Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A553HS02

Protein Details
Accession A0A553HS02    Localization Confidence High Confidence Score 22.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
996-1015QQAIAKEKERQEKLRKEREEBasic
1037-1101TDEETGEKVKRKKKSRPRTEDQPKSRSQRKKKARRDEEQESDDEAQPKKKRRLAKKDNKQYKSAEBasic
1161-1183EQTTTRTTSKRTRRGRVLDDSDEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
983-1013KRQAEAKRREEERQQAIAKEKERQEKLRKER
1044-1072KVKRKKKSRPRTEDQPKSRSQRKKKARRD
1082-1093QPKKKRRLAKKD
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031101  Ctr9  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0043231  C:intracellular membrane-bounded organelle  
GO:0016570  P:histone modification  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF13176  TPR_7  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MATTTTTARNGQLNGAANGAALIQPASKRFSDIPGTIEVPVQEDDDFINVEIDLNNLVDDPTELCDMFENEHTARLYWMTIALAYAKQNKTDRAIEVLNRGSNAMQDTTPVEKLSLISCVCWMYLRKSREAPRVPPDGALLSEAKTKDHYLQLATSSLNEASRINPAFPPLFLARGVLQLLKASLQAPSKAAAGGPIDQAKADLLKGALKSFEQASKVSQGKNMLALMGKARALYGLGNYKDALTTYQDILLKTPDLIDPDPRIGIGCCLWQLGYKDDAKQAWVRSLELNPESKALILLGLYYLDASSKVPTHSPEFIKLYKKAMTEFTQKSFKIDKNQPLTCATFAGYFLSSKNLSHVESLANKAIQYTDVNAIASDGWYLLAKKEHYSGNVETATDYYRRADEARGGLERGYLPAKFGVAQLSVLNNDLGEAKLRLEKIIQLTGKHERNYEAMILLGTLYAEEVFVNQFAATKEDKSAEMRKAIDYLEQVRTAWKDPKKNLSSDPSILLNLARLYESSQPEKALQCLSQVEQLELDQIPSSEHPDGIEDASELRNALRKNLPPQLLNNIGCFYSQAEKHERATEMFQAALSSCMRIGEKGEDIDTDALVTTISFNLGRSYESQGLTDKAVEVYEQLTARHDDYTDAQARLAYIKLRKNPNKEGPDAVAKLYQANSADLEVRALYGWYLGRVNSRKKLANVNEDPELRHYKHTLQNYDKHDRYALIGMGNLYMMAAREMRRETEQDKQKRSATYTRAVEFFDKALQLDPKNAHAAQGVAIALIEDKKDYSNALPIFLKIRETIKDANVYINIGHTYAELRQFSKAIENYEIALSKEGKSNDASILACLGRTWLNRGRHERNLEAFKTSLSYAKKALEVSPDQVHFYFNVAFVQIQLVQHIMNVAETQRTLVQLEEAMEGLEAAIVALHEIAQHPQPPYPKVDIEQRANMARNTQRKQLGRQIESQKEYEEKNKEKIAAVLEKRQAEAKRREEERQQAIAKEKERQEKLRKEREEMMAKERERDQARQAEEEAELTTDEETGEKVKRKKKSRPRTEDQPKSRSQRKKKARRDEEQESDDEAQPKKKRRLAKKDNKQYKSAEIVVDSSDDNGDDDGVLERAERAMQNRSSPLSDIDAASKVDESEDRMDVDETANQDEDEEEQTTTRTTSKRTRRGRVLDDSDEEEDGARAEEGEADAADTSMADED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.28
3 0.25
4 0.2
5 0.19
6 0.16
7 0.11
8 0.07
9 0.07
10 0.08
11 0.1
12 0.13
13 0.17
14 0.17
15 0.21
16 0.22
17 0.28
18 0.32
19 0.32
20 0.33
21 0.33
22 0.35
23 0.31
24 0.31
25 0.26
26 0.22
27 0.21
28 0.19
29 0.14
30 0.13
31 0.13
32 0.12
33 0.13
34 0.1
35 0.1
36 0.09
37 0.1
38 0.09
39 0.09
40 0.09
41 0.08
42 0.08
43 0.07
44 0.07
45 0.07
46 0.07
47 0.08
48 0.1
49 0.11
50 0.11
51 0.11
52 0.14
53 0.15
54 0.16
55 0.18
56 0.2
57 0.18
58 0.23
59 0.23
