Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A507AM62

Protein Details
Accession A0A507AM62    Localization Confidence High Confidence Score 19.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MSDHNRSRRPQGRQAWDEPQHydrophilic
24-82DRTGGGRPRDRRDRDDRDRRRDDDDRGHDQDRRRHRSRSRDRRDRNRSPPRHDDRRDYGBasic
294-316NVSGVRKEKKTEYRQYMNRQGGFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
22-112RRDRTGGGRPRDRRDRDDRDRRRDDDDRGHDQDRRRHRSRSRDRRDRNRSPPRHDDRRDYGRDRPREGGRDRDPDRRGRDEPGARHRGAVS
Subcellular Location(s) nucl 26, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MSDHNRSRRPQGRQAWDEPQERRDRTGGGRPRDRRDRDDRDRRRDDDDRGHDQDRRRHRSRSRDRRDRNRSPPRHDDRRDYGRDRPREGGRDRDPDRRGRDEPGARHRGAVSPPARGDRGGMHMYQSLVFRPRDLEMSFCAEEVQSLSIGAAVANTLTKERDRDSNNNNNRRRSASPQRSQSPERRSYRDDRGAPLPTRSKGPPEKSMSMSFRVGGGGHEERGRTRERSYEEEQHRDSFEGTPMDEDRPEGGAADGDDDDDVVVEDDDGMAAMQAMMGFGSFGTTKNKKVLGNNVSGVRKEKKTEYRQYMNRQGGFNRPLSPSR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.79
3 0.78
4 0.77
5 0.71
6 0.69
7 0.68
8 0.62
9 0.59
10 0.52
11 0.48
12 0.47
13 0.53
14 0.53
15 0.54
16 0.62
17 0.66
18 0.73
19 0.79
20 0.79
21 0.78
22 0.79
23 0.8
24 0.81
25 0.85
26 0.86
27 0.86
28 0.88
29 0.82
30 0.8
31 0.76
32 0.73
33 0.72
34 0.7
35 0.67
36 0.65
37 0.65
38 0.61
39 0.62
40 0.62
41 0.63
42 0.64
43 0.62
44 0.65
45 0.7
46 0.77
47 0.81
48 0.84
49 0.84
50 0.86
51 0.91
52 0.93
53 0.95
54 0.94
55 0.94
56 0.94
57 0.92
58 0.89
59 0.9
60 0.88
61 0.88
62 0.83
63 0.81
64 0.78
65 0.79
66 0.78
67 0.72
68 0.71
69 0.7
70 0.71
71 0.66
72 0.64
73 0.61
74 0.61
75 0.6
76 0.6
77 0.58
78 0.61
79 0.6
80 0.63
81 0.61
82 0.6
83 0.63
84 0.6
85 0.55
86 0.51
87 0.55
88 0.53
89 0.56
90 0.58
91 0.58
92 0.52
93 0.5
94 0.46
95 0.41
96 0.36
97 0.37
98 0.29
99 0.26
100 0.27
101 0.29
102 0.28
103 0.25
104 0.24
105 0.18
106 0.21
107 0.19
108 0.17
109 0.16
110 0.16
111 0.17
112 0.17
113 0.16
114 0.12
115 0.15
116 0.15
117 0.14
118 0.15
119 0.15
120 0.17
121 0.17
122 0.16
123 0.13
124 0.19
125 0.18
126 0.17
127 0.16
128 0.13
129 0.12
130 0.11
131 0.1
132 0.05
133 0.05
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.03
139 0.03
140 0.03
141 0.03
142 0.03
143 0.04
144 0.05
145 0.05
146 0.07
147 0.09
148 0.15
149 0.2
150 0.27
151 0.34
152 0.43
153 0.52
154 0.61
155 0.64
156 0.62
157 0.6
158 0.58
159 0.54
160 0.52
161 0.54
162 0.55
163 0.57
164 0.6
165 0.63
166 0.64
167 0.65
168 0.65
169 0.62
170 0.62
171 0.59
172 0.57
173 0.57
174 0.58
175 0.62
176 0.62
177 0.56
178 0.5
179 0.49
180 0.5
181 0.46
182 0.45
183 0.4
184 0.33
185 0.34
186 0.32
187 0.35
188 0.37
189 0.41
190 0.44
191 0.46
192 0.49
193 0.49
194 0.54
195 0.49
196 0.44
197 0.4
198 0.32
199 0.25
200 0.22
201 0.19
202 0.13
203 0.15
204 0.13
205 0.14
206 0.15
207 0.15
208 0.15
209 0.18
210 0.22
211 0.19
212 0.2
213 0.25
214 0.28
215 0.34
216 0.4
217 0.47
218 0.49
219 0.54
220 0.55
221 0.51
222 0.47
223 0.41
224 0.36
225 0.28
226 0.25
227 0.19
228 0.17
229 0.17
230 0.17
231 0.18
232 0.16
233 0.16
234 0.13
235 0.14
236 0.13
237 0.11
238 0.1
239 0.09
240 0.09
241 0.1
242 0.09
243 0.07
244 0.07
245 0.07
246 0.06
247 0.05
248 0.06
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.03
258 0.03
259 0.03
260 0.03
261 0.03
262 0.03
263 0.03
264 0.03
265 0.03
266 0.03
267 0.05
268 0.05
269 0.07
270 0.15
271 0.18
272 0.22
273 0.27
274 0.32
275 0.35
276 0.41
277 0.49
278 0.48
279 0.52
280 0.54
281 0.56
282 0.54
283 0.52
284 0.52
285 0.49
286 0.46
287 0.45
288 0.5
289 0.53
290 0.6
291 0.69
292 0.73
293 0.76
294 0.81
295 0.86
296 0.87
297 0.86
298 0.8
299 0.73
300 0.67
301 0.66
302 0.62
303 0.55
304 0.49