Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A553ID88

Protein Details
Accession A0A553ID88    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MAPRRPDKKSKRSGKGAISRAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-18RRPDKKSKRSGKGAI
Subcellular Location(s) mito 11.5, cyto_mito 8.833, nucl 8.5, cyto_nucl 7.333, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Pfam View protein in Pfam  
PF13424  TPR_12  
Amino Acid Sequences MAPRRPDKKSKRSGKGAISRAAAGSSNNKPVSPQVLVKAAEFQLQEGNVQDAATLAEKALEGSSPGSDDALCALNFLGQINLELGDFDTARAYLLRAVAIDEDGSKDENVGGGPEKFLSLAQLSEEGGKDSVGWFQKGAAALRERIHALEGAKGKGKQSDEETILLEELRKKLAMTLCSVAEVFMTDLSWEEDAEKRCESLTTEATMIAPDFAETWQTLANVRISQSRFDDAKAALNRSLELWKDLPPEDPSVPDFPSRVGLSRLLMEVELEQEALEVLERLVGEDDQSVEVWYLGGWGLYVMGEKQKDNKAEEDYKASWISSRVWLNQCLHLYKLQEYEDERLGEHAKELLAAIAKELGEAPVGQDEEEEDNGSGWEDEESDEEMQE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.89
2 0.88
3 0.84
4 0.8
5 0.71
6 0.62
7 0.52
8 0.45
9 0.35
10 0.28
11 0.28
12 0.27
13 0.32
14 0.32
15 0.31
16 0.31
17 0.34
18 0.37
19 0.34
20 0.33
21 0.29
22 0.34
23 0.35
24 0.34
25 0.36
26 0.31
27 0.31
28 0.27
29 0.24
30 0.21
31 0.21
32 0.21
33 0.17
34 0.18
35 0.13
36 0.13
37 0.12
38 0.09
39 0.09
40 0.1
41 0.09
42 0.07
43 0.07
44 0.07
45 0.08
46 0.08
47 0.07
48 0.07
49 0.08
50 0.08
51 0.08
52 0.09
53 0.09
54 0.08
55 0.08
56 0.09
57 0.11
58 0.1
59 0.09
60 0.09
61 0.1
62 0.1
63 0.1
64 0.09
65 0.06
66 0.07
67 0.07
68 0.08
69 0.06
70 0.06
71 0.06
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.07
78 0.07
79 0.07
80 0.08
81 0.09
82 0.09
83 0.08
84 0.09
85 0.09
86 0.09
87 0.09
88 0.07
89 0.08
90 0.08
91 0.09
92 0.08
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.08
97 0.08
98 0.09
99 0.08
100 0.09
101 0.09
102 0.09
103 0.08
104 0.08
105 0.09
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.08
110 0.08
111 0.1
112 0.1
113 0.09
114 0.09
115 0.08
116 0.08
117 0.07
118 0.12
119 0.12
120 0.13
121 0.12
122 0.12
123 0.14
124 0.16
125 0.16
126 0.15
127 0.15
128 0.18
129 0.19
130 0.2
131 0.19
132 0.17
133 0.17
134 0.15
135 0.13
136 0.16
137 0.17
138 0.17
139 0.2
140 0.2
141 0.21
142 0.23
143 0.23
144 0.2
145 0.22
146 0.25
147 0.24
148 0.24
149 0.24
150 0.2
151 0.19
152 0.17
153 0.14
154 0.12
155 0.11
156 0.1
157 0.1
158 0.09
159 0.13
160 0.16
161 0.16
162 0.16
163 0.17
164 0.17
165 0.17
166 0.17
167 0.13
168 0.1
169 0.09
170 0.06
171 0.04
172 0.04
173 0.03
174 0.04
175 0.05
176 0.05
177 0.04
178 0.05
179 0.09
180 0.11
181 0.13
182 0.13
183 0.13
184 0.13
185 0.13
186 0.14
187 0.14
188 0.13
189 0.12
190 0.13
191 0.13
192 0.13
193 0.12
194 0.1
195 0.07
196 0.05
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.06
204 0.06
205 0.07
206 0.08
207 0.1
208 0.09
209 0.1
210 0.15
211 0.15
212 0.17
213 0.19
214 0.21
215 0.2
216 0.2
217 0.22
218 0.18
219 0.24
220 0.24
221 0.24
222 0.22
223 0.21
224 0.21
225 0.2
226 0.21
227 0.14
228 0.15
229 0.14
230 0.15
231 0.18
232 0.18
233 0.19
234 0.19
235 0.22
236 0.2
237 0.2
238 0.2
239 0.2
240 0.2
241 0.19
242 0.17
243 0.14
244 0.17
245 0.16
246 0.15
247 0.15
248 0.15
249 0.15
250 0.16
251 0.16
252 0.12
253 0.12
254 0.1
255 0.09
256 0.09
257 0.08
258 0.06
259 0.06
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.04
264 0.04
265 0.03
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.06
270 0.06
271 0.07
272 0.07
273 0.08
274 0.08
275 0.08
276 0.08
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.06
281 0.05
282 0.05
283 0.04
284 0.04
285 0.03
286 0.04
287 0.04
288 0.04
289 0.05
290 0.09
291 0.11
292 0.12
293 0.18
294 0.24
295 0.28
296 0.31
297 0.34
298 0.38
299 0.42
300 0.44
301 0.45
302 0.4
303 0.39
304 0.37
305 0.33
306 0.27
307 0.24
308 0.24
309 0.24
310 0.27
311 0.3
312 0.33
313 0.39
314 0.4
315 0.44
316 0.46
317 0.41
318 0.39
319 0.36
320 0.34
321 0.32
322 0.34
323 0.29
324 0.29
325 0.3
326 0.32
327 0.32
328 0.3
329 0.27
330 0.26
331 0.27
332 0.23
333 0.21
334 0.18
335 0.14
336 0.13
337 0.13
338 0.12
339 0.13
340 0.13
341 0.12
342 0.13
343 0.13
344 0.13
345 0.13
346 0.11
347 0.09
348 0.09
349 0.1
350 0.12
351 0.12
352 0.12
353 0.11
354 0.13
355 0.15
356 0.17
357 0.17
358 0.13
359 0.13
360 0.13
361 0.14
362 0.12
363 0.09
364 0.09
365 0.08
366 0.08
367 0.1
368 0.13