Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A553HXV8

Protein Details
Accession A0A553HXV8    Localization Confidence High Confidence Score 21.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-32IPTSADPRSKRPTKKRALTPLSAQHydrophilic
115-149EERLRRDDEKTRRNREKREKKRKAREQQQRAKNGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
19-19R
22-22K
113-148GKEERLRRDDEKTRRNREKREKKRKAREQQQRAKNG
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009548  Prkrip1  
Gene Ontology GO:0003725  F:double-stranded RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06658  DUF1168  
Amino Acid Sequences MSGEGPESIPTSADPRSKRPTKKRALTPLSAQAKELDTLFAHPEQEIRTEKRDTAPRLAAPPEIVANVQGSSAGAGSGEFHVYKASRRREYERLRRMDEEVAKESADAEFERGKEERLRRDDEKTRRNREKREKKRKAREQQQRAKNGGAAGGGGGGGGGDHGGNSTAAGNCGAAGAATTHNGVKPRIQRRENDKEDGEDIAQDAVDQPMEEARGIVIEDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.34
3 0.44
4 0.53
5 0.62
6 0.7
7 0.75
8 0.8
9 0.86
10 0.88
11 0.89
12 0.88
13 0.83
14 0.78
15 0.78
16 0.75
17 0.65
18 0.55
19 0.46
20 0.4
21 0.35
22 0.29
23 0.21
24 0.13
25 0.14
26 0.17
27 0.15
28 0.14
29 0.13
30 0.15
31 0.14
32 0.19
33 0.22
34 0.23
35 0.27
36 0.29
37 0.3
38 0.36
39 0.43
40 0.42
41 0.44
42 0.45
43 0.42
44 0.44
45 0.43
46 0.37
47 0.3
48 0.26
49 0.2
50 0.16
51 0.13
52 0.1
53 0.09
54 0.08
55 0.08
56 0.06
57 0.06
58 0.05
59 0.05
60 0.04
61 0.03
62 0.03
63 0.04
64 0.05
65 0.06
66 0.06
67 0.06
68 0.07
69 0.08
70 0.13
71 0.2
72 0.28
73 0.33
74 0.37
75 0.43
76 0.52
77 0.62
78 0.68
79 0.69
80 0.67
81 0.65
82 0.63
83 0.59
84 0.55
85 0.48
86 0.42
87 0.35
88 0.29
89 0.25
90 0.23
91 0.21
92 0.15
93 0.12
94 0.08
95 0.07
96 0.08
97 0.08
98 0.1
99 0.1
100 0.12
101 0.16
102 0.2
103 0.26
104 0.3
105 0.35
106 0.36
107 0.43
108 0.51
109 0.55
110 0.6
111 0.63
112 0.68
113 0.73
114 0.78
115 0.81
116 0.84
117 0.86
118 0.87
119 0.89
120 0.91
121 0.91
122 0.95
123 0.95
124 0.95
125 0.94
126 0.94
127 0.93
128 0.92
129 0.9
130 0.86
131 0.78
132 0.68
133 0.59
134 0.48
135 0.38
136 0.28
137 0.19
138 0.11
139 0.08
140 0.06
141 0.04
142 0.04
143 0.02
144 0.02
145 0.02
146 0.02
147 0.02
148 0.02
149 0.02
150 0.03
151 0.03
152 0.04
153 0.06
154 0.06
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.04
162 0.04
163 0.05
164 0.05
165 0.06
166 0.07
167 0.08
168 0.1
169 0.13
170 0.14
171 0.2
172 0.29
173 0.38
174 0.47
175 0.52
176 0.58
177 0.66
178 0.75
179 0.75
180 0.73
181 0.65
182 0.59
183 0.56
184 0.5
185 0.4
186 0.3
187 0.24
188 0.17
189 0.14
190 0.1
191 0.1
192 0.08
193 0.08
194 0.07
195 0.07
196 0.08
197 0.1
198 0.1
199 0.09
200 0.08
201 0.09