FuNGI

A0A553HIV0

Protein Details

Accession

A0A553HIV0

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
78-98	MDEQARKKRKHDQMQEGDEDW	Acidic
108-165	KPGQGMKKKTAKEAKKKQKQEAEEAELNEKERRKEEKKAARKERKAERQRLRDEERRT	Basic
317-340	LESRRQKQAERKAHKKELRRQAKL	Basic
450-524	DGKMLKKAVKRKESAKKKSTKEWAARKEGVAKSIKDRQKKREENIRKRRDEKLLGKAGKKKGAKKTKGRAGFEGS	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
111-163	QGMKKKTAKEAKKKQKQEAEEAELNEKERRKEEKKAARKERKAERQRLRDEER
299-346	EARGADKDGKPIRTREELLESRRQKQAERKAHKKELRRQAKLEEERKR
438-530	ARRRAEGEKIKDDGKMLKKAVKRKESAKKKSTKEWAARKEGVAKSIKDRQKKREENIRKRRDEKLLGKAGKKKGAKKTKGRAGFEGSFMGKKK

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto_nucl 14.833, mito_nucl 12.499

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR029190 Rrp14/SURF6_C IPR029188 Rrp14_N IPR007019 SURF6
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF15459 RRP14 PF04935 SURF6

Amino Acid Sequences

MEDSSLKERLLNSQKAFDGLLSLIPAKMYYGEDVSLTPNLPLQDQWQRKKQTKAQAAEARRNKLDPDSALNRSVKEVMDEQARKKRKHDQMQEGDEDWSEIEGIEAEKPGQGMKKKTAKEAKKKQKQEAEEAELNEKERRKEEKKAARKERKAERQRLRDEERRTVTGVNKTKVGKREDRSNTVPNGNVSQPDPTQEPVELSADEAAEADEQAEVDEADDSDSDSDSDSDSMKSPTDTPQSPVFDTNGTPADSTEQAPSVTTSVSSTDPTSDKPKHIKIPADSAALRARLAARIQALREARGADKDGKPIRTREELLESRRQKQAERKAHKKELRRQAKLEEERKREEALASARESPGGILSPSVDVEEQNFAFGRVGFGDGSQLSHDLTHVLNRTPKKGPSDPRTALLKFESQKKRLEAMDQEKRKDIEEKEAWLTARRRAEGEKIKDDGKMLKKAVKRKESAKKKSTKEWAARKEGVAKSIKDRQKKREENIRKRRDEKLLGKAGKKKGAKKTKGRAGFEGSFMGKKK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.46
2	0.45
3	0.45
4	0.34
5	0.27
6	0.2
7	0.18
8	0.14
9	0.14
10	0.12
11	0.12
12	0.12
13	0.1
14	0.11
15	0.11
16	0.12
17	0.13
18	0.13
19	0.14
20	0.14
21	0.17
22	0.16
23	0.15
24	0.13
25	0.14
26	0.15
27	0.15
28	0.15
29	0.18
30	0.27
31	0.37
32	0.44
33	0.51
34	0.59
35	0.66
36	0.75
37	0.77
38	0.78
39	0.78
40	0.76
41	0.77
42	0.77
43	0.78
44	0.78
45	0.78
46	0.73
47	0.66
48	0.62
49	0.53
50	0.49
51	0.46
52	0.39
53	0.39
54	0.39
55	0.4
56	0.45
57	0.44
58	0.4
59	0.38
60	0.37
61	0.29
62	0.25
63	0.24
64	0.22
65	0.3
66	0.34
67	0.38
68	0.46
69	0.54
70	0.53
71	0.57
72	0.64
73	0.64
74	0.71
75	0.75
76	0.76
77	0.78
78	0.82
79	0.81
80	0.72
81	0.62
82	0.51
83	0.41
84	0.29
85	0.19
86	0.12
87	0.07
88	0.06
89	0.05
90	0.06
91	0.07
92	0.07
93	0.07
94	0.08
95	0.08
96	0.1
97	0.15
98	0.2
99	0.24
100	0.33
101	0.41
102	0.43
103	0.53
104	0.61
105	0.66
106	0.71
107	0.78
108	0.8
109	0.82
110	0.88
111	0.88
112	0.87
113	0.82
114	0.8
115	0.77
116	0.74
117	0.67
118	0.6
119	0.55
120	0.47
121	0.43
122	0.38
123	0.33
124	0.28
125	0.29
126	0.37
127	0.38
128	0.47
129	0.56
130	0.62
131	0.69
132	0.78
133	0.83
134	0.85
135	0.88
136	0.88
137	0.88
138	0.88
139	0.88
140	0.88
141	0.87
142	0.86
143	0.86
144	0.86
145	0.83
146	0.8
147	0.76
148	0.74
149	0.69
150	0.61
151	0.54
152	0.49
153	0.46
154	0.47
155	0.48
156	0.4
157	0.4
158	0.41
159	0.44
160	0.47
161	0.49
162	0.48
163	0.45
164	0.54
165	0.56
166	0.6
167	0.61
168	0.6
169	0.57
170	0.51
171	0.48
172	0.39
173	0.35
174	0.29
175	0.25
176	0.2
177	0.19
178	0.16
179	0.17
180	0.17
181	0.15
