Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A553HME6

Protein Details
Accession A0A553HME6    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-43ASKNSRSSPQPQQSKRDKKRQVLSDRLSALHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
250-254KKRKR
543-548RGKRKG
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013907  Sds3  
Gene Ontology GO:0005654  C:nucleoplasm  
Pfam View protein in Pfam  
PF08598  Sds3  
Amino Acid Sequences MAAPDAGQHVGAGASKNSRSSPQPQQSKRDKKRQVLSDRLSALSEQFNREKDRHYREELQKIQVDVNLVSRVDPYADRPLDEIDRERRERELSQAINGVSNNASNNANNNANAPHRSLLEMAGPTFQEWIREVEDLLETRDYDMTAQKYDYERKMQDYHNTHAYRTEVAKREHKALSDTLKDRLMNNIMSKKYRLVKEKEAIDISDGSALLLHPNQFSLTNPASPGGPHGKRNTRLRREMEELPGFSDNKKRKRHAADDDGSPAPPRRGDTSNATPFWQSDRLKSMRRGAGPVYSLDKLFTDKELSMTYNTAALAAHKHLLTRRDARGNVLPSPEESDTSNGDGNDDEEELSAATMERQPSHTTRSTRGGQQNFYDDKVLGIEGLANFELPSNLCKVAAQDPKMPPLIQSHYVKAYVKSESNTPASLSMEDTQHDLTVMTIWKNFQTKNGKGSNIDLDNGGRQLLKTMSIPQRRSKNATYVQRPRPSTDALSEALGVSSSSVRDEPVVNPIPINAATNSSAGAPMSRQSSLGGVAMSRTGSGRGKRKG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.18
3 0.21
4 0.23
5 0.26
6 0.3
7 0.36
8 0.45
9 0.5
10 0.6
11 0.64
12 0.73
13 0.8
14 0.86
15 0.89
16 0.89
17 0.88
18 0.88
19 0.9
20 0.9
21 0.89
22 0.88
23 0.84
24 0.81
25 0.74
26 0.65
27 0.56
28 0.47
29 0.39
30 0.36
31 0.33
32 0.3
33 0.32
34 0.35
35 0.4
36 0.41
37 0.46
38 0.48
39 0.55
40 0.56
41 0.59
42 0.65
43 0.69
44 0.78
45 0.76
46 0.73
47 0.68
48 0.62
49 0.56
50 0.47
51 0.4
52 0.3
53 0.28
54 0.23
55 0.19
56 0.18
57 0.17
58 0.16
59 0.16
60 0.16
61 0.16
62 0.23
63 0.24
64 0.24
65 0.25
66 0.28
67 0.29
68 0.31
69 0.33
70 0.32
71 0.4
72 0.42
73 0.42
74 0.42
75 0.44
76 0.42
77 0.43
78 0.44
79 0.37
80 0.37
81 0.39
82 0.36
83 0.34
84 0.32
85 0.27
86 0.18
87 0.18
88 0.16
89 0.14
90 0.15
91 0.13
92 0.16
93 0.19
94 0.21
95 0.2
96 0.2
97 0.21
98 0.24
99 0.25
100 0.24
101 0.22
102 0.2
103 0.21
104 0.2
105 0.18
106 0.19
107 0.18
108 0.16
109 0.16
110 0.15
111 0.14
112 0.15
113 0.14
114 0.12
115 0.12
116 0.14
117 0.14
118 0.15
119 0.14
120 0.14
121 0.16
122 0.15
123 0.15
124 0.14
125 0.12
126 0.12
127 0.13
128 0.12
129 0.11
130 0.15
131 0.15
132 0.15
133 0.15
134 0.18
135 0.21
136 0.28
137 0.3
138 0.33
139 0.33
140 0.36
141 0.41
142 0.42
143 0.47
144 0.46
145 0.46
146 0.48
147 0.47
148 0.43
149 0.4
150 0.38
151 0.32
152 0.3
153 0.34
154 0.31
155 0.35
156 0.42
157 0.41
158 0.46
159 0.45
160 0.42
161 0.37
162 0.35
163 0.36
164 0.37
165 0.36
166 0.33
167 0.34
168 0.34
169 0.31
170 0.31
171 0.28
172 0.24
173 0.27
174 0.31
175 0.3
176 0.31
177 0.32
178 0.33
179 0.37
180 0.4
181 0.43
182 0.43
183 0.49
184 0.53
185 0.55
186 0.53
187 0.48
188 0.42
189 0.35
190 0.29
191 0.21
192 0.16
193 0.13
194 0.08
195 0.07
196 0.07
197 0.06
198 0.07
199 0.08
200 0.06
201 0.07
202 0.08
203 0.08
204 0.09
205 0.13
206 0.14
207 0.14
208 0.14
209 0.14
210 0.14
211 0.13
212 0.16
