Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A553HSM2

Protein Details
Accession A0A553HSM2   
Localization Confidence High
Confidence Score 19.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
16-46DTWVEVHRRKGCRRVAKKAPTKKTPRAFIPGHydrophilic
338-359MSQPPCCNRRTSRRRNYEELSEHydrophilic
420-439TLCIAKQKFQPRTNRTSTKPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
23-40RRKGCRRVAKKAPTKKTP
Subcellular Location(s) cyto_nucl 12.5, nucl 22.5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012942  SRR1-like  
Pfam View protein in Pfam  
PF07985  SRR1  
Amino Acid Sequences MAPSTEKTSSEPQEADTWVEVHRRKGCRRVAKKAPTKKTPRAFIPGESTISLEQVKQEHSRFSSEWLSSPAYAQLRELLSGHTASAGTGSRITKAICFGLGTFDTPVYDWKRATHIQLAAFLAIVEHLQLEANSQIRCIFQEPIFKSVDKAFITSLGHEVVESPVGFELVDSGTMTFGIHLYRDICINILANCIPAIYIGTSCEAWIELIRINNSNLSEPFLDAHAQLQFIGDRKINLKMIDPSTTLLLYLNNPLNNLSHERKHLTLGLITGNSPRTSCTVPASALNILRCLQKWLQHTTYHVSELPYDNTSNRMDWGAWSNMFEEPQHMLSLENPKMSQPPCCNRRTSRRRNYEELSESVKKKRVAAVSGDSLTFAMNDTRWLSEPNGIFTMKHTLIRSFLADITRPIIHIFHSLHGHTLCIAKQKFQPRTNRTSTKPHSESTSIVSIILISFTKLA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.36
3 0.29
4 0.25
5 0.22
6 0.3
7 0.3
8 0.34
9 0.41
10 0.47
11 0.53
12 0.61
13 0.69
14 0.72
15 0.78
16 0.81
17 0.84
18 0.86
19 0.89
20 0.9
21 0.9
22 0.9
23 0.9
24 0.9
25 0.88
26 0.86
27 0.82
28 0.79
29 0.72
30 0.66
31 0.64
32 0.57
33 0.51
34 0.43
35 0.38
36 0.3
37 0.29
38 0.25
39 0.17
40 0.17
41 0.16
42 0.2
43 0.24
44 0.26
45 0.3
46 0.31
47 0.36
48 0.34
49 0.36
50 0.39
51 0.34
52 0.34
53 0.32
54 0.33
55 0.27
56 0.28
57 0.29
58 0.24
59 0.23
60 0.22
61 0.22
62 0.2
63 0.21
64 0.21
65 0.16
66 0.16
67 0.15
68 0.15
69 0.11
70 0.1
71 0.09
72 0.11
73 0.1
74 0.09
75 0.12
76 0.13
77 0.13
78 0.15
79 0.16
80 0.15
81 0.17
82 0.17
83 0.14
84 0.14
85 0.13
86 0.15
87 0.15
88 0.15
89 0.14
90 0.13
91 0.13
92 0.12
93 0.18
94 0.18
95 0.2
96 0.2
97 0.21
98 0.26
99 0.29
100 0.32
101 0.33
102 0.32
103 0.3
104 0.33
105 0.32
106 0.26
107 0.23
108 0.2
109 0.13
110 0.09
111 0.08
112 0.04
113 0.03
114 0.03
115 0.04
116 0.04
117 0.05
118 0.07
119 0.1
120 0.1
121 0.11
122 0.11
123 0.12
124 0.13
125 0.15
126 0.16
127 0.15
128 0.24
129 0.26
130 0.28
131 0.3
132 0.29
133 0.28
134 0.27
135 0.3
136 0.21
137 0.21
138 0.17
139 0.18
140 0.19
141 0.18
142 0.17
143 0.12
144 0.11
145 0.1
146 0.1
147 0.08
148 0.09
149 0.08
150 0.07
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.05
155 0.06
156 0.04
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.05
168 0.06