182	0.15
183	0.14
184	0.14
185	0.13
186	0.14
187	0.11
188	0.1
189	0.1
190	0.08
191	0.08
192	0.07
193	0.06
194	0.05
195	0.05
196	0.04
197	0.04
198	0.04
199	0.04
200	0.04
201	0.03
202	0.03
203	0.04
204	0.04
205	0.04
206	0.04
207	0.04
208	0.04
209	0.05
210	0.04
211	0.05
212	0.05
213	0.05
214	0.06
215	0.06
216	0.07
217	0.08
218	0.09
219	0.09
220	0.09
221	0.1
222	0.13
223	0.18
224	0.18
225	0.2
226	0.24
227	0.26
228	0.26
229	0.26
230	0.23
231	0.19
232	0.19
233	0.18
234	0.14
235	0.12
236	0.11
237	0.1
238	0.11
239	0.11
240	0.12
241	0.11
242	0.09
243	0.09
244	0.09
245	0.09
246	0.08
247	0.07
248	0.06
249	0.06
250	0.07
251	0.07
252	0.08
253	0.08
254	0.09
255	0.1
256	0.12
257	0.18
258	0.19
259	0.23
260	0.27
261	0.32
262	0.36
263	0.4
264	0.43
265	0.38
266	0.43
267	0.42
268	0.39
269	0.35
270	0.31
271	0.29
272	0.24
273	0.22
274	0.16
275	0.13
276	0.12
277	0.12
278	0.12
279	0.12
280	0.13
281	0.13
282	0.18
283	0.18
284	0.17
285	0.18
286	0.17
287	0.16
288	0.16
289	0.18
290	0.18
291	0.19
292	0.26
293	0.29
294	0.31
295	0.33
296	0.34
297	0.36
298	0.36
299	0.36
300	0.31
301	0.35
302	0.36
303	0.38
304	0.46
305	0.44
306	0.44
307	0.46
308	0.45
309	0.41
310	0.45
311	0.51
312	0.52
313	0.59
314	0.65
315	0.7
316	0.79
317	0.81
318	0.81
319	0.8
320	0.81
321	0.81
322	0.78
323	0.72
324	0.68
325	0.72
326	0.72
327	0.71
328	0.7
329	0.65
330	0.63
331	0.62
332	0.57
333	0.47
334	0.38
335	0.34
336	0.29
337	0.27
338	0.24
339	0.24
340	0.22
341	0.22
342	0.21
343	0.16
344	0.12
345	0.09
346	0.07
347	0.06
348	0.06
349	0.07
350	0.07
351	0.08
352	0.07
353	0.06
354	0.08
355	0.11
356	0.1
357	0.1
358	0.1
359	0.1
360	0.11
361	0.11
362	0.1
363	0.07
364	0.09
365	0.08
366	0.08
367	0.09
368	0.08
369	0.09
370	0.09
371	0.09
372	0.08
373	0.08
374	0.08
375	0.07
376	0.08
377	0.11
378	0.13
379	0.15
380	0.22
381	0.24
382	0.29
383	0.32
384	0.36
385	0.4
386	0.46
387	0.53
388	0.54
389	0.62
390	0.59
391	0.6
392	0.62
393	0.55
394	0.49
395	0.42
396	0.42
397	0.36
398	0.44
399	0.47
400	0.44
401	0.5
402	0.51
403	0.52
404	0.47
405	0.49
406	0.49
407	0.5
408	0.57
409	0.58
410	0.57
411	0.57
412	0.56
413	0.53
414	0.5
415	0.42
416	0.41
417	0.39
418	0.4
419	0.39
420	0.41
421	0.39
422	0.4
423	0.4
424	0.37
425	0.39
426	0.36
427	0.36
428	0.36
429	0.45
430	0.48
431	0.53
432	0.52
433	0.49
434	0.49
435	0.48
436	0.47
437	0.46
438	0.43
439	0.42
440	0.39
441	0.43
442	0.48
443	0.56
444	0.63
445	0.64
446	0.63
447	0.66
448	0.74
449	0.78
450	0.83
451	0.84
452	0.84
453	0.81
454	0.85
455	0.85
456	0.85
457	0.84
458	0.84
459	0.83
460	0.82
461	0.79
462	0.72
463	0.71
464	0.63
465	0.6
466	0.56
467	0.49
468	0.48
469	0.54
470	0.58
471	0.59
472	0.66
473	0.69
474	0.74
475	0.81
476	0.83
477	0.85
478	0.88
479	0.9
480	0.92
481	0.93
482	0.91
483	0.87
484	0.86
485	0.84
486	0.83
487	0.8
488	0.8
489	0.79
490	0.77
491	0.79
492	0.79
493	0.77
494	0.76
495	0.75
496	0.74
497	0.74
498	0.78
499	0.81
500	0.83
501	0.86
502	0.87
503	0.89
504	0.86
505	0.81
506	0.78
507	0.71
508	0.63
509	0.57
510	0.49

A0A553HIV0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer