FuNGI

C4R6X8

Protein Details

Accession

C4R6X8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
253-281	GSDYKKPVKMKKLKKKTQNKRKKLDDDEE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
257-275	KKPVKMKKLKKKTQNKRKK

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto_nucl 12.333, mito_nucl 12.333, mito 3.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045347 HIND IPR005011 SNU66/SART1
Gene Ontology	GO:0046540 C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
KEGG	ppa:PAS_chr4_0126 -
Pfam	View protein in Pfam PF19252 HIND PF03343 SART-1

Amino Acid Sequences

MGGESLSIEETNKLRKQLGLALLPVEPSVSNVSAKDSISVEKTNKLRTSIGLKPIPESTPDSETKNYEEYKREQEKQLKEKEIEQRLERLRNKASNDKLRKQGTLLDSEDSANWLENLGKAETDTAVESSKAHSADYTEHDLKGTKVAHDLKDIVDVGQDIVLTLKDGSVLDDEDELEANVLVKMKQLEENIRNKLGEEKYDELDHGPGLTGGSFRLGDAVPTEGERQKHQVRPNMKLVQFSDDEFEGEVKIGSDYKKPVKMKKLKKKTQNKRKKLDDDEEINTFKVIKLDISDEYNEEDEYSKQLSAAKANRKPIRDTAEFLAEKVEQNKVETIPLTVSTMFVDETDEFLTSLKDAVERDIEEKKDEENKIEEVKVEKPVFRKRKGISSQRKETQETDEPVPENQPVDTVEKDETKEKIIHEIEDKKVADQLSTAEPENGQETTKETNPIAATPTQLNSSESLGAGLGATLKYLKVKPSIDAQRAELQNKQLLKERERQLAVIERQINERLREQALYGGSGTQLEYTNLSKKEKERLSQLEKEREQLLKDTFQEEKLKNYNPKVNLVYTDEKGNKLSTKDAFKYMSHKFHGTFKKNNK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.3
2	0.32
3	0.35
4	0.39
5	0.43
6	0.38
7	0.36
8	0.35
9	0.33
10	0.32
11	0.28
12	0.21
13	0.14
14	0.12
15	0.14
16	0.14
17	0.14
18	0.14
19	0.19
20	0.21
21	0.21
22	0.22
23	0.2
24	0.22
25	0.24
26	0.3
27	0.28
28	0.33
29	0.37
30	0.43
31	0.45
32	0.45
33	0.42
34	0.42
35	0.46
36	0.46
37	0.51
38	0.47
39	0.45
40	0.44
41	0.45
42	0.42
43	0.38
44	0.36
45	0.31
46	0.32
47	0.34
48	0.35
49	0.35
50	0.36
51	0.36
52	0.37
53	0.37
54	0.36
55	0.4
56	0.41
57	0.49
58	0.55
59	0.57
60	0.6
61	0.65
62	0.7
63	0.74
64	0.78
65	0.75
66	0.68
67	0.7
68	0.71
69	0.71
70	0.67
71	0.6
72	0.6
73	0.59
74	0.67
75	0.64
76	0.61
77	0.6
78	0.6
79	0.63
80	0.64
81	0.66
82	0.68
83	0.72
84	0.73
85	0.74
86	0.72
87	0.67
88	0.6
89	0.57
90	0.5
91	0.47
92	0.42
93	0.34
94	0.31
95	0.3
96	0.28
97	0.22
98	0.19
99	0.12
100	0.1
101	0.09
102	0.09
103	0.1
104	0.12
105	0.11
106	0.11
107	0.11
108	0.12
109	0.11
110	0.11
111	0.11
112	0.09
113	0.09
114	0.1
115	0.1
116	0.11
117	0.14
118	0.13
119	0.13
120	0.12
121	0.13
122	0.16
123	0.2
124	0.27
125	0.25
126	0.25
127	0.25
128	0.26
129	0.25
130	0.27
131	0.24
132	0.16
133	0.22
134	0.27
135	0.28
136	0.3
137	0.31
138	0.25
139	0.27
140	0.27
141	0.19
142	0.15
143	0.14
144	0.11
145	0.1
146	0.09
147	0.06
148	0.06
149	0.06
150	0.06
151	0.05
152	0.05
153	0.05
154	0.06
155	0.07
156	0.07
157	0.08
158	0.08
159	0.08
160	0.09
161	0.08
162	0.08
163	0.07
164	0.06
165	0.06
166	0.05
167	0.06
168	0.06
169	0.06
170	0.08
171	0.09
172	0.1
173	0.13
174	0.15
175	0.23
176	0.3
177	0.37
178	0.39
179	0.4
180	0.39
181	0.36
182	0.41
183	0.34
184	0.3
185	0.28
186	0.27
187	0.26
188	0.27
189	0.27
190	0.2
191	0.19
192	0.16
193	0.11
194	0.08
195	0.07
196	0.06
197	0.06
198	0.05
199	0.04
200	0.06
201	0.06
202	0.05
203	0.07
204	0.07
205	0.07
206	0.07
207	0.08
208	0.07
209	0.08
210	0.11
211	0.13
212	0.14
213	0.16
214	0.21
215	0.27
216	0.33
217	0.38
218	0.43
219	0.45
220	0.5
221	0.57
222	0.59
223	0.53
224	0.51
225	0.47
226	0.43
227	0.39
228	0.33
229	0.26
230	0.18