169 0.06
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.09
175 0.08
176 0.09
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.07
181 0.06
182 0.05
183 0.05
184 0.04
185 0.04
186 0.05
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.06
195 0.06
196 0.08
197 0.09
198 0.1
199 0.11
200 0.12
201 0.13
202 0.13
203 0.12
204 0.12
205 0.12
206 0.11
207 0.11
208 0.1
209 0.1
210 0.08
211 0.09
212 0.08
213 0.08
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.09
219 0.08
220 0.09
221 0.1
222 0.13
223 0.14
224 0.14
225 0.15
226 0.18
227 0.19
228 0.2
229 0.19
230 0.17
231 0.16
232 0.15
233 0.13
234 0.09
235 0.08
236 0.07
237 0.1
238 0.12
239 0.12
240 0.12
241 0.13
242 0.13
243 0.14
244 0.19
245 0.18
246 0.19
247 0.21
248 0.24
249 0.24
250 0.25
251 0.25
252 0.21
253 0.18
254 0.17
255 0.16
256 0.14
257 0.13
258 0.13
259 0.13
260 0.12
261 0.11
262 0.11
263 0.12
264 0.13
265 0.14
266 0.15
267 0.15
268 0.16
269 0.17
270 0.18
271 0.18
272 0.19
273 0.18
274 0.16
275 0.16
276 0.16
277 0.16
278 0.18
279 0.18
280 0.21
281 0.25
282 0.3
283 0.33
284 0.33
285 0.35
286 0.36
287 0.35
288 0.32
289 0.29
290 0.23
291 0.22
292 0.23
293 0.22
294 0.19
295 0.18
296 0.16
297 0.18
298 0.19
299 0.17
300 0.16
301 0.14
302 0.13
303 0.13
304 0.18
305 0.17
306 0.16
307 0.17
308 0.17
309 0.17
310 0.17
311 0.16
312 0.13
313 0.12
314 0.13
315 0.12
316 0.11
317 0.11
318 0.14
319 0.22
320 0.22
321 0.21
322 0.2
323 0.21
324 0.27
325 0.27
326 0.31
327 0.32
328 0.4
329 0.46
330 0.5
331 0.56
332 0.58
333 0.69
334 0.73
335 0.75
336 0.76
337 0.8
338 0.83
339 0.84
340 0.81
341 0.79
342 0.72
343 0.64
344 0.61
345 0.57
346 0.54
347 0.52
348 0.53
349 0.46
350 0.44
351 0.47
352 0.44
353 0.41
354 0.43
355 0.43
356 0.42
357 0.41
358 0.38
359 0.32
360 0.27
361 0.23
362 0.17
363 0.12
364 0.09
365 0.07
366 0.1
367 0.11
368 0.13
369 0.14
370 0.17
371 0.18
372 0.22
373 0.23
374 0.24
375 0.26
376 0.24
377 0.23
378 0.23
379 0.29
380 0.25
381 0.28
382 0.26
383 0.25
384 0.26
385 0.28
386 0.28
387 0.23
388 0.23
389 0.22
390 0.22
391 0.21
392 0.23
393 0.21
394 0.2
395 0.19
396 0.17
397 0.15
398 0.2
399 0.21
400 0.21
401 0.25
402 0.25
403 0.28
404 0.28
405 0.27
406 0.22
407 0.23
408 0.21
409 0.27
410 0.27
411 0.28
412 0.35
413 0.45
414 0.53
415 0.58
416 0.67
417 0.66
418 0.75
419 0.8
420 0.81
421 0.77
422 0.78
423 0.78
424 0.78
425 0.74
426 0.67
427 0.64
428 0.58
429 0.55
430 0.49
431 0.46
432 0.36
433 0.31
434 0.28
435 0.22
436 0.19
437 0.18
438 0.13