Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A553HS43

Protein Details
Accession A0A553HS43    Localization Confidence High Confidence Score 15.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MTSGKEKKRKREQDGAIQPKKKVBasic
67-92QAYAKAAPSKPKKKHSKHATPSSSLLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-12KEKKRKRE
73-83APSKPKKKHSK
Subcellular Location(s) nucl 17, mito_nucl 11.833, cyto_nucl 11.333, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009668  RNA_pol-assoc_fac_A49-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF06870  RNA_pol_I_A49  
Amino Acid Sequences MTSGKEKKRKREQDGAIQPKKKVALQTTSEAPQSNTIKVASVKLGSSCPPVIATHPGLCLPSSVKFQAYAKAAPSKPKKKHSKHATPSSSLLLHSSSHSKLDYTAKEEGPGGRESHLKHYIGVFDPATGKLSVVEAKKMAVRGVVRSQQPKEEDLESRIASKNMMELRNDLGQAFGTKKAKKALAAITENAIIDNDRKTNTLAASSQAMITAIGEVTHTMASKEDLQAAADAAKPVPPGNFEAQEIQDVYTPQGLIGGELLNAIPIKDWQDAVKKGANKMLTSAFIASRLNPIGEGPDSAVRLKALRYLEFLIKFSKLVKGRTPKIPPPDKLRQLLQPAPEPVIQSIRRKFSSNQLIDKFHRDLLYTYCCALAAILSNFEFETSKIRYDLGLDDKQFGQYFREIGGRIKKATGAEKGTQVQMAVLSLPLEFPKVRYQRQKKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.9
2 0.9
3 0.89
4 0.83
5 0.75
6 0.7
7 0.64
8 0.57
9 0.53
10 0.49
11 0.48
12 0.47
13 0.51
14 0.51
15 0.51
16 0.5
17 0.43
18 0.37
19 0.37
20 0.35
21 0.31
22 0.28
23 0.25
24 0.26
25 0.26
26 0.28
27 0.23
28 0.22
29 0.21
30 0.21
31 0.23
32 0.22
33 0.25
34 0.23
35 0.2
36 0.2
37 0.2
38 0.2
39 0.24
40 0.26
41 0.23
42 0.24
43 0.24
44 0.24
45 0.23
46 0.22
47 0.18
48 0.17
49 0.2
50 0.2
51 0.2
52 0.22
53 0.23
54 0.28
55 0.29
56 0.28
57 0.28
58 0.35
59 0.37
60 0.44
61 0.53
62 0.57
63 0.62
64 0.71
65 0.78
66 0.78
67 0.87
68 0.88
69 0.89
70 0.89
71 0.91
72 0.88
73 0.81
74 0.74
75 0.67
76 0.57
77 0.46
78 0.37
79 0.27
80 0.21
81 0.18
82 0.2
83 0.17
84 0.18
85 0.18
86 0.17
87 0.19
88 0.26
89 0.27
90 0.27
91 0.32
92 0.3
93 0.31
94 0.32
95 0.3
96 0.26
97 0.25
98 0.21
99 0.17
100 0.21
101 0.22
102 0.28
103 0.32
104 0.29
105 0.28
106 0.29
107 0.31
108 0.28
109 0.29
110 0.21
111 0.17
112 0.18
113 0.17
114 0.18
115 0.14
116 0.12
117 0.1
118 0.11
119 0.14
120 0.14
121 0.16
122 0.14
123 0.15
124 0.17
125 0.17
126 0.16
127 0.15
128 0.15
129 0.17
130 0.23
131 0.28
132 0.31
133 0.37
134 0.38
135 0.4
136 0.4
137 0.38
138 0.35
139 0.33
140 0.3
141 0.26
142 0.29
143 0.24
144 0.25
145 0.24
146 0.21
147 0.18
148 0.16
149 0.18
150 0.19
151 0.21
152 0.19
153 0.19
154 0.22
155 0.23
156 0.23
157 0.18
158 0.13
159 0.12
160 0.12
161 0.12
162 0.14
163 0.18
164 0.19
165 0.22
166 0.26
167 0.27
168 0.27
169 0.3
170 0.31
171 0.32
172 0.33
173 0.31
174 0.28
175 0.27
176 0.26
177 0.21
178 0.16
179 0.09
180 0.08
181 0.09
182 0.09
183 0.09
184 0.1
185 0.1
186 0.12
187 0.12
188 0.13
189 0.12
190 0.12
191 0.12
192 0.12
193 0.11
194 0.09
195 0.09
196 0.07
197 0.06
198 0.05
199 0.04
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.05
208 0.06
209 0.07
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.07
217 0.07
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.07
223 0.07
224 0.08
225 0.1
226 0.12
227 0.13
228 0.13
229 0.15
230 0.15
231 0.15
232 0.15
233 0.12
234 0.11
235 0.1
236 0.1
237 0.09
238 0.09
239 0.07
240 0.08
241 0.08
242 0.06
243 0.07
244 0.06
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.05
253 0.08
254 0.08
255 0.09
256 0.11
257 0.17
258 0.19
259 0.22
260 0.26
261 0.25
262 0.26
263 0.3
264 0.29
265 0.23
266 0.24
267 0.22
268 0.19
269 0.18
270 0.18
271 0.14
272 0.13
273 0.14
274 0.12
275 0.13
276 0.12
277 0.11
278 0.1
279 0.1
280 0.11
281 0.11
282 0.11
283 0.09
284 0.11
285 0.12
286 0.12
287 0.13
288 0.11
289 0.11
290 0.11
291 0.15
292 0.15
293 0.15
294 0.18
295 0.2
296 0.25
297 0.25
298 0.26
299 0.23
300 0.22
301 0.21
302 0.19
303 0.24
304 0.22
305 0.25
306 0.32
307 0.39
308 0.44
309 0.53
310 0.59
311 0.59
312 0.65
313 0.7
314 0.68
315 0.67
316 0.72
317 0.7
318 0.67
319 0.64
320 0.6
321 0.59
322 0.57
323 0.52
324 0.47
325 0.42
326 0.41
327 0.39
328 0.33
329 0.27
330 0.31
331 0.31
332 0.34
333 0.38
334 0.42
335 0.42
336 0.45
337 0.46
338 0.48
339 0.55
340 0.53
341 0.56
342 0.55
343 0.59
344 0.58
345 0.62
346 0.54
347 0.46
348 0.41
349 0.33
350 0.3
351 0.3
352 0.33
353 0.28
354 0.26
355 0.23
356 0.22
357 0.2
358 0.18
359 0.13
360 0.11
361 0.11
362 0.13
363 0.12
364 0.13
365 0.13
366 0.14
367 0.14
368 0.1
369 0.15
370 0.15
371 0.17
372 0.17
373 0.18
374 0.18
375 0.2
376 0.25
377 0.27
378 0.31
379 0.3
380 0.32
381 0.32
382 0.35
383 0.34
384 0.29
385 0.25
386 0.21
387 0.21
388 0.2
389 0.24
390 0.22
391 0.27
392 0.36
393 0.37
394 0.36
395 0.36
396 0.38
397 0.38
398 0.43
399 0.43
400 0.4
401 0.4
402 0.44
403 0.46
404 0.44
405 0.41
406 0.34
407 0.28
408 0.22
409 0.19
410 0.13
411 0.1
412 0.09
413 0.08
414 0.09
415 0.09
416 0.12
417 0.11
418 0.14
419 0.24
420 0.31
421 0.41
422 0.51