213 0.19
214 0.2
215 0.23
216 0.3
217 0.37
218 0.44
219 0.54
220 0.61
221 0.61
222 0.67
223 0.67
224 0.66
225 0.64
226 0.61
227 0.58
228 0.5
229 0.42
230 0.35
231 0.33
232 0.28
233 0.23
234 0.27
235 0.28
236 0.34
237 0.41
238 0.42
239 0.49
240 0.56
241 0.64
242 0.65
243 0.67
244 0.62
245 0.57
246 0.58
247 0.5
248 0.42
249 0.34
250 0.27
251 0.18
252 0.15
253 0.14
254 0.14
255 0.15
256 0.18
257 0.24
258 0.32
259 0.36
260 0.36
261 0.36
262 0.32
263 0.3
264 0.3
265 0.3
266 0.23
267 0.19
268 0.25
269 0.28
270 0.32
271 0.36
272 0.39
273 0.37
274 0.37
275 0.37
276 0.32
277 0.31
278 0.27
279 0.25
280 0.21
281 0.17
282 0.16
283 0.14
284 0.13
285 0.12
286 0.12
287 0.11
288 0.1
289 0.1
290 0.11
291 0.12
292 0.13
293 0.12
294 0.12
295 0.11
296 0.1
297 0.1
298 0.09
299 0.07
300 0.07
301 0.07
302 0.08
303 0.09
304 0.08
305 0.1
306 0.13
307 0.15
308 0.2
309 0.25
310 0.29
311 0.33
312 0.33
313 0.36
314 0.39
315 0.4
316 0.37
317 0.32
318 0.28
319 0.22
320 0.26
321 0.22
322 0.17
323 0.15
324 0.15
325 0.14
326 0.15
327 0.17
328 0.12
329 0.12
330 0.11
331 0.11
332 0.1
333 0.09
334 0.08
335 0.06
336 0.06
337 0.06
338 0.05
339 0.05
340 0.04
341 0.05
342 0.07
343 0.08
344 0.09
345 0.11
346 0.14
347 0.16
348 0.22
349 0.28
350 0.29
351 0.32
352 0.38
353 0.39
354 0.44
355 0.5
356 0.49
357 0.46
358 0.45
359 0.48
360 0.44
361 0.42
362 0.34
363 0.26
364 0.21
365 0.19
366 0.17
367 0.09
368 0.07
369 0.08
370 0.06
371 0.08
372 0.07
373 0.07
374 0.07
375 0.07
376 0.08
377 0.06
378 0.08
379 0.09
380 0.09
381 0.09
382 0.09
383 0.12
384 0.2
385 0.26
386 0.28
387 0.34
388 0.35
389 0.39
390 0.41
391 0.38
392 0.31
393 0.3
394 0.32
395 0.31
396 0.32
397 0.32
398 0.32
399 0.35
400 0.35
401 0.32
402 0.3
403 0.27
404 0.26
405 0.25
406 0.26
407 0.28
408 0.29
409 0.27
410 0.25
411 0.23
412 0.22
413 0.21
414 0.2
415 0.17
416 0.16
417 0.16
418 0.17
419 0.16
420 0.14
421 0.14
422 0.11
423 0.09
424 0.11
425 0.12
426 0.12
427 0.12
428 0.13
429 0.17
430 0.22
431 0.22
432 0.28
433 0.35
434 0.38
435 0.45
436 0.5
437 0.49
438 0.46
439 0.5
440 0.49
441 0.41
442 0.38
443 0.31
444 0.26
445 0.25
446 0.24
447 0.21
448 0.13
449 0.11
450 0.13
451 0.13
452 0.14
453 0.13
454 0.22
455 0.31
456 0.39
457 0.44
458 0.49
459 0.58
460 0.62
461 0.68
462 0.64
463 0.64
464 0.65
465 0.7
466 0.73
467 0.74
468 0.78
469 0.79
470 0.77
471 0.72
472 0.67
473 0.61
474 0.55
475 0.48
476 0.42
477 0.34
478 0.32
479 0.28
480 0.24
481 0.19
482 0.15
483 0.11
484 0.08
485 0.08
486 0.08
487 0.09
488 0.09
489 0.1
490 0.12
491 0.14
492 0.14
493 0.22
494 0.26
495 0.25
496 0.25
497 0.24
498 0.26
499 0.24
500 0.26
501 0.17
502 0.16
503 0.17
504 0.17
505 0.17
506 0.15
507 0.15
508 0.12
509 0.13
510 0.11
511 0.13
512 0.16
513 0.16
514 0.16
515 0.16
516 0.17
517 0.18
518 0.18
519 0.15
520 0.12
521 0.12
522 0.13
523 0.12
524 0.11
525 0.11
526 0.14
527 0.2
528 0.28