60 0.21
61 0.21
62 0.2
63 0.18
64 0.14
65 0.14
66 0.11
67 0.1
68 0.1
69 0.11
70 0.12
71 0.16
72 0.25
73 0.25
74 0.31
75 0.35
76 0.38
77 0.42
78 0.44
79 0.42
80 0.39
81 0.43
82 0.4
83 0.42
84 0.44
85 0.4
86 0.36
87 0.34
88 0.29
89 0.26
90 0.25
91 0.2
92 0.15
93 0.15
94 0.18
95 0.21
96 0.22
97 0.2
98 0.18
99 0.16
100 0.17
101 0.17
102 0.19
103 0.16
104 0.15
105 0.16
106 0.16
107 0.16
108 0.18
109 0.2
110 0.22
111 0.3
112 0.34
113 0.38
114 0.46
115 0.54
116 0.61
117 0.66
118 0.66
119 0.66
120 0.69
121 0.64
122 0.56
123 0.5
124 0.42
125 0.34
126 0.29
127 0.23
128 0.17
129 0.21
130 0.2
131 0.19
132 0.19
133 0.21
134 0.23
135 0.26
136 0.27
137 0.25
138 0.27
139 0.28
140 0.27
141 0.25
142 0.22
143 0.19
144 0.18
145 0.16
146 0.14
147 0.13
148 0.12
149 0.19
150 0.2
151 0.2
152 0.19
153 0.23
154 0.23
155 0.22
156 0.26
157 0.2
158 0.21
159 0.19
160 0.2
161 0.17
162 0.18
163 0.19
164 0.15
165 0.14
166 0.13
167 0.13
168 0.12
169 0.12
170 0.1
171 0.13
172 0.15
173 0.16
174 0.16
175 0.17
176 0.17
177 0.17
178 0.16
179 0.15
180 0.14
181 0.14
182 0.17
183 0.17
184 0.17
185 0.16
186 0.17
187 0.15
188 0.14
189 0.12
190 0.1
191 0.09
192 0.12
193 0.13
194 0.14
195 0.14
196 0.13
197 0.15
198 0.17
199 0.2
200 0.18
201 0.18
202 0.2
203 0.27
204 0.3
205 0.3
206 0.3
207 0.3
208 0.29
209 0.31
210 0.29
211 0.22
212 0.19
213 0.19
214 0.17
215 0.15
216 0.15
217 0.12
218 0.12
219 0.1
220 0.1
221 0.1
222 0.12
223 0.17
224 0.18
225 0.19
226 0.19
227 0.19
228 0.19
229 0.19
230 0.16
231 0.13
232 0.15
233 0.14
234 0.18
235 0.2
236 0.2
237 0.21
238 0.21
239 0.18
240 0.15
241 0.16
242 0.13
243 0.15
244 0.16
245 0.19
246 0.2
247 0.21
248 0.21
249 0.19
250 0.19
251 0.15
252 0.16
253 0.13
254 0.12
255 0.1
256 0.1
257 0.11
258 0.13
259 0.14
260 0.15
261 0.19
262 0.19
263 0.21
264 0.25
265 0.25
266 0.25
267 0.28
268 0.26
269 0.27
270 0.27
271 0.26
272 0.25
273 0.26
274 0.29
275 0.28
276 0.29
277 0.24
278 0.24
279 0.23
280 0.2
281 0.18
282 0.12
283 0.09
284 0.06
285 0.06
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.05
293 0.05
294 0.07
295 0.08
296 0.1
297 0.11
298 0.14
299 0.19
300 0.24
301 0.26
302 0.3
303 0.33
304 0.37
305 0.41
306 0.4
307 0.4
308 0.38
309 0.37
310 0.33
311 0.34
312 0.34
313 0.38
314 0.39
315 0.4
316 0.43
317 0.42
318 0.44
319 0.45
320 0.44
321 0.45
322 0.49
323 0.53
324 0.55
325 0.57
326 0.55
327 0.52
328 0.51
329 0.41
330 0.34
331 0.26
332 0.18
333 0.16
334 0.15
335 0.12
336 0.1
337 0.1
338 0.13
339 0.12
340 0.12
341 0.14
342 0.14
343 0.15
344 0.15
345 0.16
346 0.16
347 0.18
348 0.21
349 0.2
350 0.19