231	0.17
232	0.13
233	0.12
234	0.08
235	0.07
236	0.06
237	0.05
238	0.05
239	0.07
240	0.07
241	0.1
242	0.14
243	0.19
244	0.26
245	0.3
246	0.36
247	0.45
248	0.54
249	0.63
250	0.69
251	0.76
252	0.78
253	0.84
254	0.89
255	0.89
256	0.91
257	0.91
258	0.9
259	0.89
260	0.9
261	0.88
262	0.85
263	0.79
264	0.74
265	0.68
266	0.61
267	0.54
268	0.45
269	0.36
270	0.28
271	0.22
272	0.16
273	0.12
274	0.09
275	0.06
276	0.06
277	0.08
278	0.09
279	0.11
280	0.11
281	0.11
282	0.11
283	0.12
284	0.1
285	0.09
286	0.09
287	0.07
288	0.08
289	0.09
290	0.08
291	0.08
292	0.1
293	0.1
294	0.15
295	0.22
296	0.29
297	0.32
298	0.41
299	0.45
300	0.45
301	0.47
302	0.47
303	0.48
304	0.41
305	0.4
306	0.33
307	0.37
308	0.34
309	0.31
310	0.28
311	0.21
312	0.2
313	0.19
314	0.19
315	0.11
316	0.13
317	0.14
318	0.12
319	0.13
320	0.12
321	0.11
322	0.09
323	0.1
324	0.1
325	0.08
326	0.08
327	0.07
328	0.07
329	0.07
330	0.06
331	0.07
332	0.06
333	0.07
334	0.08
335	0.08
336	0.07
337	0.07
338	0.07
339	0.06
340	0.06
341	0.05
342	0.06
343	0.06
344	0.07
345	0.09
346	0.1
347	0.12
348	0.16
349	0.17
350	0.17
351	0.17
352	0.19
353	0.24
354	0.24
355	0.24
356	0.22
357	0.24
358	0.25
359	0.25
360	0.24
361	0.19
362	0.21
363	0.25
364	0.25
365	0.25
366	0.29
367	0.39
368	0.46
369	0.48
370	0.54
371	0.49
372	0.58
373	0.64
374	0.69
375	0.7
376	0.71
377	0.76
378	0.75
379	0.77
380	0.7
381	0.63
382	0.59
383	0.55
384	0.5
385	0.43
386	0.39
387	0.36
388	0.33
389	0.32
390	0.26
391	0.19
392	0.15
393	0.13
394	0.11
395	0.13
396	0.13
397	0.14
398	0.15
399	0.16
400	0.18
401	0.21
402	0.2
403	0.2
404	0.22
405	0.21
406	0.27
407	0.26
408	0.26
409	0.3
410	0.34
411	0.33
412	0.37
413	0.37
414	0.29
415	0.31
416	0.29
417	0.23
418	0.17
419	0.18
420	0.15
421	0.16
422	0.16
423	0.14
424	0.14
425	0.15
426	0.16
427	0.14
428	0.11
429	0.09
430	0.11
431	0.15
432	0.17
433	0.19
434	0.17
435	0.2
436	0.2
437	0.21
438	0.21
439	0.18
440	0.18
441	0.17
442	0.18
443	0.17
444	0.17
445	0.17
446	0.16
447	0.17
448	0.15
449	0.13
450	0.13
451	0.1
452	0.09
453	0.08
454	0.07
455	0.06
456	0.05
457	0.05
458	0.05
459	0.06
460	0.1
461	0.12
462	0.15
463	0.2
464	0.21
465	0.23
466	0.33
467	0.41
468	0.43
469	0.44
470	0.44
471	0.46
472	0.49
473	0.5
474	0.44
475	0.38
476	0.38
477	0.38
478	0.36
479	0.36
480	0.39
481	0.42
482	0.48
483	0.5
484	0.53
485	0.53
486	0.51
487	0.48
488	0.5
489	0.48
490	0.46
491	0.44
492	0.37
493	0.38
494	0.44
495	0.43
496	0.37
497	0.37
498	0.34
499	0.32
500	0.31
501	0.29
502	0.28
503	0.25
504	0.23
505	0.2
506	0.16
507	0.14
508	0.14
509	0.13
510	0.1
511	0.1
512	0.1
513	0.12
514	0.14
515	0.21
516	0.25
517	0.28
518	0.32
519	0.35
520	0.44
521	0.49
522	0.51
523	0.54
524	0.6
525	0.65
526	0.69
527	0.74
528	0.74
529	0.69
530	0.67
531	0.63
532	0.55
533	0.49
534	0.46
535	0.42
536	0.37
537	0.38
538	0.38
539	0.35
540	0.38
541	0.44
542	0.39
543	0.43
544	0.44
545	0.5
546	0.55
547	0.61
548	0.63
549	0.58
550	0.64
551	0.61
552	0.57
553	0.52
554	0.51
555	0.49
556	0.42
557	0.48
558	0.43
559	0.41
560	0.39
561	0.39
562	0.37
563	0.33
564	0.38
565	0.36
566	0.42
567	0.44
568	0.48
569	0.48
570	0.46
571	0.51
572	0.53
573	0.55
574	0.51
575	0.52
576	0.48
577	0.55
578	0.63
579	0.63

C4R6X8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer