Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A553HNH1

Protein Details
Accession A0A553HNH1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
252-272FKQAMAQRRHNVKPHQNRELSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22, mito 2, cyto 2, cyto_mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010989  SNARE  
IPR015260  Syntaxin-6_N  
IPR000727  T_SNARE_dom  
Gene Ontology GO:0005794  C:Golgi apparatus  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0048193  P:Golgi vesicle transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF09177  Syntaxin-6_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50192  T_SNARE  
CDD cd21444  SNARE_NTD_Tlg1p-like  
cd15851  SNARE_Syntaxin6  
Amino Acid Sequences MMSSMNEEDPFLQVQQDVLTQMQNTRPLFASYLRIRSLSSTPAQSPEVASARSDLESALSTLAEDLADLVESVRAVESDPSHYGLSAHEVSRRKKLVDEVGGEIEDMREELARQTATLASSSSSSSGPSGSRAAIEARAAANDDLPHPSTFAIDDAGSTQGDDNYAEFEHQQQLQMMRDQDQQLDGVFVTVGNLRRQADDMGRELEEQHEMLEHVDTLADRVGGRLQTGMQKLNYVVRQNEDRYGQGLVLLFKQAMAQRRHNVKPHQNRELSTLDIAICGLNAEW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.12
3 0.13
4 0.12
5 0.11
6 0.13
7 0.13
8 0.16
9 0.2
10 0.26
11 0.25
12 0.26
13 0.27
14 0.27
15 0.28
16 0.27
17 0.32
18 0.3
19 0.35
20 0.34
21 0.33
22 0.32
23 0.33
24 0.34
25 0.3
26 0.28
27 0.27
28 0.27
29 0.3
30 0.31
31 0.27
32 0.26
33 0.26
34 0.25
35 0.21
36 0.2
37 0.18
38 0.18
39 0.18
40 0.17
41 0.11
42 0.1
43 0.1
44 0.1
45 0.09
46 0.07
47 0.07
48 0.07
49 0.07
50 0.05
51 0.04
52 0.04
53 0.04
54 0.04
55 0.04
56 0.04
57 0.04
58 0.04
59 0.05
60 0.04
61 0.04
62 0.05
63 0.07
64 0.08
65 0.11
66 0.13
67 0.15
68 0.15
69 0.15
70 0.15
71 0.13
72 0.17
73 0.15
74 0.15
75 0.19
76 0.25
77 0.27
78 0.35
79 0.37
80 0.33
81 0.33
82 0.37
83 0.39
84 0.38
85 0.38
86 0.33
87 0.32
88 0.31
89 0.29
90 0.24
91 0.16
92 0.1
93 0.07
94 0.05
95 0.03
96 0.04
97 0.04
98 0.07
99 0.07
100 0.07
101 0.08
102 0.08
103 0.09
104 0.09
105 0.08
106 0.07
107 0.07
108 0.08
109 0.08
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.08
114 0.08
115 0.09
116 0.1
117 0.08
118 0.08
119 0.09
120 0.09
121 0.09
122 0.09
123 0.08
124 0.07
125 0.07
126 0.08
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.08
132 0.09
133 0.09
134 0.09
135 0.09
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.07
140 0.05
141 0.05
142 0.06
143 0.07
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.05
148 0.06
149 0.06
150 0.05
151 0.05
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.08
156 0.1
157 0.1
158 0.11
159 0.11
160 0.13
161 0.14
162 0.17
163 0.17
164 0.17
165 0.2
166 0.2
167 0.19
168 0.18
169 0.17
170 0.14
171 0.13
172 0.1
173 0.07
174 0.06
175 0.05
176 0.05
177 0.08
178 0.1
179 0.1
180 0.14
181 0.14
182 0.15
183 0.16
184 0.18
185 0.18
186 0.19
187 0.2
188 0.2
189 0.2
190 0.19
191 0.18
192 0.17
193 0.15
194 0.12
195 0.1
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.07
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.07
209 0.09
210 0.09
211 0.1
212 0.1
213 0.11
214 0.16
215 0.19
216 0.22
217 0.2
218 0.21
219 0.22
220 0.28
221 0.31
222 0.29
223 0.29
224 0.3
225 0.36
226 0.37
227 0.41
228 0.37
229 0.33
230 0.3
231 0.29
232 0.24
233 0.2
234 0.19
235 0.16
236 0.14
237 0.14
238 0.12
239 0.11
240 0.15
241 0.17
242 0.23
243 0.28
244 0.34
245 0.42
246 0.51
247 0.59
248 0.64
249 0.7
250 0.73
251 0.79
252 0.81
253 0.82
254 0.78
255 0.73
256 0.7
257 0.64
258 0.56
259 0.46
260 0.38
261 0.27
262 0.22
263 0.21
264 0.15
265 0.11