMKISFEKGRISKPFEQLMSVLPAASRHALPEVFHDLMLNQDSEIIDFYPEDFEVDLNGKKMAWQGVALLPFIDMSRLLEAVEKKYPLLSREDQVRNGVGKVLLMLSDAHPGLYDEITTNFYSKRQGAPKFKLDPRTSDGLAGRVEKVDEYLPHGSLVYPLERSAMPDIEYDRSLSVHYEIPSQSHGHKSMLLRGVKLPDVVLDRNDKEQLKSKTSRSGRNHGGAPFNNRGGYHGGGRNEGRNEPGYYGSSGSYARPQPSYGGRNDYNSRDQYSGLPPPPPPGSGWAPPPPGYPGFGMGHPPPPPPAHLSGGSDGRGHNQSWNQGYAGAYPPPPPPHRYPQTGYQQGYGRGSRAPSGYDGRGSRPYDNRDRNRNYRGSGGY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.46
3 0.47
4 0.47
5 0.42
6 0.42
7 0.42
8 0.39
9 0.37
10 0.35
11 0.31
12 0.29
13 0.28
14 0.22
15 0.15
16 0.13
17 0.1
18 0.11
19 0.12
20 0.11
21 0.1
22 0.08
23 0.08
24 0.11
25 0.12
26 0.15
27 0.2
28 0.22
29 0.25
30 0.26
31 0.29
32 0.31
33 0.31
34 0.31
35 0.28
36 0.27
37 0.26
38 0.25
39 0.22
40 0.17
41 0.16
42 0.12
43 0.1
44 0.08
45 0.09
46 0.09
47 0.09
48 0.1
49 0.13
50 0.18
51 0.21
52 0.23
53 0.31
54 0.42
55 0.51
56 0.57
57 0.59
58 0.59
59 0.6
60 0.62
61 0.55
62 0.49
63 0.44
64 0.4
65 0.36
66 0.3
67 0.25
68 0.21
69 0.19
70 0.14
71 0.11
72 0.1
73 0.13
74 0.13
75 0.17
76 0.2
77 0.28
78 0.37
79 0.44
80 0.46
81 0.45
82 0.46
83 0.45
84 0.44
85 0.39
86 0.32
87 0.29
88 0.26
89 0.25
90 0.24
91 0.21
92 0.2
93 0.18
94 0.15
95 0.1
96 0.13
97 0.19
98 0.26
99 0.36
100 0.45
101 0.55
102 0.66
103 0.74
104 0.8
105 0.82
106 0.79
107 0.76
108 0.77
109 0.77
110 0.76
111 0.78
112 0.74
113 0.7
114 0.74
115 0.69
116 0.64
117 0.62
118 0.57
119 0.51
120 0.5
121 0.48
122 0.45
123 0.44
124 0.43
125 0.43
126 0.45
127 0.45
128 0.42
129 0.4
130 0.38
131 0.38
132 0.34
133 0.26
134 0.2
135 0.15
136 0.13
137 0.12
138 0.08
139 0.05
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.08
144 0.09
145 0.1
146 0.15
147 0.16
148 0.18
149 0.25
150 0.28
151 0.32
152 0.33
153 0.32
154 0.28
155 0.29
156 0.26
157 0.19
158 0.16
159 0.11
160 0.1
161 0.1
162 0.1
163 0.12
164 0.11
165 0.1
166 0.11
167 0.11
168 0.1
169 0.11
170 0.12
171 0.13
172 0.14
173 0.19
174 0.24
175 0.31
176 0.31
177 0.33
178 0.32
179 0.31
180 0.34
181 0.29
182 0.25
183 0.19
184 0.2
185 0.18
186 0.18
187 0.15
188 0.11
189 0.12
190 0.12
191 0.1
192 0.09
193 0.09
194 0.08
195 0.1
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.08
200 0.09
201 0.1
202 0.11
203 0.13
204 0.17
205 0.25
206 0.27
207 0.27
208 0.31
209 0.34
210 0.4
211 0.43
212 0.5
213 0.48
214 0.53
215 0.56
216 0.56
217 0.6
218 0.53
219 0.46
220 0.37
221 0.31
222 0.25
