Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R7L3

Protein Details
Accession C4R7L3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
275-301PANNRGRGRGRGRGRGRSNRGRSNNGEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
278-296NRGRGRGRGRGRGRSNRGR
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 10.5, mito 9, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025762  DFDF  
IPR019050  FDF_dom  
IPR025761  FFD_box  
IPR025609  Lsm14-like_N  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR047575  Sm  
Gene Ontology GO:0010494  C:cytoplasmic stress granule  
GO:0000932  C:P-body  
GO:0031370  F:eukaryotic initiation factor 4G binding  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0045947  P:negative regulation of translational initiation  
GO:0033962  P:P-body assembly  
GO:0034063  P:stress granule assembly  
KEGG ppa:PAS_chr4_0345  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12701  LSM14  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51512  DFDF  
PS51513  FFD  
PS52002  SM  
Amino Acid Sequences MSDKFIGKTISLVSQKDYRYVGVLKHIDGEVGTITLRNVRFFGSEGRIQDPAHYIPPNQGAIDQLILKGQDVKDLQVLDVSVEEVVPEPGPFYPGYNYYGQVPQMVSPQQVPPQQAPPQQIPPQQQQYQQQQQQPQRIQPQQQQVRQQPHPSQVQPQHIPKAQQQPQQTEPPQSETKQQSQERPSKELESRPPKQNASSQQQNGAPARKERPRPIGEIGDVDPNQEFDFESNNARFTEEAAKETQKAAQDETAQPSYNKQSSFFDTLSSHVETRPANNRGRGRGRGRGRGRSNRGRSNNGETPQWN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.35
3 0.37
4 0.36
5 0.29
6 0.29
7 0.3
8 0.28
9 0.31
10 0.33
11 0.29
12 0.3
13 0.29
14 0.25
15 0.22
16 0.21
17 0.12
18 0.1
19 0.1
20 0.07
21 0.08
22 0.13
23 0.14
24 0.14
25 0.14
26 0.15
27 0.16
28 0.17
29 0.23
30 0.23
31 0.26
32 0.27
33 0.3
34 0.3
35 0.29
36 0.3
37 0.28
38 0.25
39 0.26
40 0.25
41 0.22
42 0.24
43 0.29
44 0.28
45 0.24
46 0.22
47 0.18
48 0.18
49 0.19
50 0.15
51 0.11
52 0.11
53 0.11
54 0.11
55 0.14
56 0.12
57 0.16
58 0.16
59 0.18
60 0.19
61 0.19
62 0.19
63 0.16
64 0.16
65 0.1
66 0.1
67 0.09
68 0.06
69 0.05
70 0.05
71 0.05
72 0.06
73 0.05
74 0.05
75 0.06
76 0.06
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.1
81 0.11
82 0.15
83 0.15
84 0.16
85 0.17
86 0.19
87 0.18
88 0.17
89 0.16
90 0.13
91 0.15
92 0.16
93 0.14
94 0.14
95 0.16
96 0.19
97 0.22
98 0.23
99 0.22
100 0.27
101 0.31
102 0.34
103 0.35
104 0.34
105 0.38
106 0.4
107 0.43
108 0.42
109 0.44
110 0.47
111 0.47
112 0.48
113 0.49
114 0.53
115 0.56
116 0.57
117 0.55
118 0.56
119 0.58
120 0.62
121 0.57
122 0.53
123 0.53
124 0.52
125 0.53
126 0.51
127 0.56
128 0.55
129 0.57
130 0.6
131 0.58
132 0.61
133 0.59
134 0.58
135 0.51
136 0.49
137 0.48
138 0.41
139 0.42
140 0.4
141 0.43
142 0.43
143 0.42
144 0.42
145 0.39
146 0.41
147 0.39
148 0.44
149 0.43
150 0.44
151 0.45
152 0.45
153 0.47
154 0.52
155 0.48
156 0.41
157 0.36
158 0.36
159 0.35
160 0.31
161 0.35
162 0.32
163 0.36
164 0.41
165 0.43
166 0.45
167 0.5
168 0.56
169 0.52
170 0.52
171 0.48
172 0.44
173 0.45
174 0.44
175 0.46
176 0.48
177 0.51
178 0.54
179 0.57
180 0.54
181 0.53
182 0.54
183 0.52
184 0.51
185 0.54
186 0.47
187 0.47
188 0.47
189 0.49
190 0.46
191 0.43
192 0.37
193 0.33
194 0.38
195 0.41
196 0.46
197 0.49
198 0.54
199 0.53
200 0.55
201 0.55
202 0.53
203 0.46
204 0.42
205 0.37
206 0.34
207 0.3
208 0.26
209 0.21
210 0.18
211 0.17
212 0.14
213 0.13
214 0.07
215 0.1
216 0.11
217 0.16
218 0.16
219 0.17
220 0.17
221 0.18
222 0.17
223 0.16
224 0.24
225 0.2
226 0.22
227 0.24
228 0.25
229 0.26
230 0.27
231 0.28
232 0.24
233 0.24
234 0.24
235 0.24
236 0.27
237 0.29
238 0.34
239 0.34
240 0.3
241 0.29
242 0.31
243 0.35
244 0.35
245 0.32
246 0.28
247 0.3
248 0.34
249 0.4
250 0.36
251 0.31
252 0.28
253 0.3
254 0.31
255 0.3
256 0.25
257 0.2
258 0.24
259 0.22
260 0.27
261 0.35
262 0.37
263 0.4
264 0.48
265 0.54
266 0.59
267 0.66
268 0.69
269 0.66
270 0.7
271 0.72
272 0.74
273 0.77
274 0.78
275 0.8
276 0.82
277 0.85
278 0.86
279 0.87
280 0.87
281 0.86
282 0.84
283 0.8
284 0.78
285 0.77
286 0.69