351 0.17
352 0.17
353 0.16
354 0.14
355 0.12
356 0.12
357 0.12
358 0.12
359 0.12
360 0.12
361 0.12
362 0.1
363 0.1
364 0.07
365 0.05
366 0.04
367 0.05
368 0.06
369 0.07
370 0.1
371 0.11
372 0.12
373 0.16
374 0.17
375 0.18
376 0.23
377 0.23
378 0.24
379 0.24
380 0.23
381 0.2
382 0.19
383 0.19
384 0.14
385 0.14
386 0.11
387 0.1
388 0.12
389 0.13
390 0.13
391 0.15
392 0.17
393 0.19
394 0.19
395 0.19
396 0.18
397 0.18
398 0.17
399 0.15
400 0.14
401 0.11
402 0.1
403 0.1
404 0.11
405 0.1
406 0.1
407 0.1
408 0.09
409 0.1
410 0.1
411 0.1
412 0.1
413 0.1
414 0.09
415 0.07
416 0.07
417 0.07
418 0.06
419 0.07
420 0.07
421 0.07
422 0.1
423 0.11
424 0.11
425 0.11
426 0.13
427 0.15
428 0.21
429 0.21
430 0.19
431 0.23
432 0.31
433 0.35
434 0.34
435 0.32
436 0.28
437 0.28
438 0.28
439 0.25
440 0.16
441 0.12
442 0.11
443 0.09
444 0.07
445 0.06
446 0.04
447 0.03
448 0.03
449 0.03
450 0.03
451 0.03
452 0.03
453 0.04
454 0.04
455 0.04
456 0.04
457 0.06
458 0.06
459 0.09
460 0.1
461 0.1
462 0.11
463 0.12
464 0.14
465 0.16
466 0.21
467 0.21
468 0.23
469 0.24
470 0.23
471 0.23
472 0.23
473 0.2
474 0.17
475 0.19
476 0.18
477 0.17
478 0.17
479 0.17
480 0.19
481 0.2
482 0.25
483 0.27
484 0.32
485 0.35
486 0.45
487 0.47
488 0.48
489 0.5
490 0.48
491 0.47
492 0.41
493 0.39
494 0.3
495 0.27
496 0.24
497 0.19
498 0.14
499 0.1
500 0.08
501 0.07
502 0.06
503 0.08
504 0.13
505 0.16
506 0.17
507 0.18
508 0.18
509 0.2
510 0.21
511 0.2
512 0.17
513 0.14
514 0.13
515 0.14
516 0.14
517 0.16
518 0.15
519 0.14
520 0.12
521 0.12
522 0.12
523 0.11
524 0.1
525 0.06
526 0.06
527 0.07
528 0.07
529 0.1
530 0.08
531 0.08
532 0.08
533 0.09
534 0.1
535 0.09
536 0.09
537 0.06
538 0.07
539 0.07
540 0.07
541 0.06
542 0.06
543 0.09
544 0.09
545 0.13
546 0.16
547 0.19
548 0.24
549 0.3
550 0.33
551 0.3
552 0.32
553 0.34
554 0.35
555 0.33
556 0.29
557 0.23
558 0.21
559 0.19
560 0.18
561 0.14
562 0.11
563 0.11
564 0.14
565 0.18
566 0.19
567 0.21
568 0.24
569 0.23
570 0.21
571 0.22
572 0.21
573 0.17
574 0.15
575 0.13
576 0.1
577 0.1
578 0.1
579 0.08
580 0.06
581 0.05
582 0.06
583 0.06
584 0.06
585 0.08
586 0.08
587 0.08
588 0.09
589 0.09
590 0.08
591 0.09
592 0.09
593 0.08
594 0.06
595 0.05
596 0.04
597 0.04
598 0.04
599 0.03
600 0.03
601 0.04
602 0.04
603 0.04
604 0.05
605 0.06
606 0.07
607 0.08
608 0.12
609 0.15
610 0.16
611 0.16
612 0.16
613 0.17
614 0.16
615 0.15
616 0.11
617 0.08
618 0.07
619 0.06
620 0.06
621 0.05
622 0.07
623 0.07
624 0.07
625 0.08
626 0.1
627 0.1
628 0.1
629 0.1
630 0.09
631 0.1
632 0.16
633 0.18
634 0.17
635 0.16
636 0.16
637 0.16