223 0.24
224 0.19
225 0.11
226 0.1
227 0.1
228 0.09
229 0.08
230 0.06
231 0.04
232 0.03
233 0.03
234 0.04
235 0.05
236 0.06
237 0.07
238 0.08
239 0.14
240 0.16
241 0.15
242 0.19
243 0.22
244 0.26
245 0.27
246 0.28
247 0.25
248 0.28
249 0.27
250 0.24
251 0.27
252 0.23
253 0.24
254 0.26
255 0.26
256 0.23
257 0.26
258 0.34
259 0.38
260 0.44
261 0.47
262 0.49
263 0.56
264 0.61
265 0.67
266 0.61
267 0.53
268 0.48
269 0.47
270 0.42
271 0.35
272 0.3
273 0.29
274 0.28
275 0.29
276 0.28
277 0.23
278 0.24
279 0.24
280 0.25
281 0.19
282 0.23
283 0.26
284 0.25
285 0.26
286 0.32
287 0.32
288 0.33
289 0.35
290 0.34
291 0.31
292 0.38
293 0.38
294 0.34
295 0.36
296 0.32
297 0.31
298 0.31
299 0.29
300 0.21
301 0.2
302 0.18
303 0.13
304 0.13
305 0.11
306 0.07
307 0.06
308 0.06
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.07
318 0.09
319 0.11
320 0.12
321 0.15
322 0.16
323 0.16
324 0.2
325 0.18
326 0.15
327 0.14
328 0.14
329 0.1
330 0.09
331 0.08
332 0.05
333 0.05
334 0.06
335 0.08
336 0.07
337 0.08
338 0.1
339 0.1
340 0.1
341 0.1
342 0.1
343 0.07
344 0.08
345 0.11
346 0.13
347 0.13
348 0.13
349 0.16
350 0.15
351 0.16
352 0.15
353 0.11
354 0.09
355 0.1
356 0.1
357 0.08
358 0.1
359 0.11
360 0.12
361 0.13
362 0.14
363 0.13
364 0.13
365 0.12
366 0.11
367 0.11
368 0.1
369 0.1
370 0.1
371 0.09
372 0.09
373 0.09
374 0.09
375 0.1
376 0.1
377 0.1
378 0.1
379 0.13
380 0.13
381 0.13
382 0.12
383 0.11
384 0.1
385 0.1
386 0.1
387 0.07
388 0.07
389 0.07
390 0.07
391 0.07
392 0.09
393 0.11
394 0.13
395 0.2
396 0.26
397 0.28
398 0.38
399 0.42
400 0.47
401 0.55
402 0.63
403 0.66
404 0.69
405 0.74
406 0.71
407 0.75
408 0.72
409 0.72
410 0.71
411 0.67
412 0.63
413 0.61
414 0.61
415 0.6
416 0.65
417 0.66
418 0.66
419 0.67
420 0.7
421 0.67
422 0.61
423 0.57
424 0.5
425 0.45
426 0.42
427 0.4
428 0.33
429 0.35
430 0.38
431 0.37
432 0.38
433 0.36
434 0.31
435 0.31
436 0.3
437 0.29
438 0.27
439 0.31
440 0.32
441 0.35
442 0.34
443 0.3
444 0.29
445 0.27
446 0.25
447 0.2
448 0.16
449 0.09
450 0.09
451 0.07
452 0.08
453 0.07
454 0.07
455 0.06
456 0.06
457 0.09
458 0.1
459 0.09
460 0.1
461 0.1
462 0.13
463 0.14
464 0.14
465 0.12
466 0.15
467 0.16
468 0.16
469 0.17
470 0.13
471 0.12
472 0.13
473 0.13
474 0.09
475 0.08
476 0.09
477 0.11
478 0.13
479 0.13
480 0.13
481 0.12
482 0.12
483 0.12
484 0.11
485 0.08
486 0.08
487 0.1
