Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A553HL84

Protein Details
Accession A0A553HL84    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
16-37SKATSFRKIRTIKCHRNAVRLVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009332  Med22  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF06179  Med22  
Amino Acid Sequences MNRKEQNTLLVRDQTSKATSFRKIRTIKCHRNAVRLVDRAYCCHVVPDDEEPLNSCLGASVAFLDGPATQATSSDDTTDNPTIVSNTDERSHGVSSGRESTDDAQRASNISADIITGAGPSRLSHHTPANKSKENLVNALIELNLKSLFNDMASKSNPTIHPTGSVDVPPPSDSAWRLVDKLGRIFASHDHRNDHRKPASRVSKNTKPDQHKMTSANASNLLDRHELIIAAILTRFRNMVNAACAPLPTAAAIPQASLNIMTMNNEAAALIKEIENLLALNREIKQLWITGPLRKPGDADEKNLEKVIDERAANVSKLYNTLVELQSEAAKRNPAQQPQQQQQPASVPEGQNVDVKQEKGDAPVKQEYQGDSA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.4
3 0.38
4 0.37
5 0.36
6 0.43
7 0.47
8 0.5
9 0.56
10 0.61
11 0.66
12 0.72
13 0.77
14 0.79
15 0.79
16 0.85
17 0.8
18 0.81
19 0.79
20 0.77
21 0.75
22 0.69
23 0.64
24 0.61
25 0.57
26 0.51
27 0.51
28 0.43
29 0.34
30 0.31
31 0.3
32 0.24
33 0.26
34 0.27
35 0.27
36 0.25
37 0.25
38 0.25
39 0.25
40 0.22
41 0.19
42 0.14
43 0.09
44 0.08
45 0.08
46 0.06
47 0.06
48 0.06
49 0.06
50 0.06
51 0.06
52 0.06
53 0.07
54 0.07
55 0.07
56 0.06
57 0.07
58 0.1
59 0.12
60 0.12
61 0.13
62 0.14
63 0.15
64 0.21
65 0.21
66 0.18
67 0.16
68 0.16
69 0.14
70 0.14
71 0.16
72 0.12
73 0.13
74 0.15
75 0.15
76 0.16
77 0.19
78 0.19
79 0.18
80 0.18
81 0.17
82 0.19
83 0.23
84 0.22
85 0.2
86 0.21
87 0.22
88 0.28
89 0.29
90 0.26
91 0.22
92 0.22
93 0.23
94 0.22
95 0.2
96 0.13
97 0.1
98 0.09
99 0.08
100 0.08
101 0.06
102 0.06
103 0.04
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.09
109 0.12
110 0.15
111 0.18
112 0.24
113 0.31
114 0.38
115 0.47
116 0.51
117 0.52
118 0.51
119 0.54
120 0.53
121 0.48
122 0.43
123 0.36
124 0.29
125 0.24
126 0.23
127 0.17
128 0.11
129 0.09
130 0.08
131 0.07
132 0.06
133 0.06
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.09
138 0.09
139 0.13
140 0.14
141 0.15
142 0.15
143 0.19
144 0.19
145 0.2
146 0.21
147 0.18
148 0.2
149 0.19
150 0.2
151 0.17
152 0.16
153 0.14
154 0.13
155 0.13
156 0.11
157 0.1
158 0.09
159 0.1
160 0.1
161 0.12
162 0.14
163 0.14
164 0.14
165 0.15
166 0.17
167 0.17
168 0.17
169 0.16
170 0.13
171 0.12
172 0.13
173 0.16
174 0.21
175 0.23
176 0.24
177 0.26
178 0.3
179 0.37
180 0.4
181 0.43
182 0.43
183 0.46
184 0.48
185 0.55
186 0.61
187 0.6
188 0.65
189 0.65
190 0.67
191 0.66
192 0.69
193 0.68
194 0.65
195 0.65
196 0.63
197 0.58
198 0.54
199 0.51
200 0.48
201 0.45
202 0.39
203 0.34
204 0.3
205 0.27
206 0.23
207 0.21
208 0.19
209 0.14
210 0.13
211 0.12
212 0.1
213 0.09
214 0.08
215 0.09
216 0.07
217 0.06
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.08
222 0.08
223 0.07
224 0.09
225 0.1
226 0.11
227 0.13
228 0.14
229 0.15
230 0.15
231 0.14
232 0.13
233 0.12
234 0.11
235 0.07
236 0.07
237 0.06
238 0.08
239 0.08
240 0.07
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.07
245 0.07
246 0.06
247 0.06
248 0.07
249 0.07
250 0.08
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.06
255 0.07
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.07
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.06
264 0.06
265 0.07
266 0.07
267 0.09
268 0.1
269 0.12
270 0.12
271 0.13
272 0.14
273 0.14
274 0.14
275 0.21
276 0.22
277 0.27
278 0.31
279 0.37
280 0.37
281 0.36
282 0.36
283 0.33
284 0.42
285 0.37
286 0.38
287 0.4
288 0.41
289 0.42
290 0.42
291 0.36
292 0.26
293 0.25
294 0.25
295 0.23
296 0.19
297 0.19
298 0.24
299 0.26
300 0.25
301 0.25
302 0.22
303 0.18
304 0.19
305 0.19
306 0.14
307 0.14
308 0.19
309 0.19
310 0.18
311 0.18
312 0.17
313 0.21
314 0.21
315 0.22
316 0.19
317 0.23
318 0.24
319 0.32
320 0.39
321 0.42
322 0.5
323 0.56
324 0.63
325 0.66
326 0.75
327 0.71
328 0.65
329 0.6
330 0.57
331 0.52
332 0.46
333 0.44
334 0.35
335 0.33
336 0.36
337 0.33
338 0.31
339 0.29
340 0.3
341 0.29
342 0.29
343 0.27
344 0.28
345 0.27
346 0.3
347 0.36
348 0.33
349 0.35
350 0.42
351 0.43
352 0.42
353 0.44