638 0.16
639 0.15
640 0.12
641 0.14
642 0.19
643 0.25
644 0.35
645 0.42
646 0.48
647 0.56
648 0.62
649 0.61
650 0.59
651 0.55
652 0.47
653 0.46
654 0.4
655 0.32
656 0.24
657 0.19
658 0.18
659 0.16
660 0.15
661 0.11
662 0.1
663 0.1
664 0.09
665 0.1
666 0.09
667 0.09
668 0.07
669 0.06
670 0.06
671 0.05
672 0.05
673 0.05
674 0.05
675 0.05
676 0.06
677 0.07
678 0.13
679 0.18
680 0.23
681 0.27
682 0.31
683 0.34
684 0.35
685 0.44
686 0.44
687 0.49
688 0.47
689 0.45
690 0.45
691 0.43
692 0.41
693 0.36
694 0.35
695 0.27
696 0.25
697 0.24
698 0.26
699 0.32
700 0.37
701 0.41
702 0.41
703 0.48
704 0.53
705 0.6
706 0.54
707 0.49
708 0.44
709 0.37
710 0.33
711 0.27
712 0.21
713 0.13
714 0.12
715 0.11
716 0.1
717 0.1
718 0.08
719 0.05
720 0.04
721 0.04
722 0.04
723 0.06
724 0.06
725 0.09
726 0.1
727 0.12
728 0.14
729 0.17
730 0.19
731 0.27
732 0.36
733 0.42
734 0.46
735 0.49
736 0.51
737 0.51
738 0.53
739 0.52
740 0.47
741 0.47
742 0.45
743 0.43
744 0.4
745 0.39
746 0.35
747 0.28
748 0.24
749 0.18
750 0.14
751 0.12
752 0.13
753 0.16
754 0.15
755 0.18
756 0.18
757 0.19
758 0.22
759 0.22
760 0.2
761 0.17
762 0.17
763 0.13
764 0.13
765 0.11
766 0.07
767 0.07
768 0.06
769 0.06
770 0.06
771 0.05
772 0.04
773 0.05
774 0.05
775 0.06
776 0.07
777 0.08
778 0.14
779 0.15
780 0.17
781 0.17
782 0.17
783 0.2
784 0.19
785 0.2
786 0.14
787 0.17
788 0.16
789 0.19
790 0.22
791 0.21
792 0.25
793 0.24
794 0.24
795 0.22
796 0.21
797 0.17
798 0.15
799 0.13
800 0.09
801 0.09
802 0.07
803 0.08
804 0.09
805 0.14
806 0.14
807 0.14
808 0.15
809 0.16
810 0.16
811 0.21
812 0.21
813 0.2
814 0.21
815 0.2
816 0.2
817 0.21
818 0.22
819 0.16
820 0.16
821 0.15
822 0.13
823 0.17
824 0.17
825 0.17
826 0.17
827 0.18
828 0.17
829 0.18
830 0.17
831 0.13
832 0.14
833 0.13
834 0.11
835 0.09
836 0.1
837 0.1
838 0.11
839 0.17
840 0.22
841 0.29
842 0.37
843 0.46
844 0.51
845 0.56
846 0.61
847 0.6
848 0.59
849 0.59
850 0.53
851 0.47
852 0.4
853 0.32
854 0.29
855 0.25
856 0.23
857 0.19
858 0.2
859 0.2
860 0.21
861 0.23
862 0.22
863 0.23
864 0.24
865 0.24
866 0.26
867 0.28
868 0.27
869 0.27
870 0.26
871 0.25
872 0.19
873 0.19
874 0.16
875 0.12
876 0.12
877 0.1
878 0.1
879 0.09
880 0.11
881 0.1
882 0.09
883 0.09
884 0.09
885 0.09
886 0.09
887 0.09
888 0.07
889 0.06
890 0.06
891 0.07
892 0.07
893 0.07
894 0.09
895 0.09
896 0.1
897 0.1
898 0.09
899 0.1
900 0.1
901 0.11
902 0.1
903 0.09
904 0.09
905 0.08
906 0.07
907 0.06
908 0.05
909 0.03
910 0.03
911 0.03
912 0.02
913 0.03
914 0.03
915 0.03
916 0.03
917 0.04
918 0.06
919 0.08
920 0.12
921 0.13
922 0.17