488 0.11
489 0.17
490 0.19
491 0.2
492 0.21
493 0.22
494 0.22
495 0.22
496 0.27
497 0.22
498 0.2
499 0.19
500 0.18
501 0.18
502 0.18
503 0.18
504 0.12
505 0.13
506 0.14
507 0.15
508 0.2
509 0.26
510 0.31
511 0.34
512 0.36
513 0.36
514 0.34
515 0.33
516 0.27
517 0.19
518 0.13
519 0.09
520 0.06
521 0.05
522 0.05
523 0.06
524 0.07
525 0.08
526 0.11
527 0.14
528 0.17
529 0.18
530 0.2
531 0.21
532 0.23
533 0.24
534 0.25
535 0.23
536 0.23
537 0.22
538 0.2
539 0.19
540 0.16
541 0.15
542 0.11
543 0.08
544 0.05
545 0.06
546 0.06
547 0.06
548 0.06
549 0.05
550 0.07
551 0.08
552 0.08
553 0.08
554 0.09
555 0.09
556 0.09
557 0.09
558 0.08
559 0.07
560 0.08
561 0.07
562 0.07
563 0.06
564 0.06
565 0.06
566 0.06
567 0.06
568 0.06
569 0.07
570 0.08
571 0.11
572 0.11
573 0.1
574 0.11
575 0.13
576 0.13
577 0.13
578 0.13
579 0.14
580 0.15
581 0.23
582 0.28
583 0.29
584 0.29
585 0.33
586 0.41
587 0.37
588 0.4
589 0.34
590 0.31
591 0.35
592 0.37
593 0.34
594 0.28
595 0.31
596 0.3
597 0.32
598 0.3
599 0.22
600 0.2
601 0.19
602 0.16
603 0.12
604 0.09
605 0.05
606 0.04
607 0.04
608 0.05
609 0.05
610 0.05
611 0.06
612 0.07
613 0.08
614 0.12
615 0.15
616 0.15
617 0.18
618 0.19
619 0.23
620 0.25
621 0.26
622 0.23
623 0.2
624 0.19
625 0.17
626 0.17
627 0.12
628 0.1
629 0.09
630 0.07
631 0.08
632 0.12
633 0.11
634 0.1
635 0.12
636 0.12
637 0.12
638 0.14
639 0.18
640 0.21
641 0.25
642 0.33
643 0.33
644 0.39
645 0.43
646 0.49
647 0.5
648 0.48
649 0.48
650 0.4
651 0.39
652 0.33
653 0.3
654 0.26
655 0.2
656 0.15
657 0.11
658 0.11
659 0.11
660 0.12
661 0.1
662 0.07
663 0.09
664 0.1
665 0.1
666 0.13
667 0.18
668 0.17
669 0.16
670 0.16
671 0.14
672 0.15
673 0.16
674 0.12
675 0.07
676 0.08
677 0.08
678 0.08
679 0.09
680 0.07
681 0.06
682 0.06
683 0.07
684 0.07
685 0.07
686 0.07
687 0.06
688 0.06
689 0.07
690 0.09
691 0.1
692 0.09
693 0.1
694 0.09
695 0.1
696 0.12
697 0.13
698 0.11
699 0.11
700 0.12
701 0.15
702 0.16
703 0.15
704 0.12
705 0.1
706 0.1
707 0.1
708 0.08
709 0.05
710 0.05
711 0.06
712 0.06
713 0.07
714 0.1
715 0.12
716 0.15
717 0.19
718 0.18
719 0.17
720 0.2
721 0.22
722 0.2
723 0.26
724 0.25
725 0.26
726 0.35
727 0.39
728 0.37
729 0.38
730 0.39
731 0.33
732 0.3
733 0.28
734 0.18
735 0.14
736 0.13
737 0.11
738 0.08
739 0.07
740 0.08
741 0.07
742 0.1
743 0.1
744 0.09
745 0.09
746 0.1
747 0.1
748 0.09
749 0.09
750 0.07