923 0.21
924 0.23
925 0.27
926 0.29
927 0.29
928 0.29
929 0.38
930 0.42
931 0.43
932 0.45
933 0.44
934 0.44
935 0.45
936 0.42
937 0.4
938 0.39
939 0.44
940 0.43
941 0.47
942 0.51
943 0.53
944 0.59
945 0.61
946 0.64
947 0.58
948 0.63
949 0.65
950 0.65
951 0.64
952 0.59
953 0.52
954 0.46
955 0.45
956 0.44
957 0.44
958 0.41
959 0.44
960 0.47
961 0.46
962 0.44
963 0.44
964 0.42
965 0.42
966 0.41
967 0.42
968 0.44
969 0.43
970 0.43
971 0.46
972 0.44
973 0.44
974 0.5
975 0.5
976 0.54
977 0.57
978 0.62
979 0.65
980 0.69
981 0.67
982 0.66
983 0.61
984 0.56
985 0.59
986 0.6
987 0.54
988 0.53
989 0.53
990 0.54
991 0.58
992 0.63
993 0.67
994 0.71
995 0.78
996 0.8
997 0.78
998 0.74
999 0.75
1000 0.74
1001 0.73
1002 0.66
1003 0.64
1004 0.62
1005 0.58
1006 0.57
1007 0.52
1008 0.51
1009 0.46
1010 0.46
1011 0.47
1012 0.46
1013 0.48
1014 0.46
1015 0.45
1016 0.38
1017 0.34
1018 0.31
1019 0.24
1020 0.17
1021 0.14
1022 0.11
1023 0.1
1024 0.08
1025 0.07
1026 0.07
1027 0.07
1028 0.1
1029 0.15
1030 0.22
1031 0.3
1032 0.37
1033 0.47
1034 0.57
1035 0.67
1036 0.75
1037 0.81
1038 0.85
1039 0.88
1040 0.9
1041 0.92
1042 0.93
1043 0.93
1044 0.91
1045 0.88
1046 0.86
1047 0.85
1048 0.85
1049 0.85
1050 0.85
1051 0.84
1052 0.86
1053 0.89
1054 0.91
1055 0.93
1056 0.94
1057 0.93
1058 0.92
1059 0.91
1060 0.89
1061 0.82
1062 0.74
1063 0.67
1064 0.6
1065 0.54
1066 0.49
1067 0.42
1068 0.42
1069 0.45
1070 0.52
1071 0.56
1072 0.59
1073 0.65
1074 0.71
1075 0.79
1076 0.82
1077 0.86
1078 0.88
1079 0.9
1080 0.95
1081 0.9
1082 0.85
1083 0.78
1084 0.73
1085 0.69
1086 0.62
1087 0.53
1088 0.43
1089 0.4
1090 0.34
1091 0.31
1092 0.24
1093 0.17
1094 0.14
1095 0.11
1096 0.1
1097 0.09
1098 0.08
1099 0.07
1100 0.07
1101 0.08
1102 0.08
1103 0.08
1104 0.07
1105 0.07
1106 0.08
1107 0.11
1108 0.12
1109 0.14
1110 0.22
1111 0.25
1112 0.3
1113 0.34
1114 0.36
1115 0.36
1116 0.35
1117 0.34
1118 0.31
1119 0.3
1120 0.26
1121 0.25
1122 0.24
1123 0.22
1124 0.22
1125 0.2
1126 0.15
1127 0.15
1128 0.15
1129 0.16
1130 0.18
1131 0.19
1132 0.19
1133 0.2
1134 0.2
1135 0.19
1136 0.2
1137 0.19
1138 0.17
1139 0.18
1140 0.18
1141 0.16
1142 0.16
1143 0.15
1144 0.16
1145 0.16
1146 0.15
1147 0.13
1148 0.13
1149 0.14
1150 0.15
1151 0.16
1152 0.19
1153 0.19
1154 0.24
1155 0.34
1156 0.45
1157 0.55
1158 0.64
1159 0.73
1160 0.78
1161 0.85
1162 0.86
1163 0.86
1164 0.84
1165 0.8
1166 0.74
1167 0.68
1168 0.6
1169 0.51
1170 0.42
1171 0.32
1172 0.24
1173 0.18
1174 0.15
1175 0.1
1176 0.08
1177 0.08
1178 0.09
1179 0.09
1180 0.09
1181 0.09
1182 0.09
1183 0.09
1184 0.08
1185 0.08
1186 0.06