751 0.08
752 0.11
753 0.12
754 0.13
755 0.12
756 0.13
757 0.17
758 0.18
759 0.25
760 0.3
761 0.39
762 0.47
763 0.53
764 0.61
765 0.65
766 0.69
767 0.71
768 0.65
769 0.62
770 0.58
771 0.56
772 0.48
773 0.44
774 0.39
775 0.33
776 0.32
777 0.28
778 0.24
779 0.19
780 0.19
781 0.14
782 0.14
783 0.14
784 0.12
785 0.16
786 0.17
787 0.17
788 0.17
789 0.17
790 0.16
791 0.16
792 0.17
793 0.13
794 0.12
795 0.11
796 0.13
797 0.13
798 0.15
799 0.16
800 0.16
801 0.15
802 0.16
803 0.19
804 0.19
805 0.2
806 0.18
807 0.16
808 0.15
809 0.14
810 0.14
811 0.13
812 0.15
813 0.15
814 0.19
815 0.18
816 0.2
817 0.22
818 0.23
819 0.23
820 0.25
821 0.26
822 0.23
823 0.28
824 0.28
825 0.33
826 0.38
827 0.37
828 0.33
829 0.34
830 0.36
831 0.33
832 0.32
833 0.24
834 0.2
835 0.22
836 0.22
837 0.22
838 0.25
839 0.26
840 0.29
841 0.34
842 0.32
843 0.32
844 0.39
845 0.42
846 0.44
847 0.49
848 0.49
849 0.54
850 0.59
851 0.66
852 0.65
853 0.68
854 0.67
855 0.67
856 0.68
857 0.61
858 0.63
859 0.57
860 0.57
861 0.53
862 0.47
863 0.43
864 0.38
865 0.36
866 0.32
867 0.3
868 0.29
869 0.28
870 0.28
871 0.31
872 0.33
873 0.36
874 0.35
875 0.34
876 0.32
877 0.3
878 0.3
879 0.27
880 0.28
881 0.25
882 0.23
883 0.23
884 0.2
885 0.18
886 0.17
887 0.17
888 0.21
889 0.23
890 0.25
891 0.25
892 0.26
893 0.29
894 0.36
895 0.4
896 0.38
897 0.41
898 0.41
899 0.46
900 0.5
901 0.51
902 0.51
903 0.49
904 0.48
905 0.41
906 0.4
907 0.38
908 0.39
909 0.42
910 0.37
911 0.37
912 0.34
913 0.38
914 0.39
915 0.36
916 0.31
917 0.29
918 0.31
919 0.32
920 0.38
921 0.39
922 0.41
923 0.41
924 0.41
925 0.4
926 0.36
927 0.34
928 0.28
929 0.26
930 0.24
931 0.24
932 0.27
933 0.25
934 0.29
935 0.29
936 0.29
937 0.28
938 0.28
939 0.31
940 0.31
941 0.33
942 0.32
943 0.33
944 0.36
945 0.37
946 0.38
947 0.36
948 0.33
949 0.28
950 0.29
951 0.29
952 0.26
953 0.27
954 0.28
955 0.34
956 0.36
957 0.38
958 0.33
959 0.32
960 0.32
961 0.29
962 0.28
963 0.24
964 0.22
965 0.23
966 0.28
967 0.34
968 0.38
969 0.41
970 0.45
971 0.52
972 0.59
973 0.64
974 0.63
975 0.65
976 0.72
977 0.74
978 0.68
979 0.63
980 0.6
981 0.57
982 0.58
983 0.5
984 0.41
985 0.36
986 0.35
987 0.34
988 0.3
989 0.28
990 0.27
991 0.31
992 0.33
993 0.36
994 0.36
995 0.37
996 0.44
997 0.45
998 0.47
999 0.49
1000 0.55
1001 0.6
1002 0.68
1003 0.73
1004 0.76
1005 0.82
1006 0.84
1007 0.85
1008 0.84
1009 0.76